150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_2178 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_2178  Aldose 1-epimerase  100 
 
 
329 aa  682    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1674  aldose 1-epimerase  32.08 
 
 
325 aa  100  3e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.416242  hitchhiker  0.00123529 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0702  Aldose 1-epimerase  30.26 
 
 
318 aa  100  3e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0854  Aldose 1-epimerase  32.23 
 
 
300 aa  83.2  0.000000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0393175  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0628  aldose 1-epimerase  29.18 
 
 
282 aa  81.3  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.48408  normal  0.247972 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2489  Aldose 1-epimerase  28.21 
 
 
308 aa  76.6  0.0000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1267  Aldose 1-epimerase  28.2 
 
 
301 aa  75.1  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.560353  hitchhiker  0.00115827 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0866  Aldose 1-epimerase  28.29 
 
 
306 aa  73.2  0.000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.104082  normal  0.0514904 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1886  aldose 1-epimerase  27.38 
 
 
382 aa  69.3  0.00000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.369459  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1225  Aldose 1-epimerase  34.23 
 
 
302 aa  68.9  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2454  aldose 1-epimerase  25.8 
 
 
307 aa  65.5  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0044  Aldose 1-epimerase  26.64 
 
 
311 aa  63.5  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0225  galactose mutarotase  24.36 
 
 
314 aa  63.2  0.000000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00000500571  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1083  hypothetical protein  26.82 
 
 
323 aa  62.4  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000316766  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1278  Aldose 1-epimerase  32.05 
 
 
307 aa  62.4  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.265427  normal  0.286232 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1897  aldose 1-epimerase  31.06 
 
 
290 aa  60.8  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0514  aldose 1-epimerase  25.77 
 
 
327 aa  60.5  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.165305  decreased coverage  0.000622322 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2182  Aldose 1-epimerase  28.36 
 
 
299 aa  58.5  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000157648 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0523  Aldose 1-epimerase  28.62 
 
 
290 aa  58.9  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3405  Aldose 1-epimerase  27.41 
 
 
353 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.237068  normal  0.0908294 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0950  Aldose 1-epimerase  25.19 
 
 
311 aa  58.5  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0322782 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2660  aldose 1-epimerase  23.68 
 
 
306 aa  58.5  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0844306  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1019  Aldose 1-epimerase  23.9 
 
 
299 aa  57.4  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.584137  hitchhiker  0.000443551 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3398  aldose 1-epimerase  26.15 
 
 
294 aa  57.4  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.226465  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0226  galactose mutarotase  27.56 
 
 
318 aa  57.8  0.0000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00706113  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0324  Aldose 1-epimerase  25.93 
 
 
299 aa  57.4  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.296431 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6249  Aldose 1-epimerase  23.74 
 
 
296 aa  57  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.783578 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33650  galactose mutarotase-like enzyme  25.08 
 
 
318 aa  56.6  0.0000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5533  Aldose 1-epimerase  27.15 
 
 
308 aa  56.6  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0551  putative aldose-1-epimerase  26.52 
 
 
297 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.530428  normal  0.44726 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1163  aldose 1-epimerase  25.67 
 
 
323 aa  56.2  0.0000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.887027  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1015  Aldose 1-epimerase  25.27 
 
 
311 aa  55.8  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2997  Aldose 1-epimerase  26.74 
 
 
302 aa  55.8  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0040024 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0426  aldose 1-epimerase  27.7 
 
 
308 aa  55.8  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3593  Aldose 1-epimerase  26.19 
 
 
355 aa  55.8  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00379165  hitchhiker  0.0000198106 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0142  aldose 1-epimerase  25.78 
 
 
353 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0625  aldose 1-epimerase  25.78 
 
 
353 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.417593  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5039  Aldose 1-epimerase  23.71 
 
 
312 aa  55.1  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0593  aldose 1-epimerase  25.78 
 
 
353 aa  55.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.112152 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0383  Aldose 1-epimerase  25.62 
 
 
302 aa  55.1  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2754  hypothetical protein  28.44 
 
 
296 aa  54.3  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.494847  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1262  hypothetical protein  25.77 
 
 
344 aa  54.3  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0402  hypothetical protein  25.77 
 
 
357 aa  53.5  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.827093  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3303  hypothetical protein  25.77 
 
 
357 aa  53.5  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1661  aldose 1-epimerase  24.73 
 
 
306 aa  53.5  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.452505 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2482  hypothetical protein  26.04 
 
 
357 aa  53.5  0.000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283645  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8681  Aldose 1-epimerase  25.12 
 
 
303 aa  53.5  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.626175  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3963  aldose 1-epimerase  23.68 
 
 
286 aa  53.1  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.87118  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3444  aldose 1-epimerase family protein  25.77 
 
 
357 aa  53.1  0.000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.381459  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3482  aldose 1-epimerase family protein  25.77 
 
 
357 aa  53.1  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0149  Aldose 1-epimerase  26.28 
 
 
336 aa  53.1  0.000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0125238 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1083  putative aldose-1-epimerase  27.25 
 
 
305 aa  52.8  0.000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.145719  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3479  aldose 1-epimerase  25.67 
 
 
357 aa  52.8  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.329911  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2372  aldose 1-epimerase  24.15 
 
 
309 aa  52.8  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3707  aldose 1-epimerase  25.78 
 
 
353 aa  52.8  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.405661  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1269  Aldose 1-epimerase  27.98 
 
 
414 aa  52.8  0.000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0872441  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4338  hypothetical protein  25.74 
 
 
310 aa  52.4  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1522  Aldose 1-epimerase  27.17 
 
 
293 aa  52  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1235  Aldose 1-epimerase  25.09 
 
 
319 aa  51.6  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000417318 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6330  aldose 1-epimerase  31.51 
 
 
362 aa  51.2  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1585  Aldose 1-epimerase  25.57 
 
 
305 aa  51.6  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.92898  normal  0.309256 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2610  aldose 1-epimerase  24.61 
 
 
352 aa  51.6  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.169817 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0526  aldose 1-epimerase  25.78 
 
 
353 aa  50.8  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3303  putative aldose-1-epimerase  27.46 
 
 
297 aa  51.2  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.575493 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0912  aldose 1-epimerase  24.21 
 
 
295 aa  51.2  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3046  Aldose 1-epimerase  24.73 
 
 
345 aa  50.8  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.813423  normal  0.148483 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3776  aldose 1-epimerase family protein  24.34 
 
 
290 aa  50.8  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3760  Aldose 1-epimerase  22.51 
 
 
290 aa  50.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00879497  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3707  Aldose 1-epimerase  22.51 
 
 
290 aa  50.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3685  putative lacX protein  20.85 
 
 
290 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0550  aldose 1-epimerase  25.78 
 
 
353 aa  50.4  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0177374  normal  0.655719 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4408  aldose-1-epimerase family protein  23.67 
 
 
280 aa  50.4  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4230  aldose-1-epimerase family protein  23.19 
 
 
280 aa  50.4  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2069  aldose 1-epimerase  30.83 
 
 
291 aa  49.3  0.00008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.290697  normal  0.0540863 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1660  putative lacX protein  20.52 
 
 
290 aa  49.3  0.00009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0173  galactose mutarotase-like protein  27.5 
 
 
294 aa  48.9  0.0001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000630537  hitchhiker  0.00000000000000230696 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1133  aldose 1-epimerase  23.97 
 
 
290 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0696  Aldose 1-epimerase  26.59 
 
 
306 aa  48.5  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00129327 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2973  Aldose 1-epimerase  25.74 
 
 
303 aa  47.8  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000377273  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02436  hypothetical protein  24.34 
 
 
290 aa  47.8  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1124  Aldose 1-epimerase  24.34 
 
 
290 aa  47.8  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2023  aldose 1-epimerase  24.91 
 
 
298 aa  47.4  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0656  aldose-1-epimerase  22.98 
 
 
314 aa  47.8  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.629793  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1836  Aldose 1-epimerase  26.01 
 
 
315 aa  47.8  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02400  hypothetical protein  24.34 
 
 
290 aa  47.8  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2696  aldose 1-epimerase family protein  24.34 
 
 
290 aa  47.8  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2829  aldose 1-epimerase family protein  24.34 
 
 
290 aa  47.8  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2760  aldose 1-epimerase  25.62 
 
 
353 aa  47.4  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.385741 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1512  aldose 1-epimerase  20.2 
 
 
290 aa  47.8  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2697  aldose 1-epimerase family protein  23.88 
 
 
290 aa  47.4  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1503  Aldose 1-epimerase  27.03 
 
 
317 aa  47.4  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.72169 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3011  Aldose 1-epimerase  25.45 
 
 
400 aa  47  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.415447  hitchhiker  0.00870507 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0726  Aldose 1-epimerase  23.97 
 
 
328 aa  46.6  0.0006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5727  aldose 1-epimerase  26.2 
 
 
390 aa  46.6  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.306981  normal  0.628457 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6508  aldose 1-epimerase  30.06 
 
 
362 aa  46.2  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6742  aldose 1-epimerase  30.06 
 
 
362 aa  46.2  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112366  normal  0.547611 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4205  aldose 1-epimerase  29.66 
 
 
362 aa  46.2  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.613008  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6331  aldose 1-epimerase  30.06 
 
 
362 aa  46.2  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4252  aldose-1-epimerase family protein  22.28 
 
 
295 aa  46.2  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1765  putative lacX protein  20.66 
 
 
290 aa  46.2  0.0008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>