235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_0559 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_0559  Aldose 1-epimerase  100 
 
 
262 aa  541  1e-153  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.480763  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1127  aldose 1-epimerase  51.52 
 
 
269 aa  296  3e-79  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0176464  normal  0.584187 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1458  aldose 1-epimerase  49.02 
 
 
263 aa  247  1e-64  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0523  Aldose 1-epimerase  29.27 
 
 
290 aa  110  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1897  aldose 1-epimerase  28.27 
 
 
290 aa  106  4e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4264  aldose-1-epimerase family protein  28.47 
 
 
299 aa  106  4e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1278  Aldose 1-epimerase  29.19 
 
 
307 aa  104  1e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.265427  normal  0.286232 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5326  aldose-1-epimerase family protein  28.52 
 
 
300 aa  103  3e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.6155 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1019  Aldose 1-epimerase  30.15 
 
 
299 aa  102  5e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.584137  hitchhiker  0.000443551 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33650  galactose mutarotase-like enzyme  29.47 
 
 
318 aa  101  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1674  aldose 1-epimerase  26.49 
 
 
325 aa  101  1e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.416242  hitchhiker  0.00123529 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12920  galactose mutarotase-like enzyme  26.67 
 
 
321 aa  101  1e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0901551  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4230  aldose-1-epimerase family protein  29.08 
 
 
280 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4402  aldose-1-epimerase family protein  28.17 
 
 
300 aa  99.4  5e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4408  aldose-1-epimerase family protein  28.37 
 
 
280 aa  98.6  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5039  Aldose 1-epimerase  30.86 
 
 
312 aa  97.8  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1267  Aldose 1-epimerase  25.09 
 
 
301 aa  96.7  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.560353  hitchhiker  0.00115827 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2432  aldose 1-epimerase  26.1 
 
 
301 aa  94.7  1e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0573284  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4252  aldose-1-epimerase family protein  26.69 
 
 
295 aa  94.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4297  aldose-1-epimerase family protein  26.69 
 
 
295 aa  94.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3398  aldose 1-epimerase  25.09 
 
 
294 aa  94  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.226465  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4343  aldose-1-epimerase family protein  26.69 
 
 
295 aa  94.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1836  Aldose 1-epimerase  26.85 
 
 
315 aa  93.6  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03764  predicted aldose-1-epimerase  27.47 
 
 
308 aa  92  9e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4107  Aldose 1-epimerase  27.47 
 
 
308 aa  92  9e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03713  hypothetical protein  27.47 
 
 
308 aa  92  9e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3303  putative aldose-1-epimerase  25.62 
 
 
297 aa  92  9e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.575493 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1225  Aldose 1-epimerase  25.78 
 
 
302 aa  91.3  1e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1930  Aldose 1-epimerase  29.92 
 
 
316 aa  90.9  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.263285  normal  0.479856 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0866  Aldose 1-epimerase  24.75 
 
 
306 aa  90.1  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.104082  normal  0.0514904 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2489  Aldose 1-epimerase  25.17 
 
 
308 aa  89.4  6e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0656  aldose-1-epimerase  25.51 
 
 
314 aa  89  7e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.629793  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4435  Aldose 1-epimerase  25.63 
 
 
303 aa  87.8  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.340797 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3046  Aldose 1-epimerase  27.24 
 
 
345 aa  87.8  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.813423  normal  0.148483 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2182  Aldose 1-epimerase  25.58 
 
 
299 aa  87.4  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000157648 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0702  Aldose 1-epimerase  27.95 
 
 
318 aa  84  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0044  Aldose 1-epimerase  23.55 
 
 
311 aa  84  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1235  Aldose 1-epimerase  26.21 
 
 
319 aa  83.6  0.000000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000417318 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2454  aldose 1-epimerase  25.9 
 
 
307 aa  83.2  0.000000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2973  Aldose 1-epimerase  24.13 
 
 
303 aa  82.8  0.000000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000377273  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2997  Aldose 1-epimerase  27.53 
 
 
302 aa  81.3  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0040024 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8681  Aldose 1-epimerase  25.09 
 
 
303 aa  80.9  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.626175  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1083  putative aldose-1-epimerase  23.47 
 
 
305 aa  79.7  0.00000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.145719  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0426  aldose 1-epimerase  27.2 
 
 
308 aa  78.2  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0225  galactose mutarotase  24.25 
 
 
314 aa  77  0.0000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00000500571  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27460  galactose mutarotase-like enzyme  30.63 
 
 
334 aa  76.6  0.0000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0514  aldose 1-epimerase  25 
 
 
327 aa  77  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.165305  decreased coverage  0.000622322 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0173  galactose mutarotase-like protein  25.25 
 
 
294 aa  75.1  0.000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000630537  hitchhiker  0.00000000000000230696 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0226  galactose mutarotase  24.49 
 
 
318 aa  73.6  0.000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00706113  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1163  aldose 1-epimerase  24.56 
 
 
323 aa  72.8  0.000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.887027  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0766  Aldose 1-epimerase  25 
 
 
287 aa  71.2  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.474909  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1083  hypothetical protein  25.32 
 
 
323 aa  70.5  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000316766  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0726  Aldose 1-epimerase  22.66 
 
 
328 aa  70.1  0.00000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1522  Aldose 1-epimerase  23.55 
 
 
293 aa  69.7  0.00000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1357  Aldose 1-epimerase  24.05 
 
 
288 aa  68.9  0.00000000007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2697  aldose 1-epimerase family protein  27.78 
 
 
290 aa  68.9  0.00000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1503  Aldose 1-epimerase  25.79 
 
 
317 aa  67.4  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.72169 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0270  galactose mutarotase related enzyme  28.86 
 
 
291 aa  67.4  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.117354  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1743  hypothetical protein  23.99 
 
 
293 aa  67.4  0.0000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.574419  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4362  aldose 1-epimerase family protein  21.51 
 
 
295 aa  66.6  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4134  aldose 1-epimerase  21.51 
 
 
295 aa  67  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0854  Aldose 1-epimerase  22.87 
 
 
300 aa  65.9  0.0000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0393175  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4109  aldose 1-epimerase family protein  21.12 
 
 
295 aa  65.5  0.0000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0163943  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0279  putative aldose 1-epimerase  31.01 
 
 
291 aa  65.1  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.869642  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05040  galactose mutarotase-like enzyme  24.91 
 
 
323 aa  64.7  0.000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.556037  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02261  aldose 1-epimerase  24.83 
 
 
346 aa  65.1  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1024  galactose mutarotase-like protein  30.66 
 
 
298 aa  63.5  0.000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.353327  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0950  Aldose 1-epimerase  28.69 
 
 
311 aa  63.9  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0322782 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1585  Aldose 1-epimerase  24.79 
 
 
305 aa  63.2  0.000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.92898  normal  0.309256 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0761  aldose 1-epimerase  26.09 
 
 
299 aa  63.2  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02436  hypothetical protein  24.79 
 
 
290 aa  62  0.000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1124  Aldose 1-epimerase  24.79 
 
 
290 aa  62  0.000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2696  aldose 1-epimerase family protein  24.79 
 
 
290 aa  62  0.000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2829  aldose 1-epimerase family protein  24.79 
 
 
290 aa  62  0.000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02400  hypothetical protein  24.79 
 
 
290 aa  62  0.000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1015  Aldose 1-epimerase  23.17 
 
 
311 aa  62  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4277  aldose 1-epimerase  25.78 
 
 
289 aa  61.6  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.436668 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3776  aldose 1-epimerase family protein  24.79 
 
 
290 aa  62  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3707  Aldose 1-epimerase  23.72 
 
 
290 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3760  Aldose 1-epimerase  23.72 
 
 
290 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00879497  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1133  aldose 1-epimerase  23.97 
 
 
290 aa  61.2  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6249  Aldose 1-epimerase  28.85 
 
 
296 aa  61.2  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.783578 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0383  Aldose 1-epimerase  28.03 
 
 
302 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0149  Aldose 1-epimerase  27.56 
 
 
336 aa  60.1  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0125238 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4225  aldose 1-epimerase  28.91 
 
 
295 aa  59.3  0.00000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.387725  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2653  Aldose 1-epimerase  27.63 
 
 
292 aa  58.9  0.00000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3438  aldose 1-epimerase  24.29 
 
 
284 aa  58.9  0.00000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.406594  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2702  aldose 1-epimerase  25.62 
 
 
301 aa  58.2  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.932168 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2260  aldose 1-epimerase  22.31 
 
 
356 aa  58.5  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00420753  unclonable  0.0000000181907 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0696  Aldose 1-epimerase  23.05 
 
 
306 aa  58.5  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00129327 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2029  aldose 1-epimerase  26.5 
 
 
311 aa  57.4  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.99913  normal  0.429541 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2550  Aldose 1-epimerase  25.45 
 
 
289 aa  57  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1661  aldose 1-epimerase  21.86 
 
 
306 aa  57  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.452505 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2192  galactose mutarotase-like protein  22.62 
 
 
289 aa  56.6  0.0000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5831  aldose 1-epimerase  29.09 
 
 
293 aa  56.6  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0718685  normal  0.204267 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2241  Aldose 1-epimerase  24.33 
 
 
291 aa  56.2  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.61015 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2023  aldose 1-epimerase  22.55 
 
 
298 aa  55.5  0.0000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2057  aldose 1-epimerase  23.72 
 
 
305 aa  54.7  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.107394  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2993  Aldose 1-epimerase  26.9 
 
 
294 aa  54.3  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.778062  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5592  Aldose 1-epimerase  25.34 
 
 
288 aa  54.3  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0926233  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>