197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0226 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_0226  galactose mutarotase  100 
 
 
318 aa  660    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00706113  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0225  galactose mutarotase  53.04 
 
 
314 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00000500571  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2489  Aldose 1-epimerase  40.98 
 
 
308 aa  228  9e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1225  Aldose 1-epimerase  37.79 
 
 
302 aa  205  1e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2454  aldose 1-epimerase  38.08 
 
 
307 aa  179  4.999999999999999e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1278  Aldose 1-epimerase  33.98 
 
 
307 aa  164  2.0000000000000002e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.265427  normal  0.286232 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1674  aldose 1-epimerase  35.31 
 
 
325 aa  159  6e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.416242  hitchhiker  0.00123529 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1836  Aldose 1-epimerase  32.89 
 
 
315 aa  155  7e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2997  Aldose 1-epimerase  35.2 
 
 
302 aa  155  1e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0040024 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2432  aldose 1-epimerase  34.11 
 
 
301 aa  149  6e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0573284  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2182  Aldose 1-epimerase  32.01 
 
 
299 aa  148  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000157648 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4435  Aldose 1-epimerase  33.11 
 
 
303 aa  147  3e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.340797 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0866  Aldose 1-epimerase  33 
 
 
306 aa  146  6e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.104082  normal  0.0514904 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1163  aldose 1-epimerase  33.22 
 
 
323 aa  144  2e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.887027  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0514  aldose 1-epimerase  31.33 
 
 
327 aa  142  7e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.165305  decreased coverage  0.000622322 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2973  Aldose 1-epimerase  32.45 
 
 
303 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000377273  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8681  Aldose 1-epimerase  30.69 
 
 
303 aa  140  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.626175  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0426  aldose 1-epimerase  30.72 
 
 
308 aa  139  6e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12920  galactose mutarotase-like enzyme  32.57 
 
 
321 aa  137  2e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0901551  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1235  Aldose 1-epimerase  32.69 
 
 
319 aa  135  8e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000417318 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1897  aldose 1-epimerase  33.33 
 
 
290 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05040  galactose mutarotase-like enzyme  31.35 
 
 
323 aa  134  1.9999999999999998e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.556037  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3398  aldose 1-epimerase  31.54 
 
 
294 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.226465  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1019  Aldose 1-epimerase  28.62 
 
 
299 aa  130  3e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.584137  hitchhiker  0.000443551 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3303  putative aldose-1-epimerase  32.11 
 
 
297 aa  129  7.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.575493 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1267  Aldose 1-epimerase  32.39 
 
 
301 aa  123  4e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.560353  hitchhiker  0.00115827 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1522  Aldose 1-epimerase  28.67 
 
 
293 aa  120  3.9999999999999996e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0044  Aldose 1-epimerase  28.66 
 
 
311 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1083  putative aldose-1-epimerase  31.44 
 
 
305 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.145719  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33650  galactose mutarotase-like enzyme  30.92 
 
 
318 aa  119  7e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4402  aldose-1-epimerase family protein  30.9 
 
 
300 aa  119  7.999999999999999e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0854  Aldose 1-epimerase  29.9 
 
 
300 aa  117  1.9999999999999998e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0393175  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03764  predicted aldose-1-epimerase  30.43 
 
 
308 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4107  Aldose 1-epimerase  30.43 
 
 
308 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5326  aldose-1-epimerase family protein  30.56 
 
 
300 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.6155 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03713  hypothetical protein  30.43 
 
 
308 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4297  aldose-1-epimerase family protein  28.1 
 
 
295 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4343  aldose-1-epimerase family protein  28.1 
 
 
295 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4252  aldose-1-epimerase family protein  28.1 
 
 
295 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4264  aldose-1-epimerase family protein  29.93 
 
 
299 aa  110  3e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0523  Aldose 1-epimerase  29.49 
 
 
290 aa  103  5e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4408  aldose-1-epimerase family protein  27.36 
 
 
280 aa  98.6  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4230  aldose-1-epimerase family protein  26.06 
 
 
280 aa  97.4  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3046  Aldose 1-epimerase  26.38 
 
 
345 aa  96.3  6e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.813423  normal  0.148483 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5039  Aldose 1-epimerase  27.9 
 
 
312 aa  89.7  5e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0702  Aldose 1-epimerase  26.41 
 
 
318 aa  85.5  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0950  Aldose 1-epimerase  32.26 
 
 
311 aa  84  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0322782 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1015  Aldose 1-epimerase  31.52 
 
 
311 aa  79  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1458  aldose 1-epimerase  26.87 
 
 
263 aa  76.3  0.0000000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0559  Aldose 1-epimerase  24.49 
 
 
262 aa  75.1  0.000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.480763  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1083  hypothetical protein  35.29 
 
 
323 aa  72.4  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000316766  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1127  aldose 1-epimerase  24.57 
 
 
269 aa  72  0.00000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0176464  normal  0.584187 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0656  aldose-1-epimerase  26.52 
 
 
314 aa  69.7  0.00000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.629793  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002663  aldose 1-epimerase  27.69 
 
 
354 aa  67.4  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3707  Aldose 1-epimerase  24.09 
 
 
290 aa  67  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3760  Aldose 1-epimerase  24.09 
 
 
290 aa  67  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00879497  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0628  aldose 1-epimerase  27.89 
 
 
282 aa  65.1  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.48408  normal  0.247972 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0726  Aldose 1-epimerase  25.81 
 
 
328 aa  63.9  0.000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0324  Aldose 1-epimerase  23.9 
 
 
299 aa  63.9  0.000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.296431 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0383  Aldose 1-epimerase  26.42 
 
 
302 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3409  aldose 1-epimerase  28.4 
 
 
343 aa  62.8  0.000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0646401 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0149  Aldose 1-epimerase  29.38 
 
 
336 aa  62.4  0.000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0125238 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0593  aldose 1-epimerase  27.37 
 
 
353 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.112152 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27460  galactose mutarotase-like enzyme  26.19 
 
 
334 aa  62  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0142  aldose 1-epimerase  27.37 
 
 
353 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0543  aldose 1-epimerase  25.14 
 
 
343 aa  62  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.386929 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6330  aldose 1-epimerase  28.52 
 
 
362 aa  62  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0625  aldose 1-epimerase  27.37 
 
 
353 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.417593  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6030  aldose 1-epimerase  33.75 
 
 
362 aa  62  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.808799  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4277  aldose 1-epimerase  23.28 
 
 
289 aa  61.2  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.436668 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3479  aldose 1-epimerase  29.01 
 
 
357 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.329911  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2820  Aldose 1-epimerase  26.01 
 
 
380 aa  61.2  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2660  aldose 1-epimerase  24.1 
 
 
306 aa  61.6  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0844306  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2057  aldose 1-epimerase  23.43 
 
 
305 aa  60.8  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.107394  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0651  aldose 1-epimerase  29.38 
 
 
343 aa  60.5  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.225141  hitchhiker  0.000000283833 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0550  aldose 1-epimerase  26.84 
 
 
353 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0177374  normal  0.655719 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4205  aldose 1-epimerase  30.05 
 
 
362 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.613008  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1930  Aldose 1-epimerase  26.72 
 
 
316 aa  60.1  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.263285  normal  0.479856 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2482  hypothetical protein  28.57 
 
 
357 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283645  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0402  hypothetical protein  28.57 
 
 
357 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.827093  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3444  aldose 1-epimerase family protein  28.57 
 
 
357 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.381459  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3482  aldose 1-epimerase family protein  28.57 
 
 
357 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3303  hypothetical protein  28.57 
 
 
357 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0526  aldose 1-epimerase  27.37 
 
 
353 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6331  aldose 1-epimerase  33.12 
 
 
362 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1262  hypothetical protein  28.57 
 
 
344 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1357  Aldose 1-epimerase  27.06 
 
 
288 aa  59.3  0.00000009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2760  aldose 1-epimerase  25.32 
 
 
353 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.385741 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0693  aldose 1-epimerase  27.97 
 
 
343 aa  58.5  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1183  aldose 1-epimerase  29.11 
 
 
357 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1048  aldose 1-epimerase  23.17 
 
 
297 aa  58.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3669  aldose 1-epimerase  28.57 
 
 
344 aa  57.8  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6508  aldose 1-epimerase  32.5 
 
 
362 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2610  aldose 1-epimerase  26.9 
 
 
352 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.169817 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6742  aldose 1-epimerase  32.5 
 
 
362 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112366  normal  0.547611 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1325  aldose 1-epimerase  28.63 
 
 
387 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105451  normal  0.426674 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2178  Aldose 1-epimerase  27.56 
 
 
329 aa  57.8  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3579  aldose 1-epimerase  27.57 
 
 
343 aa  57  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.496972 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5648  Aldose 1-epimerase  28.5 
 
 
327 aa  56.6  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1269  Aldose 1-epimerase  25.39 
 
 
414 aa  56.6  0.0000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0872441  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>