224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2702 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_2702  aldose 1-epimerase  100 
 
 		 301 aa  621  1e-177  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.932168 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0761  aldose 1-epimerase  60.87 
 
 		 299 aa  383  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1965  Aldose 1-epimerase  54.31 
 
 		 312 aa  329  4e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.073838  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1585  hypothetical protein  54.63 
 
 		 312 aa  328  5.0000000000000004e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1637  Aldose 1-epimerase  54.31 
 
 		 312 aa  326  4.0000000000000003e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12181  normal  0.595367 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0837  aldose 1-epimerase  52.19 
 
 		 303 aa  311  5.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0568659  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1318  aldose 1-epimerase  52.19 
 
 		 303 aa  311  5.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1229  aldose 1-epimerase  52.19 
 
 		 303 aa  310  2e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1203  aldose 1-epimerase  51.85 
 
 		 320 aa  309  2.9999999999999997e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1300  aldose 1-epimerase  51.85 
 
 		 303 aa  308  5.9999999999999995e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.372594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4461  aldose 1-epimerase  51.15 
 
 		 303 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.259661  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1543  aldose 1-epimerase family protein  53.54 
 
 		 302 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.169393  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0900  aldose 1-epimerase  52.65 
 
 		 305 aa  306  3e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0870744 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2751  aldose 1-epimerase  52.53 
 
 		 399 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1989  aldose 1-epimerase  51.01 
 
 		 304 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1712  aldose 1-epimerase  53.2 
 
 		 371 aa  305  5.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.602147  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1512  aldose 1-epimerase  53.2 
 
 		 302 aa  305  7e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2838  Aldose 1-epimerase  52.7 
 
 		 323 aa  289  3e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0834033 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1297  hypothetical protein  50.84 
 
 		 306 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.114642 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1661  aldose 1-epimerase  38.33 
 
 		 306 aa  194  2e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.452505 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2057  aldose 1-epimerase  30.04 
 
 		 305 aa  124  1e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.107394  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0739  Aldose 1-epimerase  29.43 
 
 		 276 aa  118  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.220443  normal  0.0861855 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4277  aldose 1-epimerase  30.36 
 
 		 289 aa  115  7.999999999999999e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.436668 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3963  aldose 1-epimerase  31.32 
 
 		 286 aa  114  3e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.87118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1895  aldose 1-epimerase family protein  28.42 
 
 		 306 aa  113  3e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2241  Aldose 1-epimerase  28.18 
 
 		 291 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.61015 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0156  hypothetical protein  30.26 
 
 		 284 aa  109  7.000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.42374  normal  0.0793834 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3707  Aldose 1-epimerase  27.36 
 
 		 290 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0295  aldose 1-epimerase family protein  28.41 
 
 		 295 aa  107  2e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1638  Aldose 1-epimerase  28.52 
 
 		 292 aa  107  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.104568  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3760  Aldose 1-epimerase  27.46 
 
 		 290 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00879497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0186  hypothetical protein  29.09 
 
 		 282 aa  103  3e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1322  aldose 1-epimerase  30.22 
 
 		 290 aa  96.7  4e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000155463  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3685  putative lacX protein  28.72 
 
 		 290 aa  96.3  5e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17201  galactose mutarotase-related enzyme  25.99 
 
 		 282 aa  95.9  7e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.593751  normal  0.935497 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1765  putative lacX protein  30.15 
 
 		 290 aa  95.9  8e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1470  lacX protein  29.43 
 
 		 290 aa  95.5  9e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0477051  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1715  lacX protein, putative  28.09 
 
 		 290 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.725211  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1508  lacX protein  29.43 
 
 		 290 aa  94.7  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0450353  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1480  lacX protein  29.43 
 
 		 290 aa  94.7  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.383068  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1624  lacX protein  29.43 
 
 		 290 aa  94.7  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1512  aldose 1-epimerase  29.08 
 
 		 290 aa  94.7  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1660  putative lacX protein  29.08 
 
 		 290 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1692  putative lacX protein  29.43 
 
 		 290 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0921  galactose mutarotase-like protein  26.24 
 
 		 295 aa  92  1e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0180582  hitchhiker  0.00667173 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2653  Aldose 1-epimerase  36.62 
 
 		 292 aa  89.7  6e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0173  galactose mutarotase-like protein  26.84 
 
 		 294 aa  86.7  5e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000630537  hitchhiker  0.00000000000000230696 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18071  galactose mutarotase  29.78 
 
 		 284 aa  86.7  5e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1690  hypothetical protein  31.45 
 
 		 284 aa  84.7  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.400821  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1743  hypothetical protein  25.69 
 
 		 293 aa  84.3  0.000000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.574419  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25911  galactose mutarotase  26.28 
 
 		 288 aa  84.7  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17901  galactose mutarotase-like protein  31.01 
 
 		 284 aa  84.7  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.41246  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1173  hypothetical protein  24.24 
 
 		 285 aa  82.8  0.000000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20481  galactose mutarotase-like protein  24.24 
 
 		 285 aa  82.8  0.000000000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.786913 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2623  aldose 1-epimerase  35.76 
 
 		 292 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.187732 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0279  putative aldose 1-epimerase  26.95 
 
 		 291 aa  80.5  0.00000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.869642  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2846  Aldose 1-epimerase  35.92 
 
 		 292 aa  80.9  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.985751 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0270  galactose mutarotase related enzyme  25.88 
 
 		 291 aa  80.1  0.00000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.117354  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1357  Aldose 1-epimerase  23.16 
 
 		 288 aa  79.7  0.00000000000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17851  galactose mutarotase-like protein  29.22 
 
 		 284 aa  79.7  0.00000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.705452  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2069  aldose 1-epimerase  34.67 
 
 		 291 aa  79.3  0.00000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.290697  normal  0.0540863 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1472  Aldose 1-epimerase  27.33 
 
 		 295 aa  79.3  0.00000000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.355719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2443  hypothetical protein  28.51 
 
 		 291 aa  77  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6486  Aldose 1-epimerase  27.76 
 
 		 288 aa  75.1  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5996  Aldose 1-epimerase  35.88 
 
 		 289 aa  75.5  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.648016  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1761  Aldose 1-epimerase  28.05 
 
 		 286 aa  74.3  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0766  Aldose 1-epimerase  24.6 
 
 		 287 aa  73.9  0.000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.474909  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3188  aldose 1-epimerase  33.12 
 
 		 292 aa  73.9  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00301236 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3343  aldose 1-epimerase  31.41 
 
 		 297 aa  73.9  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.233307  normal  0.850547 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5592  Aldose 1-epimerase  25.89 
 
 		 288 aa  73.6  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0926233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0246  Aldose 1-epimerase  32.48 
 
 		 292 aa  72.8  0.000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0595936  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1883  Aldose 1-epimerase  33.76 
 
 		 331 aa  70.9  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0645  Aldose 1-epimerase  33.1 
 
 		 313 aa  70.5  0.00000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.148137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3295  Aldose 1-epimerase protein  27.17 
 
 		 289 aa  70.1  0.00000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.498729  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3737  LacX-related protein  25.09 
 
 		 290 aa  70.5  0.00000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4447  Aldose 1-epimerase  26.39 
 
 		 290 aa  69.7  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.840638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4821  Aldose 1-epimerase  32.28 
 
 		 295 aa  69.3  0.00000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3438  aldose 1-epimerase  26.15 
 
 		 284 aa  68.9  0.00000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.406594  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0803  aldose 1-epimerase  33.79 
 
 		 289 aa  68.9  0.00000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0432  Aldose 1-epimerase  26.47 
 
 		 292 aa  68.6  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.519948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0780  aldose 1-epimerase  26.38 
 
 		 292 aa  68.6  0.0000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000154006  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1024  galactose mutarotase-like protein  24.45 
 
 		 298 aa  68.2  0.0000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.353327  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32562  predicted protein  29.8 
 
 		 450 aa  67.8  0.0000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.170002  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0559  Aldose 1-epimerase  25.62 
 
 		 262 aa  66.6  0.0000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.480763  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1927  lacX protein  24.81 
 
 		 298 aa  63.9  0.000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2535  aldose 1-epimerase  28.46 
 
 		 304 aa  63.9  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1826  aldose 1-epimerase  30.77 
 
 		 299 aa  63.5  0.000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.51985 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2192  galactose mutarotase-like protein  22.48 
 
 		 289 aa  63.2  0.000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2550  Aldose 1-epimerase  23.91 
 
 		 289 aa  62.4  0.000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3194  aldose 1-epimerase  31.41 
 
 		 276 aa  62.4  0.000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.382378  normal  0.0888989 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2040  Aldose 1-epimerase  26.19 
 
 		 282 aa  61.6  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.439926  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71570  hypothetical protein  28.98 
 
 		 318 aa  62  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1924  Aldose 1-epimerase  27.75 
 
 		 292 aa  61.6  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.532522 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1529  Aldose 1-epimerase  26.91 
 
 		 293 aa  61.6  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6210  hypothetical protein  28.98 
 
 		 305 aa  62  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2733  aldose 1-epimerase  23.5 
 
 		 281 aa  61.2  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.616833  normal  0.530659 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5039  Aldose 1-epimerase  26.83 
 
 		 312 aa  60.8  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0702  Aldose 1-epimerase  32.67 
 
 		 318 aa  61.2  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2366  aldose 1-epimerase  28.12 
 
 		 301 aa  60.5  0.00000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.1034  normal  0.210411 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3975  aldose 1-epimerase  25.71 
 
 		 291 aa  59.7  0.00000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00305422 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>