235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_27460 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_27460  galactose mutarotase-like enzyme  100 
 
 
334 aa  665    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0726  Aldose 1-epimerase  52.13 
 
 
328 aa  336  2.9999999999999997e-91  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2454  aldose 1-epimerase  33.72 
 
 
307 aa  112  7.000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2489  Aldose 1-epimerase  32.57 
 
 
308 aa  107  3e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3046  Aldose 1-epimerase  28.52 
 
 
345 aa  103  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.813423  normal  0.148483 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1019  Aldose 1-epimerase  30.74 
 
 
299 aa  102  8e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.584137  hitchhiker  0.000443551 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1267  Aldose 1-epimerase  30.45 
 
 
301 aa  97.8  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.560353  hitchhiker  0.00115827 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1836  Aldose 1-epimerase  33.61 
 
 
315 aa  93.2  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1278  Aldose 1-epimerase  29.71 
 
 
307 aa  92  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.265427  normal  0.286232 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2432  aldose 1-epimerase  31.62 
 
 
301 aa  91.7  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0573284  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1225  Aldose 1-epimerase  33.05 
 
 
302 aa  91.7  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3398  aldose 1-epimerase  32.51 
 
 
294 aa  90.1  5e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.226465  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0044  Aldose 1-epimerase  30.33 
 
 
311 aa  89  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8681  Aldose 1-epimerase  30.68 
 
 
303 aa  87.4  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.626175  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1674  aldose 1-epimerase  30.17 
 
 
325 aa  86.7  5e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.416242  hitchhiker  0.00123529 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0514  aldose 1-epimerase  28.63 
 
 
327 aa  86.3  7e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.165305  decreased coverage  0.000622322 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0426  aldose 1-epimerase  27.34 
 
 
308 aa  86.3  7e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4435  Aldose 1-epimerase  31.63 
 
 
303 aa  84  0.000000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.340797 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5039  Aldose 1-epimerase  26.61 
 
 
312 aa  82.8  0.000000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4408  aldose-1-epimerase family protein  27.78 
 
 
280 aa  82  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0656  aldose-1-epimerase  25.98 
 
 
314 aa  81.6  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.629793  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4230  aldose-1-epimerase family protein  27.35 
 
 
280 aa  80.5  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3303  putative aldose-1-epimerase  29.91 
 
 
297 aa  80.1  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.575493 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1897  aldose 1-epimerase  35.66 
 
 
290 aa  79  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2997  Aldose 1-epimerase  30.74 
 
 
302 aa  78.6  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0040024 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1930  Aldose 1-epimerase  26.07 
 
 
316 aa  77.4  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.263285  normal  0.479856 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0559  Aldose 1-epimerase  30.63 
 
 
262 aa  76.6  0.0000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.480763  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6249  Aldose 1-epimerase  26.44 
 
 
296 aa  76.6  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.783578 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1127  aldose 1-epimerase  30.06 
 
 
269 aa  76.3  0.0000000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0176464  normal  0.584187 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2182  Aldose 1-epimerase  30.13 
 
 
299 aa  73.9  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000157648 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0866  Aldose 1-epimerase  28.63 
 
 
306 aa  73.9  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.104082  normal  0.0514904 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0324  Aldose 1-epimerase  33.59 
 
 
299 aa  72.8  0.000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.296431 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1039  Aldose 1-epimerase  27.24 
 
 
357 aa  72.8  0.000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594028  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0950  Aldose 1-epimerase  33.55 
 
 
311 aa  71.6  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0322782 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1235  Aldose 1-epimerase  30.08 
 
 
319 aa  71.6  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000417318 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12920  galactose mutarotase-like enzyme  30.74 
 
 
321 aa  70.9  0.00000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0901551  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0696  Aldose 1-epimerase  27.89 
 
 
306 aa  70.1  0.00000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00129327 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0523  Aldose 1-epimerase  27.4 
 
 
290 aa  69.3  0.00000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1015  Aldose 1-epimerase  31.43 
 
 
311 aa  69.3  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0225  galactose mutarotase  27.31 
 
 
314 aa  68.2  0.0000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00000500571  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6330  aldose 1-epimerase  30.41 
 
 
362 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4205  aldose 1-epimerase  31.63 
 
 
362 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.613008  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1522  Aldose 1-epimerase  27.78 
 
 
293 aa  67.8  0.0000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1585  Aldose 1-epimerase  27.94 
 
 
305 aa  67  0.0000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.92898  normal  0.309256 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33650  galactose mutarotase-like enzyme  27.34 
 
 
318 aa  66.2  0.0000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2973  Aldose 1-epimerase  27.85 
 
 
303 aa  65.5  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000377273  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5369  aldose 1-epimerase  26.63 
 
 
387 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2057  aldose 1-epimerase  28.74 
 
 
305 aa  65.5  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.107394  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0474  Aldose 1-epimerase  29.03 
 
 
383 aa  65.1  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.561665  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3640  Aldose 1-epimerase  28.39 
 
 
356 aa  65.1  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4402  aldose-1-epimerase family protein  23.75 
 
 
300 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2886  galactose mutarotase  29.76 
 
 
346 aa  64.3  0.000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2372  aldose 1-epimerase  31.95 
 
 
309 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2906  aldose 1-epimerase  29.76 
 
 
346 aa  64.3  0.000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.336239 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0779  aldose 1-epimerase  29.76 
 
 
346 aa  64.3  0.000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.184805  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0859  aldose 1-epimerase  29.76 
 
 
346 aa  63.9  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0241581  normal  0.840205 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0677  aldose 1-epimerase  29.76 
 
 
346 aa  64.3  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.569185  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2344  aldose 1-epimerase  28.66 
 
 
363 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.145267 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0810  aldose 1-epimerase  29.76 
 
 
346 aa  64.3  0.000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0783  aldose 1-epimerase  29.76 
 
 
346 aa  64.3  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.328342  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02436  hypothetical protein  23.65 
 
 
290 aa  63.9  0.000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1124  Aldose 1-epimerase  23.65 
 
 
290 aa  63.9  0.000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02400  hypothetical protein  23.65 
 
 
290 aa  63.9  0.000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3776  aldose 1-epimerase family protein  23.65 
 
 
290 aa  63.9  0.000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6030  aldose 1-epimerase  29.87 
 
 
362 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.808799  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2696  aldose 1-epimerase family protein  23.65 
 
 
290 aa  63.9  0.000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2829  aldose 1-epimerase family protein  23.65 
 
 
290 aa  63.9  0.000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1325  aldose 1-epimerase  27.54 
 
 
387 aa  63.2  0.000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105451  normal  0.426674 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3760  Aldose 1-epimerase  27.36 
 
 
290 aa  63.2  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00879497  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05040  galactose mutarotase-like enzyme  30.38 
 
 
323 aa  62.8  0.000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.556037  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3963  aldose 1-epimerase  27.63 
 
 
286 aa  63.2  0.000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.87118  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3707  Aldose 1-epimerase  27.36 
 
 
290 aa  63.2  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0383  Aldose 1-epimerase  32.76 
 
 
302 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03764  predicted aldose-1-epimerase  23.75 
 
 
308 aa  62.8  0.000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4107  Aldose 1-epimerase  23.75 
 
 
308 aa  62.8  0.000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03713  hypothetical protein  23.75 
 
 
308 aa  62.8  0.000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1083  putative aldose-1-epimerase  28.57 
 
 
305 aa  62.4  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.145719  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4277  aldose 1-epimerase  28.05 
 
 
289 aa  62.4  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.436668 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1431  Aldose 1-epimerase  21.29 
 
 
354 aa  62  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4264  aldose-1-epimerase family protein  24.38 
 
 
299 aa  62  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5326  aldose-1-epimerase family protein  23.33 
 
 
300 aa  62  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.6155 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1386  aldose 1-epimerase  26.91 
 
 
384 aa  62.4  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.466174  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3618  aldose 1-epimerase  26.87 
 
 
384 aa  62  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1458  aldose 1-epimerase  31.03 
 
 
263 aa  62  0.00000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1083  hypothetical protein  32.24 
 
 
323 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000316766  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2624  aldose 1-epimerase  29.7 
 
 
371 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.240433 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1133  aldose 1-epimerase  23.31 
 
 
290 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6635  Aldose 1-epimerase  29.8 
 
 
361 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.779767  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0799  aldose 1-epimerase  27.11 
 
 
397 aa  60.8  0.00000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1247  aldose 1-epimerase  29.41 
 
 
346 aa  60.8  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.942743  normal  0.442353 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3011  Aldose 1-epimerase  26.4 
 
 
400 aa  60.8  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.415447  hitchhiker  0.00870507 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3438  aldose 1-epimerase  28.69 
 
 
284 aa  59.7  0.00000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.406594  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2241  Aldose 1-epimerase  27.63 
 
 
291 aa  59.7  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.61015 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1163  aldose 1-epimerase  27.71 
 
 
323 aa  59.7  0.00000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.887027  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4338  hypothetical protein  31.36 
 
 
310 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002663  aldose 1-epimerase  26.27 
 
 
354 aa  58.9  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2369  aldose 1-epimerase  26.21 
 
 
382 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0104312  normal  0.855778 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0628  aldose 1-epimerase  35.29 
 
 
282 aa  57.8  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.48408  normal  0.247972 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2336  aldose 1-epimerase  32.67 
 
 
376 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.360362  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2697  aldose 1-epimerase family protein  27.59 
 
 
290 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>