278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0702 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_0702  Aldose 1-epimerase  100 
 
 		 318 aa  654    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1585  Aldose 1-epimerase  33.33 
 
 		 305 aa  117  3e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.92898  normal  0.309256 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0656  aldose-1-epimerase  30.38 
 
 		 314 aa  109  5e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.629793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1674  aldose 1-epimerase  31.25 
 
 		 325 aa  101  1e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.416242  hitchhiker  0.00123529 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0514  aldose 1-epimerase  31.15 
 
 		 327 aa  101  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.165305  decreased coverage  0.000622322 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2178  Aldose 1-epimerase  30.26 
 
 		 329 aa  100  3e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1083  hypothetical protein  30.23 
 
 		 323 aa  98.6  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000316766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2182  Aldose 1-epimerase  30.45 
 
 		 299 aa  95.1  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000157648 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3046  Aldose 1-epimerase  27.95 
 
 		 345 aa  94.7  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.813423  normal  0.148483 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2023  aldose 1-epimerase  29.04 
 
 		 298 aa  95.1  2e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33650  galactose mutarotase-like enzyme  30.4 
 
 		 318 aa  94  3e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2660  aldose 1-epimerase  28.84 
 
 		 306 aa  93.6  4e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0844306  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1015  Aldose 1-epimerase  27.04 
 
 		 311 aa  92.8  6e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0950  Aldose 1-epimerase  28.63 
 
 		 311 aa  92.4  9e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0322782 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0044  Aldose 1-epimerase  30.36 
 
 		 311 aa  92  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0739  Aldose 1-epimerase  27.3 
 
 		 276 aa  91.3  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.220443  normal  0.0861855 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0149  Aldose 1-epimerase  29.76 
 
 		 336 aa  90.5  3e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0125238 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4264  aldose-1-epimerase family protein  28.51 
 
 		 299 aa  90.1  4e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0426  aldose 1-epimerase  27.69 
 
 		 308 aa  90.1  5e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4402  aldose-1-epimerase family protein  26.64 
 
 		 300 aa  89.4  7e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0696  Aldose 1-epimerase  27.71 
 
 		 306 aa  89.4  7e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00129327 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2372  aldose 1-epimerase  27.85 
 
 		 309 aa  89.4  8e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03764  predicted aldose-1-epimerase  27.07 
 
 		 308 aa  89.4  9e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4107  Aldose 1-epimerase  27.07 
 
 		 308 aa  89.4  9e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03713  hypothetical protein  27.07 
 
 		 308 aa  89.4  9e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0628  aldose 1-epimerase  28.66 
 
 		 282 aa  89  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.48408  normal  0.247972 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2432  aldose 1-epimerase  25.71 
 
 		 301 aa  89  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0573284  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2029  aldose 1-epimerase  30.36 
 
 		 311 aa  88.6  1e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.99913  normal  0.429541 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0523  Aldose 1-epimerase  26.92 
 
 		 290 aa  87.8  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1267  Aldose 1-epimerase  30.98 
 
 		 301 aa  85.5  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.560353  hitchhiker  0.00115827 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0324  Aldose 1-epimerase  26.75 
 
 		 299 aa  84.7  0.000000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.296431 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0559  Aldose 1-epimerase  27.95 
 
 		 262 aa  84  0.000000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.480763  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5326  aldose-1-epimerase family protein  26.2 
 
 		 300 aa  83.6  0.000000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.6155 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0226  galactose mutarotase  26.41 
 
 		 318 aa  83.2  0.000000000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00706113  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2241  Aldose 1-epimerase  26.44 
 
 		 291 aa  83.2  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.61015 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3760  Aldose 1-epimerase  25.54 
 
 		 290 aa  82.8  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00879497  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3707  Aldose 1-epimerase  25.54 
 
 		 290 aa  82.8  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2454  aldose 1-epimerase  28.85 
 
 		 307 aa  82.4  0.000000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4252  aldose-1-epimerase family protein  26.2 
 
 		 295 aa  81.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4297  aldose-1-epimerase family protein  26.2 
 
 		 295 aa  81.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4343  aldose-1-epimerase family protein  26.2 
 
 		 295 aa  81.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1458  aldose 1-epimerase  28.78 
 
 		 263 aa  80.9  0.00000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4338  hypothetical protein  26.55 
 
 		 310 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1886  aldose 1-epimerase  27.3 
 
 		 382 aa  79.7  0.00000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.369459  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1897  aldose 1-epimerase  28 
 
 		 290 aa  80.1  0.00000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2057  aldose 1-epimerase  27.27 
 
 		 305 aa  79.7  0.00000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.107394  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4277  aldose 1-epimerase  24.84 
 
 		 289 aa  79.3  0.00000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.436668 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3398  aldose 1-epimerase  28.81 
 
 		 294 aa  79.3  0.00000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.226465  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0726  Aldose 1-epimerase  29.83 
 
 		 328 aa  79.3  0.00000000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0225  galactose mutarotase  24.81 
 
 		 314 aa  78.6  0.0000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00000500571  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5533  Aldose 1-epimerase  29.28 
 
 		 308 aa  78.6  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0383  Aldose 1-epimerase  24.84 
 
 		 302 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5039  Aldose 1-epimerase  27.85 
 
 		 312 aa  77.4  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1083  putative aldose-1-epimerase  28.81 
 
 		 305 aa  77.4  0.0000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.145719  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1019  Aldose 1-epimerase  29.07 
 
 		 299 aa  77.4  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.584137  hitchhiker  0.000443551 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1278  Aldose 1-epimerase  29.39 
 
 		 307 aa  77  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.265427  normal  0.286232 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4435  Aldose 1-epimerase  25.94 
 
 		 303 aa  77  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.340797 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3963  aldose 1-epimerase  25.11 
 
 		 286 aa  75.5  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.87118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0780  aldose 1-epimerase  26.59 
 
 		 292 aa  74.7  0.000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000154006  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17201  galactose mutarotase-related enzyme  25.87 
 
 		 282 aa  74.7  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.593751  normal  0.935497 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2192  galactose mutarotase-like protein  23.95 
 
 		 289 aa  75.1  0.000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0456  aldose 1-epimerase  25.08 
 
 		 300 aa  73.6  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1127  aldose 1-epimerase  27.34 
 
 		 269 aa  72.8  0.000000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0176464  normal  0.584187 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5648  Aldose 1-epimerase  25.23 
 
 		 327 aa  72.4  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5831  aldose 1-epimerase  27.18 
 
 		 293 aa  71.2  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0718685  normal  0.204267 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4230  aldose-1-epimerase family protein  25 
 
 		 280 aa  71.2  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4225  aldose 1-epimerase  24.38 
 
 		 295 aa  70.9  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.387725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1895  aldose 1-epimerase family protein  24.38 
 
 		 306 aa  70.9  0.00000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3303  putative aldose-1-epimerase  28.86 
 
 		 297 aa  70.1  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.575493 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0469  aldose 1-epimerase  24.41 
 
 		 300 aa  69.7  0.00000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.799033  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0480  aldose 1-epimerase  24.41 
 
 		 300 aa  69.7  0.00000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4408  aldose-1-epimerase family protein  24.56 
 
 		 280 aa  68.9  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0896  aldose 1-epimerase  27.57 
 
 		 293 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.320638 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1225  Aldose 1-epimerase  26.46 
 
 		 302 aa  68.9  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0766  Aldose 1-epimerase  22.94 
 
 		 287 aa  68.2  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.474909  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0295  aldose 1-epimerase family protein  24.32 
 
 		 295 aa  68.2  0.0000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0866  Aldose 1-epimerase  28.4 
 
 		 306 aa  68.2  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.104082  normal  0.0514904 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2489  Aldose 1-epimerase  26.34 
 
 		 308 aa  67.4  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0186  hypothetical protein  25.83 
 
 		 282 aa  66.6  0.0000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2535  aldose 1-epimerase  25.52 
 
 		 304 aa  66.2  0.0000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0854  Aldose 1-epimerase  27.6 
 
 		 300 aa  65.9  0.0000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0393175  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51460  aldose 1-epimerase  26.51 
 
 		 285 aa  65.5  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0156  hypothetical protein  25.27 
 
 		 284 aa  65.9  0.000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.42374  normal  0.0793834 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2260  aldose 1-epimerase  27.95 
 
 		 356 aa  65.5  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00420753  unclonable  0.0000000181907 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0550  aldose 1-epimerase  25.59 
 
 		 353 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0177374  normal  0.655719 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2754  hypothetical protein  24.75 
 
 		 296 aa  64.3  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.494847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0526  aldose 1-epimerase  25.59 
 
 		 353 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1836  Aldose 1-epimerase  23.9 
 
 		 315 aa  64.3  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2973  Aldose 1-epimerase  27.78 
 
 		 303 aa  63.5  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000377273  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1638  Aldose 1-epimerase  23.1 
 
 		 292 aa  63.5  0.000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.104568  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3306  aldose 1-epimerase  27.65 
 
 		 291 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0173  galactose mutarotase-like protein  31.36 
 
 		 294 aa  63.5  0.000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000630537  hitchhiker  0.00000000000000230696 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1357  Aldose 1-epimerase  21.37 
 
 		 288 aa  62.8  0.000000007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1047  hypothetical protein  26.38 
 
 		 293 aa  62.8  0.000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1661  aldose 1-epimerase  26.03 
 
 		 306 aa  62.4  0.000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.452505 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3438  aldose 1-epimerase  24.91 
 
 		 284 aa  62  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.406594  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1183  aldose 1-epimerase  24.83 
 
 		 305 aa  62  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.101584  normal  0.174259 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0142  aldose 1-epimerase  24.35 
 
 		 353 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1989  aldose 1-epimerase  30.77 
 
 		 304 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0625  aldose 1-epimerase  24.35 
 
 		 353 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.417593  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>