201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4133 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3804  Aldose 1-epimerase  93.82 
 
 
340 aa  671    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.437694 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4133  Aldose 1-epimerase  100 
 
 
340 aa  708    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.270907 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3031  aldose 1-epimerase  68.66 
 
 
338 aa  494  9.999999999999999e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.331849 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4249  aldose 1-epimerase  63.77 
 
 
353 aa  452  1.0000000000000001e-126  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0857  aldose 1-epimerase  43.03 
 
 
340 aa  306  5.0000000000000004e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0850  aldose 1-epimerase  43.03 
 
 
340 aa  305  5.0000000000000004e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2369  aldose 1-epimerase  43.32 
 
 
339 aa  304  2.0000000000000002e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2751  aldose 1-epimerase  42.47 
 
 
336 aa  260  2e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2993  Aldose 1-epimerase  40.29 
 
 
346 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.862423  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2873  aldose 1-epimerase  40.87 
 
 
346 aa  247  2e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.341142  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3099  Aldose 1-epimerase  39.42 
 
 
346 aa  243  5e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0743555 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0655  aldose 1-epimerase  39.2 
 
 
356 aa  241  1e-62  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0630  aldose 1-epimerase  39.2 
 
 
356 aa  241  1e-62  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0474  Aldose 1-epimerase  40.7 
 
 
383 aa  239  6.999999999999999e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.561665  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0451  aldose 1-epimerase  39.76 
 
 
336 aa  231  1e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.486981  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1503  Aldose 1-epimerase  40.91 
 
 
317 aa  231  1e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.72169 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1325  aldose 1-epimerase  39.77 
 
 
387 aa  228  9e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105451  normal  0.426674 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4114  aldose 1-epimerase  38.55 
 
 
346 aa  228  1e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.413717 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3076  aldose 1-epimerase  40.06 
 
 
362 aa  226  5.0000000000000005e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.253201  normal  0.313504 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0799  aldose 1-epimerase  37.78 
 
 
397 aa  224  1e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3618  aldose 1-epimerase  38.92 
 
 
384 aa  220  1.9999999999999999e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2135  galactose mutarotase  38.64 
 
 
359 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1187  aldose 1-epimerase  37.28 
 
 
354 aa  218  7.999999999999999e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.353984 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1210  aldose 1-epimerase  35.06 
 
 
347 aa  216  5e-55  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00282737  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1235  Aldose 1-epimerase  35.53 
 
 
387 aa  216  5.9999999999999996e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.153244 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1020  aldose 1-epimerase  38.59 
 
 
355 aa  215  9e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0621  Aldose 1-epimerase  37.75 
 
 
388 aa  214  1.9999999999999998e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.295352  normal  0.0428145 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1269  Aldose 1-epimerase  38.03 
 
 
414 aa  212  9e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0872441  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2977  Aldose 1-epimerase  37.22 
 
 
397 aa  211  1e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.416586 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4631  aldose 1-epimerase  38.68 
 
 
361 aa  211  2e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2636  aldose 1-epimerase  36.34 
 
 
382 aa  209  4e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0151396  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02261  aldose 1-epimerase  36.55 
 
 
346 aa  208  1e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1758  aldose 1-epimerase  37.54 
 
 
372 aa  208  1e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00365517  normal  0.11441 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7038  aldose 1-epimerase  36.39 
 
 
387 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.754242  normal  0.230743 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2683  aldose 1-epimerase  37.84 
 
 
334 aa  206  3e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.33869  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1457  aldose 1-epimerase  36.39 
 
 
387 aa  207  3e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.808924  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6371  aldose 1-epimerase  36.39 
 
 
387 aa  207  3e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2820  Aldose 1-epimerase  35.13 
 
 
380 aa  206  4e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2311  aldose 1-epimerase  37.43 
 
 
355 aa  206  4e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5727  aldose 1-epimerase  36.78 
 
 
390 aa  204  1e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.306981  normal  0.628457 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2727  Aldose 1-epimerase  37.72 
 
 
390 aa  204  1e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.265647  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2717  aldose 1-epimerase  37.15 
 
 
327 aa  204  2e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.717761  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2369  aldose 1-epimerase  36.08 
 
 
382 aa  204  3e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0104312  normal  0.855778 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3572  putative aldose 1-epimerase protein  37.65 
 
 
327 aa  203  3e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3254  aldose 1-epimerase  38.37 
 
 
327 aa  203  3e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0554047 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1122  aldose 1-epimerase  33.52 
 
 
392 aa  202  5e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6480  aldose 1-epimerase  36.49 
 
 
390 aa  202  8e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0142424  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3731  aldose 1-epimerase  34.66 
 
 
382 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.90424 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1182  aldose 1-epimerase  35.65 
 
 
356 aa  201  1.9999999999999998e-50  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0321  aldose 1-epimerase  36 
 
 
375 aa  201  1.9999999999999998e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.520613 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0738  aldose 1-epimerase  36.39 
 
 
359 aa  200  3e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.547855 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2798  aldose 1-epimerase  39.56 
 
 
321 aa  199  7e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3011  Aldose 1-epimerase  36.23 
 
 
400 aa  197  2.0000000000000003e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.415447  hitchhiker  0.00870507 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3150  hypothetical protein  36.36 
 
 
327 aa  197  3e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.516147 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1033  aldose 1-epimerase  36.36 
 
 
341 aa  197  3e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.391794  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1386  aldose 1-epimerase  36.02 
 
 
384 aa  196  4.0000000000000005e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.466174  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5369  aldose 1-epimerase  35.82 
 
 
387 aa  193  4e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0489  Aldose 1-epimerase  36.36 
 
 
393 aa  192  6e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0819  aldose 1-epimerase  37.57 
 
 
351 aa  192  7e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3008  Aldose 1-epimerase  33.04 
 
 
434 aa  192  8e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3593  Aldose 1-epimerase  31.58 
 
 
355 aa  191  1e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00379165  hitchhiker  0.0000198106 
 
 
-
 
NC_002950  PG1632  aldose 1-epimerase  36.17 
 
 
355 aa  191  2e-47  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0788  aldose 1-epimerase  36.67 
 
 
357 aa  191  2e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000118587  normal  0.618331 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1039  Aldose 1-epimerase  34.93 
 
 
357 aa  189  8e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594028  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4369  Aldose 1-epimerase  34.5 
 
 
372 aa  189  8e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.449933  normal  0.0127022 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2146  Aldose 1-epimerase  33.33 
 
 
351 aa  188  1e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0316163  normal  0.370684 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1431  Aldose 1-epimerase  34.46 
 
 
354 aa  188  1e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0809  aldose 1-epimerase  33.73 
 
 
346 aa  186  5e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1989  aldose 1-epimerase  33.23 
 
 
351 aa  186  6e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0839729  unclonable  0.000022242 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0923  aldose 1-epimerase  33.73 
 
 
346 aa  186  6e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.285804 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0837  aldose 1-epimerase  33.73 
 
 
346 aa  185  8e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1985  aldose 1-epimerase  32.93 
 
 
351 aa  185  8e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0318773  normal  0.0314397 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3534  aldose 1-epimerase  33.15 
 
 
360 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2072  aldose 1-epimerase  33.53 
 
 
351 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0156594  hitchhiker  0.00000257166 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0868  aldose 1-epimerase  33.43 
 
 
346 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.558575  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0900  aldose 1-epimerase  33.43 
 
 
346 aa  184  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03326  aldose 1-epimerase  35.29 
 
 
352 aa  182  7e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2906  aldose 1-epimerase  33.53 
 
 
346 aa  181  2e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.336239 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0779  aldose 1-epimerase  33.53 
 
 
346 aa  181  2e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.184805  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2886  galactose mutarotase  33.53 
 
 
346 aa  181  2e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002663  aldose 1-epimerase  34.76 
 
 
354 aa  181  2e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0677  aldose 1-epimerase  33.53 
 
 
346 aa  181  2e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.569185  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0810  aldose 1-epimerase  33.53 
 
 
346 aa  181  2e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0783  aldose 1-epimerase  33.53 
 
 
346 aa  181  2e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.328342  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0859  aldose 1-epimerase  33.23 
 
 
346 aa  180  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0241581  normal  0.840205 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1196  aldose 1-epimerase  35.71 
 
 
350 aa  180  2.9999999999999997e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3640  Aldose 1-epimerase  35.46 
 
 
356 aa  179  4e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1611  aldose 1-epimerase  35.82 
 
 
438 aa  179  4.999999999999999e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0628258  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2026  aldose 1-epimerase  32.09 
 
 
392 aa  179  8e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.564676  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1247  aldose 1-epimerase  33.23 
 
 
346 aa  178  1e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.942743  normal  0.442353 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1805  aldose 1-epimerase  33.92 
 
 
385 aa  177  2e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.122387 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4205  aldose 1-epimerase  36.73 
 
 
362 aa  177  2e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.613008  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6331  aldose 1-epimerase  36.73 
 
 
362 aa  177  3e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2060  aldose 1-epimerase  33.02 
 
 
351 aa  177  3e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.573655  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3154  aldose 1-epimerase  34.83 
 
 
350 aa  177  3e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2336  aldose 1-epimerase  37.85 
 
 
376 aa  176  4e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.360362  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6508  aldose 1-epimerase  36.73 
 
 
362 aa  176  4e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6742  aldose 1-epimerase  36.73 
 
 
362 aa  176  4e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112366  normal  0.547611 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2135  Aldose 1-epimerase  36.48 
 
 
345 aa  174  9.999999999999999e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0437156 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0535  aldose 1-epimerase  33.04 
 
 
341 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0136204 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>