206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1235 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1235  Aldose 1-epimerase  100 
 
 		 387 aa  791    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.153244 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2820  Aldose 1-epimerase  63.31 
 
 		 380 aa  471  1e-132  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2977  Aldose 1-epimerase  58.14 
 
 		 397 aa  466  9.999999999999999e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.416586 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1386  aldose 1-epimerase  59.5 
 
 		 384 aa  428  1e-119  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.466174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0799  aldose 1-epimerase  53.09 
 
 		 397 aa  420  1e-116  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1122  aldose 1-epimerase  53.89 
 
 		 392 aa  403  1e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0489  Aldose 1-epimerase  52.15 
 
 		 393 aa  398  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0474  Aldose 1-epimerase  54.96 
 
 		 383 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.561665  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2311  aldose 1-epimerase  55.13 
 
 		 355 aa  389  1e-107  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0321  aldose 1-epimerase  51.15 
 
 		 375 aa  381  1e-104  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.520613 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2636  aldose 1-epimerase  50.79 
 
 		 382 aa  374  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0151396  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2369  aldose 1-epimerase  50.79 
 
 		 382 aa  373  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0104312  normal  0.855778 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2727  Aldose 1-epimerase  52.47 
 
 		 390 aa  369  1e-101  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.265647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1325  aldose 1-epimerase  50.43 
 
 		 387 aa  367  1e-100  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105451  normal  0.426674 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2798  aldose 1-epimerase  54.83 
 
 		 321 aa  362  6e-99  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0621  Aldose 1-epimerase  51.12 
 
 		 388 aa  358  7e-98  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.295352  normal  0.0428145 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3731  aldose 1-epimerase  47.66 
 
 		 382 aa  354  2e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.90424 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1187  aldose 1-epimerase  49.71 
 
 		 354 aa  353  2e-96  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.353984 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1182  aldose 1-epimerase  51.41 
 
 		 356 aa  353  2e-96  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1039  Aldose 1-epimerase  48.17 
 
 		 357 aa  348  8e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594028  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0788  aldose 1-epimerase  50.28 
 
 		 357 aa  348  1e-94  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000118587  normal  0.618331 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4631  aldose 1-epimerase  49.86 
 
 		 361 aa  346  5e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3154  aldose 1-epimerase  52.92 
 
 		 350 aa  345  1e-93  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1269  Aldose 1-epimerase  47.71 
 
 		 414 aa  342  5e-93  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0872441  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1431  Aldose 1-epimerase  48.44 
 
 		 354 aa  341  1e-92  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3618  aldose 1-epimerase  48.73 
 
 		 384 aa  341  1e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6480  aldose 1-epimerase  45.27 
 
 		 390 aa  335  1e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0142424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5369  aldose 1-epimerase  44.25 
 
 		 387 aa  333  2e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1153  Aldose 1-epimerase  43.15 
 
 		 402 aa  334  2e-90  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2993  Aldose 1-epimerase  47.09 
 
 		 346 aa  333  3e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.862423  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5727  aldose 1-epimerase  45.01 
 
 		 390 aa  333  3e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.306981  normal  0.628457 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3008  Aldose 1-epimerase  47.41 
 
 		 434 aa  333  3e-90  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1457  aldose 1-epimerase  47.04 
 
 		 387 aa  331  1e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.808924  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6371  aldose 1-epimerase  47.04 
 
 		 387 aa  331  1e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3099  Aldose 1-epimerase  47.99 
 
 		 346 aa  330  3e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0743555 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2026  aldose 1-epimerase  44.92 
 
 		 392 aa  327  2.0000000000000001e-88  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.564676  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7038  aldose 1-epimerase  46.76 
 
 		 387 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.754242  normal  0.230743 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1503  Aldose 1-epimerase  50.44 
 
 		 317 aa  325  6e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.72169 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1210  aldose 1-epimerase  49.14 
 
 		 347 aa  325  1e-87  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00282737  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1632  aldose 1-epimerase  44.96 
 
 		 355 aa  322  9.000000000000001e-87  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2873  aldose 1-epimerase  44.77 
 
 		 346 aa  319  3.9999999999999996e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.341142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0655  aldose 1-epimerase  49.86 
 
 		 356 aa  318  7.999999999999999e-86  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0630  aldose 1-epimerase  49.86 
 
 		 356 aa  318  7.999999999999999e-86  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3076  aldose 1-epimerase  44.03 
 
 		 362 aa  317  2e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.253201  normal  0.313504 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2135  galactose mutarotase  47.44 
 
 		 359 aa  316  4e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4114  aldose 1-epimerase  44.19 
 
 		 346 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.413717 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2344  aldose 1-epimerase  44.94 
 
 		 363 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.145267 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2682  aldose 1-epimerase  40.1 
 
 		 406 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.508916  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1147  aldose 1-epimerase  42.6 
 
 		 368 aa  302  8.000000000000001e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.934595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1611  aldose 1-epimerase  44.26 
 
 		 438 aa  301  1e-80  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0628258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1805  aldose 1-epimerase  43.39 
 
 		 385 aa  296  4e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.122387 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3011  Aldose 1-epimerase  42.25 
 
 		 400 aa  294  1e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.415447  hitchhiker  0.00870507 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1758  aldose 1-epimerase  43.71 
 
 		 372 aa  292  8e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00365517  normal  0.11441 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4369  Aldose 1-epimerase  42.19 
 
 		 372 aa  291  1e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.449933  normal  0.0127022 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0738  aldose 1-epimerase  41.71 
 
 		 359 aa  289  4e-77  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.547855 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3640  Aldose 1-epimerase  43.59 
 
 		 356 aa  289  5.0000000000000004e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0556  aldose 1-epimerase  41.36 
 
 		 353 aa  284  1.0000000000000001e-75  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000526339  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2713  Aldose 1-epimerase  45.51 
 
 		 348 aa  282  6.000000000000001e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1020  aldose 1-epimerase  42.82 
 
 		 355 aa  282  7.000000000000001e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3593  Aldose 1-epimerase  43.43 
 
 		 355 aa  282  8.000000000000001e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00379165  hitchhiker  0.0000198106 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2723  Aldose 1-epimerase  42.86 
 
 		 350 aa  274  1.0000000000000001e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4184  Aldose 1-epimerase  39.44 
 
 		 360 aa  272  9e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4072  Aldose 1-epimerase  39.44 
 
 		 360 aa  272  9e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6330  aldose 1-epimerase  41.03 
 
 		 362 aa  270  4e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4205  aldose 1-epimerase  41.5 
 
 		 362 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.613008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3534  aldose 1-epimerase  41.5 
 
 		 360 aa  269  5.9999999999999995e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6030  aldose 1-epimerase  40.46 
 
 		 362 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.808799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002663  aldose 1-epimerase  43.99 
 
 		 354 aa  267  2e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2336  aldose 1-epimerase  41.48 
 
 		 376 aa  266  4e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.360362  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2624  aldose 1-epimerase  39.83 
 
 		 371 aa  265  1e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.240433 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1247  aldose 1-epimerase  42.11 
 
 		 346 aa  264  2e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.942743  normal  0.442353 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2886  galactose mutarotase  42.23 
 
 		 346 aa  261  1e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0783  aldose 1-epimerase  42.23 
 
 		 346 aa  261  1e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.328342  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0779  aldose 1-epimerase  42.23 
 
 		 346 aa  261  1e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.184805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2906  aldose 1-epimerase  42.23 
 
 		 346 aa  261  1e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.336239 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0677  aldose 1-epimerase  42.23 
 
 		 346 aa  261  1e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.569185  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0810  aldose 1-epimerase  42.23 
 
 		 346 aa  261  1e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6635  Aldose 1-epimerase  39.55 
 
 		 361 aa  260  3e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.779767  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1357  aldose 1-epimerase  39.78 
 
 		 351 aa  259  6e-68  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0859  aldose 1-epimerase  41.94 
 
 		 346 aa  258  9e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0241581  normal  0.840205 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1033  aldose 1-epimerase  41.76 
 
 		 341 aa  257  2e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.391794  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2018  galactose mutarotase  40.06 
 
 		 357 aa  257  3e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.237722  normal  0.693329 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0837  aldose 1-epimerase  41.94 
 
 		 346 aa  257  3e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0809  aldose 1-epimerase  41.94 
 
 		 346 aa  256  4e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0923  aldose 1-epimerase  41.64 
 
 		 346 aa  256  4e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.285804 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0819  aldose 1-epimerase  36.57 
 
 		 351 aa  255  8e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3100  aldose 1-epimerase  41.43 
 
 		 377 aa  255  9e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0868  aldose 1-epimerase  41.64 
 
 		 346 aa  255  9e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.558575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6508  aldose 1-epimerase  40.06 
 
 		 362 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0900  aldose 1-epimerase  41.64 
 
 		 346 aa  255  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6742  aldose 1-epimerase  40.06 
 
 		 362 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112366  normal  0.547611 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6331  aldose 1-epimerase  39.77 
 
 		 362 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0282  Aldose 1-epimerase  40.92 
 
 		 357 aa  251  1e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.22783  normal  0.0158756 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1196  aldose 1-epimerase  40.59 
 
 		 350 aa  244  9.999999999999999e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0577  Aldose 1-epimerase  39.51 
 
 		 330 aa  244  1.9999999999999999e-63  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1290  galactose mutarotase  40.06 
 
 		 347 aa  243  5e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.994264  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2212  aldose 1-epimerase  37.54 
 
 		 347 aa  243  6e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.939522  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03326  aldose 1-epimerase  39 
 
 		 352 aa  240  2e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2135  Aldose 1-epimerase  39.83 
 
 		 345 aa  241  2e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0437156 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1115  aldose 1-epimerase  36.68 
 
 		 351 aa  240  2.9999999999999997e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>