256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0726 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_0726  Aldose 1-epimerase  100 
 
 
328 aa  671    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27460  galactose mutarotase-like enzyme  52.13 
 
 
334 aa  336  2.9999999999999997e-91  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1278  Aldose 1-epimerase  31.43 
 
 
307 aa  113  5e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.265427  normal  0.286232 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2454  aldose 1-epimerase  33.07 
 
 
307 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2489  Aldose 1-epimerase  31.23 
 
 
308 aa  111  2.0000000000000002e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1267  Aldose 1-epimerase  31.76 
 
 
301 aa  110  4.0000000000000004e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.560353  hitchhiker  0.00115827 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0426  aldose 1-epimerase  29.43 
 
 
308 aa  105  1e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0514  aldose 1-epimerase  29.84 
 
 
327 aa  99.8  6e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.165305  decreased coverage  0.000622322 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3046  Aldose 1-epimerase  27.86 
 
 
345 aa  99  9e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.813423  normal  0.148483 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8681  Aldose 1-epimerase  33.07 
 
 
303 aa  99  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.626175  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1225  Aldose 1-epimerase  32.29 
 
 
302 aa  97.4  3e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4435  Aldose 1-epimerase  32.04 
 
 
303 aa  95.9  8e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.340797 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1019  Aldose 1-epimerase  28.86 
 
 
299 aa  92.4  9e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.584137  hitchhiker  0.000443551 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1836  Aldose 1-epimerase  31.43 
 
 
315 aa  91.3  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0656  aldose-1-epimerase  29.12 
 
 
314 aa  90.9  3e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.629793  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3303  putative aldose-1-epimerase  29.39 
 
 
297 aa  90.1  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.575493 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5039  Aldose 1-epimerase  29.36 
 
 
312 aa  89  9e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0044  Aldose 1-epimerase  27.65 
 
 
311 aa  89  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1674  aldose 1-epimerase  31.73 
 
 
325 aa  87.8  2e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.416242  hitchhiker  0.00123529 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3398  aldose 1-epimerase  28.87 
 
 
294 aa  87.8  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.226465  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1235  Aldose 1-epimerase  33.05 
 
 
319 aa  87  4e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000417318 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2432  aldose 1-epimerase  32.3 
 
 
301 aa  86.7  5e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0573284  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2182  Aldose 1-epimerase  30.99 
 
 
299 aa  85.9  8e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000157648 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12920  galactose mutarotase-like enzyme  31.15 
 
 
321 aa  85.1  0.000000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0901551  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2997  Aldose 1-epimerase  31.62 
 
 
302 aa  84  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0040024 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0866  Aldose 1-epimerase  28.74 
 
 
306 aa  80.9  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.104082  normal  0.0514904 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1127  aldose 1-epimerase  31.35 
 
 
269 aa  80.1  0.00000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0176464  normal  0.584187 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0702  Aldose 1-epimerase  29.83 
 
 
318 aa  79.3  0.00000000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1163  aldose 1-epimerase  30.83 
 
 
323 aa  78.2  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.887027  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05040  galactose mutarotase-like enzyme  31.95 
 
 
323 aa  73.2  0.000000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.556037  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3707  Aldose 1-epimerase  24.53 
 
 
290 aa  72.8  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3760  Aldose 1-epimerase  24.53 
 
 
290 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00879497  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2973  Aldose 1-epimerase  29.17 
 
 
303 aa  72  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000377273  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0523  Aldose 1-epimerase  27.49 
 
 
290 aa  72.4  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0559  Aldose 1-epimerase  22.66 
 
 
262 aa  70.1  0.00000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.480763  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1930  Aldose 1-epimerase  25.08 
 
 
316 aa  68.9  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.263285  normal  0.479856 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4230  aldose-1-epimerase family protein  27.59 
 
 
280 aa  68.9  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4408  aldose-1-epimerase family protein  27.59 
 
 
280 aa  68.9  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0225  galactose mutarotase  27.49 
 
 
314 aa  68.6  0.0000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00000500571  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1083  putative aldose-1-epimerase  29.41 
 
 
305 aa  68.6  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.145719  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2241  Aldose 1-epimerase  28.35 
 
 
291 aa  67.4  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.61015 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33650  galactose mutarotase-like enzyme  28.24 
 
 
318 aa  67.8  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0451  aldose 1-epimerase  25 
 
 
336 aa  67  0.0000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.486981  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1897  aldose 1-epimerase  27.24 
 
 
290 aa  67  0.0000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1431  Aldose 1-epimerase  27.51 
 
 
354 aa  65.5  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3640  Aldose 1-epimerase  28.57 
 
 
356 aa  64.7  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0854  Aldose 1-epimerase  29.14 
 
 
300 aa  65.1  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0393175  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2057  aldose 1-epimerase  26.6 
 
 
305 aa  64.3  0.000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.107394  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1522  Aldose 1-epimerase  34.07 
 
 
293 aa  63.9  0.000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0655  aldose 1-epimerase  26.28 
 
 
356 aa  63.2  0.000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0630  aldose 1-epimerase  26.28 
 
 
356 aa  63.2  0.000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6635  Aldose 1-epimerase  28.9 
 
 
361 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.779767  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4402  aldose-1-epimerase family protein  24.14 
 
 
300 aa  62.8  0.000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0859  aldose 1-epimerase  25.51 
 
 
346 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0241581  normal  0.840205 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4343  aldose-1-epimerase family protein  27.73 
 
 
295 aa  62  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4297  aldose-1-epimerase family protein  27.73 
 
 
295 aa  62  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1247  aldose 1-epimerase  25.66 
 
 
346 aa  62.4  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.942743  normal  0.442353 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1458  aldose 1-epimerase  25.99 
 
 
263 aa  62  0.00000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4252  aldose-1-epimerase family protein  27.73 
 
 
295 aa  62  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2886  galactose mutarotase  27.56 
 
 
346 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5369  aldose 1-epimerase  28.32 
 
 
387 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0783  aldose 1-epimerase  27.56 
 
 
346 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.328342  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0779  aldose 1-epimerase  27.56 
 
 
346 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.184805  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2906  aldose 1-epimerase  27.56 
 
 
346 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.336239 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0810  aldose 1-epimerase  27.56 
 
 
346 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1585  Aldose 1-epimerase  27.12 
 
 
305 aa  61.2  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.92898  normal  0.309256 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85423  hypothetical uncharacterized conserved protein  31.38 
 
 
302 aa  61.6  0.00000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0569839  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0677  aldose 1-epimerase  27.56 
 
 
346 aa  61.6  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.569185  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03764  predicted aldose-1-epimerase  25.1 
 
 
308 aa  60.8  0.00000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4107  Aldose 1-epimerase  25.1 
 
 
308 aa  60.8  0.00000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03713  hypothetical protein  25.1 
 
 
308 aa  60.8  0.00000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3011  Aldose 1-epimerase  25.62 
 
 
400 aa  60.8  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.415447  hitchhiker  0.00870507 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0173  galactose mutarotase-like protein  30 
 
 
294 aa  60.8  0.00000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000630537  hitchhiker  0.00000000000000230696 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3438  aldose 1-epimerase  27.21 
 
 
284 aa  60.8  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.406594  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1743  hypothetical protein  22.76 
 
 
293 aa  60.1  0.00000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.574419  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4264  aldose-1-epimerase family protein  24.79 
 
 
299 aa  59.7  0.00000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1309  Aldose 1-epimerase  24.24 
 
 
319 aa  59.7  0.00000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0694346 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4277  aldose 1-epimerase  24.85 
 
 
289 aa  58.9  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.436668 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0226  galactose mutarotase  25.81 
 
 
318 aa  58.9  0.0000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00706113  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5326  aldose-1-epimerase family protein  24.28 
 
 
300 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.6155 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3963  aldose 1-epimerase  24.61 
 
 
286 aa  58.9  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.87118  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17851  galactose mutarotase-like protein  25.82 
 
 
284 aa  58.9  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.705452  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0295  aldose 1-epimerase family protein  27.21 
 
 
295 aa  58.2  0.0000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2624  aldose 1-epimerase  25.98 
 
 
371 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.240433 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0696  Aldose 1-epimerase  24.39 
 
 
306 aa  58.2  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00129327 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0279  putative aldose 1-epimerase  24.24 
 
 
291 aa  58.2  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.869642  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1895  aldose 1-epimerase family protein  27.06 
 
 
306 aa  58.2  0.0000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1083  hypothetical protein  28.06 
 
 
323 aa  57.4  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000316766  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4205  aldose 1-epimerase  29.08 
 
 
362 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.613008  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1182  aldose 1-epimerase  22.87 
 
 
356 aa  57.4  0.0000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4072  Aldose 1-epimerase  28.64 
 
 
360 aa  57.4  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4184  Aldose 1-epimerase  28.64 
 
 
360 aa  57.4  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7038  aldose 1-epimerase  26.91 
 
 
387 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.754242  normal  0.230743 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0921  galactose mutarotase-like protein  24.59 
 
 
295 aa  56.2  0.0000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0180582  hitchhiker  0.00667173 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1269  Aldose 1-epimerase  31.55 
 
 
414 aa  56.2  0.0000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0872441  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0868  aldose 1-epimerase  27.75 
 
 
346 aa  55.8  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.558575  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3737  LacX-related protein  28.06 
 
 
290 aa  55.8  0.0000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0900  aldose 1-epimerase  27.75 
 
 
346 aa  55.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1457  aldose 1-epimerase  25.58 
 
 
387 aa  55.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.808924  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6330  aldose 1-epimerase  29.08 
 
 
362 aa  55.5  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>