122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_0469 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0469  aldose 1-epimerase  100 
 
 		 300 aa  605  9.999999999999999e-173  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.799033  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0480  aldose 1-epimerase  100 
 
 		 300 aa  605  9.999999999999999e-173  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0456  aldose 1-epimerase  99 
 
 		 300 aa  600  1e-170  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0256  aldose 1-epimerase  60.67 
 
 		 300 aa  366  1e-100  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0100614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0638  aldose 1-epimerase  59 
 
 		 300 aa  345  5e-94  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.221019 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5648  Aldose 1-epimerase  51.76 
 
 		 327 aa  303  2.0000000000000002e-81  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1483  Aldose 1-epimerase  35.71 
 
 		 313 aa  155  8e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0114405  normal  0.21833 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0866  Aldose 1-epimerase  31.06 
 
 		 306 aa  77.8  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.104082  normal  0.0514904 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1019  Aldose 1-epimerase  27.85 
 
 		 299 aa  73.6  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.584137  hitchhiker  0.000443551 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0656  aldose-1-epimerase  24.19 
 
 		 314 aa  71.6  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.629793  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0702  Aldose 1-epimerase  24.41 
 
 		 318 aa  69.7  0.00000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0044  Aldose 1-epimerase  28.94 
 
 		 311 aa  67  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3963  aldose 1-epimerase  21.16 
 
 		 286 aa  66.6  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.87118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2454  aldose 1-epimerase  32.23 
 
 		 307 aa  65.1  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0426  aldose 1-epimerase  28.75 
 
 		 308 aa  65.1  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3046  Aldose 1-epimerase  24.07 
 
 		 345 aa  62.8  0.000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.813423  normal  0.148483 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5039  Aldose 1-epimerase  24.19 
 
 		 312 aa  62  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1674  aldose 1-epimerase  29.48 
 
 		 325 aa  60.5  0.00000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.416242  hitchhiker  0.00123529 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3398  aldose 1-epimerase  26.8 
 
 		 294 aa  60.5  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.226465  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0628  aldose 1-epimerase  26.94 
 
 		 282 aa  60.5  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.48408  normal  0.247972 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2057  aldose 1-epimerase  22.95 
 
 		 305 aa  60.1  0.00000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.107394  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0514  aldose 1-epimerase  27.92 
 
 		 327 aa  59.7  0.00000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.165305  decreased coverage  0.000622322 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0383  Aldose 1-epimerase  24.78 
 
 		 302 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0896  aldose 1-epimerase  25.81 
 
 		 293 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.320638 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4338  hypothetical protein  25.1 
 
 		 310 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4435  Aldose 1-epimerase  26.14 
 
 		 303 aa  57.8  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.340797 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2973  Aldose 1-epimerase  27.92 
 
 		 303 aa  58.2  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000377273  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2241  Aldose 1-epimerase  21.56 
 
 		 291 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.61015 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0142  aldose 1-epimerase  27.6 
 
 		 353 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0625  aldose 1-epimerase  27.6 
 
 		 353 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.417593  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2997  Aldose 1-epimerase  27.92 
 
 		 302 aa  57.4  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0040024 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1585  Aldose 1-epimerase  25.97 
 
 		 305 aa  56.2  0.0000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.92898  normal  0.309256 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0173  galactose mutarotase-like protein  23.42 
 
 		 294 aa  56.2  0.0000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000630537  hitchhiker  0.00000000000000230696 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0696  Aldose 1-epimerase  25.88 
 
 		 306 aa  56.2  0.0000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00129327 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0550  aldose 1-epimerase  27.2 
 
 		 353 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0177374  normal  0.655719 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2482  hypothetical protein  25.09 
 
 		 357 aa  55.5  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283645  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3479  aldose 1-epimerase  25.09 
 
 		 357 aa  55.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.329911  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2489  Aldose 1-epimerase  26.77 
 
 		 308 aa  55.5  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0526  aldose 1-epimerase  27.2 
 
 		 353 aa  55.5  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0402  hypothetical protein  25.09 
 
 		 357 aa  55.5  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.827093  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1262  hypothetical protein  26.17 
 
 		 344 aa  55.5  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3444  aldose 1-epimerase family protein  25.09 
 
 		 357 aa  55.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.381459  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3482  aldose 1-epimerase family protein  25.09 
 
 		 357 aa  55.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3303  hypothetical protein  25.09 
 
 		 357 aa  55.5  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1173  hypothetical protein  22.18 
 
 		 285 aa  55.1  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2372  aldose 1-epimerase  25.51 
 
 		 309 aa  54.7  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20481  galactose mutarotase-like protein  22.18 
 
 		 285 aa  54.3  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.786913 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0593  aldose 1-epimerase  26.8 
 
 		 353 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.112152 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2697  aldose 1-epimerase family protein  26.11 
 
 		 290 aa  53.9  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2760  aldose 1-epimerase  26.8 
 
 		 353 aa  53.1  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.385741 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1930  Aldose 1-epimerase  24.36 
 
 		 316 aa  53.1  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.263285  normal  0.479856 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0156  hypothetical protein  25.27 
 
 		 284 aa  52.4  0.000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.42374  normal  0.0793834 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1133  aldose 1-epimerase  25.48 
 
 		 290 aa  52.4  0.000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02436  hypothetical protein  25.48 
 
 		 290 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1124  Aldose 1-epimerase  25.48 
 
 		 290 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4461  aldose 1-epimerase  27.84 
 
 		 303 aa  52  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.259661  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2696  aldose 1-epimerase family protein  25.48 
 
 		 290 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2829  aldose 1-epimerase family protein  25.48 
 
 		 290 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1229  aldose 1-epimerase  27.34 
 
 		 303 aa  51.6  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3776  aldose 1-epimerase family protein  25.48 
 
 		 290 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0739  Aldose 1-epimerase  22.3 
 
 		 276 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.220443  normal  0.0861855 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02400  hypothetical protein  25.48 
 
 		 290 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33650  galactose mutarotase-like enzyme  27.78 
 
 		 318 aa  51.6  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1183  aldose 1-epimerase  25.39 
 
 		 357 aa  51.6  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1047  hypothetical protein  25.21 
 
 		 293 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4277  aldose 1-epimerase  20.27 
 
 		 289 aa  50.8  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.436668 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3303  putative aldose-1-epimerase  28 
 
 		 297 aa  50.4  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.575493 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1886  aldose 1-epimerase  25.93 
 
 		 382 aa  50.4  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.369459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3707  Aldose 1-epimerase  19.87 
 
 		 290 aa  50.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3760  Aldose 1-epimerase  19.87 
 
 		 290 aa  50.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00879497  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1235  Aldose 1-epimerase  28.16 
 
 		 319 aa  50.4  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000417318 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2660  aldose 1-epimerase  21.37 
 
 		 306 aa  49.7  0.00006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0844306  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51460  aldose 1-epimerase  24.9 
 
 		 285 aa  49.7  0.00006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05040  galactose mutarotase-like enzyme  28.93 
 
 		 323 aa  49.3  0.00008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.556037  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1712  aldose 1-epimerase  25.78 
 
 		 371 aa  49.3  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.602147  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0149  Aldose 1-epimerase  26.2 
 
 		 336 aa  48.9  0.00009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0125238 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3707  aldose 1-epimerase  26.27 
 
 		 353 aa  48.5  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.405661  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1512  aldose 1-epimerase  25.78 
 
 		 302 aa  48.5  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1543  aldose 1-epimerase family protein  25.78 
 
 		 302 aa  48.5  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.169393  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4297  aldose-1-epimerase family protein  24.27 
 
 		 295 aa  48.9  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4343  aldose-1-epimerase family protein  24.27 
 
 		 295 aa  48.9  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4252  aldose-1-epimerase family protein  24.27 
 
 		 295 aa  48.9  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1836  Aldose 1-epimerase  27.66 
 
 		 315 aa  48.1  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25911  galactose mutarotase  23.72 
 
 		 288 aa  47.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0854  Aldose 1-epimerase  24.74 
 
 		 300 aa  47.4  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0393175  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2182  Aldose 1-epimerase  27.68 
 
 		 299 aa  47.8  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000157648 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1203  aldose 1-epimerase  26.95 
 
 		 320 aa  46.6  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8681  Aldose 1-epimerase  25 
 
 		 303 aa  46.2  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.626175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0523  Aldose 1-epimerase  26.77 
 
 		 290 aa  46.2  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3438  aldose 1-epimerase  19.22 
 
 		 284 aa  45.8  0.0008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.406594  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2754  hypothetical protein  25.91 
 
 		 296 aa  45.4  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.494847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12920  galactose mutarotase-like enzyme  27.31 
 
 		 321 aa  45.8  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0901551  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18071  galactose mutarotase  23.72 
 
 		 284 aa  45.4  0.001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17901  galactose mutarotase-like protein  22.5 
 
 		 284 aa  45.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.41246  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17201  galactose mutarotase-related enzyme  21.71 
 
 		 282 aa  45.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.593751  normal  0.935497 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1183  aldose 1-epimerase  24.12 
 
 		 305 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.101584  normal  0.174259 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2583  Aldose 1-epimerase  24.48 
 
 		 294 aa  45.4  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0761  aldose 1-epimerase  24.31 
 
 		 299 aa  44.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0279  putative aldose 1-epimerase  24.79 
 
 		 291 aa  44.3  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.869642  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2432  aldose 1-epimerase  27.48 
 
 		 301 aa  44.3  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0573284  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>