107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2550 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2550  Aldose 1-epimerase  100 
 
 		 289 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5592  Aldose 1-epimerase  44.95 
 
 		 288 aa  244  9.999999999999999e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0926233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1512  aldose 1-epimerase  41.2 
 
 		 290 aa  240  2e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3685  putative lacX protein  40.85 
 
 		 290 aa  239  4e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1470  lacX protein  40.85 
 
 		 290 aa  238  9e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0477051  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1508  lacX protein  40.85 
 
 		 290 aa  237  1e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0450353  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1480  lacX protein  40.85 
 
 		 290 aa  237  1e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.383068  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1624  lacX protein  40.85 
 
 		 290 aa  237  1e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1692  putative lacX protein  40.85 
 
 		 290 aa  237  1e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1660  putative lacX protein  40.85 
 
 		 290 aa  237  2e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1715  lacX protein, putative  40.14 
 
 		 290 aa  236  4e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.725211  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1765  putative lacX protein  40.49 
 
 		 290 aa  236  4e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3438  aldose 1-epimerase  42.11 
 
 		 284 aa  227  2e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.406594  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1322  aldose 1-epimerase  38.03 
 
 		 290 aa  224  1e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000155463  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0279  putative aldose 1-epimerase  39.38 
 
 		 291 aa  203  3e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.869642  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0270  galactose mutarotase related enzyme  39.38 
 
 		 291 aa  201  9.999999999999999e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.117354  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0921  galactose mutarotase-like protein  34.41 
 
 		 295 aa  200  1.9999999999999998e-50  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0180582  hitchhiker  0.00667173 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3737  LacX-related protein  36.93 
 
 		 290 aa  199  3e-50  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4447  Aldose 1-epimerase  36.52 
 
 		 290 aa  196  4.0000000000000005e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.840638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2192  galactose mutarotase-like protein  36.52 
 
 		 289 aa  194  1e-48  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0432  Aldose 1-epimerase  34.84 
 
 		 292 aa  194  2e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.519948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0766  Aldose 1-epimerase  39.25 
 
 		 287 aa  193  3e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.474909  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0780  aldose 1-epimerase  34.04 
 
 		 292 aa  182  7e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000154006  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1177  galactose mutarotase-like protein  34.92 
 
 		 292 aa  180  2e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1357  Aldose 1-epimerase  37.06 
 
 		 288 aa  173  2.9999999999999996e-42  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2535  aldose 1-epimerase  34.88 
 
 		 304 aa  172  3.9999999999999995e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1924  Aldose 1-epimerase  31.23 
 
 		 292 aa  173  3.9999999999999995e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.532522 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1927  lacX protein  30.85 
 
 		 298 aa  166  4e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D38  galactose mutarotase-like protein  31.31 
 
 		 301 aa  162  7e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1472  Aldose 1-epimerase  29.62 
 
 		 295 aa  161  1e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.355719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1024  galactose mutarotase-like protein  34.01 
 
 		 298 aa  154  1e-36  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.353327  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6486  Aldose 1-epimerase  29.17 
 
 		 288 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1761  Aldose 1-epimerase  31.16 
 
 		 286 aa  152  8.999999999999999e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0173  galactose mutarotase-like protein  31.94 
 
 		 294 aa  150  2e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000630537  hitchhiker  0.00000000000000230696 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0645  Aldose 1-epimerase  32.13 
 
 		 313 aa  150  2e-35  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.148137  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5996  Aldose 1-epimerase  29.35 
 
 		 289 aa  149  7e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.648016  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3295  Aldose 1-epimerase protein  29.71 
 
 		 289 aa  144  1e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.498729  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3343  aldose 1-epimerase  30.34 
 
 		 297 aa  139  6e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.233307  normal  0.850547 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1529  Aldose 1-epimerase  30.14 
 
 		 293 aa  137  2e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1743  hypothetical protein  28.91 
 
 		 293 aa  132  6e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.574419  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2846  Aldose 1-epimerase  30.22 
 
 		 292 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.985751 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2443  hypothetical protein  30.85 
 
 		 291 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2623  aldose 1-epimerase  29.5 
 
 		 292 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.187732 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1883  Aldose 1-epimerase  30.97 
 
 		 331 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0803  aldose 1-epimerase  28.62 
 
 		 289 aa  125  8.000000000000001e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2653  Aldose 1-epimerase  29.56 
 
 		 292 aa  120  3e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0246  Aldose 1-epimerase  28.01 
 
 		 292 aa  119  6e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0595936  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2069  aldose 1-epimerase  29.13 
 
 		 291 aa  115  6e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.290697  normal  0.0540863 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3188  aldose 1-epimerase  28.36 
 
 		 292 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00301236 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3963  aldose 1-epimerase  29.6 
 
 		 286 aa  91.7  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.87118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3707  Aldose 1-epimerase  28.63 
 
 		 290 aa  87.8  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3760  Aldose 1-epimerase  28.63 
 
 		 290 aa  87.8  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00879497  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1638  Aldose 1-epimerase  27.66 
 
 		 292 aa  87  4e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.104568  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2241  Aldose 1-epimerase  27.27 
 
 		 291 aa  86.3  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.61015 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0739  Aldose 1-epimerase  25.74 
 
 		 276 aa  80.1  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.220443  normal  0.0861855 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4277  aldose 1-epimerase  30.19 
 
 		 289 aa  77.4  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.436668 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2057  aldose 1-epimerase  25.85 
 
 		 305 aa  77  0.0000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.107394  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1637  Aldose 1-epimerase  26.25 
 
 		 312 aa  75.5  0.0000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12181  normal  0.595367 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0186  hypothetical protein  27.73 
 
 		 282 aa  75.1  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1585  hypothetical protein  23.86 
 
 		 312 aa  72.8  0.000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25911  galactose mutarotase  26.32 
 
 		 288 aa  72.4  0.000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1895  aldose 1-epimerase family protein  24.66 
 
 		 306 aa  72  0.00000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17201  galactose mutarotase-related enzyme  39.22 
 
 		 282 aa  71.6  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.593751  normal  0.935497 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0295  aldose 1-epimerase family protein  24.66 
 
 		 295 aa  71.6  0.00000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0156  hypothetical protein  28.57 
 
 		 284 aa  70.9  0.00000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.42374  normal  0.0793834 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1965  Aldose 1-epimerase  26.64 
 
 		 312 aa  70.5  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.073838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1173  hypothetical protein  35.14 
 
 		 285 aa  63.2  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20481  galactose mutarotase-like protein  35.14 
 
 		 285 aa  62.4  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.786913 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17851  galactose mutarotase-like protein  29.55 
 
 		 284 aa  61.6  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.705452  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1297  hypothetical protein  26.19 
 
 		 306 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.114642 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17901  galactose mutarotase-like protein  25.12 
 
 		 284 aa  58.9  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.41246  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1712  aldose 1-epimerase  23.77 
 
 		 371 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.602147  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1512  aldose 1-epimerase  23.77 
 
 		 302 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1543  aldose 1-epimerase family protein  23.77 
 
 		 302 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.169393  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0559  Aldose 1-epimerase  25.45 
 
 		 262 aa  57  0.0000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.480763  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1661  aldose 1-epimerase  23.6 
 
 		 306 aa  56.2  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.452505 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18071  galactose mutarotase  25.59 
 
 		 284 aa  55.8  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2660  aldose 1-epimerase  24.8 
 
 		 306 aa  55.8  0.0000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0844306  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1989  aldose 1-epimerase  25 
 
 		 304 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1690  hypothetical protein  27.98 
 
 		 284 aa  54.3  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.400821  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2751  aldose 1-epimerase  23.57 
 
 		 399 aa  54.7  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2702  aldose 1-epimerase  23.81 
 
 		 301 aa  54.7  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.932168 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1300  aldose 1-epimerase  25.1 
 
 		 303 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.372594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0761  aldose 1-epimerase  22.83 
 
 		 299 aa  53.9  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0837  aldose 1-epimerase  24.7 
 
 		 303 aa  53.9  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0568659  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1318  aldose 1-epimerase  24.7 
 
 		 303 aa  53.9  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0900  aldose 1-epimerase  26.32 
 
 		 305 aa  53.9  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0870744 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1674  aldose 1-epimerase  22.98 
 
 		 325 aa  53.1  0.000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.416242  hitchhiker  0.00123529 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0226  galactose mutarotase  23.64 
 
 		 318 aa  52.4  0.000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00706113  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4461  aldose 1-epimerase  25.7 
 
 		 303 aa  51.6  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.259661  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1203  aldose 1-epimerase  24.29 
 
 		 320 aa  50.8  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3194  aldose 1-epimerase  36.36 
 
 		 276 aa  50.8  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.382378  normal  0.0888989 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1229  aldose 1-epimerase  24.29 
 
 		 303 aa  51.2  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1897  aldose 1-epimerase  26.39 
 
 		 290 aa  51.6  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2135  aldose 1-epimerase  30 
 
 		 305 aa  50.8  0.00003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000747241  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5126  hypothetical protein  35.85 
 
 		 122 aa  49.7  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2838  Aldose 1-epimerase  24.44 
 
 		 323 aa  49.3  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0834033 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1127  aldose 1-epimerase  22.07 
 
 		 269 aa  47.8  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0176464  normal  0.584187 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1458  aldose 1-epimerase  28.37 
 
 		 263 aa  47.4  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3975  aldose 1-epimerase  26.57 
 
 		 291 aa  45.8  0.0009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00305422 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>