204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_0543 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0693  aldose 1-epimerase  91.81 
 
 		 343 aa  658    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3409  aldose 1-epimerase  97.08 
 
 		 343 aa  694    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0646401 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0543  aldose 1-epimerase  100 
 
 		 343 aa  711    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.386929 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3579  aldose 1-epimerase  96.79 
 
 		 343 aa  691    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.496972 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0656  Aldose 1-epimerase  81.69 
 
 		 344 aa  600  1.0000000000000001e-171  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0633  aldose 1-epimerase  81.69 
 
 		 344 aa  600  1.0000000000000001e-171  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0660  aldose 1-epimerase  81.4 
 
 		 344 aa  598  1e-170  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3729  aldose 1-epimerase  81.1 
 
 		 344 aa  597  1e-169  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3250  aldose 1-epimerase  81.23 
 
 		 344 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3669  aldose 1-epimerase  71.22 
 
 		 344 aa  524  1e-148  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0413  aldose 1-epimerase  70.88 
 
 		 342 aa  510  1e-143  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0651  aldose 1-epimerase  66.37 
 
 		 343 aa  488  1e-137  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.225141  hitchhiker  0.000000283833 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4021  aldose 1-epimerase  67.54 
 
 		 339 aa  484  1e-136  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000192131 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0535  aldose 1-epimerase  66.96 
 
 		 341 aa  474  1e-133  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0136204 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0576  aldose 1-epimerase  63.27 
 
 		 343 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3272  aldose 1-epimerase  64.24 
 
 		 346 aa  464  9.999999999999999e-131  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0965292  hitchhiker  0.000248794 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1210  aldose 1-epimerase  40.18 
 
 		 347 aa  239  4e-62  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00282737  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2820  Aldose 1-epimerase  39.44 
 
 		 380 aa  236  3e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2946  aldose 1-epimerase  41.94 
 
 		 356 aa  235  9e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2858  aldose 1-epimerase  41.94 
 
 		 356 aa  235  9e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.852671  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6330  aldose 1-epimerase  38.48 
 
 		 362 aa  233  3e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1187  aldose 1-epimerase  39.12 
 
 		 354 aa  231  2e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.353984 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0321  aldose 1-epimerase  36.9 
 
 		 375 aa  231  2e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.520613 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6030  aldose 1-epimerase  38.01 
 
 		 362 aa  229  4e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.808799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3099  Aldose 1-epimerase  38.48 
 
 		 346 aa  229  7e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0743555 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2977  Aldose 1-epimerase  37.83 
 
 		 397 aa  226  6e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.416586 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2873  aldose 1-epimerase  37.32 
 
 		 346 aa  224  1e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.341142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6331  aldose 1-epimerase  37.9 
 
 		 362 aa  225  1e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1290  galactose mutarotase  41.06 
 
 		 347 aa  224  2e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.994264  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2336  aldose 1-epimerase  38.19 
 
 		 376 aa  224  2e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.360362  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4205  aldose 1-epimerase  37.72 
 
 		 362 aa  224  2e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.613008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2993  Aldose 1-epimerase  38.17 
 
 		 346 aa  223  4e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.862423  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6508  aldose 1-epimerase  38.01 
 
 		 362 aa  223  4e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6742  aldose 1-epimerase  38.01 
 
 		 362 aa  223  4e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112366  normal  0.547611 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3640  Aldose 1-epimerase  37.9 
 
 		 356 aa  221  1.9999999999999999e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1039  Aldose 1-epimerase  37.24 
 
 		 357 aa  220  1.9999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594028  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3593  Aldose 1-epimerase  38.64 
 
 		 355 aa  219  5e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00379165  hitchhiker  0.0000198106 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1503  Aldose 1-epimerase  38.25 
 
 		 317 aa  219  7e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.72169 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4631  aldose 1-epimerase  37.68 
 
 		 361 aa  219  7e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2311  aldose 1-epimerase  37.28 
 
 		 355 aa  218  7.999999999999999e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2344  aldose 1-epimerase  36.68 
 
 		 363 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.145267 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1269  Aldose 1-epimerase  36.39 
 
 		 414 aa  218  1e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0872441  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1247  aldose 1-epimerase  38.99 
 
 		 346 aa  218  2e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.942743  normal  0.442353 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3070  aldose 1-epimerase  41.36 
 
 		 348 aa  216  5e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1325  aldose 1-epimerase  36.63 
 
 		 387 aa  215  9e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105451  normal  0.426674 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0819  aldose 1-epimerase  37.27 
 
 		 351 aa  213  2.9999999999999995e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2682  aldose 1-epimerase  37.25 
 
 		 406 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.508916  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1264  aldose 1-epimerase  40.74 
 
 		 348 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0655  aldose 1-epimerase  38.72 
 
 		 356 aa  212  7e-54  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0630  aldose 1-epimerase  38.72 
 
 		 356 aa  212  7e-54  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1182  aldose 1-epimerase  36.75 
 
 		 356 aa  212  7e-54  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6635  Aldose 1-epimerase  34.76 
 
 		 361 aa  211  1e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.779767  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0474  Aldose 1-epimerase  36.76 
 
 		 383 aa  211  1e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.561665  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03326  aldose 1-epimerase  36.42 
 
 		 352 aa  211  1e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0799  aldose 1-epimerase  35.43 
 
 		 397 aa  211  2e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4114  aldose 1-epimerase  37.2 
 
 		 346 aa  211  2e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.413717 
 
 
-
 
NC_002950  PG1632  aldose 1-epimerase  35.91 
 
 		 355 aa  210  3e-53  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2624  aldose 1-epimerase  35.04 
 
 		 371 aa  210  3e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.240433 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0489  Aldose 1-epimerase  38.04 
 
 		 393 aa  210  3e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2889  aldose 1-epimerase  40.62 
 
 		 356 aa  209  5e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1122  aldose 1-epimerase  34.88 
 
 		 392 aa  209  7e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0809  aldose 1-epimerase  38.68 
 
 		 346 aa  208  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3008  Aldose 1-epimerase  34.99 
 
 		 434 aa  208  1e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0738  aldose 1-epimerase  35.13 
 
 		 359 aa  207  2e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.547855 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0868  aldose 1-epimerase  38.36 
 
 		 346 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.558575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0837  aldose 1-epimerase  38.68 
 
 		 346 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0621  Aldose 1-epimerase  37.68 
 
 		 388 aa  207  2e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.295352  normal  0.0428145 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0923  aldose 1-epimerase  38.36 
 
 		 346 aa  206  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.285804 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0788  aldose 1-epimerase  37.85 
 
 		 357 aa  206  4e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000118587  normal  0.618331 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0900  aldose 1-epimerase  38.36 
 
 		 346 aa  205  8e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1457  aldose 1-epimerase  37.27 
 
 		 387 aa  205  1e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.808924  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6371  aldose 1-epimerase  37.27 
 
 		 387 aa  205  1e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1386  aldose 1-epimerase  37.92 
 
 		 384 aa  205  1e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.466174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1235  Aldose 1-epimerase  34.4 
 
 		 387 aa  203  3e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.153244 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1758  aldose 1-epimerase  34.68 
 
 		 372 aa  203  3e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00365517  normal  0.11441 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2906  aldose 1-epimerase  36.92 
 
 		 346 aa  202  5e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.336239 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2886  galactose mutarotase  36.92 
 
 		 346 aa  202  5e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3731  aldose 1-epimerase  37.42 
 
 		 382 aa  202  5e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.90424 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7038  aldose 1-epimerase  36.97 
 
 		 387 aa  202  5e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.754242  normal  0.230743 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0677  aldose 1-epimerase  36.92 
 
 		 346 aa  202  5e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.569185  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0779  aldose 1-epimerase  36.92 
 
 		 346 aa  202  5e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.184805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0810  aldose 1-epimerase  36.92 
 
 		 346 aa  202  5e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0783  aldose 1-epimerase  36.92 
 
 		 346 aa  202  5e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.328342  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2018  galactose mutarotase  37.46 
 
 		 357 aa  202  5e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.237722  normal  0.693329 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1170  aldose 1-epimerase  38.37 
 
 		 350 aa  202  6e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2636  aldose 1-epimerase  34.3 
 
 		 382 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0151396  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0859  aldose 1-epimerase  36.62 
 
 		 346 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0241581  normal  0.840205 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5369  aldose 1-epimerase  36.81 
 
 		 387 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2135  galactose mutarotase  35.07 
 
 		 359 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3154  aldose 1-epimerase  37.06 
 
 		 350 aa  200  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1147  aldose 1-epimerase  33.93 
 
 		 368 aa  200  3e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.934595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2026  aldose 1-epimerase  34.32 
 
 		 392 aa  200  3e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.564676  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3076  aldose 1-epimerase  35.38 
 
 		 362 aa  200  3.9999999999999996e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.253201  normal  0.313504 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3534  aldose 1-epimerase  35.96 
 
 		 360 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5727  aldose 1-epimerase  36.81 
 
 		 390 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.306981  normal  0.628457 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3618  aldose 1-epimerase  34.1 
 
 		 384 aa  200  3.9999999999999996e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4369  Aldose 1-epimerase  34.13 
 
 		 372 aa  199  7.999999999999999e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.449933  normal  0.0127022 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2727  Aldose 1-epimerase  35.4 
 
 		 390 aa  197  3e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.265647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1431  Aldose 1-epimerase  37.12 
 
 		 354 aa  196  4.0000000000000005e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2369  aldose 1-epimerase  33.43 
 
 		 382 aa  196  7e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0104312  normal  0.855778 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>