116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3343 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_3343  aldose 1-epimerase  100 
 
 
297 aa  587  1e-167  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.233307  normal  0.850547 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5996  Aldose 1-epimerase  42.25 
 
 
289 aa  236  3e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.648016  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6486  Aldose 1-epimerase  41.81 
 
 
288 aa  233  3e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2443  hypothetical protein  43.25 
 
 
291 aa  222  6e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1761  Aldose 1-epimerase  43.06 
 
 
286 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3295  Aldose 1-epimerase protein  40.99 
 
 
289 aa  213  2.9999999999999995e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.498729  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1924  Aldose 1-epimerase  42.2 
 
 
292 aa  205  7e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.532522 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3438  aldose 1-epimerase  33.71 
 
 
284 aa  187  2e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.406594  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1715  lacX protein, putative  35.64 
 
 
290 aa  178  1e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.725211  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1512  aldose 1-epimerase  34.95 
 
 
290 aa  176  4e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1765  putative lacX protein  35.29 
 
 
290 aa  176  5e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1470  lacX protein  34.27 
 
 
290 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0477051  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1508  lacX protein  34.84 
 
 
290 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0450353  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1480  lacX protein  34.84 
 
 
290 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.383068  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1624  lacX protein  34.84 
 
 
290 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1692  putative lacX protein  34.84 
 
 
290 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1660  putative lacX protein  34.6 
 
 
290 aa  172  9e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3685  putative lacX protein  34.15 
 
 
290 aa  172  9e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4447  Aldose 1-epimerase  34.15 
 
 
290 aa  171  1e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.840638  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1322  aldose 1-epimerase  35.19 
 
 
290 aa  171  1e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000155463  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0279  putative aldose 1-epimerase  31.94 
 
 
291 aa  171  2e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.869642  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0270  galactose mutarotase related enzyme  30.9 
 
 
291 aa  163  4.0000000000000004e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.117354  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3737  LacX-related protein  32.87 
 
 
290 aa  161  1e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0921  galactose mutarotase-like protein  31.6 
 
 
295 aa  157  2e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0180582  hitchhiker  0.00667173 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5592  Aldose 1-epimerase  33.07 
 
 
288 aa  157  3e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0926233  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1883  Aldose 1-epimerase  36.01 
 
 
331 aa  155  6e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2069  aldose 1-epimerase  38.38 
 
 
291 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.290697  normal  0.0540863 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0766  Aldose 1-epimerase  29.26 
 
 
287 aa  152  8e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.474909  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0432  Aldose 1-epimerase  29.66 
 
 
292 aa  152  8e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.519948  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3188  aldose 1-epimerase  35.14 
 
 
292 aa  151  1e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00301236 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1927  lacX protein  29.97 
 
 
298 aa  148  1.0000000000000001e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0780  aldose 1-epimerase  31.96 
 
 
292 aa  147  3e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000154006  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D38  galactose mutarotase-like protein  29.73 
 
 
301 aa  144  2e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2623  aldose 1-epimerase  35.02 
 
 
292 aa  144  2e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.187732 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0246  Aldose 1-epimerase  34.62 
 
 
292 aa  143  4e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0595936  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2550  Aldose 1-epimerase  29.5 
 
 
289 aa  141  9.999999999999999e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0645  Aldose 1-epimerase  32.12 
 
 
313 aa  141  9.999999999999999e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.148137  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2846  Aldose 1-epimerase  34.3 
 
 
292 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.985751 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2653  Aldose 1-epimerase  34.89 
 
 
292 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1743  hypothetical protein  27.61 
 
 
293 aa  139  4.999999999999999e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.574419  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1177  galactose mutarotase-like protein  34.63 
 
 
292 aa  137  2e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1472  Aldose 1-epimerase  33.33 
 
 
295 aa  135  9.999999999999999e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.355719  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2192  galactose mutarotase-like protein  29.66 
 
 
289 aa  134  1.9999999999999998e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2535  aldose 1-epimerase  27.96 
 
 
304 aa  128  1.0000000000000001e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0173  galactose mutarotase-like protein  29.43 
 
 
294 aa  127  3e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000630537  hitchhiker  0.00000000000000230696 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1357  Aldose 1-epimerase  27.34 
 
 
288 aa  125  1e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1024  galactose mutarotase-like protein  26.49 
 
 
298 aa  124  2e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.353327  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0803  aldose 1-epimerase  30.45 
 
 
289 aa  123  3e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1529  Aldose 1-epimerase  31.29 
 
 
293 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2241  Aldose 1-epimerase  29.6 
 
 
291 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.61015 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4277  aldose 1-epimerase  29.39 
 
 
289 aa  102  9e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.436668 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1638  Aldose 1-epimerase  25.9 
 
 
292 aa  92.4  8e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.104568  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2057  aldose 1-epimerase  29.32 
 
 
305 aa  89.7  6e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.107394  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3707  Aldose 1-epimerase  24.9 
 
 
290 aa  89.4  7e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3760  Aldose 1-epimerase  24.9 
 
 
290 aa  89  8e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00879497  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1661  aldose 1-epimerase  31.45 
 
 
306 aa  88.2  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.452505 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3963  aldose 1-epimerase  28.64 
 
 
286 aa  85.9  8e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.87118  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1712  aldose 1-epimerase  31.21 
 
 
371 aa  82  0.000000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.602147  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1512  aldose 1-epimerase  30.62 
 
 
302 aa  82.4  0.000000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0761  aldose 1-epimerase  32.23 
 
 
299 aa  82  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0739  Aldose 1-epimerase  28.69 
 
 
276 aa  81.6  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.220443  normal  0.0861855 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1543  aldose 1-epimerase family protein  30.29 
 
 
302 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.169393  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5126  hypothetical protein  45.68 
 
 
122 aa  80.5  0.00000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1989  aldose 1-epimerase  30.71 
 
 
304 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2751  aldose 1-epimerase  30.62 
 
 
399 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1895  aldose 1-epimerase family protein  24.57 
 
 
306 aa  75.1  0.000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0295  aldose 1-epimerase family protein  24.57 
 
 
295 aa  74.7  0.000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17201  galactose mutarotase-related enzyme  33.33 
 
 
282 aa  73.6  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.593751  normal  0.935497 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1300  aldose 1-epimerase  30.62 
 
 
303 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.372594  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0186  hypothetical protein  40.95 
 
 
282 aa  72.8  0.000000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0156  hypothetical protein  28.8 
 
 
284 aa  70.9  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.42374  normal  0.0793834 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0837  aldose 1-epimerase  29.13 
 
 
303 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0568659  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1318  aldose 1-epimerase  29.13 
 
 
303 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25911  galactose mutarotase  40.38 
 
 
288 aa  68.9  0.00000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2702  aldose 1-epimerase  31.41 
 
 
301 aa  68.9  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.932168 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1229  aldose 1-epimerase  29.13 
 
 
303 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4461  aldose 1-epimerase  30.62 
 
 
303 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.259661  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1203  aldose 1-epimerase  28.8 
 
 
320 aa  67  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20481  galactose mutarotase-like protein  30.07 
 
 
285 aa  65.9  0.0000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.786913 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1173  hypothetical protein  29.37 
 
 
285 aa  64.3  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1690  hypothetical protein  23.04 
 
 
284 aa  63.2  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.400821  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0149  Aldose 1-epimerase  28.66 
 
 
336 aa  63.2  0.000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0125238 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17901  galactose mutarotase-like protein  24.03 
 
 
284 aa  62.8  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.41246  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1297  hypothetical protein  27.8 
 
 
306 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.114642 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18071  galactose mutarotase  24.03 
 
 
284 aa  62.8  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1637  Aldose 1-epimerase  28.82 
 
 
312 aa  62  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12181  normal  0.595367 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1965  Aldose 1-epimerase  29.31 
 
 
312 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.073838  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0900  aldose 1-epimerase  28.62 
 
 
305 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0870744 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1585  hypothetical protein  28.62 
 
 
312 aa  57  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17851  galactose mutarotase-like protein  24.17 
 
 
284 aa  55.8  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.705452  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2838  Aldose 1-epimerase  28.02 
 
 
323 aa  53.1  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0834033 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2660  aldose 1-epimerase  23.92 
 
 
306 aa  52  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0844306  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27460  galactose mutarotase-like enzyme  31.4 
 
 
334 aa  50.1  0.00005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0225  galactose mutarotase  26.92 
 
 
314 aa  49.3  0.00009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00000500571  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2372  aldose 1-epimerase  23.62 
 
 
309 aa  48.1  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2611  aldose 1-epimerase  28.1 
 
 
304 aa  48.1  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.100158  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3303  putative aldose-1-epimerase  29.88 
 
 
297 aa  47.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.575493 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0044  Aldose 1-epimerase  27.34 
 
 
311 aa  47.4  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0726  Aldose 1-epimerase  28.57 
 
 
328 aa  47  0.0004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0559  Aldose 1-epimerase  25.17 
 
 
262 aa  46.6  0.0006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.480763  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>