264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1083 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1083  putative aldose-1-epimerase  100 
 
 		 305 aa  625  1e-178  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.145719  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2973  Aldose 1-epimerase  48.8 
 
 		 303 aa  277  2e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000377273  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2997  Aldose 1-epimerase  48.97 
 
 		 302 aa  272  6e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0040024 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8681  Aldose 1-epimerase  46.05 
 
 		 303 aa  253  3e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.626175  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0866  Aldose 1-epimerase  48.49 
 
 		 306 aa  252  5.000000000000001e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.104082  normal  0.0514904 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1836  Aldose 1-epimerase  45.92 
 
 		 315 aa  234  1.0000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3398  aldose 1-epimerase  44.04 
 
 		 294 aa  217  2e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.226465  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12920  galactose mutarotase-like enzyme  42.18 
 
 		 321 aa  202  5e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0901551  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33650  galactose mutarotase-like enzyme  42.11 
 
 		 318 aa  200  1.9999999999999998e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1267  Aldose 1-epimerase  42.03 
 
 		 301 aa  195  6e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.560353  hitchhiker  0.00115827 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4297  aldose-1-epimerase family protein  40.82 
 
 		 295 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4252  aldose-1-epimerase family protein  40.82 
 
 		 295 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4343  aldose-1-epimerase family protein  40.82 
 
 		 295 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2454  aldose 1-epimerase  43.05 
 
 		 307 aa  191  2e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1897  aldose 1-epimerase  42.27 
 
 		 290 aa  188  1e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2182  Aldose 1-epimerase  42.07 
 
 		 299 aa  188  1e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000157648 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2432  aldose 1-epimerase  41.38 
 
 		 301 aa  183  3e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0573284  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0426  aldose 1-epimerase  39.13 
 
 		 308 aa  182  5.0000000000000004e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5326  aldose-1-epimerase family protein  39.8 
 
 		 300 aa  181  9.000000000000001e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.6155 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4402  aldose-1-epimerase family protein  39.8 
 
 		 300 aa  181  1e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0514  aldose 1-epimerase  39.46 
 
 		 327 aa  181  2e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.165305  decreased coverage  0.000622322 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3303  putative aldose-1-epimerase  40.07 
 
 		 297 aa  179  5.999999999999999e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.575493 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0854  Aldose 1-epimerase  38.05 
 
 		 300 aa  177  1e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0393175  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4435  Aldose 1-epimerase  40.47 
 
 		 303 aa  176  3e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.340797 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03764  predicted aldose-1-epimerase  39.46 
 
 		 308 aa  176  5e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4107  Aldose 1-epimerase  39.46 
 
 		 308 aa  176  5e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03713  hypothetical protein  39.46 
 
 		 308 aa  176  5e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4264  aldose-1-epimerase family protein  39.6 
 
 		 299 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0044  Aldose 1-epimerase  39.02 
 
 		 311 aa  171  2e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1278  Aldose 1-epimerase  38.6 
 
 		 307 aa  168  8e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.265427  normal  0.286232 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4408  aldose-1-epimerase family protein  35.96 
 
 		 280 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2489  Aldose 1-epimerase  37.12 
 
 		 308 aa  160  2e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4230  aldose-1-epimerase family protein  35.62 
 
 		 280 aa  159  6e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1225  Aldose 1-epimerase  38.23 
 
 		 302 aa  154  2e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1019  Aldose 1-epimerase  35.07 
 
 		 299 aa  148  1.0000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.584137  hitchhiker  0.000443551 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1522  Aldose 1-epimerase  35.95 
 
 		 293 aa  146  4.0000000000000006e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0523  Aldose 1-epimerase  36.64 
 
 		 290 aa  143  3e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05040  galactose mutarotase-like enzyme  35.4 
 
 		 323 aa  143  3e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.556037  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1674  aldose 1-epimerase  34.52 
 
 		 325 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.416242  hitchhiker  0.00123529 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1235  Aldose 1-epimerase  36.39 
 
 		 319 aa  140  3e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000417318 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1163  aldose 1-epimerase  34.56 
 
 		 323 aa  137  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.887027  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0226  galactose mutarotase  32.01 
 
 		 318 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00706113  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0225  galactose mutarotase  30.38 
 
 		 314 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00000500571  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1930  Aldose 1-epimerase  31.46 
 
 		 316 aa  103  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.263285  normal  0.479856 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0656  aldose-1-epimerase  29.62 
 
 		 314 aa  99.8  5e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.629793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5039  Aldose 1-epimerase  29.57 
 
 		 312 aa  95.5  9e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3046  Aldose 1-epimerase  28.83 
 
 		 345 aa  87  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.813423  normal  0.148483 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1585  Aldose 1-epimerase  30.19 
 
 		 305 aa  84.3  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.92898  normal  0.309256 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2820  Aldose 1-epimerase  30.8 
 
 		 380 aa  82.8  0.000000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1503  Aldose 1-epimerase  28.77 
 
 		 317 aa  82.4  0.000000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.72169 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2506  aldose 1-epimerase  26.55 
 
 		 355 aa  80.1  0.00000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.288802  normal  0.200846 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0559  Aldose 1-epimerase  23.47 
 
 		 262 aa  79.7  0.00000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.480763  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1127  aldose 1-epimerase  27.18 
 
 		 269 aa  79.7  0.00000000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0176464  normal  0.584187 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1386  aldose 1-epimerase  30.67 
 
 		 384 aa  79  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.466174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1458  aldose 1-epimerase  28.14 
 
 		 263 aa  77.8  0.0000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2636  aldose 1-epimerase  28.36 
 
 		 382 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0151396  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002663  aldose 1-epimerase  27.68 
 
 		 354 aa  77.4  0.0000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1235  Aldose 1-epimerase  30.56 
 
 		 387 aa  77.4  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.153244 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0702  Aldose 1-epimerase  28.81 
 
 		 318 aa  77.4  0.0000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2993  Aldose 1-epimerase  31.84 
 
 		 346 aa  77  0.0000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.862423  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1325  aldose 1-epimerase  30.53 
 
 		 387 aa  76.6  0.0000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105451  normal  0.426674 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2798  aldose 1-epimerase  34.25 
 
 		 321 aa  76.3  0.0000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4631  aldose 1-epimerase  29.61 
 
 		 361 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2977  Aldose 1-epimerase  28.69 
 
 		 397 aa  75.1  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.416586 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0799  aldose 1-epimerase  28.11 
 
 		 397 aa  73.9  0.000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3099  Aldose 1-epimerase  33.87 
 
 		 346 aa  73.9  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0743555 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2369  aldose 1-epimerase  29.3 
 
 		 382 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0104312  normal  0.855778 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1187  aldose 1-epimerase  25.47 
 
 		 354 aa  73.6  0.000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.353984 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1153  Aldose 1-epimerase  30.3 
 
 		 402 aa  73.2  0.000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1269  Aldose 1-epimerase  30.18 
 
 		 414 aa  72.8  0.000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0872441  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1182  aldose 1-epimerase  32.73 
 
 		 356 aa  72.8  0.000000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0474  Aldose 1-epimerase  31.37 
 
 		 383 aa  72.4  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.561665  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0923  aldose 1-epimerase  29.95 
 
 		 346 aa  72  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.285804 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0837  aldose 1-epimerase  29.95 
 
 		 346 aa  72  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3640  Aldose 1-epimerase  29.95 
 
 		 356 aa  72  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0809  aldose 1-epimerase  29.95 
 
 		 346 aa  72  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0868  aldose 1-epimerase  29.95 
 
 		 346 aa  72  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.558575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4114  aldose 1-epimerase  31.25 
 
 		 346 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.413717 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0900  aldose 1-epimerase  29.95 
 
 		 346 aa  72  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1247  aldose 1-epimerase  29.6 
 
 		 346 aa  72  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.942743  normal  0.442353 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2344  aldose 1-epimerase  30.48 
 
 		 363 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.145267 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0630  aldose 1-epimerase  32.1 
 
 		 356 aa  70.9  0.00000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0655  aldose 1-epimerase  32.1 
 
 		 356 aa  70.9  0.00000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1210  aldose 1-epimerase  26.87 
 
 		 347 aa  70.5  0.00000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00282737  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2727  Aldose 1-epimerase  26.29 
 
 		 390 aa  70.9  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.265647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2018  galactose mutarotase  25.09 
 
 		 357 aa  70.5  0.00000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.237722  normal  0.693329 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2717  aldose 1-epimerase  30.65 
 
 		 327 aa  70.5  0.00000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.717761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1122  aldose 1-epimerase  28.65 
 
 		 392 aa  70.5  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2023  aldose 1-epimerase  31.1 
 
 		 298 aa  69.7  0.00000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3731  aldose 1-epimerase  26.84 
 
 		 382 aa  68.9  0.00000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.90424 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0451  aldose 1-epimerase  29.13 
 
 		 336 aa  68.9  0.00000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.486981  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3011  Aldose 1-epimerase  26.02 
 
 		 400 aa  68.6  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.415447  hitchhiker  0.00870507 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0726  Aldose 1-epimerase  29.41 
 
 		 328 aa  68.6  0.0000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1309  Aldose 1-epimerase  27.31 
 
 		 319 aa  68.2  0.0000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0694346 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4184  Aldose 1-epimerase  30.19 
 
 		 360 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4072  Aldose 1-epimerase  30.19 
 
 		 360 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0859  aldose 1-epimerase  28.77 
 
 		 346 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0241581  normal  0.840205 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_51907  predicted protein  29.6 
 
 		 443 aa  68.2  0.0000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2873  aldose 1-epimerase  31.36 
 
 		 346 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.341142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0677  aldose 1-epimerase  28.78 
 
 		 346 aa  67.4  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.569185  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>