226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeAg_B4252 on replicon NC_011149
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011083  SeHA_C4343  aldose-1-epimerase family protein  100 
 
 		 295 aa  611  9.999999999999999e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4297  aldose-1-epimerase family protein  100 
 
 		 295 aa  611  9.999999999999999e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4252  aldose-1-epimerase family protein  100 
 
 		 295 aa  611  9.999999999999999e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5326  aldose-1-epimerase family protein  70.65 
 
 		 300 aa  442  1e-123  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.6155 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4264  aldose-1-epimerase family protein  70.65 
 
 		 299 aa  438  9.999999999999999e-123  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03713  hypothetical protein  70.31 
 
 		 308 aa  435  1e-121  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03764  predicted aldose-1-epimerase  70.31 
 
 		 308 aa  435  1e-121  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4107  Aldose 1-epimerase  70.31 
 
 		 308 aa  435  1e-121  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4402  aldose-1-epimerase family protein  69.97 
 
 		 300 aa  436  1e-121  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4408  aldose-1-epimerase family protein  57.53 
 
 		 280 aa  343  2e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4230  aldose-1-epimerase family protein  57.19 
 
 		 280 aa  343  2.9999999999999997e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1083  putative aldose-1-epimerase  40.82 
 
 		 305 aa  191  1e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.145719  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3398  aldose 1-epimerase  36.86 
 
 		 294 aa  191  1e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.226465  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2997  Aldose 1-epimerase  38.06 
 
 		 302 aa  189  4e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0040024 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2973  Aldose 1-epimerase  37.5 
 
 		 303 aa  186  3e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000377273  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8681  Aldose 1-epimerase  35.81 
 
 		 303 aa  176  4e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.626175  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1897  aldose 1-epimerase  37.41 
 
 		 290 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12920  galactose mutarotase-like enzyme  34 
 
 		 321 aa  173  2.9999999999999996e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0901551  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4435  Aldose 1-epimerase  34.23 
 
 		 303 aa  166  5e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.340797 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2182  Aldose 1-epimerase  33.91 
 
 		 299 aa  164  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000157648 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3303  putative aldose-1-epimerase  35.71 
 
 		 297 aa  164  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.575493 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2432  aldose 1-epimerase  33.45 
 
 		 301 aa  162  8.000000000000001e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0573284  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1019  Aldose 1-epimerase  33.21 
 
 		 299 aa  158  9e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.584137  hitchhiker  0.000443551 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0866  Aldose 1-epimerase  33.33 
 
 		 306 aa  156  3e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.104082  normal  0.0514904 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0514  aldose 1-epimerase  32.17 
 
 		 327 aa  155  7e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.165305  decreased coverage  0.000622322 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2454  aldose 1-epimerase  33.33 
 
 		 307 aa  154  2e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1278  Aldose 1-epimerase  33.45 
 
 		 307 aa  152  4e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.265427  normal  0.286232 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1836  Aldose 1-epimerase  33.33 
 
 		 315 aa  152  5e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1267  Aldose 1-epimerase  32.86 
 
 		 301 aa  149  8e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.560353  hitchhiker  0.00115827 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2489  Aldose 1-epimerase  31.16 
 
 		 308 aa  146  3e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0426  aldose 1-epimerase  32.18 
 
 		 308 aa  145  1e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1522  Aldose 1-epimerase  32.86 
 
 		 293 aa  143  3e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0044  Aldose 1-epimerase  30.88 
 
 		 311 aa  141  9.999999999999999e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1674  aldose 1-epimerase  32.12 
 
 		 325 aa  137  2e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.416242  hitchhiker  0.00123529 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33650  galactose mutarotase-like enzyme  30.18 
 
 		 318 aa  131  1.0000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0523  Aldose 1-epimerase  32.19 
 
 		 290 aa  127  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1225  Aldose 1-epimerase  28.91 
 
 		 302 aa  124  1e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0225  galactose mutarotase  28.12 
 
 		 314 aa  125  1e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00000500571  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05040  galactose mutarotase-like enzyme  29.11 
 
 		 323 aa  116  5e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.556037  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0854  Aldose 1-epimerase  29.33 
 
 		 300 aa  113  3e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0393175  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0226  galactose mutarotase  27.39 
 
 		 318 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00706113  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1235  Aldose 1-epimerase  29.49 
 
 		 319 aa  108  9.000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000417318 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1163  aldose 1-epimerase  30.23 
 
 		 323 aa  105  1e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.887027  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0559  Aldose 1-epimerase  26.69 
 
 		 262 aa  94.4  2e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.480763  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0656  aldose-1-epimerase  27.63 
 
 		 314 aa  83.2  0.000000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.629793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1127  aldose 1-epimerase  27.84 
 
 		 269 aa  81.6  0.00000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0176464  normal  0.584187 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0702  Aldose 1-epimerase  26.2 
 
 		 318 aa  81.3  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5039  Aldose 1-epimerase  27 
 
 		 312 aa  80.1  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3046  Aldose 1-epimerase  27 
 
 		 345 aa  77.8  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.813423  normal  0.148483 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1083  hypothetical protein  29.02 
 
 		 323 aa  75.9  0.0000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000316766  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2482  hypothetical protein  24.65 
 
 		 357 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283645  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1458  aldose 1-epimerase  28.42 
 
 		 263 aa  74.7  0.000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0550  aldose 1-epimerase  25.95 
 
 		 353 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0177374  normal  0.655719 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0526  aldose 1-epimerase  25.61 
 
 		 353 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1585  Aldose 1-epimerase  26.9 
 
 		 305 aa  72.8  0.000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.92898  normal  0.309256 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1262  hypothetical protein  24.65 
 
 		 344 aa  72.4  0.000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3444  aldose 1-epimerase family protein  24.65 
 
 		 357 aa  72.4  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.381459  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3482  aldose 1-epimerase family protein  24.65 
 
 		 357 aa  72.4  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3479  aldose 1-epimerase  24.31 
 
 		 357 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.329911  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0402  hypothetical protein  24.65 
 
 		 357 aa  72  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.827093  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3303  hypothetical protein  24.65 
 
 		 357 aa  72  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1930  Aldose 1-epimerase  27.54 
 
 		 316 aa  71.6  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.263285  normal  0.479856 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0696  Aldose 1-epimerase  26.67 
 
 		 306 aa  71.2  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00129327 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1183  aldose 1-epimerase  24.3 
 
 		 357 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0142  aldose 1-epimerase  32.21 
 
 		 353 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0625  aldose 1-epimerase  32.21 
 
 		 353 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.417593  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0593  aldose 1-epimerase  32.21 
 
 		 353 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.112152 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3707  aldose 1-epimerase  30.72 
 
 		 353 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.405661  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2023  aldose 1-epimerase  26.56 
 
 		 298 aa  67.8  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0149  Aldose 1-epimerase  23.44 
 
 		 336 aa  68.2  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0125238 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0324  Aldose 1-epimerase  24.65 
 
 		 299 aa  65.5  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.296431 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2751  aldose 1-epimerase  26.48 
 
 		 336 aa  65.5  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3405  Aldose 1-epimerase  22.78 
 
 		 353 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.237068  normal  0.0908294 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0551  putative aldose-1-epimerase  22.37 
 
 		 297 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.530428  normal  0.44726 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002663  aldose 1-epimerase  26.45 
 
 		 354 aa  63.2  0.000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5533  Aldose 1-epimerase  29.2 
 
 		 308 aa  63.2  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2583  Aldose 1-epimerase  25 
 
 		 294 aa  62.8  0.000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0726  Aldose 1-epimerase  27.73 
 
 		 328 aa  62  0.00000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2754  hypothetical protein  28.04 
 
 		 296 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.494847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1503  Aldose 1-epimerase  24.41 
 
 		 317 aa  61.2  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.72169 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0628  aldose 1-epimerase  27.56 
 
 		 282 aa  61.2  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.48408  normal  0.247972 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4184  Aldose 1-epimerase  23.66 
 
 		 360 aa  61.6  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4072  Aldose 1-epimerase  23.66 
 
 		 360 aa  61.6  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2760  aldose 1-epimerase  34.23 
 
 		 353 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.385741 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03326  aldose 1-epimerase  24.47 
 
 		 352 aa  61.6  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2660  aldose 1-epimerase  24.83 
 
 		 306 aa  60.5  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0844306  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3409  aldose 1-epimerase  25.19 
 
 		 343 aa  60.8  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0646401 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3076  aldose 1-epimerase  25.17 
 
 		 362 aa  60.5  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.253201  normal  0.313504 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0576  aldose 1-epimerase  25.1 
 
 		 343 aa  60.8  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2506  aldose 1-epimerase  24.51 
 
 		 355 aa  59.7  0.00000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.288802  normal  0.200846 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0950  Aldose 1-epimerase  24.23 
 
 		 311 aa  59.7  0.00000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0322782 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1886  aldose 1-epimerase  25.13 
 
 		 382 aa  59.7  0.00000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.369459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2372  aldose 1-epimerase  25.1 
 
 		 309 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1015  Aldose 1-epimerase  23.67 
 
 		 311 aa  59.3  0.00000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3099  Aldose 1-epimerase  27.48 
 
 		 346 aa  59.3  0.00000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0743555 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3804  Aldose 1-epimerase  25.19 
 
 		 340 aa  58.9  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.437694 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0693  aldose 1-epimerase  25.56 
 
 		 343 aa  58.5  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2993  Aldose 1-epimerase  26.32 
 
 		 346 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.862423  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0270  galactose mutarotase related enzyme  29.45 
 
 		 291 aa  58.2  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.117354  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0543  aldose 1-epimerase  25.19 
 
 		 343 aa  57.8  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.386929 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>