177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0523 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0523  Aldose 1-epimerase  100 
 
 		 290 aa  577  1e-164  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33650  galactose mutarotase-like enzyme  53.08 
 
 		 318 aa  300  2e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1235  Aldose 1-epimerase  44.64 
 
 		 319 aa  221  9.999999999999999e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000417318 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1163  aldose 1-epimerase  39.45 
 
 		 323 aa  189  5.999999999999999e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.887027  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0854  Aldose 1-epimerase  39.73 
 
 		 300 aa  186  4e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0393175  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8681  Aldose 1-epimerase  39.73 
 
 		 303 aa  182  5.0000000000000004e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.626175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2432  aldose 1-epimerase  38.44 
 
 		 301 aa  181  1e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0573284  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0514  aldose 1-epimerase  39.93 
 
 		 327 aa  179  4e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.165305  decreased coverage  0.000622322 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05040  galactose mutarotase-like enzyme  39.25 
 
 		 323 aa  179  4.999999999999999e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.556037  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1267  Aldose 1-epimerase  40.21 
 
 		 301 aa  179  5.999999999999999e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.560353  hitchhiker  0.00115827 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0426  aldose 1-epimerase  38.91 
 
 		 308 aa  177  1e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2489  Aldose 1-epimerase  40.34 
 
 		 308 aa  177  2e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2454  aldose 1-epimerase  38.74 
 
 		 307 aa  177  2e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3398  aldose 1-epimerase  42.4 
 
 		 294 aa  177  2e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.226465  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1019  Aldose 1-epimerase  38.57 
 
 		 299 aa  174  9.999999999999999e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.584137  hitchhiker  0.000443551 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1836  Aldose 1-epimerase  39.18 
 
 		 315 aa  171  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2973  Aldose 1-epimerase  38.91 
 
 		 303 aa  167  2e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000377273  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2997  Aldose 1-epimerase  37.8 
 
 		 302 aa  163  3e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0040024 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0866  Aldose 1-epimerase  38.46 
 
 		 306 aa  162  9e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.104082  normal  0.0514904 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1225  Aldose 1-epimerase  40.83 
 
 		 302 aa  161  1e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2182  Aldose 1-epimerase  37.07 
 
 		 299 aa  157  2e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000157648 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4435  Aldose 1-epimerase  38.41 
 
 		 303 aa  154  1e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.340797 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1083  putative aldose-1-epimerase  36.64 
 
 		 305 aa  151  1e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.145719  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1278  Aldose 1-epimerase  39.02 
 
 		 307 aa  150  2e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.265427  normal  0.286232 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12920  galactose mutarotase-like enzyme  36.82 
 
 		 321 aa  148  1.0000000000000001e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0901551  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4402  aldose-1-epimerase family protein  33.45 
 
 		 300 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3303  putative aldose-1-epimerase  34.11 
 
 		 297 aa  145  7.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.575493 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5326  aldose-1-epimerase family protein  33.33 
 
 		 300 aa  145  8.000000000000001e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.6155 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03764  predicted aldose-1-epimerase  33.45 
 
 		 308 aa  145  1e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4107  Aldose 1-epimerase  33.45 
 
 		 308 aa  145  1e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03713  hypothetical protein  33.45 
 
 		 308 aa  145  1e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4264  aldose-1-epimerase family protein  33.21 
 
 		 299 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1674  aldose 1-epimerase  36.07 
 
 		 325 aa  136  5e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.416242  hitchhiker  0.00123529 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0044  Aldose 1-epimerase  35.59 
 
 		 311 aa  135  6.0000000000000005e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4343  aldose-1-epimerase family protein  33.22 
 
 		 295 aa  135  8e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4252  aldose-1-epimerase family protein  33.22 
 
 		 295 aa  135  8e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4297  aldose-1-epimerase family protein  33.22 
 
 		 295 aa  135  8e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1897  aldose 1-epimerase  36.11 
 
 		 290 aa  132  7.999999999999999e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1522  Aldose 1-epimerase  34.47 
 
 		 293 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4230  aldose-1-epimerase family protein  32.86 
 
 		 280 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4408  aldose-1-epimerase family protein  32.5 
 
 		 280 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0225  galactose mutarotase  32.08 
 
 		 314 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00000500571  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0559  Aldose 1-epimerase  29.27 
 
 		 262 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.480763  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0226  galactose mutarotase  29.05 
 
 		 318 aa  105  1e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00706113  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1127  aldose 1-epimerase  28.37 
 
 		 269 aa  97.1  3e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0176464  normal  0.584187 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3046  Aldose 1-epimerase  29.5 
 
 		 345 aa  96.7  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.813423  normal  0.148483 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0702  Aldose 1-epimerase  28.62 
 
 		 318 aa  92.8  6e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0149  Aldose 1-epimerase  31.35 
 
 		 336 aa  90.1  3e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0125238 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1930  Aldose 1-epimerase  26.85 
 
 		 316 aa  86.3  6e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.263285  normal  0.479856 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1458  aldose 1-epimerase  28.03 
 
 		 263 aa  85.5  0.000000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1585  Aldose 1-epimerase  30.19 
 
 		 305 aa  82.8  0.000000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.92898  normal  0.309256 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2660  aldose 1-epimerase  24.5 
 
 		 306 aa  80.5  0.00000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0844306  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0656  aldose-1-epimerase  27.41 
 
 		 314 aa  78.2  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.629793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5039  Aldose 1-epimerase  27.13 
 
 		 312 aa  77  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0726  Aldose 1-epimerase  27.49 
 
 		 328 aa  75.9  0.0000000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27460  galactose mutarotase-like enzyme  28.47 
 
 		 334 aa  74.7  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0696  Aldose 1-epimerase  29.84 
 
 		 306 aa  70.9  0.00000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00129327 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1015  Aldose 1-epimerase  29.25 
 
 		 311 aa  69.7  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6249  Aldose 1-epimerase  33.01 
 
 		 296 aa  67.4  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.783578 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5831  aldose 1-epimerase  26.94 
 
 		 293 aa  67  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0718685  normal  0.204267 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6331  aldose 1-epimerase  29.96 
 
 		 362 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3479  aldose 1-epimerase  29.53 
 
 		 357 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.329911  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3444  aldose 1-epimerase family protein  29.53 
 
 		 357 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.381459  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3482  aldose 1-epimerase family protein  29.53 
 
 		 357 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0402  hypothetical protein  29.53 
 
 		 357 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.827093  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1262  hypothetical protein  29.53 
 
 		 344 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3303  hypothetical protein  29.53 
 
 		 357 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2482  hypothetical protein  29.53 
 
 		 357 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283645  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0324  Aldose 1-epimerase  28.4 
 
 		 299 aa  65.9  0.0000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.296431 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02436  hypothetical protein  26.01 
 
 		 290 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1124  Aldose 1-epimerase  26.01 
 
 		 290 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1183  aldose 1-epimerase  29.92 
 
 		 357 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2696  aldose 1-epimerase family protein  26.01 
 
 		 290 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2829  aldose 1-epimerase family protein  26.01 
 
 		 290 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3776  aldose 1-epimerase family protein  25.51 
 
 		 290 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02400  hypothetical protein  26.01 
 
 		 290 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2336  aldose 1-epimerase  30.26 
 
 		 376 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.360362  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6508  aldose 1-epimerase  29.52 
 
 		 362 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6742  aldose 1-epimerase  29.52 
 
 		 362 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112366  normal  0.547611 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2178  Aldose 1-epimerase  28.62 
 
 		 329 aa  64.3  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6330  aldose 1-epimerase  27.04 
 
 		 362 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0950  Aldose 1-epimerase  29.13 
 
 		 311 aa  63.2  0.000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0322782 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4184  Aldose 1-epimerase  28.83 
 
 		 360 aa  62.8  0.000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4072  Aldose 1-epimerase  28.83 
 
 		 360 aa  62.8  0.000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3762  Aldose 1-epimerase  25.09 
 
 		 296 aa  62.4  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.993298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3438  aldose 1-epimerase  28.19 
 
 		 284 aa  60.8  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.406594  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4205  aldose 1-epimerase  28.31 
 
 		 362 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.613008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1503  Aldose 1-epimerase  27.67 
 
 		 317 aa  60.8  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.72169 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1133  aldose 1-epimerase  25.34 
 
 		 290 aa  60.5  0.00000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6030  aldose 1-epimerase  25.93 
 
 		 362 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.808799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2697  aldose 1-epimerase family protein  25.67 
 
 		 290 aa  60.5  0.00000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6635  Aldose 1-epimerase  31.76 
 
 		 361 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.779767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2023  aldose 1-epimerase  27.02 
 
 		 298 aa  58.5  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0550  aldose 1-epimerase  32.04 
 
 		 353 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0177374  normal  0.655719 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4277  aldose 1-epimerase  24.08 
 
 		 289 aa  56.6  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.436668 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0526  aldose 1-epimerase  32.04 
 
 		 353 aa  57  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3707  aldose 1-epimerase  32.04 
 
 		 353 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.405661  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0739  Aldose 1-epimerase  26.83 
 
 		 276 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.220443  normal  0.0861855 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2760  aldose 1-epimerase  32.04 
 
 		 353 aa  55.5  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.385741 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2057  aldose 1-epimerase  26.46 
 
 		 305 aa  55.5  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.107394  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>