194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_2717 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_2717  aldose 1-epimerase  100 
 
 		 327 aa  671    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.717761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2751  aldose 1-epimerase  43.47 
 
 		 336 aa  254  2.0000000000000002e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4249  aldose 1-epimerase  42.99 
 
 		 353 aa  244  9.999999999999999e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2369  aldose 1-epimerase  39.58 
 
 		 339 aa  233  4.0000000000000004e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0857  aldose 1-epimerase  39.34 
 
 		 340 aa  226  6e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3031  aldose 1-epimerase  39.44 
 
 		 338 aa  225  6e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.331849 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0850  aldose 1-epimerase  39.34 
 
 		 340 aa  225  7e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1503  Aldose 1-epimerase  38.86 
 
 		 317 aa  215  7e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.72169 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3572  putative aldose 1-epimerase protein  39.69 
 
 		 327 aa  212  7e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3804  Aldose 1-epimerase  36.76 
 
 		 340 aa  209  5e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.437694 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3254  aldose 1-epimerase  39.08 
 
 		 327 aa  208  1e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0554047 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0451  aldose 1-epimerase  40.65 
 
 		 336 aa  207  2e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.486981  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3150  hypothetical protein  39.38 
 
 		 327 aa  205  1e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.516147 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4133  Aldose 1-epimerase  37.15 
 
 		 340 aa  204  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.270907 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0474  Aldose 1-epimerase  38.82 
 
 		 383 aa  202  5e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.561665  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2727  Aldose 1-epimerase  38.42 
 
 		 390 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.265647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2026  aldose 1-epimerase  36.47 
 
 		 392 aa  199  3.9999999999999996e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.564676  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2683  aldose 1-epimerase  37.74 
 
 		 334 aa  199  6e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.33869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1187  aldose 1-epimerase  37.35 
 
 		 354 aa  196  3e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.353984 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0655  aldose 1-epimerase  37.54 
 
 		 356 aa  196  5.000000000000001e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0630  aldose 1-epimerase  37.54 
 
 		 356 aa  196  5.000000000000001e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2977  Aldose 1-epimerase  37.54 
 
 		 397 aa  196  6e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.416586 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1182  aldose 1-epimerase  37.09 
 
 		 356 aa  195  1e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0621  Aldose 1-epimerase  38.6 
 
 		 388 aa  191  1e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.295352  normal  0.0428145 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3731  aldose 1-epimerase  36.92 
 
 		 382 aa  188  1e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.90424 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1153  Aldose 1-epimerase  36.07 
 
 		 402 aa  187  2e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0321  aldose 1-epimerase  37.5 
 
 		 375 aa  184  2.0000000000000003e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.520613 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2135  galactose mutarotase  35.94 
 
 		 359 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2311  aldose 1-epimerase  36.72 
 
 		 355 aa  184  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2798  aldose 1-epimerase  39.41 
 
 		 321 aa  183  3e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2820  Aldose 1-epimerase  36.34 
 
 		 380 aa  182  7e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1325  aldose 1-epimerase  38.33 
 
 		 387 aa  182  7e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105451  normal  0.426674 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1039  Aldose 1-epimerase  35.36 
 
 		 357 aa  182  9.000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594028  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0788  aldose 1-epimerase  35.88 
 
 		 357 aa  182  1e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000118587  normal  0.618331 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002663  aldose 1-epimerase  35.35 
 
 		 354 aa  181  1e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4631  aldose 1-epimerase  36.99 
 
 		 361 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0799  aldose 1-epimerase  35.82 
 
 		 397 aa  180  4e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3593  Aldose 1-epimerase  35.91 
 
 		 355 aa  179  4.999999999999999e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00379165  hitchhiker  0.0000198106 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0489  Aldose 1-epimerase  35.08 
 
 		 393 aa  178  1e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0535  aldose 1-epimerase  34.24 
 
 		 341 aa  177  2e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0136204 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1122  aldose 1-epimerase  35.01 
 
 		 392 aa  177  2e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3011  Aldose 1-epimerase  35.67 
 
 		 400 aa  177  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.415447  hitchhiker  0.00870507 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4114  aldose 1-epimerase  35.01 
 
 		 346 aa  177  2e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.413717 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0738  aldose 1-epimerase  36.26 
 
 		 359 aa  176  4e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.547855 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2873  aldose 1-epimerase  32.04 
 
 		 346 aa  176  5e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.341142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1269  Aldose 1-epimerase  34.94 
 
 		 414 aa  176  5e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0872441  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2636  aldose 1-epimerase  34.77 
 
 		 382 aa  176  6e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0151396  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3099  Aldose 1-epimerase  32.04 
 
 		 346 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0743555 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1235  Aldose 1-epimerase  34.8 
 
 		 387 aa  174  9.999999999999999e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.153244 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1758  aldose 1-epimerase  34.1 
 
 		 372 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00365517  normal  0.11441 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3618  aldose 1-epimerase  34.58 
 
 		 384 aa  173  2.9999999999999996e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2946  aldose 1-epimerase  33.72 
 
 		 356 aa  172  5e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2858  aldose 1-epimerase  33.72 
 
 		 356 aa  172  5e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.852671  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2369  aldose 1-epimerase  34.2 
 
 		 382 aa  172  9e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0104312  normal  0.855778 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1290  galactose mutarotase  35.29 
 
 		 347 aa  172  9e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.994264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2072  aldose 1-epimerase  35.21 
 
 		 351 aa  172  9e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0156594  hitchhiker  0.00000257166 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4369  Aldose 1-epimerase  31.3 
 
 		 372 aa  172  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.449933  normal  0.0127022 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0576  aldose 1-epimerase  34.93 
 
 		 343 aa  171  1e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2993  Aldose 1-epimerase  33.03 
 
 		 346 aa  170  2e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.862423  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1985  aldose 1-epimerase  34.91 
 
 		 351 aa  171  2e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0318773  normal  0.0314397 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3640  Aldose 1-epimerase  34.86 
 
 		 356 aa  170  2e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1632  aldose 1-epimerase  33.83 
 
 		 355 aa  168  1e-40  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1989  aldose 1-epimerase  35.21 
 
 		 351 aa  168  1e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0839729  unclonable  0.000022242 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1611  aldose 1-epimerase  35.36 
 
 		 438 aa  167  2e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0628258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3076  aldose 1-epimerase  33.14 
 
 		 362 aa  167  2.9999999999999998e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.253201  normal  0.313504 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1386  aldose 1-epimerase  34.87 
 
 		 384 aa  167  2.9999999999999998e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.466174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2060  aldose 1-epimerase  36.04 
 
 		 351 aa  166  4e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.573655  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1033  aldose 1-epimerase  34.64 
 
 		 341 aa  165  8e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.391794  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5727  aldose 1-epimerase  34.32 
 
 		 390 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.306981  normal  0.628457 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6480  aldose 1-epimerase  34.62 
 
 		 390 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0142424  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1431  Aldose 1-epimerase  32.85 
 
 		 354 aa  165  1.0000000000000001e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3008  Aldose 1-epimerase  34.14 
 
 		 434 aa  164  2.0000000000000002e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1210  aldose 1-epimerase  32.93 
 
 		 347 aa  163  4.0000000000000004e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00282737  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7038  aldose 1-epimerase  33.63 
 
 		 387 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.754242  normal  0.230743 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1309  Aldose 1-epimerase  34.56 
 
 		 319 aa  162  6e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0694346 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1196  aldose 1-epimerase  34.98 
 
 		 350 aa  162  1e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0819  aldose 1-epimerase  33.23 
 
 		 351 aa  161  2e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1457  aldose 1-epimerase  33.33 
 
 		 387 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.808924  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6371  aldose 1-epimerase  33.33 
 
 		 387 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1247  aldose 1-epimerase  33.53 
 
 		 346 aa  161  2e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.942743  normal  0.442353 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0413  aldose 1-epimerase  34.04 
 
 		 342 aa  160  3e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2506  aldose 1-epimerase  33.44 
 
 		 355 aa  160  3e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.288802  normal  0.200846 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3154  aldose 1-epimerase  33.13 
 
 		 350 aa  160  3e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2146  Aldose 1-epimerase  35.03 
 
 		 351 aa  160  4e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0316163  normal  0.370684 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5369  aldose 1-epimerase  34.9 
 
 		 387 aa  159  5e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2682  aldose 1-epimerase  34.11 
 
 		 406 aa  159  5e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.508916  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0859  aldose 1-epimerase  32.84 
 
 		 346 aa  159  6e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0241581  normal  0.840205 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0543  aldose 1-epimerase  33.43 
 
 		 343 aa  158  1e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.386929 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3272  aldose 1-epimerase  32.84 
 
 		 346 aa  158  1e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0965292  hitchhiker  0.000248794 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2886  galactose mutarotase  32.55 
 
 		 346 aa  157  2e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1147  aldose 1-epimerase  32.05 
 
 		 368 aa  158  2e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.934595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0677  aldose 1-epimerase  32.55 
 
 		 346 aa  157  2e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.569185  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0783  aldose 1-epimerase  32.55 
 
 		 346 aa  157  2e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.328342  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2906  aldose 1-epimerase  32.55 
 
 		 346 aa  157  2e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.336239 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2051  Aldose 1-epimerase  31.4 
 
 		 341 aa  157  2e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0779  aldose 1-epimerase  32.55 
 
 		 346 aa  157  2e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.184805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0282  Aldose 1-epimerase  34.55 
 
 		 357 aa  157  2e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.22783  normal  0.0158756 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0810  aldose 1-epimerase  32.55 
 
 		 346 aa  157  2e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0656  Aldose 1-epimerase  31.76 
 
 		 344 aa  157  3e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0633  aldose 1-epimerase  31.76 
 
 		 344 aa  157  3e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>