157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1225 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_1225  Aldose 1-epimerase  100 
 
 
302 aa  595  1e-169  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1278  Aldose 1-epimerase  56.15 
 
 
307 aa  318  9e-86  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.265427  normal  0.286232 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2489  Aldose 1-epimerase  54.36 
 
 
308 aa  313  1.9999999999999998e-84  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4435  Aldose 1-epimerase  44.71 
 
 
303 aa  212  4.9999999999999996e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.340797 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0225  galactose mutarotase  41.5 
 
 
314 aa  210  2e-53  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00000500571  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2454  aldose 1-epimerase  43.71 
 
 
307 aa  210  3e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2182  Aldose 1-epimerase  42.32 
 
 
299 aa  206  4e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000157648 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0514  aldose 1-epimerase  41.97 
 
 
327 aa  202  7e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.165305  decreased coverage  0.000622322 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1674  aldose 1-epimerase  42.63 
 
 
325 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.416242  hitchhiker  0.00123529 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3303  putative aldose-1-epimerase  42.76 
 
 
297 aa  201  9.999999999999999e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.575493 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0226  galactose mutarotase  37.79 
 
 
318 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00706113  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2997  Aldose 1-epimerase  40.47 
 
 
302 aa  196  5.000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0040024 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1836  Aldose 1-epimerase  40.8 
 
 
315 aa  194  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12920  galactose mutarotase-like enzyme  41.75 
 
 
321 aa  194  2e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0901551  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2432  aldose 1-epimerase  40.61 
 
 
301 aa  193  3e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0573284  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0426  aldose 1-epimerase  39.6 
 
 
308 aa  190  2.9999999999999997e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05040  galactose mutarotase-like enzyme  39.74 
 
 
323 aa  186  3e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.556037  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1019  Aldose 1-epimerase  38.8 
 
 
299 aa  184  1.0000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.584137  hitchhiker  0.000443551 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1235  Aldose 1-epimerase  39.12 
 
 
319 aa  184  1.0000000000000001e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000417318 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33650  galactose mutarotase-like enzyme  40.67 
 
 
318 aa  183  3e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8681  Aldose 1-epimerase  40.4 
 
 
303 aa  183  3e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.626175  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1267  Aldose 1-epimerase  39.8 
 
 
301 aa  178  8e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.560353  hitchhiker  0.00115827 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2973  Aldose 1-epimerase  38.72 
 
 
303 aa  178  1e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000377273  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1163  aldose 1-epimerase  36.95 
 
 
323 aa  175  8e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.887027  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1897  aldose 1-epimerase  38.33 
 
 
290 aa  165  9e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3398  aldose 1-epimerase  39.53 
 
 
294 aa  163  3e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.226465  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0866  Aldose 1-epimerase  40.07 
 
 
306 aa  163  3e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.104082  normal  0.0514904 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1522  Aldose 1-epimerase  36.91 
 
 
293 aa  161  2e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1083  putative aldose-1-epimerase  38.23 
 
 
305 aa  154  2e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.145719  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0523  Aldose 1-epimerase  40.83 
 
 
290 aa  153  2.9999999999999998e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4402  aldose-1-epimerase family protein  32.75 
 
 
300 aa  150  4e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0854  Aldose 1-epimerase  37.33 
 
 
300 aa  148  1.0000000000000001e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0393175  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4264  aldose-1-epimerase family protein  32.87 
 
 
299 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5326  aldose-1-epimerase family protein  32.4 
 
 
300 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.6155 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03764  predicted aldose-1-epimerase  32.64 
 
 
308 aa  145  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4107  Aldose 1-epimerase  32.64 
 
 
308 aa  145  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03713  hypothetical protein  32.64 
 
 
308 aa  145  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0044  Aldose 1-epimerase  34.81 
 
 
311 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4408  aldose-1-epimerase family protein  30.21 
 
 
280 aa  125  9e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4297  aldose-1-epimerase family protein  28.91 
 
 
295 aa  124  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4343  aldose-1-epimerase family protein  28.91 
 
 
295 aa  124  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4252  aldose-1-epimerase family protein  28.91 
 
 
295 aa  124  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4230  aldose-1-epimerase family protein  29.86 
 
 
280 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5039  Aldose 1-epimerase  28.91 
 
 
312 aa  100  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0656  aldose-1-epimerase  26.54 
 
 
314 aa  97.8  2e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.629793  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0726  Aldose 1-epimerase  32.29 
 
 
328 aa  97.4  2e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3046  Aldose 1-epimerase  27.04 
 
 
345 aa  95.1  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.813423  normal  0.148483 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27460  galactose mutarotase-like enzyme  33.05 
 
 
334 aa  91.7  1e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0559  Aldose 1-epimerase  25.78 
 
 
262 aa  91.3  2e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.480763  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1930  Aldose 1-epimerase  27.54 
 
 
316 aa  90.5  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.263285  normal  0.479856 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1127  aldose 1-epimerase  29.45 
 
 
269 aa  84.3  0.000000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0176464  normal  0.584187 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1585  Aldose 1-epimerase  31.91 
 
 
305 aa  82.4  0.000000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.92898  normal  0.309256 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2336  aldose 1-epimerase  32.46 
 
 
376 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.360362  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6330  aldose 1-epimerase  33.62 
 
 
362 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4205  aldose 1-epimerase  33.33 
 
 
362 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.613008  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0696  Aldose 1-epimerase  28.52 
 
 
306 aa  69.7  0.00000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00129327 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0628  aldose 1-epimerase  34.62 
 
 
282 aa  69.3  0.00000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.48408  normal  0.247972 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0702  Aldose 1-epimerase  26.46 
 
 
318 aa  68.9  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2178  Aldose 1-epimerase  34.23 
 
 
329 aa  68.9  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6635  Aldose 1-epimerase  31.94 
 
 
361 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.779767  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6030  aldose 1-epimerase  33.62 
 
 
362 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.808799  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2624  aldose 1-epimerase  30.7 
 
 
371 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.240433 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0149  Aldose 1-epimerase  30.59 
 
 
336 aa  63.5  0.000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0125238 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4184  Aldose 1-epimerase  30.92 
 
 
360 aa  62.8  0.000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4072  Aldose 1-epimerase  30.92 
 
 
360 aa  62.8  0.000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3707  Aldose 1-epimerase  25 
 
 
290 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3760  Aldose 1-epimerase  25 
 
 
290 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00879497  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0324  Aldose 1-epimerase  25.1 
 
 
299 aa  60.8  0.00000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.296431 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1458  aldose 1-epimerase  25.26 
 
 
263 aa  60.5  0.00000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6331  aldose 1-epimerase  28.97 
 
 
362 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1083  hypothetical protein  28.43 
 
 
323 aa  60.1  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000316766  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4109  aldose 1-epimerase family protein  23.83 
 
 
295 aa  60.1  0.00000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0163943  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2660  aldose 1-epimerase  20.91 
 
 
306 aa  59.7  0.00000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0844306  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4362  aldose 1-epimerase family protein  24.62 
 
 
295 aa  59.7  0.00000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4134  aldose 1-epimerase  24.62 
 
 
295 aa  59.3  0.00000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2372  aldose 1-epimerase  28.14 
 
 
309 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6508  aldose 1-epimerase  28.5 
 
 
362 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6742  aldose 1-epimerase  28.5 
 
 
362 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112366  normal  0.547611 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0896  aldose 1-epimerase  25.77 
 
 
293 aa  55.8  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.320638 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0630  aldose 1-epimerase  33.53 
 
 
356 aa  55.8  0.0000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0655  aldose 1-epimerase  33.53 
 
 
356 aa  55.8  0.0000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0950  Aldose 1-epimerase  30.41 
 
 
311 aa  55.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0322782 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5533  Aldose 1-epimerase  29.44 
 
 
308 aa  54.7  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5648  Aldose 1-epimerase  28.67 
 
 
327 aa  53.9  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1048  aldose 1-epimerase  24.69 
 
 
297 aa  53.1  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2023  aldose 1-epimerase  29.39 
 
 
298 aa  52.4  0.000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6249  Aldose 1-epimerase  24.6 
 
 
296 aa  52  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.783578 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2344  aldose 1-epimerase  28.9 
 
 
363 aa  52  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.145267 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1886  aldose 1-epimerase  25.93 
 
 
382 aa  51.6  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.369459  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1015  Aldose 1-epimerase  28.07 
 
 
311 aa  50.8  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2993  Aldose 1-epimerase  29.03 
 
 
294 aa  50.4  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.778062  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4225  aldose 1-epimerase  21.3 
 
 
295 aa  50.1  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.387725  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1503  Aldose 1-epimerase  27.59 
 
 
317 aa  49.7  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.72169 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2583  Aldose 1-epimerase  29.03 
 
 
294 aa  49.3  0.00007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1210  aldose 1-epimerase  25.86 
 
 
347 aa  49.7  0.00007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00282737  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1047  hypothetical protein  22.49 
 
 
293 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4277  aldose 1-epimerase  24.62 
 
 
289 aa  48.5  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.436668 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1182  aldose 1-epimerase  25.9 
 
 
356 aa  48.9  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2069  aldose 1-epimerase  32.26 
 
 
291 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.290697  normal  0.0540863 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2610  aldose 1-epimerase  27.62 
 
 
352 aa  48.5  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.169817 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>