158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0279 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0279  putative aldose 1-epimerase  100 
 
 		 291 aa  594  1e-169  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.869642  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0270  galactose mutarotase related enzyme  97.59 
 
 		 291 aa  580  1.0000000000000001e-165  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.117354  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3685  putative lacX protein  44.83 
 
 		 290 aa  268  5e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1512  aldose 1-epimerase  44.14 
 
 		 290 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1322  aldose 1-epimerase  43.94 
 
 		 290 aa  265  8e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000155463  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1470  lacX protein  44.14 
 
 		 290 aa  265  8.999999999999999e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0477051  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1508  lacX protein  44.14 
 
 		 290 aa  264  1e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0450353  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1480  lacX protein  44.14 
 
 		 290 aa  264  1e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.383068  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1692  putative lacX protein  44.14 
 
 		 290 aa  264  1e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1624  lacX protein  44.14 
 
 		 290 aa  264  1e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1715  lacX protein, putative  43.45 
 
 		 290 aa  264  2e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.725211  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1765  putative lacX protein  43.79 
 
 		 290 aa  263  2e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1660  putative lacX protein  43.45 
 
 		 290 aa  262  4.999999999999999e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0766  Aldose 1-epimerase  43.32 
 
 		 287 aa  234  1.0000000000000001e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.474909  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4447  Aldose 1-epimerase  40.83 
 
 		 290 aa  231  8.000000000000001e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.840638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0432  Aldose 1-epimerase  39.59 
 
 		 292 aa  229  5e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.519948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3438  aldose 1-epimerase  43.21 
 
 		 284 aa  229  5e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.406594  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3737  LacX-related protein  41.3 
 
 		 290 aa  223  2e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2192  galactose mutarotase-like protein  39.58 
 
 		 289 aa  220  1.9999999999999999e-56  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5592  Aldose 1-epimerase  41.18 
 
 		 288 aa  218  1e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0926233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0921  galactose mutarotase-like protein  36.86 
 
 		 295 aa  207  2e-52  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0180582  hitchhiker  0.00667173 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2550  Aldose 1-epimerase  39.38 
 
 		 289 aa  203  3e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1357  Aldose 1-epimerase  39.24 
 
 		 288 aa  192  6e-48  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2535  aldose 1-epimerase  37.33 
 
 		 304 aa  190  2.9999999999999997e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1177  galactose mutarotase-like protein  36.73 
 
 		 292 aa  187  2e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1927  lacX protein  35.45 
 
 		 298 aa  186  5e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D38  galactose mutarotase-like protein  34.92 
 
 		 301 aa  179  5.999999999999999e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5996  Aldose 1-epimerase  32.4 
 
 		 289 aa  176  4e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.648016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0780  aldose 1-epimerase  34.8 
 
 		 292 aa  171  1e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000154006  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6486  Aldose 1-epimerase  32.73 
 
 		 288 aa  171  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2623  aldose 1-epimerase  33.45 
 
 		 292 aa  170  2e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.187732 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3295  Aldose 1-epimerase protein  31.91 
 
 		 289 aa  170  3e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.498729  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3343  aldose 1-epimerase  32.85 
 
 		 297 aa  167  1e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.233307  normal  0.850547 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2846  Aldose 1-epimerase  33.45 
 
 		 292 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.985751 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3188  aldose 1-epimerase  32.95 
 
 		 292 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00301236 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1024  galactose mutarotase-like protein  33.78 
 
 		 298 aa  164  2.0000000000000002e-39  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.353327  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1761  Aldose 1-epimerase  32.64 
 
 		 286 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0645  Aldose 1-epimerase  31.25 
 
 		 313 aa  162  9e-39  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.148137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0246  Aldose 1-epimerase  30.8 
 
 		 292 aa  161  1e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0595936  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1529  Aldose 1-epimerase  29.12 
 
 		 293 aa  159  4e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2443  hypothetical protein  33.22 
 
 		 291 aa  158  9e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0173  galactose mutarotase-like protein  30.51 
 
 		 294 aa  157  2e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000630537  hitchhiker  0.00000000000000230696 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1924  Aldose 1-epimerase  30.21 
 
 		 292 aa  157  2e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.532522 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2069  aldose 1-epimerase  30.6 
 
 		 291 aa  157  2e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.290697  normal  0.0540863 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0803  aldose 1-epimerase  31.41 
 
 		 289 aa  157  3e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1883  Aldose 1-epimerase  30.6 
 
 		 331 aa  156  4e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2653  Aldose 1-epimerase  32.05 
 
 		 292 aa  153  4e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1472  Aldose 1-epimerase  28.42 
 
 		 295 aa  152  5.9999999999999996e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.355719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1743  hypothetical protein  34.35 
 
 		 293 aa  140  3e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.574419  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4277  aldose 1-epimerase  30.52 
 
 		 289 aa  96.3  5e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.436668 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3963  aldose 1-epimerase  32.87 
 
 		 286 aa  91.3  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.87118  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2057  aldose 1-epimerase  31.48 
 
 		 305 aa  89.4  7e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.107394  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1638  Aldose 1-epimerase  32.26 
 
 		 292 aa  88.6  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.104568  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0739  Aldose 1-epimerase  29.86 
 
 		 276 aa  80.5  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.220443  normal  0.0861855 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1661  aldose 1-epimerase  26.15 
 
 		 306 aa  79  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.452505 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3707  Aldose 1-epimerase  30.05 
 
 		 290 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3760  Aldose 1-epimerase  30.05 
 
 		 290 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00879497  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2241  Aldose 1-epimerase  29.44 
 
 		 291 aa  73.6  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.61015 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0186  hypothetical protein  35.64 
 
 		 282 aa  70.9  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0156  hypothetical protein  25.6 
 
 		 284 aa  70.1  0.00000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.42374  normal  0.0793834 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1965  Aldose 1-epimerase  23.22 
 
 		 312 aa  69.7  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.073838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2702  aldose 1-epimerase  26.47 
 
 		 301 aa  69.3  0.00000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.932168 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1895  aldose 1-epimerase family protein  23.53 
 
 		 306 aa  67.4  0.0000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0295  aldose 1-epimerase family protein  23.53 
 
 		 295 aa  67.8  0.0000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0559  Aldose 1-epimerase  31.01 
 
 		 262 aa  65.1  0.000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.480763  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0761  aldose 1-epimerase  21.97 
 
 		 299 aa  65.1  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1637  Aldose 1-epimerase  23.6 
 
 		 312 aa  65.1  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12181  normal  0.595367 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2751  aldose 1-epimerase  25.99 
 
 		 399 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2489  Aldose 1-epimerase  27.59 
 
 		 308 aa  63.5  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1512  aldose 1-epimerase  24.32 
 
 		 302 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17201  galactose mutarotase-related enzyme  35.29 
 
 		 282 aa  63.2  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.593751  normal  0.935497 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1543  aldose 1-epimerase family protein  24.32 
 
 		 302 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.169393  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18071  galactose mutarotase  28.83 
 
 		 284 aa  62  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1585  hypothetical protein  23.22 
 
 		 312 aa  61.6  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1712  aldose 1-epimerase  23.94 
 
 		 371 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.602147  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1897  aldose 1-epimerase  18.37 
 
 		 290 aa  60.1  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17901  galactose mutarotase-like protein  28.38 
 
 		 284 aa  60.1  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.41246  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0900  aldose 1-epimerase  23.83 
 
 		 305 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0870744 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5126  hypothetical protein  33.65 
 
 		 122 aa  59.7  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1690  hypothetical protein  28.89 
 
 		 284 aa  59.3  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.400821  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1173  hypothetical protein  36.63 
 
 		 285 aa  58.9  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0702  Aldose 1-epimerase  21.71 
 
 		 318 aa  58.9  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20481  galactose mutarotase-like protein  36.63 
 
 		 285 aa  58.2  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.786913 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4343  aldose-1-epimerase family protein  29.46 
 
 		 295 aa  57.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4297  aldose-1-epimerase family protein  29.46 
 
 		 295 aa  57.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0726  Aldose 1-epimerase  24.24 
 
 		 328 aa  58.2  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4252  aldose-1-epimerase family protein  29.46 
 
 		 295 aa  57.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4264  aldose-1-epimerase family protein  27.13 
 
 		 299 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17851  galactose mutarotase-like protein  27.93 
 
 		 284 aa  55.8  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.705452  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25911  galactose mutarotase  32.04 
 
 		 288 aa  55.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4402  aldose-1-epimerase family protein  25.18 
 
 		 300 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1848  putative aldose 1-epimerase  27.63 
 
 		 291 aa  53.9  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.905542  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27460  galactose mutarotase-like enzyme  24.82 
 
 		 334 aa  54.3  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2454  aldose 1-epimerase  28.3 
 
 		 307 aa  53.1  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5326  aldose-1-epimerase family protein  26.4 
 
 		 300 aa  52.8  0.000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.6155 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1300  aldose 1-epimerase  23.55 
 
 		 303 aa  52.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.372594  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03764  predicted aldose-1-epimerase  26.4 
 
 		 308 aa  52.8  0.000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4107  Aldose 1-epimerase  26.4 
 
 		 308 aa  52.8  0.000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03713  hypothetical protein  26.4 
 
 		 308 aa  52.8  0.000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0523  Aldose 1-epimerase  25.47 
 
 		 290 aa  52  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>