123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1019 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_1019  Aldose 1-epimerase  100 
 
 		 299 aa  601  1.0000000000000001e-171  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.584137  hitchhiker  0.000443551 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0514  aldose 1-epimerase  47.99 
 
 		 327 aa  279  4e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.165305  decreased coverage  0.000622322 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0426  aldose 1-epimerase  46.64 
 
 		 308 aa  267  2e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2454  aldose 1-epimerase  42.67 
 
 		 307 aa  227  2e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3398  aldose 1-epimerase  37.71 
 
 		 294 aa  192  6e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.226465  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2489  Aldose 1-epimerase  37.37 
 
 		 308 aa  191  1e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1278  Aldose 1-epimerase  38.59 
 
 		 307 aa  190  2.9999999999999997e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.265427  normal  0.286232 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8681  Aldose 1-epimerase  36 
 
 		 303 aa  190  2.9999999999999997e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.626175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1267  Aldose 1-epimerase  36.86 
 
 		 301 aa  187  2e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.560353  hitchhiker  0.00115827 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2997  Aldose 1-epimerase  36.54 
 
 		 302 aa  185  7e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0040024 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1225  Aldose 1-epimerase  38.8 
 
 		 302 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1836  Aldose 1-epimerase  36.67 
 
 		 315 aa  183  4.0000000000000006e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2182  Aldose 1-epimerase  36.91 
 
 		 299 aa  178  1e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000157648 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0044  Aldose 1-epimerase  37.41 
 
 		 311 aa  177  2e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2973  Aldose 1-epimerase  34.78 
 
 		 303 aa  177  3e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000377273  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3303  putative aldose-1-epimerase  38 
 
 		 297 aa  176  3e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.575493 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12920  galactose mutarotase-like enzyme  35.23 
 
 		 321 aa  176  5e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0901551  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4435  Aldose 1-epimerase  34.77 
 
 		 303 aa  175  7e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.340797 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4402  aldose-1-epimerase family protein  32.76 
 
 		 300 aa  175  9e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33650  galactose mutarotase-like enzyme  34.56 
 
 		 318 aa  172  5.999999999999999e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5326  aldose-1-epimerase family protein  31.8 
 
 		 300 aa  172  6.999999999999999e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.6155 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03764  predicted aldose-1-epimerase  32.64 
 
 		 308 aa  171  1e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4107  Aldose 1-epimerase  32.64 
 
 		 308 aa  171  1e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03713  hypothetical protein  32.64 
 
 		 308 aa  171  1e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0866  Aldose 1-epimerase  38.28 
 
 		 306 aa  169  4e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.104082  normal  0.0514904 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0523  Aldose 1-epimerase  38.57 
 
 		 290 aa  169  6e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4264  aldose-1-epimerase family protein  33.1 
 
 		 299 aa  167  2e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1674  aldose 1-epimerase  35.27 
 
 		 325 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.416242  hitchhiker  0.00123529 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0854  Aldose 1-epimerase  35.23 
 
 		 300 aa  160  3e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0393175  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1897  aldose 1-epimerase  37.93 
 
 		 290 aa  158  8e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4297  aldose-1-epimerase family protein  33.21 
 
 		 295 aa  158  9e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4343  aldose-1-epimerase family protein  33.21 
 
 		 295 aa  158  9e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4252  aldose-1-epimerase family protein  33.21 
 
 		 295 aa  158  9e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2432  aldose 1-epimerase  33.33 
 
 		 301 aa  158  1e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0573284  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1235  Aldose 1-epimerase  35.57 
 
 		 319 aa  156  3e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000417318 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05040  galactose mutarotase-like enzyme  33.11 
 
 		 323 aa  156  4e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.556037  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4408  aldose-1-epimerase family protein  31.23 
 
 		 280 aa  149  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1083  putative aldose-1-epimerase  35.07 
 
 		 305 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.145719  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4230  aldose-1-epimerase family protein  30.88 
 
 		 280 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1163  aldose 1-epimerase  33 
 
 		 323 aa  147  3e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.887027  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1522  Aldose 1-epimerase  32.2 
 
 		 293 aa  142  6e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0226  galactose mutarotase  28.62 
 
 		 318 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00706113  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0225  galactose mutarotase  26.71 
 
 		 314 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00000500571  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0559  Aldose 1-epimerase  30.15 
 
 		 262 aa  102  6e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.480763  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27460  galactose mutarotase-like enzyme  30.74 
 
 		 334 aa  102  7e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0726  Aldose 1-epimerase  28.86 
 
 		 328 aa  92.4  8e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0656  aldose-1-epimerase  28.29 
 
 		 314 aa  92.4  9e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.629793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3046  Aldose 1-epimerase  26.74 
 
 		 345 aa  91.3  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.813423  normal  0.148483 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5039  Aldose 1-epimerase  24.7 
 
 		 312 aa  85.9  8e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1458  aldose 1-epimerase  27.64 
 
 		 263 aa  85.5  9e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5648  Aldose 1-epimerase  27.55 
 
 		 327 aa  84.7  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1127  aldose 1-epimerase  28.68 
 
 		 269 aa  80.1  0.00000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0176464  normal  0.584187 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0702  Aldose 1-epimerase  29.07 
 
 		 318 aa  77.4  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1585  Aldose 1-epimerase  27.52 
 
 		 305 aa  73.9  0.000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.92898  normal  0.309256 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0149  Aldose 1-epimerase  27.55 
 
 		 336 aa  73.9  0.000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0125238 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0469  aldose 1-epimerase  27.85 
 
 		 300 aa  73.6  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.799033  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0480  aldose 1-epimerase  27.85 
 
 		 300 aa  73.6  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0456  aldose 1-epimerase  27.85 
 
 		 300 aa  73.6  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0628  aldose 1-epimerase  26.81 
 
 		 282 aa  67.4  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.48408  normal  0.247972 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0256  aldose 1-epimerase  26.07 
 
 		 300 aa  65.9  0.0000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0100614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0638  aldose 1-epimerase  25.21 
 
 		 300 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.221019 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0696  Aldose 1-epimerase  25.93 
 
 		 306 aa  64.3  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00129327 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1503  Aldose 1-epimerase  26.14 
 
 		 317 aa  63.9  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.72169 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1930  Aldose 1-epimerase  23.1 
 
 		 316 aa  64.3  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.263285  normal  0.479856 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2023  aldose 1-epimerase  28.57 
 
 		 298 aa  60.8  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2178  Aldose 1-epimerase  23.9 
 
 		 329 aa  57.4  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0739  Aldose 1-epimerase  24.3 
 
 		 276 aa  55.8  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.220443  normal  0.0861855 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0142  aldose 1-epimerase  30.63 
 
 		 353 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0625  aldose 1-epimerase  30.63 
 
 		 353 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.417593  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6249  Aldose 1-epimerase  25.85 
 
 		 296 aa  55.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.783578 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1024  galactose mutarotase-like protein  25.89 
 
 		 298 aa  53.9  0.000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.353327  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3438  aldose 1-epimerase  24.77 
 
 		 284 aa  53.5  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.406594  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0593  aldose 1-epimerase  30.63 
 
 		 353 aa  53.5  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.112152 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0324  Aldose 1-epimerase  24.29 
 
 		 299 aa  53.5  0.000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.296431 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2029  aldose 1-epimerase  24.88 
 
 		 311 aa  52.8  0.000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.99913  normal  0.429541 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3593  Aldose 1-epimerase  23.86 
 
 		 355 aa  52.4  0.000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00379165  hitchhiker  0.0000198106 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0896  aldose 1-epimerase  26.34 
 
 		 293 aa  52  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.320638 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0279  putative aldose 1-epimerase  22.22 
 
 		 291 aa  52  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.869642  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3760  Aldose 1-epimerase  21.74 
 
 		 290 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00879497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0270  galactose mutarotase related enzyme  22.96 
 
 		 291 aa  51.2  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.117354  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3707  Aldose 1-epimerase  20.74 
 
 		 290 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0651  aldose 1-epimerase  23.97 
 
 		 343 aa  50.4  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.225141  hitchhiker  0.000000283833 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002663  aldose 1-epimerase  25.49 
 
 		 354 aa  50.1  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2372  aldose 1-epimerase  30.77 
 
 		 309 aa  49.7  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1886  aldose 1-epimerase  27.61 
 
 		 382 aa  49.7  0.00006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.369459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0383  Aldose 1-epimerase  29.3 
 
 		 302 aa  49.7  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3707  aldose 1-epimerase  29.73 
 
 		 353 aa  49.3  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.405661  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_002950  PG1632  aldose 1-epimerase  27.52 
 
 		 355 aa  48.5  0.0001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1183  aldose 1-epimerase  26.8 
 
 		 357 aa  48.5  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2660  aldose 1-epimerase  18.63 
 
 		 306 aa  48.5  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0844306  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4249  aldose 1-epimerase  24.34 
 
 		 353 aa  48.5  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1047  hypothetical protein  26.26 
 
 		 293 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1048  aldose 1-epimerase  23.51 
 
 		 297 aa  48.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0550  aldose 1-epimerase  27.27 
 
 		 353 aa  48.1  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0177374  normal  0.655719 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02261  aldose 1-epimerase  27.43 
 
 		 346 aa  47.8  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2583  Aldose 1-epimerase  28.31 
 
 		 294 aa  48.1  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2482  hypothetical protein  26.8 
 
 		 357 aa  47.4  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283645  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3479  aldose 1-epimerase  26.8 
 
 		 357 aa  47.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.329911  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0526  aldose 1-epimerase  27.93 
 
 		 353 aa  47.4  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3303  hypothetical protein  26.8 
 
 		 357 aa  47.4  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>