190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_3272 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_3272  aldose 1-epimerase  100 
 
 		 346 aa  716    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0965292  hitchhiker  0.000248794 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4021  aldose 1-epimerase  67.35 
 
 		 339 aa  489  1e-137  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000192131 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0576  aldose 1-epimerase  66.86 
 
 		 343 aa  471  1e-132  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0693  aldose 1-epimerase  65.01 
 
 		 343 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0651  aldose 1-epimerase  64.06 
 
 		 343 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.225141  hitchhiker  0.000000283833 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0543  aldose 1-epimerase  64.24 
 
 		 343 aa  464  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.386929 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0413  aldose 1-epimerase  65.51 
 
 		 342 aa  461  1e-129  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3409  aldose 1-epimerase  63.95 
 
 		 343 aa  463  1e-129  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0646401 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3579  aldose 1-epimerase  64.24 
 
 		 343 aa  464  1e-129  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.496972 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3729  aldose 1-epimerase  63.08 
 
 		 344 aa  455  1e-127  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0656  Aldose 1-epimerase  63.37 
 
 		 344 aa  456  1e-127  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0633  aldose 1-epimerase  63.37 
 
 		 344 aa  456  1e-127  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0660  aldose 1-epimerase  63.37 
 
 		 344 aa  456  1e-127  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3669  aldose 1-epimerase  61.16 
 
 		 344 aa  448  1e-125  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3250  aldose 1-epimerase  61.63 
 
 		 344 aa  444  1.0000000000000001e-124  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0535  aldose 1-epimerase  61.63 
 
 		 341 aa  429  1e-119  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0136204 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0474  Aldose 1-epimerase  40.55 
 
 		 383 aa  237  2e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.561665  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4205  aldose 1-epimerase  37.54 
 
 		 362 aa  226  4e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.613008  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3099  Aldose 1-epimerase  39.29 
 
 		 346 aa  224  1e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0743555 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2993  Aldose 1-epimerase  39.05 
 
 		 346 aa  223  3e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.862423  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6030  aldose 1-epimerase  36.36 
 
 		 362 aa  223  4e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.808799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3593  Aldose 1-epimerase  37.87 
 
 		 355 aa  221  9.999999999999999e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00379165  hitchhiker  0.0000198106 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6330  aldose 1-epimerase  36.07 
 
 		 362 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2820  Aldose 1-epimerase  37.35 
 
 		 380 aa  220  3e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2977  Aldose 1-epimerase  37.72 
 
 		 397 aa  219  7.999999999999999e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.416586 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2336  aldose 1-epimerase  36.84 
 
 		 376 aa  218  1e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.360362  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2873  aldose 1-epimerase  37.8 
 
 		 346 aa  218  2e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.341142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6508  aldose 1-epimerase  37.24 
 
 		 362 aa  217  2e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6742  aldose 1-epimerase  37.24 
 
 		 362 aa  217  2e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112366  normal  0.547611 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4114  aldose 1-epimerase  38.46 
 
 		 346 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.413717 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2135  galactose mutarotase  36.66 
 
 		 359 aa  216  4e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6331  aldose 1-epimerase  37.24 
 
 		 362 aa  216  4e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1210  aldose 1-epimerase  37.2 
 
 		 347 aa  216  4e-55  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00282737  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0655  aldose 1-epimerase  38.62 
 
 		 356 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0630  aldose 1-epimerase  38.62 
 
 		 356 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1182  aldose 1-epimerase  35.35 
 
 		 356 aa  213  2.9999999999999995e-54  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1503  Aldose 1-epimerase  38.21 
 
 		 317 aa  213  4.9999999999999996e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.72169 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4631  aldose 1-epimerase  36.63 
 
 		 361 aa  210  3e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0321  aldose 1-epimerase  35.01 
 
 		 375 aa  210  4e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.520613 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1187  aldose 1-epimerase  35.94 
 
 		 354 aa  209  8e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.353984 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3731  aldose 1-epimerase  37.24 
 
 		 382 aa  208  1e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.90424 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2369  aldose 1-epimerase  36.71 
 
 		 382 aa  207  3e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0104312  normal  0.855778 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0489  Aldose 1-epimerase  37.04 
 
 		 393 aa  207  3e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1325  aldose 1-epimerase  36.55 
 
 		 387 aa  207  3e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105451  normal  0.426674 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3008  Aldose 1-epimerase  35.31 
 
 		 434 aa  206  6e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2636  aldose 1-epimerase  35.76 
 
 		 382 aa  205  9e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0151396  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2798  aldose 1-epimerase  37.38 
 
 		 321 aa  203  4e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0799  aldose 1-epimerase  36.21 
 
 		 397 aa  202  5e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2682  aldose 1-epimerase  35.51 
 
 		 406 aa  202  7e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.508916  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1235  Aldose 1-epimerase  34.45 
 
 		 387 aa  200  1.9999999999999998e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.153244 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1386  aldose 1-epimerase  35.65 
 
 		 384 aa  200  3e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.466174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1290  galactose mutarotase  36.5 
 
 		 347 aa  199  7e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.994264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1457  aldose 1-epimerase  38.3 
 
 		 387 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.808924  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6371  aldose 1-epimerase  38.3 
 
 		 387 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2018  galactose mutarotase  35.21 
 
 		 357 aa  197  2.0000000000000003e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.237722  normal  0.693329 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3076  aldose 1-epimerase  36.36 
 
 		 362 aa  197  3e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.253201  normal  0.313504 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7038  aldose 1-epimerase  38.3 
 
 		 387 aa  196  3e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.754242  normal  0.230743 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1147  aldose 1-epimerase  34.73 
 
 		 368 aa  196  4.0000000000000005e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.934595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2344  aldose 1-epimerase  35.33 
 
 		 363 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.145267 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0788  aldose 1-epimerase  35.98 
 
 		 357 aa  196  5.000000000000001e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000118587  normal  0.618331 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2946  aldose 1-epimerase  36.2 
 
 		 356 aa  195  9e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2858  aldose 1-epimerase  36.2 
 
 		 356 aa  195  9e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.852671  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2886  galactose mutarotase  36.61 
 
 		 346 aa  194  1e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0677  aldose 1-epimerase  36.61 
 
 		 346 aa  194  1e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.569185  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2906  aldose 1-epimerase  36.61 
 
 		 346 aa  194  1e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.336239 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0779  aldose 1-epimerase  36.61 
 
 		 346 aa  194  1e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.184805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0810  aldose 1-epimerase  36.61 
 
 		 346 aa  194  1e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0783  aldose 1-epimerase  36.61 
 
 		 346 aa  194  1e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.328342  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0621  Aldose 1-epimerase  35.88 
 
 		 388 aa  194  2e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.295352  normal  0.0428145 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3618  aldose 1-epimerase  34.69 
 
 		 384 aa  194  3e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002663  aldose 1-epimerase  35.29 
 
 		 354 aa  193  3e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2311  aldose 1-epimerase  35.19 
 
 		 355 aa  193  4e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1632  aldose 1-epimerase  34.47 
 
 		 355 aa  192  6e-48  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5369  aldose 1-epimerase  38.23 
 
 		 387 aa  192  6e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0859  aldose 1-epimerase  35.82 
 
 		 346 aa  192  6e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0241581  normal  0.840205 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0282  Aldose 1-epimerase  35.31 
 
 		 357 aa  192  8e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.22783  normal  0.0158756 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1269  Aldose 1-epimerase  35.77 
 
 		 414 aa  192  1e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0872441  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3070  aldose 1-epimerase  35.31 
 
 		 348 aa  191  1e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1039  Aldose 1-epimerase  36.34 
 
 		 357 aa  191  1e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594028  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4072  Aldose 1-epimerase  34.31 
 
 		 360 aa  191  2e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1247  aldose 1-epimerase  34.56 
 
 		 346 aa  191  2e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.942743  normal  0.442353 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4184  Aldose 1-epimerase  34.31 
 
 		 360 aa  191  2e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1264  aldose 1-epimerase  35.61 
 
 		 348 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1758  aldose 1-epimerase  32.85 
 
 		 372 aa  190  4e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00365517  normal  0.11441 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03326  aldose 1-epimerase  34.15 
 
 		 352 aa  189  7e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0738  aldose 1-epimerase  33.63 
 
 		 359 aa  189  8e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.547855 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0819  aldose 1-epimerase  34.52 
 
 		 351 aa  188  1e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1122  aldose 1-epimerase  32.75 
 
 		 392 aa  188  1e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3640  Aldose 1-epimerase  35.07 
 
 		 356 aa  188  1e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2727  Aldose 1-epimerase  34.16 
 
 		 390 aa  187  2e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.265647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1344  aldose 1-epimerase  33.24 
 
 		 343 aa  186  4e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6635  Aldose 1-epimerase  31.79 
 
 		 361 aa  186  4e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.779767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3154  aldose 1-epimerase  35.57 
 
 		 350 aa  185  9e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3534  aldose 1-epimerase  33.71 
 
 		 360 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5727  aldose 1-epimerase  35.58 
 
 		 390 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.306981  normal  0.628457 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2889  aldose 1-epimerase  35.1 
 
 		 356 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2624  aldose 1-epimerase  31.81 
 
 		 371 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.240433 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1153  Aldose 1-epimerase  34.99 
 
 		 402 aa  181  1e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1431  Aldose 1-epimerase  33.13 
 
 		 354 aa  181  2e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2506  aldose 1-epimerase  31.89 
 
 		 355 aa  180  2.9999999999999997e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.288802  normal  0.200846 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>