109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0780 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0780  aldose 1-epimerase  100 
 
 		 292 aa  610  9.999999999999999e-175  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000154006  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1177  galactose mutarotase-like protein  39.59 
 
 		 292 aa  234  2.0000000000000002e-60  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2192  galactose mutarotase-like protein  40.48 
 
 		 289 aa  230  2e-59  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0921  galactose mutarotase-like protein  38.46 
 
 		 295 aa  217  2e-55  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0180582  hitchhiker  0.00667173 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1470  lacX protein  38.98 
 
 		 290 aa  209  6e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0477051  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1508  lacX protein  38.98 
 
 		 290 aa  208  1e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0450353  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1480  lacX protein  38.98 
 
 		 290 aa  208  1e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.383068  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1624  lacX protein  38.98 
 
 		 290 aa  208  1e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1692  putative lacX protein  38.98 
 
 		 290 aa  208  1e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1512  aldose 1-epimerase  39.25 
 
 		 290 aa  207  2e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1660  putative lacX protein  39.72 
 
 		 290 aa  207  2e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3685  putative lacX protein  38.75 
 
 		 290 aa  207  2e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1715  lacX protein, putative  39.25 
 
 		 290 aa  206  3e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.725211  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1322  aldose 1-epimerase  38.41 
 
 		 290 aa  206  4e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000155463  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1765  putative lacX protein  39.25 
 
 		 290 aa  206  4e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3737  LacX-related protein  37.88 
 
 		 290 aa  198  7.999999999999999e-50  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1024  galactose mutarotase-like protein  34.34 
 
 		 298 aa  186  3e-46  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.353327  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2550  Aldose 1-epimerase  34.04 
 
 		 289 aa  182  8.000000000000001e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0645  Aldose 1-epimerase  34.64 
 
 		 313 aa  181  1e-44  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.148137  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5592  Aldose 1-epimerase  36.56 
 
 		 288 aa  176  3e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0926233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2535  aldose 1-epimerase  35.76 
 
 		 304 aa  172  5e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0279  putative aldose 1-epimerase  34.8 
 
 		 291 aa  171  1e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.869642  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2443  hypothetical protein  34.38 
 
 		 291 aa  167  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0270  galactose mutarotase related enzyme  34.12 
 
 		 291 aa  167  2.9999999999999998e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.117354  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0173  galactose mutarotase-like protein  32.54 
 
 		 294 aa  166  5e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000630537  hitchhiker  0.00000000000000230696 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3438  aldose 1-epimerase  32.29 
 
 		 284 aa  163  2.0000000000000002e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.406594  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1357  Aldose 1-epimerase  34.84 
 
 		 288 aa  160  2e-38  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1761  Aldose 1-epimerase  34.81 
 
 		 286 aa  155  7e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4447  Aldose 1-epimerase  32.42 
 
 		 290 aa  154  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.840638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1743  hypothetical protein  29.35 
 
 		 293 aa  152  5e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.574419  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0766  Aldose 1-epimerase  31.88 
 
 		 287 aa  151  1e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.474909  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1927  lacX protein  34.67 
 
 		 298 aa  144  1e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3343  aldose 1-epimerase  32.27 
 
 		 297 aa  142  6e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.233307  normal  0.850547 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0432  Aldose 1-epimerase  29.93 
 
 		 292 aa  142  9e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.519948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1924  Aldose 1-epimerase  31.54 
 
 		 292 aa  140  1.9999999999999998e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.532522 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3295  Aldose 1-epimerase protein  32.07 
 
 		 289 aa  139  6e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.498729  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D38  galactose mutarotase-like protein  30.82 
 
 		 301 aa  137  2e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6486  Aldose 1-epimerase  29.9 
 
 		 288 aa  136  5e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5996  Aldose 1-epimerase  28.52 
 
 		 289 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.648016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1529  Aldose 1-epimerase  28.28 
 
 		 293 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1472  Aldose 1-epimerase  29.33 
 
 		 295 aa  126  5e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.355719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2069  aldose 1-epimerase  31.78 
 
 		 291 aa  124  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.290697  normal  0.0540863 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2846  Aldose 1-epimerase  29.39 
 
 		 292 aa  124  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.985751 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3188  aldose 1-epimerase  31.4 
 
 		 292 aa  123  4e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00301236 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2623  aldose 1-epimerase  28.99 
 
 		 292 aa  122  6e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.187732 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2653  Aldose 1-epimerase  31.73 
 
 		 292 aa  120  3e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0803  aldose 1-epimerase  29.33 
 
 		 289 aa  116  3.9999999999999997e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0246  Aldose 1-epimerase  29.39 
 
 		 292 aa  115  7.999999999999999e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0595936  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1965  Aldose 1-epimerase  25.76 
 
 		 312 aa  89  8e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.073838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1883  Aldose 1-epimerase  25.98 
 
 		 331 aa  89  9e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1585  hypothetical protein  24.57 
 
 		 312 aa  87  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1637  Aldose 1-epimerase  26.62 
 
 		 312 aa  85.1  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12181  normal  0.595367 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0761  aldose 1-epimerase  26.91 
 
 		 299 aa  83.2  0.000000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3707  Aldose 1-epimerase  27.97 
 
 		 290 aa  79  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3760  Aldose 1-epimerase  27.97 
 
 		 290 aa  79  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00879497  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0739  Aldose 1-epimerase  32.88 
 
 		 276 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.220443  normal  0.0861855 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0702  Aldose 1-epimerase  26.59 
 
 		 318 aa  74.7  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4277  aldose 1-epimerase  28.63 
 
 		 289 aa  72  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.436668 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1895  aldose 1-epimerase family protein  25.2 
 
 		 306 aa  70.9  0.00000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1661  aldose 1-epimerase  25.66 
 
 		 306 aa  71.2  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.452505 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1638  Aldose 1-epimerase  25.4 
 
 		 292 aa  70.9  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.104568  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2057  aldose 1-epimerase  27.46 
 
 		 305 aa  70.9  0.00000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.107394  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3963  aldose 1-epimerase  25.36 
 
 		 286 aa  68.9  0.00000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.87118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0295  aldose 1-epimerase family protein  25.73 
 
 		 295 aa  68.6  0.0000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0156  hypothetical protein  26.34 
 
 		 284 aa  67  0.0000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.42374  normal  0.0793834 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17901  galactose mutarotase-like protein  27.57 
 
 		 284 aa  67  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.41246  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2702  aldose 1-epimerase  26.38 
 
 		 301 aa  65.1  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.932168 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18071  galactose mutarotase  26.64 
 
 		 284 aa  64.7  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2241  Aldose 1-epimerase  31.21 
 
 		 291 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.61015 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2751  aldose 1-epimerase  24.37 
 
 		 399 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0900  aldose 1-epimerase  27.63 
 
 		 305 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0870744 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1690  hypothetical protein  25.23 
 
 		 284 aa  61.6  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.400821  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0186  hypothetical protein  24.54 
 
 		 282 aa  60.8  0.00000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1512  aldose 1-epimerase  24.29 
 
 		 302 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1543  aldose 1-epimerase family protein  24.29 
 
 		 302 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.169393  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1712  aldose 1-epimerase  25 
 
 		 371 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.602147  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25911  galactose mutarotase  25 
 
 		 288 aa  60.1  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1989  aldose 1-epimerase  24.83 
 
 		 304 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1229  aldose 1-epimerase  24.17 
 
 		 303 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4461  aldose 1-epimerase  24.09 
 
 		 303 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.259661  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1173  hypothetical protein  28.75 
 
 		 285 aa  57  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20481  galactose mutarotase-like protein  28.75 
 
 		 285 aa  57  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.786913 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1300  aldose 1-epimerase  25.25 
 
 		 303 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.372594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1203  aldose 1-epimerase  24.58 
 
 		 320 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17851  galactose mutarotase-like protein  30.77 
 
 		 284 aa  55.8  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.705452  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17201  galactose mutarotase-related enzyme  24.82 
 
 		 282 aa  54.3  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.593751  normal  0.935497 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0837  aldose 1-epimerase  23.75 
 
 		 303 aa  53.5  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0568659  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1318  aldose 1-epimerase  23.75 
 
 		 303 aa  53.5  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0866  Aldose 1-epimerase  22.17 
 
 		 306 aa  53.1  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.104082  normal  0.0514904 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1297  hypothetical protein  24.92 
 
 		 306 aa  50.1  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.114642 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2838  Aldose 1-epimerase  24.9 
 
 		 323 aa  49.7  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0834033 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27460  galactose mutarotase-like enzyme  27.27 
 
 		 334 aa  49.7  0.00006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2182  Aldose 1-epimerase  23.84 
 
 		 299 aa  49.3  0.00008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000157648 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5126  hypothetical protein  34.43 
 
 		 122 aa  48.5  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1897  aldose 1-epimerase  22.38 
 
 		 290 aa  48.5  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2660  aldose 1-epimerase  29.09 
 
 		 306 aa  48.1  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0844306  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1585  Aldose 1-epimerase  28.44 
 
 		 305 aa  48.1  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.92898  normal  0.309256 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3303  putative aldose-1-epimerase  23.76 
 
 		 297 aa  47.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.575493 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1015  Aldose 1-epimerase  20.24 
 
 		 311 aa  46.6  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0696  Aldose 1-epimerase  22.94 
 
 		 306 aa  46.6  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00129327 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>