184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B2372 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B2372  aldose 1-epimerase  100 
 
 
309 aa  629  1e-179  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4338  hypothetical protein  62.42 
 
 
310 aa  387  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0383  Aldose 1-epimerase  61.07 
 
 
302 aa  380  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2029  aldose 1-epimerase  40.71 
 
 
311 aa  230  2e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.99913  normal  0.429541 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0628  aldose 1-epimerase  37.59 
 
 
282 aa  156  5.0000000000000005e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.48408  normal  0.247972 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2754  hypothetical protein  36.75 
 
 
296 aa  154  1e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.494847  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2583  Aldose 1-epimerase  35.25 
 
 
294 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2760  aldose 1-epimerase  35.52 
 
 
353 aa  153  4e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.385741 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0550  aldose 1-epimerase  34.47 
 
 
353 aa  152  7e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0177374  normal  0.655719 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2993  Aldose 1-epimerase  35.14 
 
 
294 aa  151  1e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.778062  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0593  aldose 1-epimerase  33.56 
 
 
353 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.112152 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0526  aldose 1-epimerase  33.22 
 
 
353 aa  149  5e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0324  Aldose 1-epimerase  32.23 
 
 
299 aa  148  1.0000000000000001e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.296431 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3707  aldose 1-epimerase  33.22 
 
 
353 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.405661  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0142  aldose 1-epimerase  32.88 
 
 
353 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0625  aldose 1-epimerase  32.88 
 
 
353 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.417593  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1183  aldose 1-epimerase  32.88 
 
 
357 aa  147  3e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1262  hypothetical protein  34.23 
 
 
344 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3444  aldose 1-epimerase family protein  34.23 
 
 
357 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.381459  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3482  aldose 1-epimerase family protein  34.23 
 
 
357 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2482  hypothetical protein  34.23 
 
 
357 aa  144  3e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283645  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0402  hypothetical protein  34.23 
 
 
357 aa  143  3e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.827093  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3303  hypothetical protein  34.23 
 
 
357 aa  143  3e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1886  aldose 1-epimerase  31.35 
 
 
382 aa  143  3e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.369459  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3405  Aldose 1-epimerase  32.31 
 
 
353 aa  143  4e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.237068  normal  0.0908294 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3479  aldose 1-epimerase  33.89 
 
 
357 aa  142  5e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.329911  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1083  hypothetical protein  34.43 
 
 
323 aa  142  6e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000316766  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0551  putative aldose-1-epimerase  32.87 
 
 
297 aa  142  6e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.530428  normal  0.44726 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1585  Aldose 1-epimerase  35.41 
 
 
305 aa  142  8e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.92898  normal  0.309256 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0950  Aldose 1-epimerase  32.88 
 
 
311 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0322782 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1015  Aldose 1-epimerase  32.66 
 
 
311 aa  140  3e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3474  Aldose 1-epimerase  32.88 
 
 
296 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.84486 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3762  Aldose 1-epimerase  32.24 
 
 
296 aa  134  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.993298  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2260  aldose 1-epimerase  31.02 
 
 
356 aa  132  1.0000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00420753  unclonable  0.0000000181907 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6249  Aldose 1-epimerase  28.38 
 
 
296 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.783578 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4225  aldose 1-epimerase  31.02 
 
 
295 aa  130  4.0000000000000003e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.387725  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2610  aldose 1-epimerase  31.01 
 
 
352 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.169817 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5831  aldose 1-epimerase  30.61 
 
 
293 aa  127  3e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0718685  normal  0.204267 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0912  aldose 1-epimerase  30.26 
 
 
295 aa  119  7.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1047  hypothetical protein  30.69 
 
 
293 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0896  aldose 1-epimerase  30.43 
 
 
293 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.320638 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3776  aldose 1-epimerase family protein  27 
 
 
290 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02436  hypothetical protein  27 
 
 
290 aa  117  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1124  Aldose 1-epimerase  27 
 
 
290 aa  117  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02400  hypothetical protein  27 
 
 
290 aa  117  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2696  aldose 1-epimerase family protein  27 
 
 
290 aa  117  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2829  aldose 1-epimerase family protein  27 
 
 
290 aa  117  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1133  aldose 1-epimerase  27 
 
 
290 aa  116  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2023  aldose 1-epimerase  35.81 
 
 
298 aa  116  5e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2697  aldose 1-epimerase family protein  26.67 
 
 
290 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3306  aldose 1-epimerase  29.77 
 
 
291 aa  108  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51460  aldose 1-epimerase  27.34 
 
 
285 aa  107  3e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5533  Aldose 1-epimerase  29.57 
 
 
308 aa  106  4e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0696  Aldose 1-epimerase  32.04 
 
 
306 aa  105  1e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00129327 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4246  aldose 1-epimerase  27.8 
 
 
289 aa  99  9e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0149  Aldose 1-epimerase  29.03 
 
 
336 aa  94.4  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0125238 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1199  aldose 1-epimerase  26.77 
 
 
289 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.938894 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0702  Aldose 1-epimerase  27.85 
 
 
318 aa  89.4  8e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1165  aldose 1-epimerase  26.44 
 
 
289 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0252324 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1183  aldose 1-epimerase  26.57 
 
 
305 aa  86.7  5e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.101584  normal  0.174259 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5039  Aldose 1-epimerase  29.15 
 
 
312 aa  84  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1267  Aldose 1-epimerase  31.43 
 
 
301 aa  82  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.560353  hitchhiker  0.00115827 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4277  aldose 1-epimerase  25.61 
 
 
289 aa  75.9  0.0000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.436668 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3398  aldose 1-epimerase  28.34 
 
 
294 aa  75.5  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.226465  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2660  aldose 1-epimerase  25.2 
 
 
306 aa  75.5  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0844306  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1674  aldose 1-epimerase  29.1 
 
 
325 aa  74.7  0.000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.416242  hitchhiker  0.00123529 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3963  aldose 1-epimerase  21.4 
 
 
286 aa  73.6  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.87118  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2057  aldose 1-epimerase  24.79 
 
 
305 aa  73.6  0.000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.107394  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2489  Aldose 1-epimerase  30.04 
 
 
308 aa  72  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1895  aldose 1-epimerase family protein  24.69 
 
 
306 aa  71.2  0.00000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1836  Aldose 1-epimerase  26.39 
 
 
315 aa  68.9  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2241  Aldose 1-epimerase  25.31 
 
 
291 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.61015 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4402  aldose-1-epimerase family protein  25.11 
 
 
300 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1278  Aldose 1-epimerase  32.75 
 
 
307 aa  65.1  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.265427  normal  0.286232 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5326  aldose-1-epimerase family protein  24.68 
 
 
300 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.6155 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0739  Aldose 1-epimerase  25.21 
 
 
276 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.220443  normal  0.0861855 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5648  Aldose 1-epimerase  30.36 
 
 
327 aa  64.3  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0295  aldose 1-epimerase family protein  24.39 
 
 
295 aa  64.7  0.000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27460  galactose mutarotase-like enzyme  31.95 
 
 
334 aa  63.9  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1637  Aldose 1-epimerase  27.76 
 
 
312 aa  63.9  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12181  normal  0.595367 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0866  Aldose 1-epimerase  35.19 
 
 
306 aa  63.2  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.104082  normal  0.0514904 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03764  predicted aldose-1-epimerase  24.24 
 
 
308 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4107  Aldose 1-epimerase  24.24 
 
 
308 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1048  aldose 1-epimerase  27.68 
 
 
297 aa  61.6  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03713  hypothetical protein  24.24 
 
 
308 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3760  Aldose 1-epimerase  21.4 
 
 
290 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00879497  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3707  Aldose 1-epimerase  21.4 
 
 
290 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4264  aldose-1-epimerase family protein  25.75 
 
 
299 aa  60.8  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1897  aldose 1-epimerase  29.55 
 
 
290 aa  60.5  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1512  aldose 1-epimerase  31.55 
 
 
302 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1543  aldose 1-epimerase family protein  31.55 
 
 
302 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.169393  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4408  aldose-1-epimerase family protein  23.63 
 
 
280 aa  60.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1712  aldose 1-epimerase  31.55 
 
 
371 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.602147  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0044  Aldose 1-epimerase  36.61 
 
 
311 aa  60.5  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4230  aldose-1-epimerase family protein  23.68 
 
 
280 aa  60.5  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0514  aldose 1-epimerase  34.71 
 
 
327 aa  60.5  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.165305  decreased coverage  0.000622322 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1585  hypothetical protein  27.94 
 
 
312 aa  60.1  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4252  aldose-1-epimerase family protein  25.1 
 
 
295 aa  59.3  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3046  Aldose 1-epimerase  24.59 
 
 
345 aa  59.3  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.813423  normal  0.148483 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4297  aldose-1-epimerase family protein  25.1 
 
 
295 aa  59.3  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>