247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0225 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_0225  galactose mutarotase  100 
 
 
314 aa  653    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00000500571  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0226  galactose mutarotase  53.04 
 
 
318 aa  335  9e-91  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00706113  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2489  Aldose 1-epimerase  43.23 
 
 
308 aa  235  8e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1225  Aldose 1-epimerase  41.5 
 
 
302 aa  210  2e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1278  Aldose 1-epimerase  38.67 
 
 
307 aa  193  3e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.265427  normal  0.286232 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2454  aldose 1-epimerase  37.92 
 
 
307 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4435  Aldose 1-epimerase  35.41 
 
 
303 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.340797 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2973  Aldose 1-epimerase  34.75 
 
 
303 aa  162  8.000000000000001e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000377273  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2997  Aldose 1-epimerase  35.88 
 
 
302 aa  161  1e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0040024 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8681  Aldose 1-epimerase  33.66 
 
 
303 aa  160  4e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.626175  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1674  aldose 1-epimerase  31.56 
 
 
325 aa  157  2e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.416242  hitchhiker  0.00123529 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1836  Aldose 1-epimerase  33.89 
 
 
315 aa  156  4e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3303  putative aldose-1-epimerase  34.87 
 
 
297 aa  153  4e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.575493 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12920  galactose mutarotase-like enzyme  33 
 
 
321 aa  151  2e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0901551  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2182  Aldose 1-epimerase  33.88 
 
 
299 aa  151  2e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000157648 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2432  aldose 1-epimerase  33.66 
 
 
301 aa  147  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0573284  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0426  aldose 1-epimerase  29.57 
 
 
308 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0514  aldose 1-epimerase  30.87 
 
 
327 aa  146  4.0000000000000006e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.165305  decreased coverage  0.000622322 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3398  aldose 1-epimerase  32.14 
 
 
294 aa  146  6e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.226465  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4402  aldose-1-epimerase family protein  28.62 
 
 
300 aa  139  6e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0866  Aldose 1-epimerase  33.55 
 
 
306 aa  139  8.999999999999999e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.104082  normal  0.0514904 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5326  aldose-1-epimerase family protein  29.03 
 
 
300 aa  138  1e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.6155 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1897  aldose 1-epimerase  31.92 
 
 
290 aa  137  2e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.481432 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03764  predicted aldose-1-epimerase  29.03 
 
 
308 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4107  Aldose 1-epimerase  29.03 
 
 
308 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03713  hypothetical protein  29.03 
 
 
308 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1522  Aldose 1-epimerase  30.54 
 
 
293 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1235  Aldose 1-epimerase  31.82 
 
 
319 aa  133  3.9999999999999996e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000417318 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1163  aldose 1-epimerase  32.44 
 
 
323 aa  131  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.887027  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4264  aldose-1-epimerase family protein  27.85 
 
 
299 aa  130  3e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0044  Aldose 1-epimerase  32.03 
 
 
311 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4252  aldose-1-epimerase family protein  28.12 
 
 
295 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4297  aldose-1-epimerase family protein  28.12 
 
 
295 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4343  aldose-1-epimerase family protein  28.12 
 
 
295 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0854  Aldose 1-epimerase  31.07 
 
 
300 aa  120  1.9999999999999998e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0393175  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1019  Aldose 1-epimerase  26.71 
 
 
299 aa  119  4.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.584137  hitchhiker  0.000443551 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1267  Aldose 1-epimerase  30.17 
 
 
301 aa  117  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.560353  hitchhiker  0.00115827 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33650  galactose mutarotase-like enzyme  31.76 
 
 
318 aa  117  3e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0523  Aldose 1-epimerase  31.4 
 
 
290 aa  117  3.9999999999999997e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05040  galactose mutarotase-like enzyme  30.43 
 
 
323 aa  113  3e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.556037  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1083  putative aldose-1-epimerase  30.38 
 
 
305 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.145719  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3046  Aldose 1-epimerase  25.7 
 
 
345 aa  109  7.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.813423  normal  0.148483 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4408  aldose-1-epimerase family protein  28.91 
 
 
280 aa  102  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4230  aldose-1-epimerase family protein  28.43 
 
 
280 aa  102  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5039  Aldose 1-epimerase  25.48 
 
 
312 aa  95.9  8e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0702  Aldose 1-epimerase  24.81 
 
 
318 aa  78.6  0.0000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0559  Aldose 1-epimerase  24.25 
 
 
262 aa  77  0.0000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.480763  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0696  Aldose 1-epimerase  25.17 
 
 
306 aa  73.6  0.000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00129327 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0324  Aldose 1-epimerase  24.17 
 
 
299 aa  72.8  0.000000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.296431 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002663  aldose 1-epimerase  30.05 
 
 
354 aa  71.6  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0656  aldose-1-epimerase  23.4 
 
 
314 aa  71.6  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.629793  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0149  Aldose 1-epimerase  26.91 
 
 
336 aa  70.9  0.00000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0125238 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1183  aldose 1-epimerase  28.1 
 
 
357 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0142  aldose 1-epimerase  27.45 
 
 
353 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0625  aldose 1-epimerase  27.45 
 
 
353 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.417593  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3618  aldose 1-epimerase  28.14 
 
 
384 aa  69.3  0.00000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2482  hypothetical protein  26.97 
 
 
357 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283645  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3479  aldose 1-epimerase  26.97 
 
 
357 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.329911  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0550  aldose 1-epimerase  27.45 
 
 
353 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0177374  normal  0.655719 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0402  hypothetical protein  26.97 
 
 
357 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.827093  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3303  hypothetical protein  26.97 
 
 
357 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1262  hypothetical protein  26.97 
 
 
344 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3444  aldose 1-epimerase family protein  26.97 
 
 
357 aa  69.3  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.381459  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3482  aldose 1-epimerase family protein  26.97 
 
 
357 aa  69.3  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0726  Aldose 1-epimerase  27.49 
 
 
328 aa  68.6  0.0000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0526  aldose 1-epimerase  27.45 
 
 
353 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6030  aldose 1-epimerase  25.9 
 
 
362 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.808799  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27460  galactose mutarotase-like enzyme  27.31 
 
 
334 aa  68.2  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0593  aldose 1-epimerase  26.8 
 
 
353 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.112152 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4205  aldose 1-epimerase  25.07 
 
 
362 aa  67  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.613008  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1325  aldose 1-epimerase  30.26 
 
 
387 aa  67  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105451  normal  0.426674 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6330  aldose 1-epimerase  25.38 
 
 
362 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4249  aldose 1-epimerase  30.04 
 
 
353 aa  66.2  0.0000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4277  aldose 1-epimerase  25.3 
 
 
289 aa  65.9  0.0000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.436668 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0950  Aldose 1-epimerase  24.62 
 
 
311 aa  65.5  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0322782 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1122  aldose 1-epimerase  27.05 
 
 
392 aa  65.5  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3707  aldose 1-epimerase  26.14 
 
 
353 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.405661  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0628  aldose 1-epimerase  25.17 
 
 
282 aa  64.7  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.48408  normal  0.247972 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2760  aldose 1-epimerase  25.49 
 
 
353 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.385741 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3031  aldose 1-epimerase  27.5 
 
 
338 aa  64.3  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.331849 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1357  Aldose 1-epimerase  22.93 
 
 
288 aa  63.5  0.000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0655  aldose 1-epimerase  25.44 
 
 
356 aa  63.5  0.000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1458  aldose 1-epimerase  25 
 
 
263 aa  63.5  0.000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0630  aldose 1-epimerase  25.44 
 
 
356 aa  63.5  0.000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4631  aldose 1-epimerase  26.29 
 
 
361 aa  63.5  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2178  Aldose 1-epimerase  24.36 
 
 
329 aa  63.2  0.000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3405  Aldose 1-epimerase  25 
 
 
353 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.237068  normal  0.0908294 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0173  galactose mutarotase-like protein  33.02 
 
 
294 aa  62.8  0.000000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000630537  hitchhiker  0.00000000000000230696 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1930  Aldose 1-epimerase  24.81 
 
 
316 aa  62.8  0.000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.263285  normal  0.479856 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1503  Aldose 1-epimerase  26.42 
 
 
317 aa  61.6  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.72169 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1269  Aldose 1-epimerase  29.1 
 
 
414 aa  61.2  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0872441  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1024  galactose mutarotase-like protein  28.57 
 
 
298 aa  61.6  0.00000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.353327  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0912  aldose 1-epimerase  24.21 
 
 
295 aa  61.2  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2660  aldose 1-epimerase  24.19 
 
 
306 aa  61.6  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0844306  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1015  Aldose 1-epimerase  22.06 
 
 
311 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0621  Aldose 1-epimerase  25.22 
 
 
388 aa  61.6  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.295352  normal  0.0428145 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6508  aldose 1-epimerase  24.17 
 
 
362 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6331  aldose 1-epimerase  24.09 
 
 
362 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6742  aldose 1-epimerase  24.17 
 
 
362 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112366  normal  0.547611 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1886  aldose 1-epimerase  27.27 
 
 
382 aa  60.1  0.00000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.369459  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>