229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5039 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_5039  Aldose 1-epimerase  100 
 
 		 312 aa  650    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3046  Aldose 1-epimerase  39.24 
 
 		 345 aa  228  1e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.813423  normal  0.148483 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0656  aldose-1-epimerase  32.42 
 
 		 314 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.629793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2973  Aldose 1-epimerase  27.78 
 
 		 303 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000377273  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3303  putative aldose-1-epimerase  29.08 
 
 		 297 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.575493 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2454  aldose 1-epimerase  31.02 
 
 		 307 aa  113  3e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0426  aldose 1-epimerase  28.68 
 
 		 308 aa  104  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1897  aldose 1-epimerase  29.71 
 
 		 290 aa  103  3e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1930  Aldose 1-epimerase  31.22 
 
 		 316 aa  103  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.263285  normal  0.479856 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0514  aldose 1-epimerase  27.41 
 
 		 327 aa  103  5e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.165305  decreased coverage  0.000622322 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1235  Aldose 1-epimerase  28.09 
 
 		 319 aa  103  5e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000417318 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1585  Aldose 1-epimerase  30.26 
 
 		 305 aa  100  2e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.92898  normal  0.309256 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1225  Aldose 1-epimerase  28.91 
 
 		 302 aa  100  3e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2997  Aldose 1-epimerase  27.99 
 
 		 302 aa  100  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0040024 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1836  Aldose 1-epimerase  29.37 
 
 		 315 aa  99.8  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1163  aldose 1-epimerase  30.96 
 
 		 323 aa  99  9e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.887027  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05040  galactose mutarotase-like enzyme  31.25 
 
 		 323 aa  99  1e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.556037  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0559  Aldose 1-epimerase  30.86 
 
 		 262 aa  97.8  2e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.480763  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1267  Aldose 1-epimerase  30.92 
 
 		 301 aa  97.8  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.560353  hitchhiker  0.00115827 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33650  galactose mutarotase-like enzyme  26.07 
 
 		 318 aa  96.7  5e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2182  Aldose 1-epimerase  28.17 
 
 		 299 aa  95.9  7e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000157648 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0225  galactose mutarotase  25.48 
 
 		 314 aa  95.9  8e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00000500571  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1083  putative aldose-1-epimerase  29.57 
 
 		 305 aa  95.5  9e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.145719  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1674  aldose 1-epimerase  30.15 
 
 		 325 aa  94  3e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.416242  hitchhiker  0.00123529 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0696  Aldose 1-epimerase  26.92 
 
 		 306 aa  92  1e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00129327 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1127  aldose 1-epimerase  28.52 
 
 		 269 aa  92  1e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0176464  normal  0.584187 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1458  aldose 1-epimerase  28.57 
 
 		 263 aa  90.9  2e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2432  aldose 1-epimerase  27.95 
 
 		 301 aa  90.1  4e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0573284  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0726  Aldose 1-epimerase  29.36 
 
 		 328 aa  89  9e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2489  Aldose 1-epimerase  25.93 
 
 		 308 aa  87.8  2e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8681  Aldose 1-epimerase  25.59 
 
 		 303 aa  88.2  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.626175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0324  Aldose 1-epimerase  25.88 
 
 		 299 aa  87  3e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.296431 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1278  Aldose 1-epimerase  24.34 
 
 		 307 aa  86.7  5e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.265427  normal  0.286232 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3963  aldose 1-epimerase  24.66 
 
 		 286 aa  86.7  5e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.87118  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0854  Aldose 1-epimerase  25.69 
 
 		 300 aa  86.3  7e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0393175  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1019  Aldose 1-epimerase  24.7 
 
 		 299 aa  85.9  8e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.584137  hitchhiker  0.000443551 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4435  Aldose 1-epimerase  26.01 
 
 		 303 aa  85.1  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.340797 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0226  galactose mutarotase  27.9 
 
 		 318 aa  85.1  0.000000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00706113  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2372  aldose 1-epimerase  29.15 
 
 		 309 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4277  aldose 1-epimerase  25.32 
 
 		 289 aa  83.6  0.000000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.436668 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27460  galactose mutarotase-like enzyme  26.61 
 
 		 334 aa  82.8  0.000000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3760  Aldose 1-epimerase  25.08 
 
 		 290 aa  80.9  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00879497  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3707  Aldose 1-epimerase  25.08 
 
 		 290 aa  81.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4264  aldose-1-epimerase family protein  25.91 
 
 		 299 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4252  aldose-1-epimerase family protein  27 
 
 		 295 aa  80.1  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4343  aldose-1-epimerase family protein  27 
 
 		 295 aa  80.1  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4297  aldose-1-epimerase family protein  27 
 
 		 295 aa  80.1  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5326  aldose-1-epimerase family protein  24.49 
 
 		 300 aa  79.3  0.00000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.6155 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0044  Aldose 1-epimerase  25.78 
 
 		 311 aa  78.6  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1522  Aldose 1-epimerase  26.32 
 
 		 293 aa  79  0.0000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4402  aldose-1-epimerase family protein  24.9 
 
 		 300 aa  78.6  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2057  aldose 1-epimerase  24 
 
 		 305 aa  77.8  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.107394  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0702  Aldose 1-epimerase  27.85 
 
 		 318 aa  77.4  0.0000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03764  predicted aldose-1-epimerase  24.49 
 
 		 308 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4107  Aldose 1-epimerase  24.49 
 
 		 308 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03713  hypothetical protein  24.49 
 
 		 308 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0523  Aldose 1-epimerase  27.13 
 
 		 290 aa  73.6  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3398  aldose 1-epimerase  27.89 
 
 		 294 aa  73.6  0.000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.226465  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12920  galactose mutarotase-like enzyme  27.46 
 
 		 321 aa  71.6  0.00000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0901551  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2023  aldose 1-epimerase  24.83 
 
 		 298 aa  71.2  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6331  aldose 1-epimerase  27.16 
 
 		 362 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4408  aldose-1-epimerase family protein  27.66 
 
 		 280 aa  70.1  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1886  aldose 1-epimerase  24.31 
 
 		 382 aa  70.1  0.00000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.369459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4230  aldose-1-epimerase family protein  27.66 
 
 		 280 aa  69.3  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4184  Aldose 1-epimerase  28.95 
 
 		 360 aa  68.9  0.00000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0866  Aldose 1-epimerase  25.97 
 
 		 306 aa  68.9  0.00000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.104082  normal  0.0514904 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4072  Aldose 1-epimerase  28.95 
 
 		 360 aa  68.9  0.00000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5592  Aldose 1-epimerase  26.97 
 
 		 288 aa  68.6  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0926233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6330  aldose 1-epimerase  26.2 
 
 		 362 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1585  hypothetical protein  24.76 
 
 		 312 aa  68.2  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5648  Aldose 1-epimerase  25.98 
 
 		 327 aa  67.4  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02261  aldose 1-epimerase  27.45 
 
 		 346 aa  66.2  0.0000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1638  Aldose 1-epimerase  24.05 
 
 		 292 aa  65.9  0.0000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.104568  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0186  hypothetical protein  26.13 
 
 		 282 aa  65.1  0.000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0628  aldose 1-epimerase  24.5 
 
 		 282 aa  65.5  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.48408  normal  0.247972 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0739  Aldose 1-epimerase  21.14 
 
 		 276 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.220443  normal  0.0861855 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6508  aldose 1-epimerase  26.29 
 
 		 362 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6742  aldose 1-epimerase  26.29 
 
 		 362 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112366  normal  0.547611 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4205  aldose 1-epimerase  25.33 
 
 		 362 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.613008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6030  aldose 1-epimerase  28.18 
 
 		 362 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.808799  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0149  Aldose 1-epimerase  24.09 
 
 		 336 aa  63.2  0.000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0125238 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3405  Aldose 1-epimerase  25.09 
 
 		 353 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.237068  normal  0.0908294 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1083  hypothetical protein  23.74 
 
 		 323 aa  62.4  0.000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000316766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0469  aldose 1-epimerase  24.19 
 
 		 300 aa  62  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.799033  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2241  Aldose 1-epimerase  22.18 
 
 		 291 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.61015 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0480  aldose 1-epimerase  24.19 
 
 		 300 aa  62  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0456  aldose 1-epimerase  24.9 
 
 		 300 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0551  putative aldose-1-epimerase  24.73 
 
 		 297 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.530428  normal  0.44726 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2624  aldose 1-epimerase  26.32 
 
 		 371 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.240433 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2344  aldose 1-epimerase  28.12 
 
 		 363 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.145267 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6635  Aldose 1-epimerase  26.14 
 
 		 361 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.779767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4225  aldose 1-epimerase  21.78 
 
 		 295 aa  60.5  0.00000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.387725  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6249  Aldose 1-epimerase  23.03 
 
 		 296 aa  59.3  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.783578 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1187  aldose 1-epimerase  34.25 
 
 		 354 aa  58.5  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.353984 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2754  hypothetical protein  22.41 
 
 		 296 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.494847  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2482  hypothetical protein  24.14 
 
 		 357 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283645  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0402  hypothetical protein  24.14 
 
 		 357 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.827093  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1262  hypothetical protein  23.18 
 
 		 344 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3444  aldose 1-epimerase family protein  24.14 
 
 		 357 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.381459  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3482  aldose 1-epimerase family protein  24.14 
 
 		 357 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>