196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1033 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_1033  aldose 1-epimerase  100 
 
 		 341 aa  681    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.391794  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1503  Aldose 1-epimerase  53.29 
 
 		 317 aa  302  6.000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.72169 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3099  Aldose 1-epimerase  50.14 
 
 		 346 aa  301  1e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0743555 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2993  Aldose 1-epimerase  50.29 
 
 		 346 aa  297  1e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.862423  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2873  aldose 1-epimerase  48.7 
 
 		 346 aa  296  5e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.341142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4114  aldose 1-epimerase  50.14 
 
 		 346 aa  290  2e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.413717 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1457  aldose 1-epimerase  49.86 
 
 		 387 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.808924  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6371  aldose 1-epimerase  49.86 
 
 		 387 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7038  aldose 1-epimerase  49.58 
 
 		 387 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.754242  normal  0.230743 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0621  Aldose 1-epimerase  49.02 
 
 		 388 aa  283  4.0000000000000003e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.295352  normal  0.0428145 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6480  aldose 1-epimerase  48.31 
 
 		 390 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0142424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2977  Aldose 1-epimerase  44.96 
 
 		 397 aa  281  1e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.416586 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5727  aldose 1-epimerase  48.59 
 
 		 390 aa  280  2e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.306981  normal  0.628457 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5369  aldose 1-epimerase  47.58 
 
 		 387 aa  278  9e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1039  Aldose 1-epimerase  47.88 
 
 		 357 aa  275  1.0000000000000001e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594028  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0655  aldose 1-epimerase  45.85 
 
 		 356 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0630  aldose 1-epimerase  45.85 
 
 		 356 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1805  aldose 1-epimerase  46.84 
 
 		 385 aa  272  7e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.122387 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3008  Aldose 1-epimerase  44.77 
 
 		 434 aa  268  7e-71  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1182  aldose 1-epimerase  40.52 
 
 		 356 aa  265  1e-69  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2311  aldose 1-epimerase  45.33 
 
 		 355 aa  261  1e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1122  aldose 1-epimerase  40.68 
 
 		 392 aa  261  2e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1386  aldose 1-epimerase  44.04 
 
 		 384 aa  260  3e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.466174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1235  Aldose 1-epimerase  41.76 
 
 		 387 aa  258  1e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.153244 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2820  Aldose 1-epimerase  42.24 
 
 		 380 aa  257  2e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1325  aldose 1-epimerase  44.01 
 
 		 387 aa  256  3e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105451  normal  0.426674 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0474  Aldose 1-epimerase  46.26 
 
 		 383 aa  256  5e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.561665  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4369  Aldose 1-epimerase  44.8 
 
 		 372 aa  255  7e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.449933  normal  0.0127022 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1187  aldose 1-epimerase  42.61 
 
 		 354 aa  255  8e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.353984 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1269  Aldose 1-epimerase  43.09 
 
 		 414 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0872441  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0489  Aldose 1-epimerase  40.8 
 
 		 393 aa  252  6e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1210  aldose 1-epimerase  41.45 
 
 		 347 aa  252  7e-66  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00282737  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3731  aldose 1-epimerase  41.36 
 
 		 382 aa  251  9.000000000000001e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.90424 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0819  aldose 1-epimerase  44.74 
 
 		 351 aa  250  2e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0799  aldose 1-epimerase  43.02 
 
 		 397 aa  247  3e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2636  aldose 1-epimerase  39.72 
 
 		 382 aa  245  6.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0151396  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2727  Aldose 1-epimerase  41.69 
 
 		 390 aa  245  9e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.265647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3011  Aldose 1-epimerase  43.88 
 
 		 400 aa  243  3e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.415447  hitchhiker  0.00870507 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2369  aldose 1-epimerase  39.61 
 
 		 382 aa  242  7.999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0104312  normal  0.855778 
 
 
-
 
NC_002950  PG1632  aldose 1-epimerase  39.32 
 
 		 355 aa  241  1e-62  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2798  aldose 1-epimerase  45.57 
 
 		 321 aa  241  1e-62  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1758  aldose 1-epimerase  42.21 
 
 		 372 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00365517  normal  0.11441 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4631  aldose 1-epimerase  43.79 
 
 		 361 aa  238  1e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3618  aldose 1-epimerase  41.62 
 
 		 384 aa  236  5.0000000000000005e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3593  Aldose 1-epimerase  42.03 
 
 		 355 aa  235  9e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00379165  hitchhiker  0.0000198106 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0321  aldose 1-epimerase  40.23 
 
 		 375 aa  233  4.0000000000000004e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.520613 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0788  aldose 1-epimerase  40.4 
 
 		 357 aa  231  1e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000118587  normal  0.618331 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0738  aldose 1-epimerase  38.03 
 
 		 359 aa  231  2e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.547855 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3154  aldose 1-epimerase  42.36 
 
 		 350 aa  230  3e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1153  Aldose 1-epimerase  42.02 
 
 		 402 aa  229  5e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1431  Aldose 1-epimerase  37.43 
 
 		 354 aa  228  2e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2135  galactose mutarotase  43.87 
 
 		 359 aa  226  6e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1611  aldose 1-epimerase  40.64 
 
 		 438 aa  225  7e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0628258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1290  galactose mutarotase  40.41 
 
 		 347 aa  223  3e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.994264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3640  Aldose 1-epimerase  41.57 
 
 		 356 aa  223  4.9999999999999996e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2946  aldose 1-epimerase  39.65 
 
 		 356 aa  220  3e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2858  aldose 1-epimerase  39.65 
 
 		 356 aa  220  3e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.852671  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3076  aldose 1-epimerase  40.72 
 
 		 362 aa  219  3.9999999999999997e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.253201  normal  0.313504 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6330  aldose 1-epimerase  43.48 
 
 		 362 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002663  aldose 1-epimerase  38.71 
 
 		 354 aa  219  5e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2135  Aldose 1-epimerase  36.58 
 
 		 345 aa  218  7.999999999999999e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0437156 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0282  Aldose 1-epimerase  42.9 
 
 		 357 aa  216  5e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.22783  normal  0.0158756 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3100  aldose 1-epimerase  40.34 
 
 		 377 aa  215  9.999999999999999e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6030  aldose 1-epimerase  42.9 
 
 		 362 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.808799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2026  aldose 1-epimerase  35.8 
 
 		 392 aa  214  1.9999999999999998e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.564676  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6331  aldose 1-epimerase  42.61 
 
 		 362 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6508  aldose 1-epimerase  42.9 
 
 		 362 aa  212  7e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6742  aldose 1-epimerase  42.9 
 
 		 362 aa  212  7e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112366  normal  0.547611 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4205  aldose 1-epimerase  41.74 
 
 		 362 aa  211  2e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.613008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03326  aldose 1-epimerase  36.24 
 
 		 352 aa  211  2e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0556  aldose 1-epimerase  34.86 
 
 		 353 aa  210  3e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000526339  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2713  Aldose 1-epimerase  41.84 
 
 		 348 aa  210  3e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2336  aldose 1-epimerase  42.65 
 
 		 376 aa  207  1e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.360362  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2723  Aldose 1-epimerase  39.18 
 
 		 350 aa  208  1e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1020  aldose 1-epimerase  40.88 
 
 		 355 aa  206  4e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1147  aldose 1-epimerase  39.26 
 
 		 368 aa  206  5e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.934595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4072  Aldose 1-epimerase  39.94 
 
 		 360 aa  204  2e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02261  aldose 1-epimerase  40.59 
 
 		 346 aa  204  2e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4184  Aldose 1-epimerase  39.94 
 
 		 360 aa  204  2e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1115  aldose 1-epimerase  34.13 
 
 		 351 aa  204  2e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6635  Aldose 1-epimerase  38.66 
 
 		 361 aa  204  2e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.779767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3534  aldose 1-epimerase  37.78 
 
 		 360 aa  202  6e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0535  aldose 1-epimerase  37.8 
 
 		 341 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0136204 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2018  galactose mutarotase  36.92 
 
 		 357 aa  200  3e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.237722  normal  0.693329 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3031  aldose 1-epimerase  37.76 
 
 		 338 aa  199  7e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.331849 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3070  aldose 1-epimerase  37.65 
 
 		 348 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4133  Aldose 1-epimerase  36.36 
 
 		 340 aa  197  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.270907 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1247  aldose 1-epimerase  35.88 
 
 		 346 aa  195  7e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.942743  normal  0.442353 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1264  aldose 1-epimerase  37.65 
 
 		 348 aa  195  8.000000000000001e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0413  aldose 1-epimerase  35.26 
 
 		 342 aa  194  1e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3804  Aldose 1-epimerase  36.58 
 
 		 340 aa  195  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.437694 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00230  aldose 1-epimerase  35.82 
 
 		 340 aa  194  1e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2624  aldose 1-epimerase  37.78 
 
 		 371 aa  194  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.240433 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0451  aldose 1-epimerase  38.7 
 
 		 336 aa  193  4e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.486981  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2682  aldose 1-epimerase  34.38 
 
 		 406 aa  192  7e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.508916  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3250  aldose 1-epimerase  33.62 
 
 		 344 aa  192  7e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2212  aldose 1-epimerase  34.11 
 
 		 347 aa  191  1e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.939522  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0859  aldose 1-epimerase  35.23 
 
 		 346 aa  191  1e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0241581  normal  0.840205 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0783  aldose 1-epimerase  35.23 
 
 		 346 aa  191  2e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.328342  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0779  aldose 1-epimerase  35.23 
 
 		 346 aa  191  2e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.184805  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>