172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0514 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_0514  aldose 1-epimerase  100 
 
 		 327 aa  646    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.165305  decreased coverage  0.000622322 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0426  aldose 1-epimerase  84.09 
 
 		 308 aa  517  1.0000000000000001e-145  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1019  Aldose 1-epimerase  47.99 
 
 		 299 aa  279  5e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.584137  hitchhiker  0.000443551 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2454  aldose 1-epimerase  46.03 
 
 		 307 aa  249  7e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33650  galactose mutarotase-like enzyme  42.19 
 
 		 318 aa  217  2e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3398  aldose 1-epimerase  40.52 
 
 		 294 aa  204  1e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.226465  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2973  Aldose 1-epimerase  40.6 
 
 		 303 aa  204  2e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000377273  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1278  Aldose 1-epimerase  41.25 
 
 		 307 aa  204  2e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.265427  normal  0.286232 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2997  Aldose 1-epimerase  39.33 
 
 		 302 aa  203  4e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0040024 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1225  Aldose 1-epimerase  41.97 
 
 		 302 aa  202  8e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0044  Aldose 1-epimerase  45.55 
 
 		 311 aa  201  9.999999999999999e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8681  Aldose 1-epimerase  39.6 
 
 		 303 aa  197  3e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.626175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2182  Aldose 1-epimerase  38.59 
 
 		 299 aa  194  2e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000157648 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1836  Aldose 1-epimerase  37.5 
 
 		 315 aa  192  7e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4435  Aldose 1-epimerase  37.09 
 
 		 303 aa  191  1e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.340797 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1267  Aldose 1-epimerase  38.46 
 
 		 301 aa  189  5e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.560353  hitchhiker  0.00115827 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2432  aldose 1-epimerase  36.99 
 
 		 301 aa  187  2e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0573284  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2489  Aldose 1-epimerase  39.32 
 
 		 308 aa  185  9e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1083  putative aldose-1-epimerase  39.46 
 
 		 305 aa  181  2e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.145719  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3303  putative aldose-1-epimerase  38 
 
 		 297 aa  181  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.575493 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1674  aldose 1-epimerase  40.6 
 
 		 325 aa  176  4e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.416242  hitchhiker  0.00123529 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1522  Aldose 1-epimerase  36.6 
 
 		 293 aa  172  6.999999999999999e-42  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0523  Aldose 1-epimerase  39.93 
 
 		 290 aa  171  1e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5326  aldose-1-epimerase family protein  32.66 
 
 		 300 aa  171  2e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.6155 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0854  Aldose 1-epimerase  36.96 
 
 		 300 aa  167  2e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0393175  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1897  aldose 1-epimerase  38.7 
 
 		 290 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4402  aldose-1-epimerase family protein  32.32 
 
 		 300 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05040  galactose mutarotase-like enzyme  35.86 
 
 		 323 aa  166  5e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.556037  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03764  predicted aldose-1-epimerase  32.32 
 
 		 308 aa  166  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4107  Aldose 1-epimerase  32.32 
 
 		 308 aa  166  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03713  hypothetical protein  32.32 
 
 		 308 aa  166  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4264  aldose-1-epimerase family protein  33 
 
 		 299 aa  166  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1163  aldose 1-epimerase  35.22 
 
 		 323 aa  162  6e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.887027  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12920  galactose mutarotase-like enzyme  35.55 
 
 		 321 aa  160  3e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0901551  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1235  Aldose 1-epimerase  34.64 
 
 		 319 aa  158  1e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000417318 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0866  Aldose 1-epimerase  36.52 
 
 		 306 aa  156  5.0000000000000005e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.104082  normal  0.0514904 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4252  aldose-1-epimerase family protein  32.17 
 
 		 295 aa  155  9e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4343  aldose-1-epimerase family protein  32.17 
 
 		 295 aa  155  9e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4297  aldose-1-epimerase family protein  32.17 
 
 		 295 aa  155  9e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0225  galactose mutarotase  30.87 
 
 		 314 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00000500571  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4408  aldose-1-epimerase family protein  32.99 
 
 		 280 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4230  aldose-1-epimerase family protein  32.64 
 
 		 280 aa  140  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0226  galactose mutarotase  31 
 
 		 318 aa  138  1e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00706113  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5039  Aldose 1-epimerase  27.41 
 
 		 312 aa  103  5e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0702  Aldose 1-epimerase  31.15 
 
 		 318 aa  101  2e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0726  Aldose 1-epimerase  29.84 
 
 		 328 aa  99.8  6e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3046  Aldose 1-epimerase  28.73 
 
 		 345 aa  93.6  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.813423  normal  0.148483 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1585  Aldose 1-epimerase  31.06 
 
 		 305 aa  92.8  7e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.92898  normal  0.309256 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1127  aldose 1-epimerase  28.03 
 
 		 269 aa  88.6  1e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0176464  normal  0.584187 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0696  Aldose 1-epimerase  29.11 
 
 		 306 aa  89  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00129327 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0149  Aldose 1-epimerase  30.53 
 
 		 336 aa  87.8  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0125238 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27460  galactose mutarotase-like enzyme  28.63 
 
 		 334 aa  86.3  7e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0628  aldose 1-epimerase  31.17 
 
 		 282 aa  80.5  0.00000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.48408  normal  0.247972 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0559  Aldose 1-epimerase  25 
 
 		 262 aa  77  0.0000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.480763  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02261  aldose 1-epimerase  28.34 
 
 		 346 aa  74.3  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0656  aldose-1-epimerase  24.82 
 
 		 314 aa  73.6  0.000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.629793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1458  aldose 1-epimerase  26.46 
 
 		 263 aa  70.5  0.00000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1503  Aldose 1-epimerase  27.07 
 
 		 317 aa  69.3  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.72169 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2660  aldose 1-epimerase  24.01 
 
 		 306 aa  67.4  0.0000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0844306  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2023  aldose 1-epimerase  27.76 
 
 		 298 aa  66.2  0.0000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1886  aldose 1-epimerase  30.86 
 
 		 382 aa  64.7  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.369459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0383  Aldose 1-epimerase  36.11 
 
 		 302 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1083  hypothetical protein  32.33 
 
 		 323 aa  62  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000316766  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1015  Aldose 1-epimerase  29.17 
 
 		 311 aa  62.4  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1930  Aldose 1-epimerase  22.87 
 
 		 316 aa  61.2  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.263285  normal  0.479856 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0456  aldose 1-epimerase  27.5 
 
 		 300 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2372  aldose 1-epimerase  34.71 
 
 		 309 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2178  Aldose 1-epimerase  25.77 
 
 		 329 aa  60.5  0.00000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0950  Aldose 1-epimerase  30 
 
 		 311 aa  60.5  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0322782 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3760  Aldose 1-epimerase  22.48 
 
 		 290 aa  60.1  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00879497  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3707  Aldose 1-epimerase  22.48 
 
 		 290 aa  60.1  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0469  aldose 1-epimerase  27.92 
 
 		 300 aa  59.7  0.00000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.799033  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0480  aldose 1-epimerase  27.92 
 
 		 300 aa  59.7  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6249  Aldose 1-epimerase  24.21 
 
 		 296 aa  59.7  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.783578 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2029  aldose 1-epimerase  29.5 
 
 		 311 aa  59.3  0.00000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.99913  normal  0.429541 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0739  Aldose 1-epimerase  26.7 
 
 		 276 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.220443  normal  0.0861855 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2754  hypothetical protein  33.82 
 
 		 296 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.494847  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4184  Aldose 1-epimerase  24.73 
 
 		 360 aa  56.6  0.0000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4072  Aldose 1-epimerase  24.73 
 
 		 360 aa  56.6  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4338  hypothetical protein  31.48 
 
 		 310 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5533  Aldose 1-epimerase  33.63 
 
 		 308 aa  56.2  0.0000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0474  Aldose 1-epimerase  26.28 
 
 		 383 aa  55.5  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.561665  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2624  aldose 1-epimerase  23.16 
 
 		 371 aa  55.1  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.240433 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3593  Aldose 1-epimerase  24.16 
 
 		 355 aa  54.7  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00379165  hitchhiker  0.0000198106 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3640  Aldose 1-epimerase  30.04 
 
 		 356 aa  54.3  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5648  Aldose 1-epimerase  26.28 
 
 		 327 aa  53.5  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2583  Aldose 1-epimerase  28.22 
 
 		 294 aa  53.5  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4631  aldose 1-epimerase  28.76 
 
 		 361 aa  53.5  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6635  Aldose 1-epimerase  24.16 
 
 		 361 aa  53.5  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.779767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2751  aldose 1-epimerase  27.31 
 
 		 336 aa  53.1  0.000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0324  Aldose 1-epimerase  22.4 
 
 		 299 aa  53.1  0.000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.296431 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4277  aldose 1-epimerase  22.57 
 
 		 289 aa  52.8  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.436668 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1048  aldose 1-epimerase  27.36 
 
 		 297 aa  52  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2260  aldose 1-epimerase  25.15 
 
 		 356 aa  52  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00420753  unclonable  0.0000000181907 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4133  Aldose 1-epimerase  26.11 
 
 		 340 aa  51.6  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.270907 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0173  galactose mutarotase-like protein  27.03 
 
 		 294 aa  51.6  0.00002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000630537  hitchhiker  0.00000000000000230696 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2697  aldose 1-epimerase family protein  25 
 
 		 290 aa  52  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2977  Aldose 1-epimerase  24.15 
 
 		 397 aa  52  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.416586 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2993  Aldose 1-epimerase  27.61 
 
 		 294 aa  51.6  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.778062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2241  Aldose 1-epimerase  21.99 
 
 		 291 aa  50.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.61015 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>