180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0426 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0426  aldose 1-epimerase  100 
 
 		 308 aa  612  9.999999999999999e-175  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0514  aldose 1-epimerase  84.09 
 
 		 327 aa  517  1e-146  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.165305  decreased coverage  0.000622322 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1019  Aldose 1-epimerase  46.64 
 
 		 299 aa  267  2e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.584137  hitchhiker  0.000443551 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2454  aldose 1-epimerase  46.36 
 
 		 307 aa  251  1e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33650  galactose mutarotase-like enzyme  39.53 
 
 		 318 aa  198  7.999999999999999e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3398  aldose 1-epimerase  40.4 
 
 		 294 aa  197  1.0000000000000001e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.226465  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2997  Aldose 1-epimerase  38.33 
 
 		 302 aa  194  1e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0040024 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2182  Aldose 1-epimerase  38.93 
 
 		 299 aa  192  5e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000157648 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2973  Aldose 1-epimerase  38.93 
 
 		 303 aa  191  1e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000377273  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0044  Aldose 1-epimerase  41.78 
 
 		 311 aa  191  2e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1225  Aldose 1-epimerase  39.6 
 
 		 302 aa  190  2.9999999999999997e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8681  Aldose 1-epimerase  38 
 
 		 303 aa  188  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.626175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4435  Aldose 1-epimerase  36.67 
 
 		 303 aa  187  2e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.340797 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1278  Aldose 1-epimerase  37.42 
 
 		 307 aa  184  1.0000000000000001e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.265427  normal  0.286232 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2489  Aldose 1-epimerase  39.32 
 
 		 308 aa  184  2.0000000000000003e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3303  putative aldose-1-epimerase  37.33 
 
 		 297 aa  183  4.0000000000000006e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.575493 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1083  putative aldose-1-epimerase  39.13 
 
 		 305 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.145719  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1836  Aldose 1-epimerase  35.45 
 
 		 315 aa  182  6e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2432  aldose 1-epimerase  36.64 
 
 		 301 aa  180  2.9999999999999997e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0573284  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0854  Aldose 1-epimerase  37.79 
 
 		 300 aa  173  3.9999999999999995e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0393175  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1267  Aldose 1-epimerase  36.03 
 
 		 301 aa  172  7.999999999999999e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.560353  hitchhiker  0.00115827 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0523  Aldose 1-epimerase  38.91 
 
 		 290 aa  170  2e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0866  Aldose 1-epimerase  39.45 
 
 		 306 aa  167  2e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.104082  normal  0.0514904 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1674  aldose 1-epimerase  39.39 
 
 		 325 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.416242  hitchhiker  0.00123529 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5326  aldose-1-epimerase family protein  32.32 
 
 		 300 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.6155 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4402  aldose-1-epimerase family protein  31.99 
 
 		 300 aa  162  7e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1897  aldose 1-epimerase  37.8 
 
 		 290 aa  161  1e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.481432 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03764  predicted aldose-1-epimerase  31.99 
 
 		 308 aa  159  4e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4107  Aldose 1-epimerase  31.99 
 
 		 308 aa  159  4e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03713  hypothetical protein  31.99 
 
 		 308 aa  159  4e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1163  aldose 1-epimerase  34.01 
 
 		 323 aa  155  7e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.887027  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4264  aldose-1-epimerase family protein  31.99 
 
 		 299 aa  155  8e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12920  galactose mutarotase-like enzyme  34.55 
 
 		 321 aa  154  2e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0901551  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1235  Aldose 1-epimerase  34.68 
 
 		 319 aa  153  2.9999999999999998e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000417318 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1522  Aldose 1-epimerase  33.11 
 
 		 293 aa  152  8e-36  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0225  galactose mutarotase  29.57 
 
 		 314 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00000500571  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4343  aldose-1-epimerase family protein  32.18 
 
 		 295 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4297  aldose-1-epimerase family protein  32.18 
 
 		 295 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4252  aldose-1-epimerase family protein  32.18 
 
 		 295 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05040  galactose mutarotase-like enzyme  32.78 
 
 		 323 aa  144  3e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.556037  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0226  galactose mutarotase  30.72 
 
 		 318 aa  136  4e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00706113  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4408  aldose-1-epimerase family protein  32.99 
 
 		 280 aa  134  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4230  aldose-1-epimerase family protein  32.64 
 
 		 280 aa  133  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0726  Aldose 1-epimerase  29.43 
 
 		 328 aa  105  1e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5039  Aldose 1-epimerase  28.68 
 
 		 312 aa  104  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3046  Aldose 1-epimerase  28.06 
 
 		 345 aa  102  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.813423  normal  0.148483 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0149  Aldose 1-epimerase  31.3 
 
 		 336 aa  94.4  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0125238 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1585  Aldose 1-epimerase  29.28 
 
 		 305 aa  93.2  5e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.92898  normal  0.309256 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0696  Aldose 1-epimerase  30.45 
 
 		 306 aa  92  1e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00129327 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0702  Aldose 1-epimerase  27.69 
 
 		 318 aa  90.1  4e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0656  aldose-1-epimerase  26.52 
 
 		 314 aa  87.8  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.629793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27460  galactose mutarotase-like enzyme  27.34 
 
 		 334 aa  86.3  6e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0559  Aldose 1-epimerase  27.2 
 
 		 262 aa  78.2  0.0000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.480763  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1127  aldose 1-epimerase  27.69 
 
 		 269 aa  72.8  0.000000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0176464  normal  0.584187 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5648  Aldose 1-epimerase  27.9 
 
 		 327 aa  72  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0628  aldose 1-epimerase  29.84 
 
 		 282 aa  72  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.48408  normal  0.247972 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1930  Aldose 1-epimerase  22.88 
 
 		 316 aa  70.9  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.263285  normal  0.479856 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1503  Aldose 1-epimerase  25.8 
 
 		 317 aa  68.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.72169 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0456  aldose 1-epimerase  28.33 
 
 		 300 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1632  aldose 1-epimerase  26.11 
 
 		 355 aa  67.4  0.0000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2023  aldose 1-epimerase  28.36 
 
 		 298 aa  67  0.0000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02261  aldose 1-epimerase  25.89 
 
 		 346 aa  67  0.0000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3760  Aldose 1-epimerase  22.82 
 
 		 290 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00879497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0469  aldose 1-epimerase  28.75 
 
 		 300 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.799033  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0480  aldose 1-epimerase  28.75 
 
 		 300 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3707  Aldose 1-epimerase  22.82 
 
 		 290 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2751  aldose 1-epimerase  29.58 
 
 		 336 aa  63.9  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1458  aldose 1-epimerase  27.49 
 
 		 263 aa  63.2  0.000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0383  Aldose 1-epimerase  25.75 
 
 		 302 aa  62  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2660  aldose 1-epimerase  23.46 
 
 		 306 aa  61.2  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0844306  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1083  hypothetical protein  32.23 
 
 		 323 aa  60.5  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000316766  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4184  Aldose 1-epimerase  24.35 
 
 		 360 aa  60.1  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6249  Aldose 1-epimerase  24.9 
 
 		 296 aa  60.5  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.783578 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4072  Aldose 1-epimerase  24.35 
 
 		 360 aa  60.1  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0739  Aldose 1-epimerase  25.11 
 
 		 276 aa  59.7  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.220443  normal  0.0861855 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4338  hypothetical protein  24.79 
 
 		 310 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2029  aldose 1-epimerase  30 
 
 		 311 aa  58.9  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.99913  normal  0.429541 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0761  aldose 1-epimerase  25.11 
 
 		 299 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0638  aldose 1-epimerase  26.76 
 
 		 300 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.221019 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4205  aldose 1-epimerase  24.38 
 
 		 362 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.613008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6330  aldose 1-epimerase  23.44 
 
 		 362 aa  57  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3640  Aldose 1-epimerase  28.22 
 
 		 356 aa  56.6  0.0000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4631  aldose 1-epimerase  26.74 
 
 		 361 aa  56.6  0.0000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2820  Aldose 1-epimerase  25 
 
 		 380 aa  56.2  0.0000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1182  aldose 1-epimerase  21.03 
 
 		 356 aa  56.2  0.0000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2135  Aldose 1-epimerase  23.61 
 
 		 345 aa  56.2  0.0000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0437156 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2697  aldose 1-epimerase family protein  24.35 
 
 		 290 aa  55.8  0.0000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2178  Aldose 1-epimerase  27.7 
 
 		 329 aa  55.8  0.0000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1235  Aldose 1-epimerase  23.64 
 
 		 387 aa  55.5  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.153244 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1886  aldose 1-epimerase  26.8 
 
 		 382 aa  54.7  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.369459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2624  aldose 1-epimerase  23.43 
 
 		 371 aa  54.3  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.240433 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6030  aldose 1-epimerase  23.72 
 
 		 362 aa  53.9  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.808799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2977  Aldose 1-epimerase  23.49 
 
 		 397 aa  53.5  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.416586 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0324  Aldose 1-epimerase  23.36 
 
 		 299 aa  53.5  0.000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.296431 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3593  Aldose 1-epimerase  24.57 
 
 		 355 aa  53.5  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00379165  hitchhiker  0.0000198106 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002663  aldose 1-epimerase  24.12 
 
 		 354 aa  53.1  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2372  aldose 1-epimerase  28.36 
 
 		 309 aa  53.1  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2336  aldose 1-epimerase  23.08 
 
 		 376 aa  52.8  0.000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.360362  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4277  aldose 1-epimerase  22.22 
 
 		 289 aa  52.8  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.436668 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2754  hypothetical protein  26.47 
 
 		 296 aa  52.4  0.000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.494847  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>