120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0246 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_0246  Aldose 1-epimerase  100 
 
 		 292 aa  579  1e-164  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0595936  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3188  aldose 1-epimerase  79.31 
 
 		 292 aa  434  1e-121  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00301236 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2623  aldose 1-epimerase  69.52 
 
 		 292 aa  394  1e-109  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.187732 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2069  aldose 1-epimerase  69.76 
 
 		 291 aa  395  1e-109  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.290697  normal  0.0540863 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2846  Aldose 1-epimerase  68.73 
 
 		 292 aa  395  1e-109  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.985751 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2653  Aldose 1-epimerase  70.45 
 
 		 292 aa  380  1e-104  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1883  Aldose 1-epimerase  46.81 
 
 		 331 aa  251  1e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0803  aldose 1-epimerase  41.38 
 
 		 289 aa  216  2e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1761  Aldose 1-epimerase  39.35 
 
 		 286 aa  169  5e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3295  Aldose 1-epimerase protein  37.41 
 
 		 289 aa  169  7e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.498729  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2443  hypothetical protein  40.66 
 
 		 291 aa  168  9e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0279  putative aldose 1-epimerase  30.8 
 
 		 291 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.869642  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6486  Aldose 1-epimerase  35.56 
 
 		 288 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0270  galactose mutarotase related enzyme  29.86 
 
 		 291 aa  163  3e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.117354  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5996  Aldose 1-epimerase  35.59 
 
 		 289 aa  160  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.648016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3438  aldose 1-epimerase  31.16 
 
 		 284 aa  159  6e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.406594  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0766  Aldose 1-epimerase  28.32 
 
 		 287 aa  156  3e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.474909  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3737  LacX-related protein  34.03 
 
 		 290 aa  155  1e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0173  galactose mutarotase-like protein  33.44 
 
 		 294 aa  153  2.9999999999999998e-36  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000630537  hitchhiker  0.00000000000000230696 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1924  Aldose 1-epimerase  38.21 
 
 		 292 aa  150  2e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.532522 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3685  putative lacX protein  31.14 
 
 		 290 aa  146  3e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4447  Aldose 1-epimerase  33.21 
 
 		 290 aa  146  4.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.840638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0432  Aldose 1-epimerase  32.01 
 
 		 292 aa  145  6e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.519948  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1470  lacX protein  31.49 
 
 		 290 aa  144  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0477051  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3343  aldose 1-epimerase  36.86 
 
 		 297 aa  144  2e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.233307  normal  0.850547 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1512  aldose 1-epimerase  31.51 
 
 		 290 aa  144  2e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1715  lacX protein, putative  31.51 
 
 		 290 aa  143  3e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.725211  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1508  lacX protein  31.49 
 
 		 290 aa  143  4e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0450353  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1480  lacX protein  31.49 
 
 		 290 aa  143  4e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.383068  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1624  lacX protein  31.49 
 
 		 290 aa  143  4e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1765  putative lacX protein  31.51 
 
 		 290 aa  143  4e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1692  putative lacX protein  31.49 
 
 		 290 aa  143  4e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1660  putative lacX protein  31.06 
 
 		 290 aa  142  7e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1529  Aldose 1-epimerase  32.65 
 
 		 293 aa  138  1e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2535  aldose 1-epimerase  30.5 
 
 		 304 aa  136  4e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2192  galactose mutarotase-like protein  28 
 
 		 289 aa  135  9.999999999999999e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5592  Aldose 1-epimerase  29.24 
 
 		 288 aa  132  6e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0926233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0921  galactose mutarotase-like protein  29.9 
 
 		 295 aa  130  4.0000000000000003e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0180582  hitchhiker  0.00667173 
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D38  galactose mutarotase-like protein  28.71 
 
 		 301 aa  129  6e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1322  aldose 1-epimerase  30.34 
 
 		 290 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000155463  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0645  Aldose 1-epimerase  31.39 
 
 		 313 aa  127  2.0000000000000002e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.148137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1743  hypothetical protein  27.27 
 
 		 293 aa  126  4.0000000000000003e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.574419  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2550  Aldose 1-epimerase  28.72 
 
 		 289 aa  124  1e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1472  Aldose 1-epimerase  34.7 
 
 		 295 aa  124  1e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.355719  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1927  lacX protein  29.35 
 
 		 298 aa  124  2e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1357  Aldose 1-epimerase  26.55 
 
 		 288 aa  121  9.999999999999999e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1177  galactose mutarotase-like protein  31.7 
 
 		 292 aa  120  3e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0780  aldose 1-epimerase  29.39 
 
 		 292 aa  118  9.999999999999999e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000154006  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1024  galactose mutarotase-like protein  24.52 
 
 		 298 aa  110  4.0000000000000004e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.353327  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0739  Aldose 1-epimerase  37.01 
 
 		 276 aa  86.3  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.220443  normal  0.0861855 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1638  Aldose 1-epimerase  23.88 
 
 		 292 aa  81.6  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.104568  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0156  hypothetical protein  29.69 
 
 		 284 aa  73.6  0.000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.42374  normal  0.0793834 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0186  hypothetical protein  26.16 
 
 		 282 aa  72  0.00000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2241  Aldose 1-epimerase  29.23 
 
 		 291 aa  71.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.61015 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1895  aldose 1-epimerase family protein  24.48 
 
 		 306 aa  70.5  0.00000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0761  aldose 1-epimerase  32.7 
 
 		 299 aa  69.7  0.00000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4277  aldose 1-epimerase  24.32 
 
 		 289 aa  69.7  0.00000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.436668 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0295  aldose 1-epimerase family protein  24.32 
 
 		 295 aa  66.6  0.0000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1173  hypothetical protein  23.98 
 
 		 285 aa  65.1  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1965  Aldose 1-epimerase  28.12 
 
 		 312 aa  65.1  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.073838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20481  galactose mutarotase-like protein  23.98 
 
 		 285 aa  64.7  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.786913 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2702  aldose 1-epimerase  32.73 
 
 		 301 aa  63.9  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.932168 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3707  Aldose 1-epimerase  24.32 
 
 		 290 aa  63.5  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3760  Aldose 1-epimerase  24.83 
 
 		 290 aa  63.5  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00879497  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1637  Aldose 1-epimerase  27.37 
 
 		 312 aa  62.8  0.000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12181  normal  0.595367 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17901  galactose mutarotase-like protein  28.15 
 
 		 284 aa  61.6  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.41246  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1661  aldose 1-epimerase  31.5 
 
 		 306 aa  61.6  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.452505 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2057  aldose 1-epimerase  27.69 
 
 		 305 aa  60.5  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.107394  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25911  galactose mutarotase  25.84 
 
 		 288 aa  60.1  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17201  galactose mutarotase-related enzyme  33.33 
 
 		 282 aa  60.1  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.593751  normal  0.935497 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3963  aldose 1-epimerase  23.83 
 
 		 286 aa  59.7  0.00000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.87118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18071  galactose mutarotase  28.15 
 
 		 284 aa  58.9  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1585  hypothetical protein  27.18 
 
 		 312 aa  58.5  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1203  aldose 1-epimerase  28.04 
 
 		 320 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0900  aldose 1-epimerase  31.33 
 
 		 305 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0870744 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1229  aldose 1-epimerase  28.76 
 
 		 303 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17851  galactose mutarotase-like protein  23.87 
 
 		 284 aa  56.2  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.705452  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1690  hypothetical protein  25.37 
 
 		 284 aa  55.5  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.400821  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1989  aldose 1-epimerase  31.55 
 
 		 304 aa  55.5  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4461  aldose 1-epimerase  27.03 
 
 		 303 aa  54.3  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.259661  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0837  aldose 1-epimerase  27.61 
 
 		 303 aa  53.1  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0568659  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1318  aldose 1-epimerase  27.61 
 
 		 303 aa  53.1  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1712  aldose 1-epimerase  30.25 
 
 		 371 aa  52  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.602147  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1512  aldose 1-epimerase  30.25 
 
 		 302 aa  52  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1543  aldose 1-epimerase family protein  30.25 
 
 		 302 aa  51.6  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.169393  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1300  aldose 1-epimerase  31.52 
 
 		 303 aa  52  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.372594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2076  aldose 1-epimerase  26.11 
 
 		 278 aa  51.6  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2751  aldose 1-epimerase  31.71 
 
 		 399 aa  51.6  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4821  Aldose 1-epimerase  27.45 
 
 		 295 aa  50.4  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2660  aldose 1-epimerase  22.73 
 
 		 306 aa  50.4  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0844306  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85423  hypothetical uncharacterized conserved protein  27.04 
 
 		 302 aa  50.1  0.00005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0569839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5126  hypothetical protein  29.41 
 
 		 122 aa  49.7  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0866  Aldose 1-epimerase  29.94 
 
 		 306 aa  49.7  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.104082  normal  0.0514904 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1897  aldose 1-epimerase  34.17 
 
 		 290 aa  49.7  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1848  putative aldose 1-epimerase  30.26 
 
 		 291 aa  48.9  0.00009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.905542  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5533  Aldose 1-epimerase  31.46 
 
 		 308 aa  48.9  0.00009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3194  aldose 1-epimerase  30.5 
 
 		 276 aa  47.8  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.382378  normal  0.0888989 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1587  hypothetical protein  25.66 
 
 		 296 aa  48.1  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000393399  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0324  Aldose 1-epimerase  26.72 
 
 		 299 aa  47.8  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.296431 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0559  Aldose 1-epimerase  24 
 
 		 262 aa  47.4  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.480763  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>