125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5592 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5592  Aldose 1-epimerase  100 
 
 		 288 aa  598  1e-170  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0926233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0432  Aldose 1-epimerase  44.76 
 
 		 292 aa  252  4.0000000000000004e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.519948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2550  Aldose 1-epimerase  44.95 
 
 		 289 aa  244  9.999999999999999e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3737  LacX-related protein  43.71 
 
 		 290 aa  232  4.0000000000000004e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1765  putative lacX protein  38.01 
 
 		 290 aa  225  8e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3438  aldose 1-epimerase  41.05 
 
 		 284 aa  224  2e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.406594  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1715  lacX protein, putative  38.01 
 
 		 290 aa  223  4e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.725211  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1512  aldose 1-epimerase  38.36 
 
 		 290 aa  223  4e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3685  putative lacX protein  38.75 
 
 		 290 aa  222  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0766  Aldose 1-epimerase  43.02 
 
 		 287 aa  221  9.999999999999999e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.474909  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1470  lacX protein  38.01 
 
 		 290 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0477051  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2192  galactose mutarotase-like protein  42.71 
 
 		 289 aa  220  1.9999999999999999e-56  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1508  lacX protein  38.01 
 
 		 290 aa  219  3e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0450353  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1480  lacX protein  38.01 
 
 		 290 aa  219  3e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.383068  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1624  lacX protein  38.01 
 
 		 290 aa  219  3e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1660  putative lacX protein  39.1 
 
 		 290 aa  219  3e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1692  putative lacX protein  38.01 
 
 		 290 aa  219  3e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1322  aldose 1-epimerase  39.24 
 
 		 290 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000155463  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4447  Aldose 1-epimerase  42.07 
 
 		 290 aa  219  3.9999999999999997e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.840638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0279  putative aldose 1-epimerase  41.18 
 
 		 291 aa  218  1e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.869642  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0270  galactose mutarotase related enzyme  40.48 
 
 		 291 aa  209  3e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.117354  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1761  Aldose 1-epimerase  37.91 
 
 		 286 aa  207  1e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1357  Aldose 1-epimerase  39.15 
 
 		 288 aa  201  8e-51  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0921  galactose mutarotase-like protein  34.38 
 
 		 295 aa  200  1.9999999999999998e-50  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0180582  hitchhiker  0.00667173 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2535  aldose 1-epimerase  38.13 
 
 		 304 aa  188  1e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1924  Aldose 1-epimerase  37.19 
 
 		 292 aa  182  4.0000000000000006e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.532522 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1177  galactose mutarotase-like protein  36.05 
 
 		 292 aa  182  6e-45  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2443  hypothetical protein  37.01 
 
 		 291 aa  181  1e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0780  aldose 1-epimerase  36.56 
 
 		 292 aa  176  3e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000154006  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0173  galactose mutarotase-like protein  33 
 
 		 294 aa  174  9.999999999999999e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000630537  hitchhiker  0.00000000000000230696 
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D38  galactose mutarotase-like protein  34.68 
 
 		 301 aa  169  7e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1024  galactose mutarotase-like protein  35.25 
 
 		 298 aa  168  1e-40  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.353327  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1927  lacX protein  31.42 
 
 		 298 aa  161  1e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3295  Aldose 1-epimerase protein  32.52 
 
 		 289 aa  157  2e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.498729  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1743  hypothetical protein  31.47 
 
 		 293 aa  157  3e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.574419  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3343  aldose 1-epimerase  33.61 
 
 		 297 aa  155  8e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.233307  normal  0.850547 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6486  Aldose 1-epimerase  31.41 
 
 		 288 aa  151  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1472  Aldose 1-epimerase  30.36 
 
 		 295 aa  150  2e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.355719  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0645  Aldose 1-epimerase  29.93 
 
 		 313 aa  150  2e-35  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.148137  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5996  Aldose 1-epimerase  31.64 
 
 		 289 aa  150  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.648016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1529  Aldose 1-epimerase  30 
 
 		 293 aa  149  5e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3188  aldose 1-epimerase  30.82 
 
 		 292 aa  144  1e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00301236 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2846  Aldose 1-epimerase  32.85 
 
 		 292 aa  142  6e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.985751 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2623  aldose 1-epimerase  32.48 
 
 		 292 aa  139  7e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.187732 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0803  aldose 1-epimerase  29.56 
 
 		 289 aa  133  3e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1883  Aldose 1-epimerase  30.69 
 
 		 331 aa  132  5e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2653  Aldose 1-epimerase  30.66 
 
 		 292 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0246  Aldose 1-epimerase  29.24 
 
 		 292 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0595936  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2069  aldose 1-epimerase  28.21 
 
 		 291 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.290697  normal  0.0540863 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2241  Aldose 1-epimerase  28.57 
 
 		 291 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.61015 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2057  aldose 1-epimerase  28.21 
 
 		 305 aa  99.4  6e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.107394  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3760  Aldose 1-epimerase  31.74 
 
 		 290 aa  96.7  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00879497  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3707  Aldose 1-epimerase  31.74 
 
 		 290 aa  96.7  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1638  Aldose 1-epimerase  27.53 
 
 		 292 aa  90.9  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.104568  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4277  aldose 1-epimerase  25.82 
 
 		 289 aa  90.1  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.436668 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3963  aldose 1-epimerase  26.21 
 
 		 286 aa  89.4  7e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.87118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0739  Aldose 1-epimerase  26.59 
 
 		 276 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.220443  normal  0.0861855 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0761  aldose 1-epimerase  26.84 
 
 		 299 aa  82.8  0.000000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1173  hypothetical protein  28.57 
 
 		 285 aa  80.5  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20481  galactose mutarotase-like protein  28.14 
 
 		 285 aa  80.1  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.786913 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17201  galactose mutarotase-related enzyme  39.81 
 
 		 282 aa  80.1  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.593751  normal  0.935497 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0156  hypothetical protein  27.65 
 
 		 284 aa  79.3  0.00000000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.42374  normal  0.0793834 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25911  galactose mutarotase  26.05 
 
 		 288 aa  79  0.00000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0186  hypothetical protein  26.11 
 
 		 282 aa  75.1  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1965  Aldose 1-epimerase  26.95 
 
 		 312 aa  72  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.073838  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1637  Aldose 1-epimerase  25.59 
 
 		 312 aa  70.5  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12181  normal  0.595367 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0900  aldose 1-epimerase  28.01 
 
 		 305 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0870744 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5039  Aldose 1-epimerase  26.97 
 
 		 312 aa  68.6  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1895  aldose 1-epimerase family protein  24.05 
 
 		 306 aa  67  0.0000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1661  aldose 1-epimerase  25 
 
 		 306 aa  66.6  0.0000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.452505 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1229  aldose 1-epimerase  26.92 
 
 		 303 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1585  hypothetical protein  23.44 
 
 		 312 aa  64.3  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4461  aldose 1-epimerase  26.69 
 
 		 303 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.259661  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1989  aldose 1-epimerase  25.86 
 
 		 304 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0295  aldose 1-epimerase family protein  23.83 
 
 		 295 aa  63.9  0.000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17901  galactose mutarotase-like protein  25.1 
 
 		 284 aa  63.2  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.41246  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2702  aldose 1-epimerase  25.89 
 
 		 301 aa  62.8  0.000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.932168 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1203  aldose 1-epimerase  26.07 
 
 		 320 aa  62  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5126  hypothetical protein  37.35 
 
 		 122 aa  62  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0837  aldose 1-epimerase  26.5 
 
 		 303 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0568659  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1318  aldose 1-epimerase  26.5 
 
 		 303 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18071  galactose mutarotase  24.77 
 
 		 284 aa  60.5  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1297  hypothetical protein  26.69 
 
 		 306 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.114642 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1690  hypothetical protein  24.08 
 
 		 284 aa  58.2  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.400821  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17851  galactose mutarotase-like protein  22.48 
 
 		 284 aa  57.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.705452  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0702  Aldose 1-epimerase  24.22 
 
 		 318 aa  57.8  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1300  aldose 1-epimerase  25.31 
 
 		 303 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.372594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1674  aldose 1-epimerase  22.65 
 
 		 325 aa  56.6  0.0000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.416242  hitchhiker  0.00123529 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0696  Aldose 1-epimerase  25.9 
 
 		 306 aa  55.8  0.0000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00129327 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0559  Aldose 1-epimerase  25.34 
 
 		 262 aa  54.3  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.480763  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2838  Aldose 1-epimerase  27.6 
 
 		 323 aa  54.7  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0834033 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1897  aldose 1-epimerase  24.16 
 
 		 290 aa  53.9  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1512  aldose 1-epimerase  24.36 
 
 		 302 aa  53.9  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0726  Aldose 1-epimerase  24.07 
 
 		 328 aa  53.5  0.000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1543  aldose 1-epimerase family protein  24.36 
 
 		 302 aa  53.5  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.169393  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3194  aldose 1-epimerase  29.2 
 
 		 276 aa  52.8  0.000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.382378  normal  0.0888989 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27460  galactose mutarotase-like enzyme  26.67 
 
 		 334 aa  52.4  0.000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3762  Aldose 1-epimerase  25.9 
 
 		 296 aa  52.4  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.993298  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1712  aldose 1-epimerase  24 
 
 		 371 aa  51.6  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.602147  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3474  Aldose 1-epimerase  24.1 
 
 		 296 aa  52  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.84486 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>