150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A4230 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011094  SeSA_A4230  aldose-1-epimerase family protein  100 
 
 
280 aa  582  1.0000000000000001e-165  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4408  aldose-1-epimerase family protein  98.57 
 
 
280 aa  575  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4297  aldose-1-epimerase family protein  57.19 
 
 
295 aa  343  2e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4343  aldose-1-epimerase family protein  57.19 
 
 
295 aa  343  2e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4252  aldose-1-epimerase family protein  57.19 
 
 
295 aa  343  2e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5326  aldose-1-epimerase family protein  55.14 
 
 
300 aa  332  3e-90  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.6155 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4264  aldose-1-epimerase family protein  55.33 
 
 
299 aa  332  5e-90  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4402  aldose-1-epimerase family protein  55.14 
 
 
300 aa  330  1e-89  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03764  predicted aldose-1-epimerase  54.45 
 
 
308 aa  325  7e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4107  Aldose 1-epimerase  54.45 
 
 
308 aa  325  7e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03713  hypothetical protein  54.45 
 
 
308 aa  325  7e-88  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2997  Aldose 1-epimerase  39.79 
 
 
302 aa  196  4.0000000000000005e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0040024 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2973  Aldose 1-epimerase  39.51 
 
 
303 aa  192  7e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000377273  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8681  Aldose 1-epimerase  37.97 
 
 
303 aa  189  5e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.626175  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2432  aldose 1-epimerase  36.99 
 
 
301 aa  169  4e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0573284  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3398  aldose 1-epimerase  34.36 
 
 
294 aa  167  2e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.226465  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12920  galactose mutarotase-like enzyme  34.9 
 
 
321 aa  162  4.0000000000000004e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0901551  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1278  Aldose 1-epimerase  34.15 
 
 
307 aa  162  7e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.265427  normal  0.286232 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1897  aldose 1-epimerase  37.06 
 
 
290 aa  160  2e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1083  putative aldose-1-epimerase  35.62 
 
 
305 aa  159  5e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.145719  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2182  Aldose 1-epimerase  34.24 
 
 
299 aa  154  2e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000157648 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4435  Aldose 1-epimerase  33.56 
 
 
303 aa  153  2e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.340797 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1522  Aldose 1-epimerase  36.88 
 
 
293 aa  151  1e-35  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0866  Aldose 1-epimerase  35.86 
 
 
306 aa  149  4e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.104082  normal  0.0514904 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1836  Aldose 1-epimerase  32.19 
 
 
315 aa  149  6e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1019  Aldose 1-epimerase  30.88 
 
 
299 aa  148  1.0000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.584137  hitchhiker  0.000443551 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2489  Aldose 1-epimerase  32.39 
 
 
308 aa  148  1.0000000000000001e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2454  aldose 1-epimerase  32.28 
 
 
307 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3303  putative aldose-1-epimerase  33.1 
 
 
297 aa  146  4.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.575493 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1267  Aldose 1-epimerase  32.27 
 
 
301 aa  143  3e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.560353  hitchhiker  0.00115827 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0044  Aldose 1-epimerase  31.27 
 
 
311 aa  142  5e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0514  aldose 1-epimerase  32.64 
 
 
327 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.165305  decreased coverage  0.000622322 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0426  aldose 1-epimerase  32.64 
 
 
308 aa  133  3e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1225  Aldose 1-epimerase  29.86 
 
 
302 aa  124  2e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0523  Aldose 1-epimerase  32.14 
 
 
290 aa  122  5e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33650  galactose mutarotase-like enzyme  28.96 
 
 
318 aa  122  8e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1674  aldose 1-epimerase  32.18 
 
 
325 aa  118  9e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.416242  hitchhiker  0.00123529 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0225  galactose mutarotase  28.43 
 
 
314 aa  102  7e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00000500571  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05040  galactose mutarotase-like enzyme  28.12 
 
 
323 aa  102  9e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.556037  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0559  Aldose 1-epimerase  29.08 
 
 
262 aa  100  2e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.480763  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0854  Aldose 1-epimerase  28.38 
 
 
300 aa  99.8  4e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0393175  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1235  Aldose 1-epimerase  28.77 
 
 
319 aa  98.2  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000417318 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1163  aldose 1-epimerase  27.76 
 
 
323 aa  93.2  4e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.887027  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1127  aldose 1-epimerase  29.02 
 
 
269 aa  93.6  4e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0176464  normal  0.584187 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0226  galactose mutarotase  27.36 
 
 
318 aa  92.8  5e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00706113  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1458  aldose 1-epimerase  28.57 
 
 
263 aa  88.2  1e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0656  aldose-1-epimerase  25.91 
 
 
314 aa  80.5  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.629793  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27460  galactose mutarotase-like enzyme  27.35 
 
 
334 aa  80.5  0.00000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3046  Aldose 1-epimerase  26.67 
 
 
345 aa  78.2  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.813423  normal  0.148483 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1585  Aldose 1-epimerase  29.87 
 
 
305 aa  72.4  0.000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.92898  normal  0.309256 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0702  Aldose 1-epimerase  25 
 
 
318 aa  71.2  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5039  Aldose 1-epimerase  27.66 
 
 
312 aa  69.3  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0726  Aldose 1-epimerase  27.59 
 
 
328 aa  68.9  0.00000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0696  Aldose 1-epimerase  26.64 
 
 
306 aa  62.8  0.000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00129327 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1083  hypothetical protein  32.41 
 
 
323 aa  60.8  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000316766  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2372  aldose 1-epimerase  23.68 
 
 
309 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1048  aldose 1-epimerase  24.07 
 
 
297 aa  59.3  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0324  Aldose 1-epimerase  26.38 
 
 
299 aa  58.9  0.00000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.296431 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2482  hypothetical protein  22.86 
 
 
357 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283645  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6249  Aldose 1-epimerase  23.81 
 
 
296 aa  57.4  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.783578 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1015  Aldose 1-epimerase  30.84 
 
 
311 aa  57.4  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3707  Aldose 1-epimerase  24.9 
 
 
290 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3760  Aldose 1-epimerase  24.9 
 
 
290 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00879497  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1930  Aldose 1-epimerase  26.81 
 
 
316 aa  57.4  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.263285  normal  0.479856 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4338  hypothetical protein  25 
 
 
310 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0950  Aldose 1-epimerase  30.84 
 
 
311 aa  56.6  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0322782 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3479  aldose 1-epimerase  29.25 
 
 
357 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.329911  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0402  hypothetical protein  29.25 
 
 
357 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.827093  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5533  Aldose 1-epimerase  29.73 
 
 
308 aa  56.2  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3444  aldose 1-epimerase family protein  29.25 
 
 
357 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.381459  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3482  aldose 1-epimerase family protein  29.25 
 
 
357 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3303  hypothetical protein  29.25 
 
 
357 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1183  aldose 1-epimerase  29.25 
 
 
357 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1262  hypothetical protein  29.25 
 
 
344 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0149  Aldose 1-epimerase  24.78 
 
 
336 aa  55.5  0.0000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0125238 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0142  aldose 1-epimerase  31.13 
 
 
353 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0625  aldose 1-epimerase  31.13 
 
 
353 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.417593  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0383  Aldose 1-epimerase  23.5 
 
 
302 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2506  aldose 1-epimerase  26.17 
 
 
355 aa  54.3  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.288802  normal  0.200846 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0628  aldose 1-epimerase  27.21 
 
 
282 aa  54.3  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.48408  normal  0.247972 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0551  putative aldose-1-epimerase  22.88 
 
 
297 aa  53.9  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.530428  normal  0.44726 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2610  aldose 1-epimerase  21.99 
 
 
352 aa  53.9  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.169817 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3707  aldose 1-epimerase  31.13 
 
 
353 aa  53.5  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.405661  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0593  aldose 1-epimerase  30.19 
 
 
353 aa  53.5  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.112152 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3474  Aldose 1-epimerase  24.68 
 
 
296 aa  53.1  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.84486 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3405  Aldose 1-epimerase  22.79 
 
 
353 aa  53.1  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.237068  normal  0.0908294 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4109  aldose 1-epimerase family protein  25.52 
 
 
295 aa  52.4  0.000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0163943  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0837  aldose 1-epimerase  30.09 
 
 
303 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0568659  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1203  aldose 1-epimerase  32.23 
 
 
320 aa  52  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1318  aldose 1-epimerase  30.09 
 
 
303 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4461  aldose 1-epimerase  30.56 
 
 
303 aa  50.8  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.259661  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0526  aldose 1-epimerase  29.25 
 
 
353 aa  51.2  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0550  aldose 1-epimerase  28.97 
 
 
353 aa  51.6  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0177374  normal  0.655719 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3762  Aldose 1-epimerase  24.68 
 
 
296 aa  50.8  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.993298  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1229  aldose 1-epimerase  29.47 
 
 
303 aa  50.8  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2178  Aldose 1-epimerase  23.19 
 
 
329 aa  50.4  0.00004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0912  aldose 1-epimerase  27.08 
 
 
295 aa  49.7  0.00005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1512  aldose 1-epimerase  29.55 
 
 
302 aa  49.3  0.00008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1712  aldose 1-epimerase  29.55 
 
 
371 aa  48.5  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.602147  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1297  hypothetical protein  27.32 
 
 
306 aa  48.5  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.114642 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>