175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_12920 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_12920  galactose mutarotase-like enzyme  100 
 
 
321 aa  642    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0901551  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2432  aldose 1-epimerase  50.51 
 
 
301 aa  266  2.9999999999999995e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0573284  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2182  Aldose 1-epimerase  49.49 
 
 
299 aa  264  2e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000157648 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4435  Aldose 1-epimerase  44.63 
 
 
303 aa  229  5e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.340797 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2489  Aldose 1-epimerase  41.69 
 
 
308 aa  207  1e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1836  Aldose 1-epimerase  39.24 
 
 
315 aa  207  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8681  Aldose 1-epimerase  40.4 
 
 
303 aa  206  5e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.626175  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3398  aldose 1-epimerase  42.81 
 
 
294 aa  204  2e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.226465  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1083  putative aldose-1-epimerase  42.18 
 
 
305 aa  202  5e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.145719  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1278  Aldose 1-epimerase  42.05 
 
 
307 aa  198  1.0000000000000001e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.265427  normal  0.286232 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1225  Aldose 1-epimerase  41.75 
 
 
302 aa  194  2e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3303  putative aldose-1-epimerase  42.19 
 
 
297 aa  194  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.575493 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4402  aldose-1-epimerase family protein  36.81 
 
 
300 aa  189  7e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1897  aldose 1-epimerase  43.43 
 
 
290 aa  188  8e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2997  Aldose 1-epimerase  39.46 
 
 
302 aa  188  1e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0040024 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2973  Aldose 1-epimerase  39.39 
 
 
303 aa  186  4e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000377273  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5326  aldose-1-epimerase family protein  36.48 
 
 
300 aa  186  4e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.6155 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0866  Aldose 1-epimerase  43 
 
 
306 aa  185  9e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.104082  normal  0.0514904 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4264  aldose-1-epimerase family protein  36.67 
 
 
299 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2454  aldose 1-epimerase  40.92 
 
 
307 aa  183  3e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03764  predicted aldose-1-epimerase  35.5 
 
 
308 aa  179  4.999999999999999e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4107  Aldose 1-epimerase  35.5 
 
 
308 aa  179  4.999999999999999e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03713  hypothetical protein  35.5 
 
 
308 aa  179  4.999999999999999e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1019  Aldose 1-epimerase  35.23 
 
 
299 aa  176  6e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.584137  hitchhiker  0.000443551 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4297  aldose-1-epimerase family protein  34 
 
 
295 aa  173  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4252  aldose-1-epimerase family protein  34 
 
 
295 aa  173  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4343  aldose-1-epimerase family protein  34 
 
 
295 aa  173  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1267  Aldose 1-epimerase  39.1 
 
 
301 aa  169  5e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.560353  hitchhiker  0.00115827 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4230  aldose-1-epimerase family protein  34.9 
 
 
280 aa  162  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4408  aldose-1-epimerase family protein  34.56 
 
 
280 aa  161  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0514  aldose 1-epimerase  35.55 
 
 
327 aa  160  2e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.165305  decreased coverage  0.000622322 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1522  Aldose 1-epimerase  37.79 
 
 
293 aa  159  8e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0044  Aldose 1-epimerase  34.88 
 
 
311 aa  156  4e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0426  aldose 1-epimerase  34.55 
 
 
308 aa  154  2e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0225  galactose mutarotase  33 
 
 
314 aa  151  2e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00000500571  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05040  galactose mutarotase-like enzyme  35.35 
 
 
323 aa  147  3e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.556037  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33650  galactose mutarotase-like enzyme  34.78 
 
 
318 aa  147  3e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1674  aldose 1-epimerase  33.79 
 
 
325 aa  141  9.999999999999999e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.416242  hitchhiker  0.00123529 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0523  Aldose 1-epimerase  36.82 
 
 
290 aa  141  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1235  Aldose 1-epimerase  34.98 
 
 
319 aa  140  3.9999999999999997e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000417318 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0226  galactose mutarotase  32.57 
 
 
318 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00706113  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0854  Aldose 1-epimerase  33.89 
 
 
300 aa  127  3e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0393175  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1163  aldose 1-epimerase  32.27 
 
 
323 aa  116  6e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.887027  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0559  Aldose 1-epimerase  26.67 
 
 
262 aa  101  2e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.480763  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3046  Aldose 1-epimerase  27.33 
 
 
345 aa  94  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.813423  normal  0.148483 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1458  aldose 1-epimerase  27.36 
 
 
263 aa  88.2  2e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1127  aldose 1-epimerase  27.33 
 
 
269 aa  88.2  2e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0176464  normal  0.584187 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0726  Aldose 1-epimerase  31.15 
 
 
328 aa  85.1  0.000000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0656  aldose-1-epimerase  25.32 
 
 
314 aa  73.6  0.000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.629793  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5039  Aldose 1-epimerase  27.46 
 
 
312 aa  71.6  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27460  galactose mutarotase-like enzyme  30.74 
 
 
334 aa  70.9  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2336  aldose 1-epimerase  31.88 
 
 
376 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.360362  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0628  aldose 1-epimerase  27.92 
 
 
282 aa  69.7  0.00000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.48408  normal  0.247972 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1930  Aldose 1-epimerase  27.65 
 
 
316 aa  69.3  0.00000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.263285  normal  0.479856 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3150  hypothetical protein  31.58 
 
 
327 aa  68.6  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.516147 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6330  aldose 1-epimerase  32.89 
 
 
362 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3572  putative aldose 1-epimerase protein  29.71 
 
 
327 aa  64.7  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3254  aldose 1-epimerase  30.35 
 
 
327 aa  64.7  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0554047 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4205  aldose 1-epimerase  32.89 
 
 
362 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.613008  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6030  aldose 1-epimerase  32.46 
 
 
362 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.808799  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002663  aldose 1-epimerase  25.81 
 
 
354 aa  60.8  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3011  Aldose 1-epimerase  29.15 
 
 
400 aa  60.5  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.415447  hitchhiker  0.00870507 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4184  Aldose 1-epimerase  27.81 
 
 
360 aa  60.8  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4072  Aldose 1-epimerase  27.81 
 
 
360 aa  60.8  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2506  aldose 1-epimerase  27.42 
 
 
355 aa  60.1  0.00000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.288802  normal  0.200846 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0702  Aldose 1-epimerase  26.47 
 
 
318 aa  59.3  0.00000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0630  aldose 1-epimerase  34.3 
 
 
356 aa  58.9  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0655  aldose 1-epimerase  34.3 
 
 
356 aa  58.9  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2727  Aldose 1-epimerase  25.75 
 
 
390 aa  58.2  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.265647  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2624  aldose 1-epimerase  26.3 
 
 
371 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.240433 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2697  aldose 1-epimerase family protein  22.44 
 
 
290 aa  55.8  0.0000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1269  Aldose 1-epimerase  30.26 
 
 
414 aa  55.8  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0872441  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4249  aldose 1-epimerase  27.49 
 
 
353 aa  55.5  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2820  Aldose 1-epimerase  25.78 
 
 
380 aa  55.5  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0912  aldose 1-epimerase  26.61 
 
 
295 aa  55.5  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6331  aldose 1-epimerase  33.33 
 
 
362 aa  55.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6635  Aldose 1-epimerase  27.78 
 
 
361 aa  55.5  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.779767  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0142  aldose 1-epimerase  29.59 
 
 
353 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0625  aldose 1-epimerase  29.59 
 
 
353 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.417593  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2026  aldose 1-epimerase  23.93 
 
 
392 aa  53.9  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.564676  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2660  aldose 1-epimerase  26.25 
 
 
306 aa  53.9  0.000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0844306  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6508  aldose 1-epimerase  32.81 
 
 
362 aa  53.5  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6742  aldose 1-epimerase  32.81 
 
 
362 aa  53.5  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112366  normal  0.547611 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1309  Aldose 1-epimerase  26.67 
 
 
319 aa  53.5  0.000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0694346 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02436  hypothetical protein  22.53 
 
 
290 aa  52.8  0.000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1124  Aldose 1-epimerase  22.53 
 
 
290 aa  52.8  0.000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02400  hypothetical protein  22.53 
 
 
290 aa  52.8  0.000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2696  aldose 1-epimerase family protein  22.53 
 
 
290 aa  52.8  0.000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2829  aldose 1-epimerase family protein  22.53 
 
 
290 aa  52.8  0.000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1503  Aldose 1-epimerase  26.1 
 
 
317 aa  52.8  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.72169 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2682  aldose 1-epimerase  30.81 
 
 
406 aa  52.8  0.000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.508916  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0593  aldose 1-epimerase  28.99 
 
 
353 aa  52.8  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.112152 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1133  aldose 1-epimerase  22.18 
 
 
290 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1344  aldose 1-epimerase  24.44 
 
 
343 aa  51.2  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0149  Aldose 1-epimerase  27.34 
 
 
336 aa  51.2  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0125238 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3031  aldose 1-epimerase  27.68 
 
 
338 aa  51.6  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.331849 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1585  Aldose 1-epimerase  26.95 
 
 
305 aa  51.6  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.92898  normal  0.309256 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0803  aldose 1-epimerase  33.12 
 
 
289 aa  51.2  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3707  aldose 1-epimerase  29.59 
 
 
353 aa  50.8  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.405661  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3776  aldose 1-epimerase family protein  22.53 
 
 
290 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>