98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4447 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4447  Aldose 1-epimerase  100 
 
 		 290 aa  603  1.0000000000000001e-171  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.840638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0432  Aldose 1-epimerase  42.56 
 
 		 292 aa  252  6e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.519948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0270  galactose mutarotase related enzyme  41.52 
 
 		 291 aa  234  1.0000000000000001e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.117354  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1765  putative lacX protein  39.79 
 
 		 290 aa  232  7.000000000000001e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0279  putative aldose 1-epimerase  40.83 
 
 		 291 aa  231  8.000000000000001e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.869642  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1512  aldose 1-epimerase  39.79 
 
 		 290 aa  230  3e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1660  putative lacX protein  39.79 
 
 		 290 aa  230  3e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3685  putative lacX protein  39.18 
 
 		 290 aa  229  3e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1715  lacX protein, putative  39.79 
 
 		 290 aa  229  4e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.725211  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1624  lacX protein  39.18 
 
 		 290 aa  227  2e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1508  lacX protein  39.18 
 
 		 290 aa  227  2e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0450353  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1480  lacX protein  39.18 
 
 		 290 aa  227  2e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.383068  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1692  putative lacX protein  39.18 
 
 		 290 aa  227  2e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1470  lacX protein  38.62 
 
 		 290 aa  227  2e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0477051  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1322  aldose 1-epimerase  39.52 
 
 		 290 aa  226  4e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000155463  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3737  LacX-related protein  41.32 
 
 		 290 aa  224  1e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5592  Aldose 1-epimerase  42.07 
 
 		 288 aa  219  3.9999999999999997e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0926233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3438  aldose 1-epimerase  40.28 
 
 		 284 aa  214  1.9999999999999998e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.406594  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2192  galactose mutarotase-like protein  40.34 
 
 		 289 aa  201  9e-51  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2550  Aldose 1-epimerase  36.52 
 
 		 289 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0766  Aldose 1-epimerase  35.89 
 
 		 287 aa  196  4.0000000000000005e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.474909  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1177  galactose mutarotase-like protein  36.61 
 
 		 292 aa  186  3e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0921  galactose mutarotase-like protein  32.52 
 
 		 295 aa  179  7e-44  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0180582  hitchhiker  0.00667173 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1761  Aldose 1-epimerase  36.27 
 
 		 286 aa  172  6.999999999999999e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1472  Aldose 1-epimerase  32.5 
 
 		 295 aa  170  3e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.355719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3343  aldose 1-epimerase  34.78 
 
 		 297 aa  169  4e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.233307  normal  0.850547 
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D38  galactose mutarotase-like protein  32.99 
 
 		 301 aa  166  5e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1357  Aldose 1-epimerase  34.3 
 
 		 288 aa  164  1.0000000000000001e-39  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1927  lacX protein  30.51 
 
 		 298 aa  160  3e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2535  aldose 1-epimerase  33 
 
 		 304 aa  159  5e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5996  Aldose 1-epimerase  32.75 
 
 		 289 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.648016  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6486  Aldose 1-epimerase  31.82 
 
 		 288 aa  153  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0780  aldose 1-epimerase  32.42 
 
 		 292 aa  154  2e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000154006  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2443  hypothetical protein  33.1 
 
 		 291 aa  150  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1883  Aldose 1-epimerase  32.84 
 
 		 331 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2623  aldose 1-epimerase  35.2 
 
 		 292 aa  145  6e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.187732 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2846  Aldose 1-epimerase  35.2 
 
 		 292 aa  145  6e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.985751 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0803  aldose 1-epimerase  31.82 
 
 		 289 aa  145  1e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3188  aldose 1-epimerase  34.66 
 
 		 292 aa  144  1e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00301236 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0173  galactose mutarotase-like protein  30.15 
 
 		 294 aa  143  3e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000630537  hitchhiker  0.00000000000000230696 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2069  aldose 1-epimerase  31.88 
 
 		 291 aa  143  4e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.290697  normal  0.0540863 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0246  Aldose 1-epimerase  33.21 
 
 		 292 aa  142  6e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0595936  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0645  Aldose 1-epimerase  31.02 
 
 		 313 aa  142  7e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.148137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3295  Aldose 1-epimerase protein  32.53 
 
 		 289 aa  142  7e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.498729  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1529  Aldose 1-epimerase  28.82 
 
 		 293 aa  138  1e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1924  Aldose 1-epimerase  34.38 
 
 		 292 aa  136  4e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.532522 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1743  hypothetical protein  29.71 
 
 		 293 aa  135  6.0000000000000005e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.574419  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2653  Aldose 1-epimerase  35.56 
 
 		 292 aa  133  3e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1024  galactose mutarotase-like protein  29.31 
 
 		 298 aa  133  3.9999999999999996e-30  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.353327  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2057  aldose 1-epimerase  28.05 
 
 		 305 aa  84.7  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.107394  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3963  aldose 1-epimerase  27.31 
 
 		 286 aa  81.6  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.87118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3760  Aldose 1-epimerase  25.7 
 
 		 290 aa  80.9  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00879497  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3707  Aldose 1-epimerase  25.7 
 
 		 290 aa  80.9  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0739  Aldose 1-epimerase  25.6 
 
 		 276 aa  79.3  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.220443  normal  0.0861855 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4277  aldose 1-epimerase  25.56 
 
 		 289 aa  76.6  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.436668 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2241  Aldose 1-epimerase  25.7 
 
 		 291 aa  75.1  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.61015 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1638  Aldose 1-epimerase  25.3 
 
 		 292 aa  74.7  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.104568  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1585  hypothetical protein  25.42 
 
 		 312 aa  73.6  0.000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1637  Aldose 1-epimerase  26.92 
 
 		 312 aa  69.3  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12181  normal  0.595367 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1965  Aldose 1-epimerase  24.66 
 
 		 312 aa  67  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.073838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1512  aldose 1-epimerase  27.21 
 
 		 302 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1712  aldose 1-epimerase  27.21 
 
 		 371 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.602147  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1543  aldose 1-epimerase family protein  27.21 
 
 		 302 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.169393  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2702  aldose 1-epimerase  26.39 
 
 		 301 aa  63.2  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.932168 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0837  aldose 1-epimerase  27.45 
 
 		 303 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0568659  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1318  aldose 1-epimerase  27.45 
 
 		 303 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1300  aldose 1-epimerase  27.06 
 
 		 303 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.372594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0761  aldose 1-epimerase  26.46 
 
 		 299 aa  60.8  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0156  hypothetical protein  27.68 
 
 		 284 aa  60.8  0.00000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.42374  normal  0.0793834 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1989  aldose 1-epimerase  26.27 
 
 		 304 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5126  hypothetical protein  35.71 
 
 		 122 aa  57.4  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1661  aldose 1-epimerase  25.11 
 
 		 306 aa  55.1  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.452505 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2751  aldose 1-epimerase  26.07 
 
 		 399 aa  55.1  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1229  aldose 1-epimerase  25.88 
 
 		 303 aa  54.3  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1203  aldose 1-epimerase  26.67 
 
 		 320 aa  54.7  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0900  aldose 1-epimerase  27.2 
 
 		 305 aa  55.1  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0870744 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4461  aldose 1-epimerase  26.67 
 
 		 303 aa  53.5  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.259661  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0295  aldose 1-epimerase family protein  23.63 
 
 		 295 aa  53.1  0.000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1895  aldose 1-epimerase family protein  24.12 
 
 		 306 aa  52  0.00001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1690  hypothetical protein  23.94 
 
 		 284 aa  52  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.400821  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17901  galactose mutarotase-like protein  22.64 
 
 		 284 aa  50.8  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.41246  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0186  hypothetical protein  23.15 
 
 		 282 aa  50.4  0.00003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18071  galactose mutarotase  22.17 
 
 		 284 aa  50.4  0.00004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0044  Aldose 1-epimerase  26.94 
 
 		 311 aa  50.1  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1173  hypothetical protein  27.73 
 
 		 285 aa  50.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20481  galactose mutarotase-like protein  27.73 
 
 		 285 aa  49.3  0.00007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.786913 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3568  hypothetical protein  29.38 
 
 		 330 aa  49.3  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.398485 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2135  aldose 1-epimerase  28.21 
 
 		 305 aa  48.5  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000747241  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17851  galactose mutarotase-like protein  21.7 
 
 		 284 aa  48.5  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.705452  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3405  Aldose 1-epimerase  33.33 
 
 		 353 aa  47.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.237068  normal  0.0908294 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3194  aldose 1-epimerase  31.65 
 
 		 276 aa  48.1  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.382378  normal  0.0888989 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25911  galactose mutarotase  23.04 
 
 		 288 aa  48.1  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0551  putative aldose-1-epimerase  34.62 
 
 		 297 aa  48.1  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.530428  normal  0.44726 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1297  hypothetical protein  26.34 
 
 		 306 aa  47.4  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.114642 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0702  Aldose 1-epimerase  25.9 
 
 		 318 aa  45.8  0.0008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3975  aldose 1-epimerase  25.5 
 
 		 291 aa  45.4  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00305422 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2838  Aldose 1-epimerase  23.64 
 
 		 323 aa  44.3  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0834033 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0102  Aldose 1-epimerase  26.03 
 
 		 356 aa  43.1  0.006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>