179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3331 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_3331  aldose 1-epimerase  100 
 
 		 379 aa  757    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2889  aldose 1-epimerase  44.14 
 
 		 356 aa  259  7e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1264  aldose 1-epimerase  42.38 
 
 		 348 aa  253  3e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3070  aldose 1-epimerase  41.83 
 
 		 348 aa  248  1e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1170  aldose 1-epimerase  42.27 
 
 		 350 aa  241  1e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1290  galactose mutarotase  42.31 
 
 		 347 aa  236  7e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.994264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2946  aldose 1-epimerase  40.61 
 
 		 356 aa  234  1.0000000000000001e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0837  aldose 1-epimerase  41.27 
 
 		 346 aa  234  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0900  aldose 1-epimerase  41.27 
 
 		 346 aa  235  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2858  aldose 1-epimerase  40.61 
 
 		 356 aa  234  1.0000000000000001e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.852671  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0868  aldose 1-epimerase  41.27 
 
 		 346 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.558575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0923  aldose 1-epimerase  41.27 
 
 		 346 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.285804 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0809  aldose 1-epimerase  41.27 
 
 		 346 aa  234  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2906  aldose 1-epimerase  38.69 
 
 		 346 aa  230  2e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.336239 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2886  galactose mutarotase  38.69 
 
 		 346 aa  230  2e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0677  aldose 1-epimerase  38.69 
 
 		 346 aa  230  2e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.569185  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0810  aldose 1-epimerase  38.69 
 
 		 346 aa  230  2e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0783  aldose 1-epimerase  38.69 
 
 		 346 aa  230  2e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.328342  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0779  aldose 1-epimerase  38.69 
 
 		 346 aa  230  2e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.184805  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0859  aldose 1-epimerase  38.69 
 
 		 346 aa  230  3e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0241581  normal  0.840205 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1247  aldose 1-epimerase  39.06 
 
 		 346 aa  216  4e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.942743  normal  0.442353 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03326  aldose 1-epimerase  37.18 
 
 		 352 aa  209  6e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1196  aldose 1-epimerase  38.9 
 
 		 350 aa  203  5e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002663  aldose 1-epimerase  35.91 
 
 		 354 aa  189  9e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2506  aldose 1-epimerase  34.05 
 
 		 355 aa  187  2e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.288802  normal  0.200846 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0474  Aldose 1-epimerase  36.34 
 
 		 383 aa  187  3e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.561665  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0236  aldose 1-epimerase  33.15 
 
 		 347 aa  182  6e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2018  galactose mutarotase  34.89 
 
 		 357 aa  182  9.000000000000001e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.237722  normal  0.693329 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0819  aldose 1-epimerase  39.38 
 
 		 351 aa  179  7e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2820  Aldose 1-epimerase  32.33 
 
 		 380 aa  178  1e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2727  Aldose 1-epimerase  32.88 
 
 		 390 aa  179  1e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.265647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1187  aldose 1-epimerase  33.7 
 
 		 354 aa  175  9.999999999999999e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.353984 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0799  aldose 1-epimerase  33.99 
 
 		 397 aa  175  9.999999999999999e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3076  aldose 1-epimerase  37.96 
 
 		 362 aa  173  5e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.253201  normal  0.313504 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0788  aldose 1-epimerase  32.47 
 
 		 357 aa  172  1e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000118587  normal  0.618331 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1269  Aldose 1-epimerase  35.29 
 
 		 414 aa  169  8e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0872441  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4631  aldose 1-epimerase  36.77 
 
 		 361 aa  167  2e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0655  aldose 1-epimerase  36.52 
 
 		 356 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1235  Aldose 1-epimerase  31.32 
 
 		 387 aa  167  2.9999999999999998e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.153244 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2798  aldose 1-epimerase  39.02 
 
 		 321 aa  167  2.9999999999999998e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0630  aldose 1-epimerase  36.52 
 
 		 356 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2977  Aldose 1-epimerase  31.68 
 
 		 397 aa  165  1.0000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.416586 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2135  galactose mutarotase  32.38 
 
 		 359 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1325  aldose 1-epimerase  34.86 
 
 		 387 aa  161  2e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105451  normal  0.426674 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0489  Aldose 1-epimerase  29.78 
 
 		 393 aa  159  7e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1210  aldose 1-epimerase  31.23 
 
 		 347 aa  159  1e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00282737  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2344  aldose 1-epimerase  37.25 
 
 		 363 aa  158  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.145267 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2624  aldose 1-epimerase  34.96 
 
 		 371 aa  157  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.240433 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1386  aldose 1-epimerase  32.15 
 
 		 384 aa  157  3e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.466174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1122  aldose 1-epimerase  30.03 
 
 		 392 aa  157  3e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2993  Aldose 1-epimerase  35.43 
 
 		 346 aa  156  4e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.862423  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6330  aldose 1-epimerase  35.77 
 
 		 362 aa  157  4e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6030  aldose 1-epimerase  36.42 
 
 		 362 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.808799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1020  aldose 1-epimerase  35.33 
 
 		 355 aa  156  6e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4072  Aldose 1-epimerase  36.61 
 
 		 360 aa  155  8e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4184  Aldose 1-epimerase  36.61 
 
 		 360 aa  155  8e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6508  aldose 1-epimerase  36.39 
 
 		 362 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6742  aldose 1-epimerase  36.39 
 
 		 362 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112366  normal  0.547611 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3640  Aldose 1-epimerase  38.24 
 
 		 356 aa  155  1e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4205  aldose 1-epimerase  37.54 
 
 		 362 aa  154  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.613008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6331  aldose 1-epimerase  36.1 
 
 		 362 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1503  Aldose 1-epimerase  36.88 
 
 		 317 aa  154  4e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.72169 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3099  Aldose 1-epimerase  36.21 
 
 		 346 aa  153  4e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0743555 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1611  aldose 1-epimerase  35.78 
 
 		 438 aa  152  7e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0628258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2026  aldose 1-epimerase  28.01 
 
 		 392 aa  152  1e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.564676  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2336  aldose 1-epimerase  36.31 
 
 		 376 aa  151  2e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.360362  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0321  aldose 1-epimerase  34.09 
 
 		 375 aa  151  2e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.520613 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2873  aldose 1-epimerase  35.63 
 
 		 346 aa  149  7e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.341142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6635  Aldose 1-epimerase  33.52 
 
 		 361 aa  149  8e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.779767  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1632  aldose 1-epimerase  30.64 
 
 		 355 aa  148  1.0000000000000001e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3250  aldose 1-epimerase  32.12 
 
 		 344 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00698  hypothetical protein  39.82 
 
 		 205 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0118292  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4369  Aldose 1-epimerase  37.38 
 
 		 372 aa  147  4.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.449933  normal  0.0127022 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1758  aldose 1-epimerase  32.79 
 
 		 372 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00365517  normal  0.11441 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1182  aldose 1-epimerase  27.98 
 
 		 356 aa  147  4.0000000000000006e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1039  Aldose 1-epimerase  38.91 
 
 		 357 aa  146  5e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594028  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3618  aldose 1-epimerase  31.59 
 
 		 384 aa  146  5e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3008  Aldose 1-epimerase  31.46 
 
 		 434 aa  146  5e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2636  aldose 1-epimerase  30.33 
 
 		 382 aa  145  1e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0151396  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1431  Aldose 1-epimerase  29.25 
 
 		 354 aa  145  1e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0621  Aldose 1-epimerase  34.16 
 
 		 388 aa  145  1e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.295352  normal  0.0428145 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0693  aldose 1-epimerase  32.12 
 
 		 343 aa  142  7e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1153  Aldose 1-epimerase  31.55 
 
 		 402 aa  142  9e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3031  aldose 1-epimerase  34.31 
 
 		 338 aa  142  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.331849 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4249  aldose 1-epimerase  33.06 
 
 		 353 aa  141  1.9999999999999998e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2311  aldose 1-epimerase  36.45 
 
 		 355 aa  141  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4114  aldose 1-epimerase  33.33 
 
 		 346 aa  140  3e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.413717 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3011  Aldose 1-epimerase  33.14 
 
 		 400 aa  140  3e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.415447  hitchhiker  0.00870507 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0738  aldose 1-epimerase  33.24 
 
 		 359 aa  140  4.999999999999999e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.547855 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0543  aldose 1-epimerase  33.11 
 
 		 343 aa  138  2e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.386929 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3729  aldose 1-epimerase  31.79 
 
 		 344 aa  138  2e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0576  aldose 1-epimerase  30.92 
 
 		 343 aa  137  4e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0633  aldose 1-epimerase  31.79 
 
 		 344 aa  136  5e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0656  Aldose 1-epimerase  31.79 
 
 		 344 aa  136  5e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4021  aldose 1-epimerase  30.46 
 
 		 339 aa  136  5e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000192131 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3731  aldose 1-epimerase  28.37 
 
 		 382 aa  136  8e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.90424 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0413  aldose 1-epimerase  32.45 
 
 		 342 aa  135  9e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0660  aldose 1-epimerase  31.79 
 
 		 344 aa  135  9e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5369  aldose 1-epimerase  36.36 
 
 		 387 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3669  aldose 1-epimerase  31.92 
 
 		 344 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>