217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0451 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_0451  aldose 1-epimerase  100 
 
 
336 aa  696    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.486981  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0474  Aldose 1-epimerase  46.2 
 
 
383 aa  256  4e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.561665  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0030  aldose 1-epimerase  41.16 
 
 
335 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.413428  normal  0.24254 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3031  aldose 1-epimerase  42.95 
 
 
338 aa  243  3e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.331849 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1210  aldose 1-epimerase  42.69 
 
 
347 aa  243  3.9999999999999997e-63  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00282737  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3804  Aldose 1-epimerase  40.98 
 
 
340 aa  239  6.999999999999999e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.437694 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4249  aldose 1-epimerase  41.32 
 
 
353 aa  238  2e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4133  Aldose 1-epimerase  39.76 
 
 
340 aa  231  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.270907 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0655  aldose 1-epimerase  41.49 
 
 
356 aa  230  2e-59  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0630  aldose 1-epimerase  41.49 
 
 
356 aa  230  2e-59  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0857  aldose 1-epimerase  41.99 
 
 
340 aa  228  1e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3731  aldose 1-epimerase  39.64 
 
 
382 aa  228  1e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.90424 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0799  aldose 1-epimerase  40.53 
 
 
397 aa  227  2e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0850  aldose 1-epimerase  42.21 
 
 
340 aa  227  2e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2311  aldose 1-epimerase  41.32 
 
 
355 aa  227  2e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2636  aldose 1-epimerase  39.52 
 
 
382 aa  227  3e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0151396  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3099  Aldose 1-epimerase  43.87 
 
 
346 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0743555 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0489  Aldose 1-epimerase  37.2 
 
 
393 aa  225  7e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2369  aldose 1-epimerase  39.82 
 
 
382 aa  224  2e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0104312  normal  0.855778 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1503  Aldose 1-epimerase  42.12 
 
 
317 aa  223  3e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.72169 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0621  Aldose 1-epimerase  43.08 
 
 
388 aa  223  4e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.295352  normal  0.0428145 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1187  aldose 1-epimerase  40.43 
 
 
354 aa  222  4.9999999999999996e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.353984 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2873  aldose 1-epimerase  43.23 
 
 
346 aa  222  6e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.341142  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2993  Aldose 1-epimerase  42.28 
 
 
346 aa  222  8e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.862423  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3618  aldose 1-epimerase  41.96 
 
 
384 aa  221  1.9999999999999999e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2369  aldose 1-epimerase  40.71 
 
 
339 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4631  aldose 1-epimerase  42.64 
 
 
361 aa  220  3e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4114  aldose 1-epimerase  41.84 
 
 
346 aa  219  5e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.413717 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2798  aldose 1-epimerase  44.05 
 
 
321 aa  218  1e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1235  Aldose 1-epimerase  39.44 
 
 
387 aa  217  2e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.153244 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1325  aldose 1-epimerase  39.88 
 
 
387 aa  216  5e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105451  normal  0.426674 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2727  Aldose 1-epimerase  39.02 
 
 
390 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.265647  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4369  Aldose 1-epimerase  37.75 
 
 
372 aa  216  5.9999999999999996e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.449933  normal  0.0127022 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3640  Aldose 1-epimerase  40.67 
 
 
356 aa  215  8e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1269  Aldose 1-epimerase  39.94 
 
 
414 aa  215  9e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0872441  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1457  aldose 1-epimerase  41.34 
 
 
387 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.808924  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1431  Aldose 1-epimerase  37.35 
 
 
354 aa  214  1.9999999999999998e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6371  aldose 1-epimerase  41.34 
 
 
387 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1182  aldose 1-epimerase  39.09 
 
 
356 aa  214  1.9999999999999998e-54  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2820  Aldose 1-epimerase  37.58 
 
 
380 aa  213  2.9999999999999995e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3593  Aldose 1-epimerase  37.73 
 
 
355 aa  212  9e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00379165  hitchhiker  0.0000198106 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1122  aldose 1-epimerase  38.67 
 
 
392 aa  210  2e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0321  aldose 1-epimerase  40.06 
 
 
375 aa  210  3e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.520613 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7038  aldose 1-epimerase  41.03 
 
 
387 aa  210  3e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.754242  normal  0.230743 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1386  aldose 1-epimerase  38.07 
 
 
384 aa  209  5e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.466174  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1247  aldose 1-epimerase  36.5 
 
 
346 aa  209  6e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.942743  normal  0.442353 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02261  aldose 1-epimerase  38.77 
 
 
346 aa  209  8e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03326  aldose 1-epimerase  35.54 
 
 
352 aa  208  1e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3076  aldose 1-epimerase  38.46 
 
 
362 aa  207  1e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.253201  normal  0.313504 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2018  galactose mutarotase  36.69 
 
 
357 aa  207  2e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.237722  normal  0.693329 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2717  aldose 1-epimerase  40.65 
 
 
327 aa  207  2e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.717761  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1039  Aldose 1-epimerase  38.79 
 
 
357 aa  207  3e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594028  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2135  galactose mutarotase  40.72 
 
 
359 aa  207  3e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2977  Aldose 1-epimerase  37.99 
 
 
397 aa  206  5e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.416586 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2751  aldose 1-epimerase  39.14 
 
 
336 aa  206  6e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5369  aldose 1-epimerase  39.16 
 
 
387 aa  205  1e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1758  aldose 1-epimerase  38.42 
 
 
372 aa  204  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00365517  normal  0.11441 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1196  aldose 1-epimerase  35.65 
 
 
350 aa  204  2e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3011  Aldose 1-epimerase  37.46 
 
 
400 aa  203  3e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.415447  hitchhiker  0.00870507 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0819  aldose 1-epimerase  38.44 
 
 
351 aa  201  9.999999999999999e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002663  aldose 1-epimerase  37.46 
 
 
354 aa  201  9.999999999999999e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6480  aldose 1-epimerase  37.43 
 
 
390 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0142424  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5727  aldose 1-epimerase  37.43 
 
 
390 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.306981  normal  0.628457 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2713  Aldose 1-epimerase  39.14 
 
 
348 aa  200  3e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0868  aldose 1-epimerase  35.28 
 
 
346 aa  200  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.558575  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0837  aldose 1-epimerase  35.28 
 
 
346 aa  200  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0923  aldose 1-epimerase  35.28 
 
 
346 aa  200  3.9999999999999996e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.285804 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00230  aldose 1-epimerase  36.78 
 
 
340 aa  199  3.9999999999999996e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0738  aldose 1-epimerase  37.8 
 
 
359 aa  199  5e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.547855 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0809  aldose 1-epimerase  35.28 
 
 
346 aa  199  7e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2723  Aldose 1-epimerase  37.99 
 
 
350 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0900  aldose 1-epimerase  34.97 
 
 
346 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3534  aldose 1-epimerase  34.68 
 
 
360 aa  196  3e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3008  Aldose 1-epimerase  37.2 
 
 
434 aa  196  6e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2135  Aldose 1-epimerase  34.25 
 
 
345 aa  196  6e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0437156 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4072  Aldose 1-epimerase  39.16 
 
 
360 aa  195  8.000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4184  Aldose 1-epimerase  39.16 
 
 
360 aa  195  8.000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2946  aldose 1-epimerase  37.96 
 
 
356 aa  194  1e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1153  Aldose 1-epimerase  36.92 
 
 
402 aa  194  1e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2858  aldose 1-epimerase  37.96 
 
 
356 aa  194  1e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.852671  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3154  aldose 1-epimerase  38.48 
 
 
350 aa  194  2e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4205  aldose 1-epimerase  38.81 
 
 
362 aa  194  2e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.613008  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2336  aldose 1-epimerase  40 
 
 
376 aa  193  3e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.360362  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6508  aldose 1-epimerase  39.05 
 
 
362 aa  193  3e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6742  aldose 1-epimerase  39.05 
 
 
362 aa  193  3e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112366  normal  0.547611 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2146  Aldose 1-epimerase  37.42 
 
 
351 aa  193  4e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0316163  normal  0.370684 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0236  aldose 1-epimerase  39.34 
 
 
347 aa  193  4e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1033  aldose 1-epimerase  38.7 
 
 
341 aa  193  4e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.391794  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2886  galactose mutarotase  34.66 
 
 
346 aa  192  5e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0783  aldose 1-epimerase  34.66 
 
 
346 aa  192  5e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.328342  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0779  aldose 1-epimerase  34.66 
 
 
346 aa  192  5e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.184805  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2906  aldose 1-epimerase  34.66 
 
 
346 aa  192  5e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.336239 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2072  aldose 1-epimerase  36.39 
 
 
351 aa  192  5e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0156594  hitchhiker  0.00000257166 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0677  aldose 1-epimerase  34.66 
 
 
346 aa  192  5e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.569185  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6331  aldose 1-epimerase  39.88 
 
 
362 aa  192  5e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0810  aldose 1-epimerase  34.66 
 
 
346 aa  192  5e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1985  aldose 1-epimerase  36.39 
 
 
351 aa  192  7e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0318773  normal  0.0314397 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0535  aldose 1-epimerase  37.79 
 
 
341 aa  192  8e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0136204 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0556  aldose 1-epimerase  35.45 
 
 
353 aa  191  1e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000526339  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0859  aldose 1-epimerase  34.36 
 
 
346 aa  191  1e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0241581  normal  0.840205 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>