216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_1325 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_1325  aldose 1-epimerase  100 
 
 		 387 aa  776    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105451  normal  0.426674 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4631  aldose 1-epimerase  72.86 
 
 		 361 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3618  aldose 1-epimerase  58.67 
 
 		 384 aa  447  1.0000000000000001e-124  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3076  aldose 1-epimerase  51.42 
 
 		 362 aa  376  1e-103  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.253201  normal  0.313504 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0474  Aldose 1-epimerase  52.23 
 
 		 383 aa  376  1e-103  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.561665  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0799  aldose 1-epimerase  51.95 
 
 		 397 aa  372  1e-102  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0738  aldose 1-epimerase  53.12 
 
 		 359 aa  370  1e-101  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.547855 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2135  galactose mutarotase  54.47 
 
 		 359 aa  370  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1235  Aldose 1-epimerase  50.43 
 
 		 387 aa  367  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.153244 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0621  Aldose 1-epimerase  54.44 
 
 		 388 aa  356  5e-97  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.295352  normal  0.0428145 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5369  aldose 1-epimerase  49.34 
 
 		 387 aa  355  1e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1153  Aldose 1-epimerase  50 
 
 		 402 aa  355  1e-96  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6480  aldose 1-epimerase  49.6 
 
 		 390 aa  353  2e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0142424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1457  aldose 1-epimerase  49.73 
 
 		 387 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.808924  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5727  aldose 1-epimerase  49.6 
 
 		 390 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.306981  normal  0.628457 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6371  aldose 1-epimerase  49.73 
 
 		 387 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2636  aldose 1-epimerase  46.21 
 
 		 382 aa  350  3e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0151396  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2820  Aldose 1-epimerase  47.04 
 
 		 380 aa  347  2e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7038  aldose 1-epimerase  51 
 
 		 387 aa  347  2e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.754242  normal  0.230743 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1269  Aldose 1-epimerase  50.27 
 
 		 414 aa  346  4e-94  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0872441  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2369  aldose 1-epimerase  45.67 
 
 		 382 aa  345  5e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0104312  normal  0.855778 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1386  aldose 1-epimerase  48.96 
 
 		 384 aa  343  2e-93  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.466174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1020  aldose 1-epimerase  52.71 
 
 		 355 aa  341  1e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0321  aldose 1-epimerase  50.98 
 
 		 375 aa  338  9.999999999999999e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.520613 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2977  Aldose 1-epimerase  46.77 
 
 		 397 aa  336  3.9999999999999995e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.416586 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3731  aldose 1-epimerase  45.74 
 
 		 382 aa  335  7e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.90424 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0819  aldose 1-epimerase  48.56 
 
 		 351 aa  327  2.0000000000000001e-88  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2311  aldose 1-epimerase  50.99 
 
 		 355 aa  326  5e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2993  Aldose 1-epimerase  49.71 
 
 		 346 aa  325  9e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.862423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1122  aldose 1-epimerase  43.08 
 
 		 392 aa  325  9e-88  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1187  aldose 1-epimerase  46.82 
 
 		 354 aa  321  9.999999999999999e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.353984 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0489  Aldose 1-epimerase  47.98 
 
 		 393 aa  320  3e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4114  aldose 1-epimerase  50.56 
 
 		 346 aa  317  2e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.413717 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2798  aldose 1-epimerase  52.47 
 
 		 321 aa  317  2e-85  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2727  Aldose 1-epimerase  45.05 
 
 		 390 aa  317  3e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.265647  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3008  Aldose 1-epimerase  44.72 
 
 		 434 aa  315  8e-85  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3099  Aldose 1-epimerase  48.27 
 
 		 346 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0743555 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0655  aldose 1-epimerase  48.03 
 
 		 356 aa  309  5.9999999999999995e-83  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0630  aldose 1-epimerase  48.03 
 
 		 356 aa  309  5.9999999999999995e-83  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1039  Aldose 1-epimerase  47.16 
 
 		 357 aa  308  8e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594028  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2873  aldose 1-epimerase  47.98 
 
 		 346 aa  308  8e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.341142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3011  Aldose 1-epimerase  46.09 
 
 		 400 aa  303  3.0000000000000004e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.415447  hitchhiker  0.00870507 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1503  Aldose 1-epimerase  48.99 
 
 		 317 aa  302  8.000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.72169 
 
 
-
 
NC_002950  PG1632  aldose 1-epimerase  44.16 
 
 		 355 aa  299  5e-80  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0788  aldose 1-epimerase  45.48 
 
 		 357 aa  299  5e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000118587  normal  0.618331 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2026  aldose 1-epimerase  44.48 
 
 		 392 aa  299  7e-80  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.564676  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1182  aldose 1-epimerase  42.61 
 
 		 356 aa  297  2e-79  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4369  Aldose 1-epimerase  46.01 
 
 		 372 aa  293  3e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.449933  normal  0.0127022 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1147  aldose 1-epimerase  43.82 
 
 		 368 aa  291  1e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.934595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1611  aldose 1-epimerase  44.32 
 
 		 438 aa  291  1e-77  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0628258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1758  aldose 1-epimerase  44.99 
 
 		 372 aa  290  3e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00365517  normal  0.11441 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3154  aldose 1-epimerase  46.13 
 
 		 350 aa  285  1.0000000000000001e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1805  aldose 1-epimerase  43.68 
 
 		 385 aa  283  4.0000000000000003e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.122387 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1431  Aldose 1-epimerase  39.6 
 
 		 354 aa  277  2e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1210  aldose 1-epimerase  40.92 
 
 		 347 aa  275  9e-73  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00282737  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0282  Aldose 1-epimerase  46.86 
 
 		 357 aa  275  1.0000000000000001e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.22783  normal  0.0158756 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3640  Aldose 1-epimerase  46.02 
 
 		 356 aa  272  6e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3593  Aldose 1-epimerase  41.13 
 
 		 355 aa  268  1e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00379165  hitchhiker  0.0000198106 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2344  aldose 1-epimerase  45.24 
 
 		 363 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.145267 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002663  aldose 1-epimerase  43.15 
 
 		 354 aa  265  1e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4205  aldose 1-epimerase  44.09 
 
 		 362 aa  263  4e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.613008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6030  aldose 1-epimerase  44.64 
 
 		 362 aa  261  1e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.808799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3534  aldose 1-epimerase  39.39 
 
 		 360 aa  261  1e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6330  aldose 1-epimerase  44.93 
 
 		 362 aa  261  2e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2682  aldose 1-epimerase  37.43 
 
 		 406 aa  259  8e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.508916  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2336  aldose 1-epimerase  44.32 
 
 		 376 aa  258  1e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.360362  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6331  aldose 1-epimerase  44.11 
 
 		 362 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6508  aldose 1-epimerase  44.32 
 
 		 362 aa  257  2e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6742  aldose 1-epimerase  44.32 
 
 		 362 aa  257  2e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112366  normal  0.547611 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4072  Aldose 1-epimerase  42.17 
 
 		 360 aa  256  4e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4184  Aldose 1-epimerase  42.17 
 
 		 360 aa  256  4e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1033  aldose 1-epimerase  44.01 
 
 		 341 aa  256  4e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.391794  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0556  aldose 1-epimerase  38.57 
 
 		 353 aa  256  6e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000526339  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6635  Aldose 1-epimerase  43.02 
 
 		 361 aa  255  8e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.779767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2624  aldose 1-epimerase  43.02 
 
 		 371 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.240433 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2369  aldose 1-epimerase  43.1 
 
 		 339 aa  251  1e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3100  aldose 1-epimerase  42.78 
 
 		 377 aa  249  7e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4249  aldose 1-epimerase  42.9 
 
 		 353 aa  248  1e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1196  aldose 1-epimerase  39.07 
 
 		 350 aa  248  2e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02261  aldose 1-epimerase  41.26 
 
 		 346 aa  242  9e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2713  Aldose 1-epimerase  41.57 
 
 		 348 aa  241  1e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2018  galactose mutarotase  38.26 
 
 		 357 aa  241  1e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.237722  normal  0.693329 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2506  aldose 1-epimerase  39.18 
 
 		 355 aa  241  2e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.288802  normal  0.200846 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00230  aldose 1-epimerase  38.22 
 
 		 340 aa  239  5e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2723  Aldose 1-epimerase  40 
 
 		 350 aa  239  6.999999999999999e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0850  aldose 1-epimerase  40.23 
 
 		 340 aa  236  4e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2946  aldose 1-epimerase  38.79 
 
 		 356 aa  236  5.0000000000000005e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2858  aldose 1-epimerase  38.79 
 
 		 356 aa  236  5.0000000000000005e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.852671  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0857  aldose 1-epimerase  39.94 
 
 		 340 aa  234  2.0000000000000002e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1247  aldose 1-epimerase  39.53 
 
 		 346 aa  234  3e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.942743  normal  0.442353 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2135  Aldose 1-epimerase  37.78 
 
 		 345 aa  233  6e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0437156 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03326  aldose 1-epimerase  37.61 
 
 		 352 aa  233  6e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0535  aldose 1-epimerase  39.19 
 
 		 341 aa  232  8.000000000000001e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0136204 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3031  aldose 1-epimerase  41.38 
 
 		 338 aa  232  8.000000000000001e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.331849 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1357  aldose 1-epimerase  35.67 
 
 		 351 aa  228  1e-58  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1344  aldose 1-epimerase  36.09 
 
 		 343 aa  228  1e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4133  Aldose 1-epimerase  39.77 
 
 		 340 aa  228  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.270907 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1115  aldose 1-epimerase  34.57 
 
 		 351 aa  228  1e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3804  Aldose 1-epimerase  40.34 
 
 		 340 aa  227  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.437694 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2146  Aldose 1-epimerase  34.93 
 
 		 351 aa  227  3e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0316163  normal  0.370684 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>