197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_4264 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_4264  aldose-1-epimerase family protein  100 
 
 		 299 aa  624  1e-178  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5326  aldose-1-epimerase family protein  94.67 
 
 		 300 aa  592  1e-168  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.6155 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03764  predicted aldose-1-epimerase  95 
 
 		 308 aa  589  1e-167  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4107  Aldose 1-epimerase  95 
 
 		 308 aa  589  1e-167  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03713  hypothetical protein  95 
 
 		 308 aa  589  1e-167  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4402  aldose-1-epimerase family protein  94 
 
 		 300 aa  586  1e-166  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4252  aldose-1-epimerase family protein  70.65 
 
 		 295 aa  438  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4297  aldose-1-epimerase family protein  70.65 
 
 		 295 aa  438  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4343  aldose-1-epimerase family protein  70.65 
 
 		 295 aa  438  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4408  aldose-1-epimerase family protein  56.01 
 
 		 280 aa  333  2e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4230  aldose-1-epimerase family protein  55.33 
 
 		 280 aa  332  6e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2997  Aldose 1-epimerase  38.31 
 
 		 302 aa  194  1e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0040024 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3398  aldose 1-epimerase  37.29 
 
 		 294 aa  189  4e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.226465  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2973  Aldose 1-epimerase  37.72 
 
 		 303 aa  189  5.999999999999999e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000377273  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2182  Aldose 1-epimerase  37.5 
 
 		 299 aa  188  7e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000157648 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8681  Aldose 1-epimerase  37.5 
 
 		 303 aa  188  8e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.626175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12920  galactose mutarotase-like enzyme  36.67 
 
 		 321 aa  184  1.0000000000000001e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0901551  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4435  Aldose 1-epimerase  35.33 
 
 		 303 aa  178  1e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.340797 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1897  aldose 1-epimerase  38.6 
 
 		 290 aa  178  1e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2432  aldose 1-epimerase  34.83 
 
 		 301 aa  176  3e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0573284  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1083  putative aldose-1-epimerase  39.6 
 
 		 305 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.145719  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1019  Aldose 1-epimerase  33.1 
 
 		 299 aa  167  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.584137  hitchhiker  0.000443551 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3303  putative aldose-1-epimerase  36.62 
 
 		 297 aa  166  4e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.575493 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0514  aldose 1-epimerase  33 
 
 		 327 aa  166  5e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.165305  decreased coverage  0.000622322 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2454  aldose 1-epimerase  34.22 
 
 		 307 aa  162  4.0000000000000004e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1836  Aldose 1-epimerase  34.14 
 
 		 315 aa  162  5.0000000000000005e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1278  Aldose 1-epimerase  34.81 
 
 		 307 aa  160  3e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.265427  normal  0.286232 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0426  aldose 1-epimerase  31.99 
 
 		 308 aa  155  7e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1522  Aldose 1-epimerase  33.22 
 
 		 293 aa  150  2e-35  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1225  Aldose 1-epimerase  32.87 
 
 		 302 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0044  Aldose 1-epimerase  31.58 
 
 		 311 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0866  Aldose 1-epimerase  31.27 
 
 		 306 aa  144  1e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.104082  normal  0.0514904 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2489  Aldose 1-epimerase  31.46 
 
 		 308 aa  144  2e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1267  Aldose 1-epimerase  32.53 
 
 		 301 aa  142  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.560353  hitchhiker  0.00115827 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33650  galactose mutarotase-like enzyme  29.15 
 
 		 318 aa  138  1e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0523  Aldose 1-epimerase  32.51 
 
 		 290 aa  135  9e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1674  aldose 1-epimerase  34.12 
 
 		 325 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.416242  hitchhiker  0.00123529 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1235  Aldose 1-epimerase  32.65 
 
 		 319 aa  134  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000417318 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0225  galactose mutarotase  27.85 
 
 		 314 aa  130  3e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00000500571  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0854  Aldose 1-epimerase  31.27 
 
 		 300 aa  120  1.9999999999999998e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0393175  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1163  aldose 1-epimerase  29.49 
 
 		 323 aa  119  9e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.887027  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05040  galactose mutarotase-like enzyme  29.17 
 
 		 323 aa  114  2.0000000000000002e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.556037  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0559  Aldose 1-epimerase  28.47 
 
 		 262 aa  106  4e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.480763  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0226  galactose mutarotase  29.93 
 
 		 318 aa  106  4e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00706113  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1458  aldose 1-epimerase  29.43 
 
 		 263 aa  94.7  2e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1127  aldose 1-epimerase  28.82 
 
 		 269 aa  93.2  4e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0176464  normal  0.584187 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0702  Aldose 1-epimerase  28.51 
 
 		 318 aa  90.1  4e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0149  Aldose 1-epimerase  25.2 
 
 		 336 aa  82.4  0.000000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0125238 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5039  Aldose 1-epimerase  25.91 
 
 		 312 aa  80.9  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1930  Aldose 1-epimerase  28.1 
 
 		 316 aa  79  0.00000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.263285  normal  0.479856 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0656  aldose-1-epimerase  25.41 
 
 		 314 aa  79  0.00000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.629793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1585  Aldose 1-epimerase  30.54 
 
 		 305 aa  74.7  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.92898  normal  0.309256 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0550  aldose 1-epimerase  26.42 
 
 		 353 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0177374  normal  0.655719 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3046  Aldose 1-epimerase  25.28 
 
 		 345 aa  73.9  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.813423  normal  0.148483 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0142  aldose 1-epimerase  27.13 
 
 		 353 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0625  aldose 1-epimerase  27.13 
 
 		 353 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.417593  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0526  aldose 1-epimerase  25.52 
 
 		 353 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0593  aldose 1-epimerase  27.13 
 
 		 353 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.112152 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0324  Aldose 1-epimerase  25.21 
 
 		 299 aa  72.4  0.000000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.296431 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2583  Aldose 1-epimerase  28.34 
 
 		 294 aa  72  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1183  aldose 1-epimerase  27.02 
 
 		 357 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6249  Aldose 1-epimerase  26.11 
 
 		 296 aa  70.1  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.783578 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3707  aldose 1-epimerase  26.02 
 
 		 353 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.405661  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0651  aldose 1-epimerase  26.98 
 
 		 343 aa  68.9  0.00000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.225141  hitchhiker  0.000000283833 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0696  Aldose 1-epimerase  24.48 
 
 		 306 aa  68.6  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00129327 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2482  hypothetical protein  26.61 
 
 		 357 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283645  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3479  aldose 1-epimerase  26.61 
 
 		 357 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.329911  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0402  hypothetical protein  26.61 
 
 		 357 aa  67  0.0000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.827093  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1262  hypothetical protein  26.61 
 
 		 344 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3444  aldose 1-epimerase family protein  26.61 
 
 		 357 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.381459  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3482  aldose 1-epimerase family protein  26.61 
 
 		 357 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3303  hypothetical protein  26.61 
 
 		 357 aa  67  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2993  Aldose 1-epimerase  27.27 
 
 		 294 aa  65.9  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.778062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3405  Aldose 1-epimerase  25.57 
 
 		 353 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.237068  normal  0.0908294 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0551  putative aldose-1-epimerase  24.79 
 
 		 297 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.530428  normal  0.44726 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6635  Aldose 1-epimerase  24.91 
 
 		 361 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.779767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4072  Aldose 1-epimerase  24.35 
 
 		 360 aa  65.1  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4184  Aldose 1-epimerase  24.35 
 
 		 360 aa  65.1  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5831  aldose 1-epimerase  25.88 
 
 		 293 aa  64.7  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0718685  normal  0.204267 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2760  aldose 1-epimerase  24.8 
 
 		 353 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.385741 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4338  hypothetical protein  26.53 
 
 		 310 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2057  aldose 1-epimerase  24.07 
 
 		 305 aa  63.9  0.000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.107394  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1886  aldose 1-epimerase  26.12 
 
 		 382 aa  63.5  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.369459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2029  aldose 1-epimerase  27.84 
 
 		 311 aa  61.6  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.99913  normal  0.429541 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27460  galactose mutarotase-like enzyme  24.38 
 
 		 334 aa  62  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2610  aldose 1-epimerase  25.69 
 
 		 352 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.169817 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2372  aldose 1-epimerase  25.75 
 
 		 309 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0656  Aldose 1-epimerase  25.37 
 
 		 344 aa  60.1  0.00000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0633  aldose 1-epimerase  25.37 
 
 		 344 aa  60.1  0.00000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4277  aldose 1-epimerase  25.81 
 
 		 289 aa  60.1  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.436668 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0726  Aldose 1-epimerase  24.79 
 
 		 328 aa  59.7  0.00000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3729  aldose 1-epimerase  25 
 
 		 344 aa  60.1  0.00000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3409  aldose 1-epimerase  27.27 
 
 		 343 aa  59.7  0.00000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0646401 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2751  aldose 1-epimerase  25.16 
 
 		 336 aa  59.3  0.00000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0660  aldose 1-epimerase  25.37 
 
 		 344 aa  59.3  0.00000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0543  aldose 1-epimerase  27.27 
 
 		 343 aa  58.9  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.386929 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2506  aldose 1-epimerase  25.41 
 
 		 355 aa  58.9  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.288802  normal  0.200846 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0279  putative aldose 1-epimerase  27.13 
 
 		 291 aa  57.8  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.869642  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4109  aldose 1-epimerase family protein  26.59 
 
 		 295 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0163943  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0576  aldose 1-epimerase  23.62 
 
 		 343 aa  57  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>