114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1522 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1522  Aldose 1-epimerase  100 
 
 		 293 aa  584  1e-166  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1278  Aldose 1-epimerase  38.33 
 
 		 307 aa  177  1e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.265427  normal  0.286232 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0514  aldose 1-epimerase  36.6 
 
 		 327 aa  172  5.999999999999999e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.165305  decreased coverage  0.000622322 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2997  Aldose 1-epimerase  37.5 
 
 		 302 aa  171  1e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0040024 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8681  Aldose 1-epimerase  36.82 
 
 		 303 aa  170  3e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.626175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2973  Aldose 1-epimerase  38 
 
 		 303 aa  167  1e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000377273  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2454  aldose 1-epimerase  37.62 
 
 		 307 aa  165  6.9999999999999995e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1674  aldose 1-epimerase  38.49 
 
 		 325 aa  163  4.0000000000000004e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.416242  hitchhiker  0.00123529 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1836  Aldose 1-epimerase  36.12 
 
 		 315 aa  162  6e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1225  Aldose 1-epimerase  36.91 
 
 		 302 aa  161  2e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2489  Aldose 1-epimerase  36.79 
 
 		 308 aa  160  2e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12920  galactose mutarotase-like enzyme  37.79 
 
 		 321 aa  159  7e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0901551  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0866  Aldose 1-epimerase  38.49 
 
 		 306 aa  153  4e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.104082  normal  0.0514904 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03764  predicted aldose-1-epimerase  33.1 
 
 		 308 aa  152  7e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4107  Aldose 1-epimerase  33.1 
 
 		 308 aa  152  7e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03713  hypothetical protein  33.1 
 
 		 308 aa  152  7e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0426  aldose 1-epimerase  33.11 
 
 		 308 aa  152  8e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4408  aldose-1-epimerase family protein  36.64 
 
 		 280 aa  152  8e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3398  aldose 1-epimerase  36.77 
 
 		 294 aa  151  1e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.226465  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4230  aldose-1-epimerase family protein  36.88 
 
 		 280 aa  151  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4402  aldose-1-epimerase family protein  33.1 
 
 		 300 aa  150  2e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4264  aldose-1-epimerase family protein  33.22 
 
 		 299 aa  150  2e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4435  Aldose 1-epimerase  37.85 
 
 		 303 aa  149  5e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.340797 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5326  aldose-1-epimerase family protein  32.75 
 
 		 300 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.6155 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1083  putative aldose-1-epimerase  35.95 
 
 		 305 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.145719  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4297  aldose-1-epimerase family protein  32.86 
 
 		 295 aa  143  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4343  aldose-1-epimerase family protein  32.86 
 
 		 295 aa  143  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4252  aldose-1-epimerase family protein  32.86 
 
 		 295 aa  143  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1019  Aldose 1-epimerase  32.2 
 
 		 299 aa  142  5e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.584137  hitchhiker  0.000443551 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0044  Aldose 1-epimerase  34.93 
 
 		 311 aa  141  9.999999999999999e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33650  galactose mutarotase-like enzyme  34.67 
 
 		 318 aa  137  2e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3303  putative aldose-1-epimerase  34.9 
 
 		 297 aa  136  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.575493 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0225  galactose mutarotase  30.54 
 
 		 314 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00000500571  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1163  aldose 1-epimerase  34 
 
 		 323 aa  132  5e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.887027  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1235  Aldose 1-epimerase  34.24 
 
 		 319 aa  130  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000417318 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05040  galactose mutarotase-like enzyme  34.24 
 
 		 323 aa  129  4.0000000000000003e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.556037  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2432  aldose 1-epimerase  33 
 
 		 301 aa  129  6e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0573284  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0523  Aldose 1-epimerase  34.47 
 
 		 290 aa  123  4e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1267  Aldose 1-epimerase  32.31 
 
 		 301 aa  120  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.560353  hitchhiker  0.00115827 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0226  galactose mutarotase  29 
 
 		 318 aa  117  3e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00706113  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1897  aldose 1-epimerase  33.1 
 
 		 290 aa  115  6e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2182  Aldose 1-epimerase  30.27 
 
 		 299 aa  116  6e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000157648 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0854  Aldose 1-epimerase  29.31 
 
 		 300 aa  100  4e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0393175  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1458  aldose 1-epimerase  31.32 
 
 		 263 aa  87  3e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3046  Aldose 1-epimerase  26.75 
 
 		 345 aa  81.3  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.813423  normal  0.148483 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5039  Aldose 1-epimerase  26.32 
 
 		 312 aa  79  0.00000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1127  aldose 1-epimerase  26.98 
 
 		 269 aa  77  0.0000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0176464  normal  0.584187 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0656  aldose-1-epimerase  27.06 
 
 		 314 aa  76.6  0.0000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.629793  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0559  Aldose 1-epimerase  23.55 
 
 		 262 aa  69.7  0.00000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.480763  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0149  Aldose 1-epimerase  32.27 
 
 		 336 aa  68.6  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0125238 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27460  galactose mutarotase-like enzyme  27.78 
 
 		 334 aa  67.8  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1585  Aldose 1-epimerase  32.2 
 
 		 305 aa  64.3  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.92898  normal  0.309256 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0726  Aldose 1-epimerase  34.07 
 
 		 328 aa  63.9  0.000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1930  Aldose 1-epimerase  27.2 
 
 		 316 aa  61.6  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.263285  normal  0.479856 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0803  aldose 1-epimerase  28.63 
 
 		 289 aa  61.6  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1015  Aldose 1-epimerase  28.79 
 
 		 311 aa  57.4  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0702  Aldose 1-epimerase  25.64 
 
 		 318 aa  56.6  0.0000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0696  Aldose 1-epimerase  30.09 
 
 		 306 aa  56.6  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00129327 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0950  Aldose 1-epimerase  27.89 
 
 		 311 aa  56.6  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0322782 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2241  Aldose 1-epimerase  24.5 
 
 		 291 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.61015 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3707  Aldose 1-epimerase  21.43 
 
 		 290 aa  53.5  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3760  Aldose 1-epimerase  21.43 
 
 		 290 aa  53.5  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00879497  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0324  Aldose 1-epimerase  24.34 
 
 		 299 aa  52.8  0.000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.296431 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2178  Aldose 1-epimerase  27.17 
 
 		 329 aa  52  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0279  putative aldose 1-epimerase  27.19 
 
 		 291 aa  51.6  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.869642  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0270  galactose mutarotase related enzyme  28.07 
 
 		 291 aa  51.2  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.117354  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3438  aldose 1-epimerase  28.83 
 
 		 284 aa  51.2  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.406594  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17201  galactose mutarotase-related enzyme  22.34 
 
 		 282 aa  51.2  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.593751  normal  0.935497 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0628  aldose 1-epimerase  27.27 
 
 		 282 aa  51.6  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.48408  normal  0.247972 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1083  hypothetical protein  28.97 
 
 		 323 aa  50.8  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000316766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0739  Aldose 1-epimerase  25.62 
 
 		 276 aa  50.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.220443  normal  0.0861855 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2029  aldose 1-epimerase  24.68 
 
 		 311 aa  50.1  0.00005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.99913  normal  0.429541 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1965  Aldose 1-epimerase  31.46 
 
 		 312 aa  49.7  0.00006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.073838  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2754  hypothetical protein  30.46 
 
 		 296 aa  49.3  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.494847  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5533  Aldose 1-epimerase  31.13 
 
 		 308 aa  49.3  0.00008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1585  hypothetical protein  30.56 
 
 		 312 aa  48.9  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2057  aldose 1-epimerase  25 
 
 		 305 aa  48.9  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.107394  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1638  Aldose 1-epimerase  27.68 
 
 		 292 aa  48.9  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.104568  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2192  galactose mutarotase-like protein  24.34 
 
 		 289 aa  47.8  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1637  Aldose 1-epimerase  30.56 
 
 		 312 aa  47.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12181  normal  0.595367 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02436  hypothetical protein  26.74 
 
 		 290 aa  47.4  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1124  Aldose 1-epimerase  26.74 
 
 		 290 aa  47.4  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4277  aldose 1-epimerase  22.38 
 
 		 289 aa  47.4  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.436668 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2696  aldose 1-epimerase family protein  26.74 
 
 		 290 aa  47.4  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2829  aldose 1-epimerase family protein  26.74 
 
 		 290 aa  47.4  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02400  hypothetical protein  26.74 
 
 		 290 aa  47.4  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1183  aldose 1-epimerase  27.48 
 
 		 357 aa  46.6  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3776  aldose 1-epimerase family protein  26.74 
 
 		 290 aa  47  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1048  aldose 1-epimerase  23.05 
 
 		 297 aa  46.6  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2697  aldose 1-epimerase family protein  26.74 
 
 		 290 aa  46.2  0.0006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1133  aldose 1-epimerase  26.16 
 
 		 290 aa  45.8  0.0008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002663  aldose 1-epimerase  24.52 
 
 		 354 aa  45.8  0.0008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0761  aldose 1-epimerase  30.93 
 
 		 299 aa  44.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0469  aldose 1-epimerase  27.39 
 
 		 300 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.799033  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0480  aldose 1-epimerase  27.39 
 
 		 300 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2610  aldose 1-epimerase  25.93 
 
 		 352 aa  43.9  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.169817 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5592  Aldose 1-epimerase  34.72 
 
 		 288 aa  43.9  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0926233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2702  aldose 1-epimerase  26.27 
 
 		 301 aa  43.5  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.932168 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2018  galactose mutarotase  25.1 
 
 		 357 aa  43.5  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.237722  normal  0.693329 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3405  Aldose 1-epimerase  26.38 
 
 		 353 aa  43.5  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.237068  normal  0.0908294 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>