210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2369 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2636  aldose 1-epimerase  95.81 
 
 		 382 aa  752    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0151396  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2369  aldose 1-epimerase  100 
 
 		 382 aa  779    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0104312  normal  0.855778 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3731  aldose 1-epimerase  79.05 
 
 		 382 aa  618  1e-176  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.90424 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1386  aldose 1-epimerase  53.49 
 
 		 384 aa  392  1e-108  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.466174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0799  aldose 1-epimerase  49.49 
 
 		 397 aa  374  1e-102  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3618  aldose 1-epimerase  49.87 
 
 		 384 aa  372  1e-102  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1457  aldose 1-epimerase  49.21 
 
 		 387 aa  368  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.808924  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6371  aldose 1-epimerase  49.21 
 
 		 387 aa  368  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0621  Aldose 1-epimerase  53.6 
 
 		 388 aa  370  1e-101  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.295352  normal  0.0428145 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1235  Aldose 1-epimerase  53.41 
 
 		 387 aa  370  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.153244 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5369  aldose 1-epimerase  49.35 
 
 		 387 aa  365  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0474  Aldose 1-epimerase  49.44 
 
 		 383 aa  368  1e-100  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.561665  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7038  aldose 1-epimerase  51.26 
 
 		 387 aa  363  2e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.754242  normal  0.230743 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0489  Aldose 1-epimerase  50.43 
 
 		 393 aa  358  9e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0321  aldose 1-epimerase  50 
 
 		 375 aa  354  1e-96  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.520613 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6480  aldose 1-epimerase  47.89 
 
 		 390 aa  354  1e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0142424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5727  aldose 1-epimerase  47.89 
 
 		 390 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.306981  normal  0.628457 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2820  Aldose 1-epimerase  49.6 
 
 		 380 aa  350  2e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1269  Aldose 1-epimerase  49.31 
 
 		 414 aa  348  1e-94  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0872441  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1153  Aldose 1-epimerase  46.72 
 
 		 402 aa  347  1e-94  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1325  aldose 1-epimerase  45.67 
 
 		 387 aa  345  5e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105451  normal  0.426674 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2311  aldose 1-epimerase  49.71 
 
 		 355 aa  342  1e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1122  aldose 1-epimerase  47.12 
 
 		 392 aa  340  2.9999999999999998e-92  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1187  aldose 1-epimerase  48.28 
 
 		 354 aa  338  9.999999999999999e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.353984 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1431  Aldose 1-epimerase  48.15 
 
 		 354 aa  337  1.9999999999999998e-91  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2727  Aldose 1-epimerase  47.92 
 
 		 390 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.265647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0655  aldose 1-epimerase  50.28 
 
 		 356 aa  335  9e-91  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0630  aldose 1-epimerase  50.28 
 
 		 356 aa  335  9e-91  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3008  Aldose 1-epimerase  47.68 
 
 		 434 aa  331  1e-89  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2977  Aldose 1-epimerase  48.86 
 
 		 397 aa  327  3e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.416586 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4631  aldose 1-epimerase  47.89 
 
 		 361 aa  325  9e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1182  aldose 1-epimerase  47.03 
 
 		 356 aa  325  9e-88  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3076  aldose 1-epimerase  46.35 
 
 		 362 aa  324  2e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.253201  normal  0.313504 
 
 
-
 
NC_002950  PG1632  aldose 1-epimerase  43.59 
 
 		 355 aa  320  3.9999999999999996e-86  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2798  aldose 1-epimerase  51.08 
 
 		 321 aa  319  5e-86  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3099  Aldose 1-epimerase  46.84 
 
 		 346 aa  319  5e-86  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0743555 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1147  aldose 1-epimerase  47.04 
 
 		 368 aa  318  7e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.934595  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1039  Aldose 1-epimerase  46.59 
 
 		 357 aa  317  2e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594028  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4114  aldose 1-epimerase  46.11 
 
 		 346 aa  316  4e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.413717 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1210  aldose 1-epimerase  47.89 
 
 		 347 aa  316  4e-85  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00282737  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3011  Aldose 1-epimerase  44.88 
 
 		 400 aa  313  1.9999999999999998e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.415447  hitchhiker  0.00870507 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2873  aldose 1-epimerase  46.26 
 
 		 346 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.341142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2993  Aldose 1-epimerase  46.42 
 
 		 346 aa  312  6.999999999999999e-84  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.862423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3154  aldose 1-epimerase  47.41 
 
 		 350 aa  311  1e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4369  Aldose 1-epimerase  44.09 
 
 		 372 aa  311  2e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.449933  normal  0.0127022 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2135  galactose mutarotase  46.29 
 
 		 359 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0788  aldose 1-epimerase  47.77 
 
 		 357 aa  307  2.0000000000000002e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000118587  normal  0.618331 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2026  aldose 1-epimerase  43.4 
 
 		 392 aa  304  1.0000000000000001e-81  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.564676  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3640  Aldose 1-epimerase  46.74 
 
 		 356 aa  298  2e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1503  Aldose 1-epimerase  47.13 
 
 		 317 aa  296  3e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.72169 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1805  aldose 1-epimerase  41.76 
 
 		 385 aa  295  9e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.122387 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0738  aldose 1-epimerase  42.42 
 
 		 359 aa  290  4e-77  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.547855 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1611  aldose 1-epimerase  41.8 
 
 		 438 aa  289  5.0000000000000004e-77  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0628258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1020  aldose 1-epimerase  45.27 
 
 		 355 aa  289  5.0000000000000004e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1758  aldose 1-epimerase  42.78 
 
 		 372 aa  289  7e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00365517  normal  0.11441 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3593  Aldose 1-epimerase  43.37 
 
 		 355 aa  288  8e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00379165  hitchhiker  0.0000198106 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0556  aldose 1-epimerase  41.79 
 
 		 353 aa  282  9e-75  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000526339  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2682  aldose 1-epimerase  42.69 
 
 		 406 aa  281  1e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.508916  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3534  aldose 1-epimerase  41 
 
 		 360 aa  269  5.9999999999999995e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0282  Aldose 1-epimerase  43.71 
 
 		 357 aa  267  2e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.22783  normal  0.0158756 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0819  aldose 1-epimerase  41.08 
 
 		 351 aa  262  8.999999999999999e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2344  aldose 1-epimerase  39.95 
 
 		 363 aa  257  3e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.145267 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2713  Aldose 1-epimerase  42.09 
 
 		 348 aa  256  6e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2135  Aldose 1-epimerase  40.29 
 
 		 345 aa  251  1e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0437156 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6331  aldose 1-epimerase  40.66 
 
 		 362 aa  251  2e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2723  Aldose 1-epimerase  40.35 
 
 		 350 aa  251  2e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6508  aldose 1-epimerase  40.38 
 
 		 362 aa  248  9e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6742  aldose 1-epimerase  40.38 
 
 		 362 aa  248  9e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112366  normal  0.547611 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4205  aldose 1-epimerase  40.06 
 
 		 362 aa  245  8e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.613008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1033  aldose 1-epimerase  39.61 
 
 		 341 aa  242  9e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.391794  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6030  aldose 1-epimerase  38.32 
 
 		 362 aa  240  2e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.808799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2336  aldose 1-epimerase  40.44 
 
 		 376 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.360362  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6330  aldose 1-epimerase  38.59 
 
 		 362 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2146  Aldose 1-epimerase  37.53 
 
 		 351 aa  238  2e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0316163  normal  0.370684 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3100  aldose 1-epimerase  37.96 
 
 		 377 aa  236  4e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1985  aldose 1-epimerase  38.55 
 
 		 351 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0318773  normal  0.0314397 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2072  aldose 1-epimerase  38.55 
 
 		 351 aa  233  3e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0156594  hitchhiker  0.00000257166 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2018  galactose mutarotase  39.71 
 
 		 357 aa  233  3e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.237722  normal  0.693329 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1247  aldose 1-epimerase  38.26 
 
 		 346 aa  233  4.0000000000000004e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.942743  normal  0.442353 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03326  aldose 1-epimerase  37.97 
 
 		 352 aa  233  5e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0535  aldose 1-epimerase  38.84 
 
 		 341 aa  232  7.000000000000001e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0136204 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1115  aldose 1-epimerase  35 
 
 		 351 aa  232  7.000000000000001e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1989  aldose 1-epimerase  38.27 
 
 		 351 aa  231  2e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0839729  unclonable  0.000022242 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2060  aldose 1-epimerase  39.15 
 
 		 351 aa  230  3e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.573655  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0779  aldose 1-epimerase  37.57 
 
 		 346 aa  228  2e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.184805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0810  aldose 1-epimerase  37.57 
 
 		 346 aa  228  2e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2886  galactose mutarotase  37.57 
 
 		 346 aa  228  2e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0783  aldose 1-epimerase  37.57 
 
 		 346 aa  228  2e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.328342  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002663  aldose 1-epimerase  38.7 
 
 		 354 aa  228  2e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2906  aldose 1-epimerase  37.57 
 
 		 346 aa  228  2e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.336239 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0677  aldose 1-epimerase  37.57 
 
 		 346 aa  228  2e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.569185  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2212  aldose 1-epimerase  36.16 
 
 		 347 aa  227  3e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.939522  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1357  aldose 1-epimerase  36.97 
 
 		 351 aa  226  4e-58  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0859  aldose 1-epimerase  37.28 
 
 		 346 aa  226  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0241581  normal  0.840205 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4184  Aldose 1-epimerase  37.05 
 
 		 360 aa  224  2e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4072  Aldose 1-epimerase  37.05 
 
 		 360 aa  224  2e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0451  aldose 1-epimerase  39.82 
 
 		 336 aa  224  3e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.486981  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02261  aldose 1-epimerase  38.9 
 
 		 346 aa  223  3e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2624  aldose 1-epimerase  39.01 
 
 		 371 aa  223  6e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.240433 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0837  aldose 1-epimerase  36.71 
 
 		 346 aa  221  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>