125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_1133 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010468  EcolC_1133  aldose 1-epimerase  100 
 
 		 290 aa  605  9.999999999999999e-173  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02436  hypothetical protein  98.28 
 
 		 290 aa  593  1e-168  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1124  Aldose 1-epimerase  98.28 
 
 		 290 aa  593  1e-168  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2696  aldose 1-epimerase family protein  98.28 
 
 		 290 aa  593  1e-168  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2829  aldose 1-epimerase family protein  98.28 
 
 		 290 aa  593  1e-168  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3776  aldose 1-epimerase family protein  97.93 
 
 		 290 aa  592  1e-168  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02400  hypothetical protein  98.28 
 
 		 290 aa  593  1e-168  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2697  aldose 1-epimerase family protein  95.52 
 
 		 290 aa  579  1e-164  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4225  aldose 1-epimerase  50.17 
 
 		 295 aa  295  5e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.387725  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6249  Aldose 1-epimerase  43.69 
 
 		 296 aa  251  7e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.783578 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3762  Aldose 1-epimerase  37.29 
 
 		 296 aa  181  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.993298  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3474  Aldose 1-epimerase  37.02 
 
 		 296 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.84486 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1183  aldose 1-epimerase  35.12 
 
 		 357 aa  160  2e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3479  aldose 1-epimerase  35.45 
 
 		 357 aa  157  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.329911  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2482  hypothetical protein  35.12 
 
 		 357 aa  156  4e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283645  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1262  hypothetical protein  35.12 
 
 		 344 aa  156  4e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3444  aldose 1-epimerase family protein  35.12 
 
 		 357 aa  156  4e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.381459  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3482  aldose 1-epimerase family protein  35.12 
 
 		 357 aa  156  4e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0402  hypothetical protein  35.12 
 
 		 357 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.827093  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3303  hypothetical protein  35.12 
 
 		 357 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2760  aldose 1-epimerase  33.45 
 
 		 353 aa  149  7e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.385741 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0896  aldose 1-epimerase  33.33 
 
 		 293 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.320638 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0551  putative aldose-1-epimerase  32.76 
 
 		 297 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.530428  normal  0.44726 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2610  aldose 1-epimerase  32.09 
 
 		 352 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.169817 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0550  aldose 1-epimerase  32.32 
 
 		 353 aa  145  6e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0177374  normal  0.655719 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0142  aldose 1-epimerase  32.32 
 
 		 353 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0625  aldose 1-epimerase  32.32 
 
 		 353 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.417593  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3405  Aldose 1-epimerase  31.89 
 
 		 353 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.237068  normal  0.0908294 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0526  aldose 1-epimerase  32.32 
 
 		 353 aa  145  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5831  aldose 1-epimerase  33.11 
 
 		 293 aa  145  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0718685  normal  0.204267 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0593  aldose 1-epimerase  32.32 
 
 		 353 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.112152 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1047  hypothetical protein  31.86 
 
 		 293 aa  137  1e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0628  aldose 1-epimerase  33.58 
 
 		 282 aa  137  1e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.48408  normal  0.247972 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3707  aldose 1-epimerase  32.32 
 
 		 353 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.405661  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0912  aldose 1-epimerase  33.07 
 
 		 295 aa  130  2.0000000000000002e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3306  aldose 1-epimerase  32.21 
 
 		 291 aa  128  8.000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2993  Aldose 1-epimerase  31.88 
 
 		 294 aa  126  3e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.778062  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2754  hypothetical protein  30.9 
 
 		 296 aa  126  5e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.494847  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2583  Aldose 1-epimerase  31.65 
 
 		 294 aa  126  5e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2260  aldose 1-epimerase  30.71 
 
 		 356 aa  121  9.999999999999999e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00420753  unclonable  0.0000000181907 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1183  aldose 1-epimerase  32.8 
 
 		 305 aa  119  6e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.101584  normal  0.174259 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1585  Aldose 1-epimerase  28.85 
 
 		 305 aa  118  9.999999999999999e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.92898  normal  0.309256 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2372  aldose 1-epimerase  27 
 
 		 309 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0383  Aldose 1-epimerase  29.13 
 
 		 302 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1199  aldose 1-epimerase  30.33 
 
 		 289 aa  112  9e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.938894 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1015  Aldose 1-epimerase  29.77 
 
 		 311 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1165  aldose 1-epimerase  29.92 
 
 		 289 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0252324 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4246  aldose 1-epimerase  28.79 
 
 		 289 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0324  Aldose 1-epimerase  29.96 
 
 		 299 aa  109  4.0000000000000004e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.296431 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4338  hypothetical protein  29.09 
 
 		 310 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2029  aldose 1-epimerase  30.45 
 
 		 311 aa  108  7.000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.99913  normal  0.429541 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0950  Aldose 1-epimerase  28.66 
 
 		 311 aa  108  7.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0322782 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51460  aldose 1-epimerase  31.19 
 
 		 285 aa  107  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1886  aldose 1-epimerase  27.85 
 
 		 382 aa  104  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.369459  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1083  hypothetical protein  27.78 
 
 		 323 aa  97.4  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000316766  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0696  Aldose 1-epimerase  29.23 
 
 		 306 aa  97.1  3e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00129327 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5533  Aldose 1-epimerase  30 
 
 		 308 aa  87.8  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0149  Aldose 1-epimerase  27.21 
 
 		 336 aa  83.2  0.000000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0125238 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1458  aldose 1-epimerase  25.87 
 
 		 263 aa  80.9  0.00000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2023  aldose 1-epimerase  25.55 
 
 		 298 aa  75.9  0.0000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3398  aldose 1-epimerase  24.39 
 
 		 294 aa  74.7  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.226465  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1836  Aldose 1-epimerase  26.28 
 
 		 315 aa  69.7  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0044  Aldose 1-epimerase  32.92 
 
 		 311 aa  66.2  0.0000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4362  aldose 1-epimerase family protein  26.62 
 
 		 295 aa  65.5  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1127  aldose 1-epimerase  24.29 
 
 		 269 aa  63.9  0.000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0176464  normal  0.584187 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4109  aldose 1-epimerase family protein  26.24 
 
 		 295 aa  63.5  0.000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0163943  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4134  aldose 1-epimerase  26.24 
 
 		 295 aa  63.5  0.000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1897  aldose 1-epimerase  25.09 
 
 		 290 aa  63.2  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2432  aldose 1-epimerase  23.67 
 
 		 301 aa  62  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0573284  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8681  Aldose 1-epimerase  26.57 
 
 		 303 aa  62  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.626175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27460  galactose mutarotase-like enzyme  23.31 
 
 		 334 aa  61.6  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0559  Aldose 1-epimerase  23.97 
 
 		 262 aa  61.2  0.00000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.480763  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1674  aldose 1-epimerase  22.48 
 
 		 325 aa  61.2  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.416242  hitchhiker  0.00123529 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1048  aldose 1-epimerase  24.78 
 
 		 297 aa  60.8  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1278  Aldose 1-epimerase  23.51 
 
 		 307 aa  60.5  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.265427  normal  0.286232 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0523  Aldose 1-epimerase  24.92 
 
 		 290 aa  58.9  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2489  Aldose 1-epimerase  26.8 
 
 		 308 aa  55.5  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0702  Aldose 1-epimerase  27.67 
 
 		 318 aa  54.7  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0456  aldose 1-epimerase  25.8 
 
 		 300 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0866  Aldose 1-epimerase  28.46 
 
 		 306 aa  54.3  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.104082  normal  0.0514904 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0656  aldose-1-epimerase  23.48 
 
 		 314 aa  52.8  0.000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.629793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0469  aldose 1-epimerase  25.48 
 
 		 300 aa  52.4  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.799033  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0480  aldose 1-epimerase  25.48 
 
 		 300 aa  52.4  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4264  aldose-1-epimerase family protein  25 
 
 		 299 aa  52.4  0.000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12920  galactose mutarotase-like enzyme  22.18 
 
 		 321 aa  52.4  0.000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0901551  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5326  aldose-1-epimerase family protein  24.69 
 
 		 300 aa  52.4  0.000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.6155 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0173  galactose mutarotase-like protein  29.91 
 
 		 294 aa  52  0.00001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000630537  hitchhiker  0.00000000000000230696 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0426  aldose 1-epimerase  23.23 
 
 		 308 aa  51.6  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1267  Aldose 1-epimerase  23.36 
 
 		 301 aa  50.8  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.560353  hitchhiker  0.00115827 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0726  Aldose 1-epimerase  24.83 
 
 		 328 aa  50.1  0.00005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4402  aldose-1-epimerase family protein  24.37 
 
 		 300 aa  49.7  0.00006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2057  aldose 1-epimerase  22.01 
 
 		 305 aa  49.3  0.00007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.107394  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33650  galactose mutarotase-like enzyme  23.18 
 
 		 318 aa  49.3  0.00007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4408  aldose-1-epimerase family protein  25.42 
 
 		 280 aa  48.9  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2178  Aldose 1-epimerase  23.97 
 
 		 329 aa  48.5  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0739  Aldose 1-epimerase  23.44 
 
 		 276 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.220443  normal  0.0861855 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0514  aldose 1-epimerase  23.41 
 
 		 327 aa  47.8  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.165305  decreased coverage  0.000622322 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0761  aldose 1-epimerase  24.27 
 
 		 299 aa  47.4  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4435  Aldose 1-epimerase  22.73 
 
 		 303 aa  47.4  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.340797 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1930  Aldose 1-epimerase  21.66 
 
 		 316 aa  47.4  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.263285  normal  0.479856 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>