128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_0526 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008390  Bamb_0526  aldose 1-epimerase  100 
 
 
353 aa  702    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0550  aldose 1-epimerase  98.87 
 
 
353 aa  697    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0177374  normal  0.655719 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0142  aldose 1-epimerase  92.71 
 
 
353 aa  593  1e-168  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0625  aldose 1-epimerase  92.71 
 
 
353 aa  593  1e-168  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.417593  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0593  aldose 1-epimerase  93.01 
 
 
353 aa  593  1e-168  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.112152 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2760  aldose 1-epimerase  89.06 
 
 
353 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.385741 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3707  aldose 1-epimerase  93.71 
 
 
353 aa  567  1e-161  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.405661  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3479  aldose 1-epimerase  72.39 
 
 
357 aa  495  1e-139  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.329911  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3444  aldose 1-epimerase family protein  72.39 
 
 
357 aa  496  1e-139  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.381459  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3482  aldose 1-epimerase family protein  72.39 
 
 
357 aa  496  1e-139  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2482  hypothetical protein  71.83 
 
 
357 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283645  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0402  hypothetical protein  72.11 
 
 
357 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.827093  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3303  hypothetical protein  72.11 
 
 
357 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1183  aldose 1-epimerase  71.55 
 
 
357 aa  490  1e-137  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1262  hypothetical protein  74.15 
 
 
344 aa  488  1e-137  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3405  Aldose 1-epimerase  67.93 
 
 
353 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.237068  normal  0.0908294 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0551  putative aldose-1-epimerase  69.13 
 
 
297 aa  424  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.530428  normal  0.44726 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2610  aldose 1-epimerase  63.43 
 
 
352 aa  413  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.169817 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2583  Aldose 1-epimerase  47.44 
 
 
294 aa  257  2e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2993  Aldose 1-epimerase  46.76 
 
 
294 aa  256  3e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.778062  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2754  hypothetical protein  49.48 
 
 
296 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.494847  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5831  aldose 1-epimerase  40.56 
 
 
293 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0718685  normal  0.204267 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51460  aldose 1-epimerase  39.1 
 
 
285 aa  191  1e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3306  aldose 1-epimerase  37.24 
 
 
291 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0912  aldose 1-epimerase  40 
 
 
295 aa  182  9.000000000000001e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1199  aldose 1-epimerase  37.46 
 
 
289 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.938894 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0896  aldose 1-epimerase  37.85 
 
 
293 aa  176  4e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.320638 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1047  hypothetical protein  38.3 
 
 
293 aa  176  6e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1165  aldose 1-epimerase  36.77 
 
 
289 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0252324 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2260  aldose 1-epimerase  35.93 
 
 
356 aa  175  9.999999999999999e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00420753  unclonable  0.0000000181907 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1886  aldose 1-epimerase  36.7 
 
 
382 aa  172  6.999999999999999e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.369459  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1183  aldose 1-epimerase  33.77 
 
 
305 aa  170  3e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.101584  normal  0.174259 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4246  aldose 1-epimerase  34.47 
 
 
289 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0628  aldose 1-epimerase  37.23 
 
 
282 aa  153  5e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.48408  normal  0.247972 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6249  Aldose 1-epimerase  33.33 
 
 
296 aa  153  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.783578 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2029  aldose 1-epimerase  33.99 
 
 
311 aa  150  2e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.99913  normal  0.429541 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2372  aldose 1-epimerase  33.33 
 
 
309 aa  150  3e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3474  Aldose 1-epimerase  38.46 
 
 
296 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.84486 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02436  hypothetical protein  32.66 
 
 
290 aa  147  3e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1124  Aldose 1-epimerase  32.66 
 
 
290 aa  147  3e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2696  aldose 1-epimerase family protein  32.66 
 
 
290 aa  147  3e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2829  aldose 1-epimerase family protein  32.66 
 
 
290 aa  147  3e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4225  aldose 1-epimerase  31.85 
 
 
295 aa  147  3e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.387725  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3762  Aldose 1-epimerase  38.03 
 
 
296 aa  147  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.993298  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02400  hypothetical protein  32.66 
 
 
290 aa  147  3e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3776  aldose 1-epimerase family protein  32.32 
 
 
290 aa  145  1e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1133  aldose 1-epimerase  32.32 
 
 
290 aa  144  2e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2697  aldose 1-epimerase family protein  32.43 
 
 
290 aa  142  8e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4338  hypothetical protein  30.67 
 
 
310 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0383  Aldose 1-epimerase  31 
 
 
302 aa  137  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0324  Aldose 1-epimerase  31.67 
 
 
299 aa  137  3.0000000000000003e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.296431 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0950  Aldose 1-epimerase  32.89 
 
 
311 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0322782 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1015  Aldose 1-epimerase  33.22 
 
 
311 aa  133  6e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1585  Aldose 1-epimerase  30.61 
 
 
305 aa  121  1.9999999999999998e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.92898  normal  0.309256 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1083  hypothetical protein  33.33 
 
 
323 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000316766  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2023  aldose 1-epimerase  29.33 
 
 
298 aa  104  2e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0696  Aldose 1-epimerase  30.93 
 
 
306 aa  102  1e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00129327 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5533  Aldose 1-epimerase  29.64 
 
 
308 aa  89  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0149  Aldose 1-epimerase  27.85 
 
 
336 aa  82  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0125238 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4362  aldose 1-epimerase family protein  24.34 
 
 
295 aa  74.3  0.000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4297  aldose-1-epimerase family protein  32.89 
 
 
295 aa  73.9  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4343  aldose-1-epimerase family protein  32.89 
 
 
295 aa  73.9  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4252  aldose-1-epimerase family protein  32.89 
 
 
295 aa  73.9  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4134  aldose 1-epimerase  24.34 
 
 
295 aa  73.6  0.000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4109  aldose 1-epimerase family protein  24.34 
 
 
295 aa  73.2  0.000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0163943  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4264  aldose-1-epimerase family protein  25.69 
 
 
299 aa  73.2  0.000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1048  aldose 1-epimerase  28.57 
 
 
297 aa  72.4  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5326  aldose-1-epimerase family protein  25.61 
 
 
300 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.6155 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0225  galactose mutarotase  27.45 
 
 
314 aa  70.1  0.00000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00000500571  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4402  aldose-1-epimerase family protein  24.91 
 
 
300 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03764  predicted aldose-1-epimerase  25.57 
 
 
308 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4107  Aldose 1-epimerase  25.57 
 
 
308 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03713  hypothetical protein  25.57 
 
 
308 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4277  aldose 1-epimerase  23.59 
 
 
289 aa  67  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.436668 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0702  Aldose 1-epimerase  24.72 
 
 
318 aa  64.7  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3963  aldose 1-epimerase  23.17 
 
 
286 aa  62  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.87118  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0739  Aldose 1-epimerase  27.49 
 
 
276 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.220443  normal  0.0861855 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2489  Aldose 1-epimerase  31.43 
 
 
308 aa  62  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1836  Aldose 1-epimerase  25.97 
 
 
315 aa  60.8  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0226  galactose mutarotase  27.37 
 
 
318 aa  60.1  0.00000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00706113  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2057  aldose 1-epimerase  24.04 
 
 
305 aa  59.7  0.00000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.107394  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1674  aldose 1-epimerase  32.11 
 
 
325 aa  59.3  0.00000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.416242  hitchhiker  0.00123529 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0044  Aldose 1-epimerase  33.96 
 
 
311 aa  58.9  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4435  Aldose 1-epimerase  30.06 
 
 
303 aa  58.2  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.340797 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3398  aldose 1-epimerase  30.56 
 
 
294 aa  57  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.226465  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0523  Aldose 1-epimerase  32.04 
 
 
290 aa  56.6  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3760  Aldose 1-epimerase  23.91 
 
 
290 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00879497  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5648  Aldose 1-epimerase  28.47 
 
 
327 aa  55.8  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3707  Aldose 1-epimerase  23.91 
 
 
290 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0469  aldose 1-epimerase  27.2 
 
 
300 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.799033  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0480  aldose 1-epimerase  27.2 
 
 
300 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0456  aldose 1-epimerase  27.6 
 
 
300 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1278  Aldose 1-epimerase  28.22 
 
 
307 aa  54.7  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.265427  normal  0.286232 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2660  aldose 1-epimerase  22.7 
 
 
306 aa  53.9  0.000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0844306  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0866  Aldose 1-epimerase  28.03 
 
 
306 aa  53.1  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.104082  normal  0.0514904 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5039  Aldose 1-epimerase  22.44 
 
 
312 aa  52.8  0.000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3303  putative aldose-1-epimerase  28.74 
 
 
297 aa  52.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.575493 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3046  Aldose 1-epimerase  25.63 
 
 
345 aa  52.4  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.813423  normal  0.148483 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4408  aldose-1-epimerase family protein  29.25 
 
 
280 aa  52.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2241  Aldose 1-epimerase  22.58 
 
 
291 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.61015 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>