202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_6371 on replicon NC_008544
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008060  Bcen_1457  aldose 1-epimerase  100 
 
 
387 aa  786    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.808924  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5727  aldose 1-epimerase  85.13 
 
 
390 aa  671    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.306981  normal  0.628457 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6371  aldose 1-epimerase  100 
 
 
387 aa  786    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7038  aldose 1-epimerase  98.45 
 
 
387 aa  774    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.754242  normal  0.230743 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6480  aldose 1-epimerase  84.62 
 
 
390 aa  666    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0142424  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5369  aldose 1-epimerase  81.14 
 
 
387 aa  627  1e-178  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1153  Aldose 1-epimerase  54.67 
 
 
402 aa  404  1e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2636  aldose 1-epimerase  50 
 
 
382 aa  378  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0151396  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2369  aldose 1-epimerase  49.21 
 
 
382 aa  368  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0104312  normal  0.855778 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3731  aldose 1-epimerase  50.68 
 
 
382 aa  361  1e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.90424 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0799  aldose 1-epimerase  50.92 
 
 
397 aa  358  7e-98  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1325  aldose 1-epimerase  49.73 
 
 
387 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105451  normal  0.426674 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0321  aldose 1-epimerase  47.81 
 
 
375 aa  345  1e-93  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.520613 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3099  Aldose 1-epimerase  50 
 
 
346 aa  345  1e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0743555 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0621  Aldose 1-epimerase  52.75 
 
 
388 aa  344  2e-93  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.295352  normal  0.0428145 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2873  aldose 1-epimerase  49.42 
 
 
346 aa  338  7e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.341142  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1147  aldose 1-epimerase  46.95 
 
 
368 aa  334  1e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.934595  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2993  Aldose 1-epimerase  48.7 
 
 
346 aa  334  1e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.862423  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0474  Aldose 1-epimerase  47.89 
 
 
383 aa  334  2e-90  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.561665  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0655  aldose 1-epimerase  51.41 
 
 
356 aa  334  2e-90  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0630  aldose 1-epimerase  51.41 
 
 
356 aa  334  2e-90  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4114  aldose 1-epimerase  50.43 
 
 
346 aa  332  8e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.413717 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1235  Aldose 1-epimerase  47.04 
 
 
387 aa  330  2e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.153244 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1269  Aldose 1-epimerase  49.86 
 
 
414 aa  330  3e-89  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0872441  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1210  aldose 1-epimerase  49.02 
 
 
347 aa  327  3e-88  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00282737  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1386  aldose 1-epimerase  46.21 
 
 
384 aa  325  6e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.466174  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2820  Aldose 1-epimerase  45.08 
 
 
380 aa  323  3e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3076  aldose 1-epimerase  48.86 
 
 
362 aa  321  9.999999999999999e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.253201  normal  0.313504 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1039  Aldose 1-epimerase  48.88 
 
 
357 aa  320  3e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594028  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1611  aldose 1-epimerase  46.05 
 
 
438 aa  319  3.9999999999999996e-86  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0628258  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2727  Aldose 1-epimerase  47.41 
 
 
390 aa  319  5e-86  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.265647  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1122  aldose 1-epimerase  43.05 
 
 
392 aa  319  7e-86  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4631  aldose 1-epimerase  49 
 
 
361 aa  318  9e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0489  Aldose 1-epimerase  44.63 
 
 
393 aa  318  1e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3618  aldose 1-epimerase  46.92 
 
 
384 aa  317  2e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1805  aldose 1-epimerase  46.37 
 
 
385 aa  315  9.999999999999999e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.122387 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3011  Aldose 1-epimerase  45.76 
 
 
400 aa  312  6.999999999999999e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.415447  hitchhiker  0.00870507 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1187  aldose 1-epimerase  43.87 
 
 
354 aa  308  1.0000000000000001e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.353984 
 
 
-
 
NC_002950  PG1632  aldose 1-epimerase  44 
 
 
355 aa  304  1.0000000000000001e-81  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1503  Aldose 1-epimerase  48.55 
 
 
317 aa  301  1e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.72169 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3008  Aldose 1-epimerase  45.33 
 
 
434 aa  300  2e-80  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2977  Aldose 1-epimerase  42.67 
 
 
397 aa  300  2e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.416586 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2311  aldose 1-epimerase  47.37 
 
 
355 aa  299  5e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2798  aldose 1-epimerase  49.38 
 
 
321 aa  298  2e-79  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1182  aldose 1-epimerase  42.74 
 
 
356 aa  296  6e-79  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4369  Aldose 1-epimerase  44.26 
 
 
372 aa  293  3e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.449933  normal  0.0127022 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1758  aldose 1-epimerase  43.34 
 
 
372 aa  291  1e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00365517  normal  0.11441 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3534  aldose 1-epimerase  43.06 
 
 
360 aa  291  1e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2135  galactose mutarotase  45.63 
 
 
359 aa  289  7e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1431  Aldose 1-epimerase  40.68 
 
 
354 aa  288  2e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3154  aldose 1-epimerase  46.51 
 
 
350 aa  287  2.9999999999999996e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1033  aldose 1-epimerase  49.86 
 
 
341 aa  286  4e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.391794  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0738  aldose 1-epimerase  43.59 
 
 
359 aa  283  3.0000000000000004e-75  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.547855 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0788  aldose 1-epimerase  44.35 
 
 
357 aa  280  3e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000118587  normal  0.618331 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0556  aldose 1-epimerase  38.76 
 
 
353 aa  278  1e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000526339  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2026  aldose 1-epimerase  38.63 
 
 
392 aa  276  4e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.564676  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1020  aldose 1-epimerase  44.32 
 
 
355 aa  270  2.9999999999999997e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3593  Aldose 1-epimerase  43.18 
 
 
355 aa  268  1e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00379165  hitchhiker  0.0000198106 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0282  Aldose 1-epimerase  43.43 
 
 
357 aa  262  6e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.22783  normal  0.0158756 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0819  aldose 1-epimerase  41.76 
 
 
351 aa  261  2e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2682  aldose 1-epimerase  39.55 
 
 
406 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.508916  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3640  Aldose 1-epimerase  43.3 
 
 
356 aa  253  4.0000000000000004e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2135  Aldose 1-epimerase  42.12 
 
 
345 aa  250  3e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0437156 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6030  aldose 1-epimerase  42.51 
 
 
362 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.808799  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6330  aldose 1-epimerase  43.71 
 
 
362 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6635  Aldose 1-epimerase  40.17 
 
 
361 aa  242  1e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.779767  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2336  aldose 1-epimerase  44.29 
 
 
376 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.360362  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2624  aldose 1-epimerase  40.17 
 
 
371 aa  239  9e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.240433 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4205  aldose 1-epimerase  42.21 
 
 
362 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.613008  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6331  aldose 1-epimerase  42 
 
 
362 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6508  aldose 1-epimerase  42 
 
 
362 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6742  aldose 1-epimerase  42 
 
 
362 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112366  normal  0.547611 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2723  Aldose 1-epimerase  38.84 
 
 
350 aa  229  7e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3669  aldose 1-epimerase  39.09 
 
 
344 aa  227  2e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2713  Aldose 1-epimerase  38.18 
 
 
348 aa  227  3e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2344  aldose 1-epimerase  39.46 
 
 
363 aa  226  6e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.145267 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0535  aldose 1-epimerase  40.43 
 
 
341 aa  226  6e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0136204 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2018  galactose mutarotase  36.95 
 
 
357 aa  225  8e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.237722  normal  0.693329 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3100  aldose 1-epimerase  39.83 
 
 
377 aa  225  1e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2946  aldose 1-epimerase  39.58 
 
 
356 aa  222  7e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2858  aldose 1-epimerase  39.58 
 
 
356 aa  222  7e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.852671  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1357  aldose 1-epimerase  36.49 
 
 
351 aa  221  1.9999999999999999e-56  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00230  aldose 1-epimerase  37.28 
 
 
340 aa  221  1.9999999999999999e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1344  aldose 1-epimerase  34.4 
 
 
343 aa  216  4e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02261  aldose 1-epimerase  38.58 
 
 
346 aa  216  5e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0451  aldose 1-epimerase  41.34 
 
 
336 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.486981  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3250  aldose 1-epimerase  37.92 
 
 
344 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2212  aldose 1-epimerase  34.51 
 
 
347 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.939522  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1515  Aldose 1-epimerase  35.83 
 
 
355 aa  212  9e-54  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1551  aldose 1-epimerase  34.2 
 
 
340 aa  212  1e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1115  aldose 1-epimerase  32.5 
 
 
351 aa  210  3e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4184  Aldose 1-epimerase  36.44 
 
 
360 aa  210  4e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4072  Aldose 1-epimerase  36.44 
 
 
360 aa  210  4e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3729  aldose 1-epimerase  38.18 
 
 
344 aa  209  6e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0656  Aldose 1-epimerase  38.48 
 
 
344 aa  209  7e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0633  aldose 1-epimerase  38.48 
 
 
344 aa  209  7e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0660  aldose 1-epimerase  38.48 
 
 
344 aa  209  8e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03326  aldose 1-epimerase  35.63 
 
 
352 aa  207  2e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4133  Aldose 1-epimerase  36.39 
 
 
340 aa  207  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.270907 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3031  aldose 1-epimerase  39.24 
 
 
338 aa  206  5e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.331849 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>