124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1661 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_1661  aldose 1-epimerase  100 
 
 
306 aa  627  1e-179  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.452505 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2702  aldose 1-epimerase  38.33 
 
 
301 aa  188  1e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.932168 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0761  aldose 1-epimerase  37.2 
 
 
299 aa  172  5e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0837  aldose 1-epimerase  36.07 
 
 
303 aa  169  4e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0568659  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1318  aldose 1-epimerase  36.07 
 
 
303 aa  169  4e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1300  aldose 1-epimerase  35.76 
 
 
303 aa  165  8e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.372594  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1989  aldose 1-epimerase  36.3 
 
 
304 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0900  aldose 1-epimerase  33.77 
 
 
305 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0870744 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1965  Aldose 1-epimerase  36.52 
 
 
312 aa  162  9e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.073838  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4461  aldose 1-epimerase  34.75 
 
 
303 aa  161  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.259661  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1543  aldose 1-epimerase family protein  35.74 
 
 
302 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.169393  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1512  aldose 1-epimerase  35.74 
 
 
302 aa  160  3e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1712  aldose 1-epimerase  35.4 
 
 
371 aa  159  4e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.602147  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2751  aldose 1-epimerase  35.74 
 
 
399 aa  159  5e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1585  hypothetical protein  35.53 
 
 
312 aa  158  9e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1229  aldose 1-epimerase  34.44 
 
 
303 aa  158  9e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1203  aldose 1-epimerase  34.44 
 
 
320 aa  158  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1637  Aldose 1-epimerase  35.15 
 
 
312 aa  149  5e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12181  normal  0.595367 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1297  hypothetical protein  33.77 
 
 
306 aa  149  7e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.114642 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2838  Aldose 1-epimerase  34 
 
 
323 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0834033 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1715  lacX protein, putative  25.33 
 
 
290 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.725211  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3343  aldose 1-epimerase  31.45 
 
 
297 aa  87.8  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.233307  normal  0.850547 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1765  putative lacX protein  26.98 
 
 
290 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3685  putative lacX protein  26.59 
 
 
290 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1470  lacX protein  26.59 
 
 
290 aa  86.3  5e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0477051  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1660  putative lacX protein  25.17 
 
 
290 aa  86.3  6e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0739  Aldose 1-epimerase  25.35 
 
 
276 aa  86.3  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.220443  normal  0.0861855 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1508  lacX protein  26.59 
 
 
290 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0450353  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1480  lacX protein  26.59 
 
 
290 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.383068  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1624  lacX protein  26.59 
 
 
290 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1512  aldose 1-epimerase  26.59 
 
 
290 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1692  putative lacX protein  26.59 
 
 
290 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1638  Aldose 1-epimerase  25 
 
 
292 aa  84  0.000000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.104568  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0921  galactose mutarotase-like protein  26.53 
 
 
295 aa  83.2  0.000000000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0180582  hitchhiker  0.00667173 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1322  aldose 1-epimerase  24.75 
 
 
290 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000155463  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0766  Aldose 1-epimerase  23.92 
 
 
287 aa  81.3  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.474909  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0270  galactose mutarotase related enzyme  25.69 
 
 
291 aa  81.3  0.00000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.117354  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1895  aldose 1-epimerase family protein  26.59 
 
 
306 aa  81.3  0.00000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3963  aldose 1-epimerase  25.52 
 
 
286 aa  80.1  0.00000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.87118  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0295  aldose 1-epimerase family protein  27.06 
 
 
295 aa  79.7  0.00000000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0279  putative aldose 1-epimerase  26.15 
 
 
291 aa  79  0.0000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.869642  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0156  hypothetical protein  28.41 
 
 
284 aa  76.6  0.0000000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.42374  normal  0.0793834 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3707  Aldose 1-epimerase  24.57 
 
 
290 aa  75.9  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3760  Aldose 1-epimerase  24.57 
 
 
290 aa  75.9  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00879497  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3737  LacX-related protein  26.24 
 
 
290 aa  74.3  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2057  aldose 1-epimerase  23.05 
 
 
305 aa  74.3  0.000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.107394  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2535  aldose 1-epimerase  26.58 
 
 
304 aa  73.6  0.000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D38  galactose mutarotase-like protein  27.03 
 
 
301 aa  73.2  0.000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17851  galactose mutarotase-like protein  24.14 
 
 
284 aa  72.4  0.000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.705452  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0173  galactose mutarotase-like protein  24.91 
 
 
294 aa  71.6  0.00000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000630537  hitchhiker  0.00000000000000230696 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18071  galactose mutarotase  23.36 
 
 
284 aa  72.4  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17901  galactose mutarotase-like protein  23.66 
 
 
284 aa  72  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.41246  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17201  galactose mutarotase-related enzyme  25.76 
 
 
282 aa  72  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.593751  normal  0.935497 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1761  Aldose 1-epimerase  30.31 
 
 
286 aa  71.6  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2241  Aldose 1-epimerase  24.38 
 
 
291 aa  71.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.61015 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1690  hypothetical protein  22.9 
 
 
284 aa  71.2  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.400821  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0780  aldose 1-epimerase  25.66 
 
 
292 aa  71.2  0.00000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000154006  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2623  aldose 1-epimerase  28.57 
 
 
292 aa  69.7  0.00000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.187732 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3438  aldose 1-epimerase  24.91 
 
 
284 aa  68.2  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.406594  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2846  Aldose 1-epimerase  28.14 
 
 
292 aa  67  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.985751 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2443  hypothetical protein  28.83 
 
 
291 aa  67  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5592  Aldose 1-epimerase  25 
 
 
288 aa  66.6  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0926233  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5996  Aldose 1-epimerase  27.19 
 
 
289 aa  66.6  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.648016  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6486  Aldose 1-epimerase  26.84 
 
 
288 aa  66.6  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1924  Aldose 1-epimerase  29.26 
 
 
292 aa  65.5  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.532522 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1743  hypothetical protein  23.28 
 
 
293 aa  65.1  0.000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.574419  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2040  Aldose 1-epimerase  26.38 
 
 
282 aa  64.7  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.439926  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0186  hypothetical protein  28.67 
 
 
282 aa  63.9  0.000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4277  aldose 1-epimerase  23.26 
 
 
289 aa  63.5  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.436668 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1357  Aldose 1-epimerase  22.07 
 
 
288 aa  62.8  0.000000007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0702  Aldose 1-epimerase  26.03 
 
 
318 aa  62.4  0.000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1927  lacX protein  22.35 
 
 
298 aa  62  0.00000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1173  hypothetical protein  25 
 
 
285 aa  60.8  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20481  galactose mutarotase-like protein  24.62 
 
 
285 aa  59.7  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.786913 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2069  aldose 1-epimerase  29.65 
 
 
291 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.290697  normal  0.0540863 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2192  galactose mutarotase-like protein  23.37 
 
 
289 aa  57.8  0.0000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0559  Aldose 1-epimerase  21.86 
 
 
262 aa  57  0.0000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.480763  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2550  Aldose 1-epimerase  23.6 
 
 
289 aa  56.2  0.0000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0866  Aldose 1-epimerase  31.79 
 
 
306 aa  56.2  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.104082  normal  0.0514904 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4447  Aldose 1-epimerase  25.11 
 
 
290 aa  55.1  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.840638  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1472  Aldose 1-epimerase  24.39 
 
 
295 aa  54.7  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.355719  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1024  galactose mutarotase-like protein  23.11 
 
 
298 aa  55.1  0.000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.353327  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0246  Aldose 1-epimerase  30.5 
 
 
292 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0595936  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2733  aldose 1-epimerase  22.7 
 
 
281 aa  53.9  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.616833  normal  0.530659 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25911  galactose mutarotase  26.75 
 
 
288 aa  53.9  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85423  hypothetical uncharacterized conserved protein  23.64 
 
 
302 aa  53.9  0.000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0569839  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2178  Aldose 1-epimerase  24.73 
 
 
329 aa  53.5  0.000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0432  Aldose 1-epimerase  22.03 
 
 
292 aa  53.5  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.519948  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27460  galactose mutarotase-like enzyme  28.87 
 
 
334 aa  53.1  0.000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0726  Aldose 1-epimerase  26.24 
 
 
328 aa  52.8  0.000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3295  Aldose 1-epimerase protein  29.06 
 
 
289 aa  52  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.498729  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4821  Aldose 1-epimerase  26.79 
 
 
295 aa  51.6  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1046  aldose 1-epimerase  28.4 
 
 
287 aa  51.2  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3188  aldose 1-epimerase  29.59 
 
 
292 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00301236 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2653  Aldose 1-epimerase  29.21 
 
 
292 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_39942  predicted protein  24.54 
 
 
301 aa  51.6  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3975  aldose 1-epimerase  26.85 
 
 
291 aa  50.4  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00305422 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32562  predicted protein  25 
 
 
450 aa  50.4  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.170002  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1458  aldose 1-epimerase  25.49 
 
 
263 aa  50.4  0.00004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5240  aldose 1-epimerase  26.63 
 
 
298 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.39186  normal  0.120069 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>