113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0912 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_0912  aldose 1-epimerase  100 
 
 		 295 aa  600  1.0000000000000001e-171  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5831  aldose 1-epimerase  42.86 
 
 		 293 aa  230  2e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0718685  normal  0.204267 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3405  Aldose 1-epimerase  39.93 
 
 		 353 aa  199  5e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.237068  normal  0.0908294 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0551  putative aldose-1-epimerase  41.79 
 
 		 297 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.530428  normal  0.44726 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2583  Aldose 1-epimerase  41.78 
 
 		 294 aa  194  2e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2993  Aldose 1-epimerase  41.5 
 
 		 294 aa  192  4e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.778062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2610  aldose 1-epimerase  39.53 
 
 		 352 aa  188  9e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.169817 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2760  aldose 1-epimerase  41.78 
 
 		 353 aa  188  1e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.385741 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0526  aldose 1-epimerase  40.21 
 
 		 353 aa  180  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0142  aldose 1-epimerase  40.21 
 
 		 353 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0625  aldose 1-epimerase  40.21 
 
 		 353 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.417593  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3707  aldose 1-epimerase  40.89 
 
 		 353 aa  179  4e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.405661  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0550  aldose 1-epimerase  40.14 
 
 		 353 aa  179  4e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0177374  normal  0.655719 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0593  aldose 1-epimerase  40.21 
 
 		 353 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.112152 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1183  aldose 1-epimerase  38.41 
 
 		 357 aa  172  5e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1262  hypothetical protein  38.28 
 
 		 344 aa  172  5e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3444  aldose 1-epimerase family protein  38.41 
 
 		 357 aa  172  5e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.381459  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3482  aldose 1-epimerase family protein  38.41 
 
 		 357 aa  172  5e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2482  hypothetical protein  38.41 
 
 		 357 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283645  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3479  aldose 1-epimerase  38.41 
 
 		 357 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.329911  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0402  hypothetical protein  38.41 
 
 		 357 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.827093  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3303  hypothetical protein  38.41 
 
 		 357 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2754  hypothetical protein  38.7 
 
 		 296 aa  169  8e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.494847  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0896  aldose 1-epimerase  36.77 
 
 		 293 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.320638 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3306  aldose 1-epimerase  36.81 
 
 		 291 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1165  aldose 1-epimerase  37.76 
 
 		 289 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0252324 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1199  aldose 1-epimerase  37.41 
 
 		 289 aa  149  8e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.938894 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1047  hypothetical protein  38.02 
 
 		 293 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3474  Aldose 1-epimerase  36.48 
 
 		 296 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.84486 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1183  aldose 1-epimerase  37.5 
 
 		 305 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.101584  normal  0.174259 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51460  aldose 1-epimerase  34.71 
 
 		 285 aa  144  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3762  Aldose 1-epimerase  36.07 
 
 		 296 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.993298  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4246  aldose 1-epimerase  35.14 
 
 		 289 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2260  aldose 1-epimerase  31.58 
 
 		 356 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00420753  unclonable  0.0000000181907 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4225  aldose 1-epimerase  31.56 
 
 		 295 aa  130  2.0000000000000002e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.387725  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1133  aldose 1-epimerase  33.07 
 
 		 290 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3776  aldose 1-epimerase family protein  33.07 
 
 		 290 aa  130  3e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02436  hypothetical protein  33.07 
 
 		 290 aa  129  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1124  Aldose 1-epimerase  33.07 
 
 		 290 aa  129  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2696  aldose 1-epimerase family protein  33.07 
 
 		 290 aa  129  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2829  aldose 1-epimerase family protein  33.07 
 
 		 290 aa  129  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02400  hypothetical protein  33.07 
 
 		 290 aa  129  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2697  aldose 1-epimerase family protein  32.68 
 
 		 290 aa  127  3e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6249  Aldose 1-epimerase  30.97 
 
 		 296 aa  126  5e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.783578 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1585  Aldose 1-epimerase  28.81 
 
 		 305 aa  119  3.9999999999999996e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.92898  normal  0.309256 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2372  aldose 1-epimerase  30.26 
 
 		 309 aa  119  7e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0628  aldose 1-epimerase  33.96 
 
 		 282 aa  119  7e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.48408  normal  0.247972 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0696  Aldose 1-epimerase  29.93 
 
 		 306 aa  117  1.9999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00129327 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0950  Aldose 1-epimerase  35.37 
 
 		 311 aa  116  6e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0322782 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1015  Aldose 1-epimerase  34.96 
 
 		 311 aa  115  6e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0324  Aldose 1-epimerase  30.61 
 
 		 299 aa  114  3e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.296431 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1886  aldose 1-epimerase  30.67 
 
 		 382 aa  113  4.0000000000000004e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.369459  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1083  hypothetical protein  35.29 
 
 		 323 aa  112  6e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000316766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4338  hypothetical protein  30.26 
 
 		 310 aa  106  5e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0383  Aldose 1-epimerase  27.24 
 
 		 302 aa  103  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2023  aldose 1-epimerase  30.98 
 
 		 298 aa  103  4e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2029  aldose 1-epimerase  30.85 
 
 		 311 aa  102  8e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.99913  normal  0.429541 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5533  Aldose 1-epimerase  33.94 
 
 		 308 aa  87.8  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3398  aldose 1-epimerase  30.54 
 
 		 294 aa  76.3  0.0000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.226465  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1278  Aldose 1-epimerase  32.73 
 
 		 307 aa  72.4  0.000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.265427  normal  0.286232 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1897  aldose 1-epimerase  28.51 
 
 		 290 aa  72  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0149  Aldose 1-epimerase  26.35 
 
 		 336 aa  70.1  0.00000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0125238 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1127  aldose 1-epimerase  26.52 
 
 		 269 aa  65.5  0.000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0176464  normal  0.584187 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2489  Aldose 1-epimerase  32.21 
 
 		 308 aa  65.5  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1267  Aldose 1-epimerase  26.97 
 
 		 301 aa  64.3  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.560353  hitchhiker  0.00115827 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0044  Aldose 1-epimerase  30.67 
 
 		 311 aa  62.4  0.000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0225  galactose mutarotase  24.21 
 
 		 314 aa  61.2  0.00000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00000500571  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0656  aldose-1-epimerase  25.47 
 
 		 314 aa  59.3  0.00000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.629793  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5326  aldose-1-epimerase family protein  26.52 
 
 		 300 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.6155 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4109  aldose 1-epimerase family protein  27.52 
 
 		 295 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0163943  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4362  aldose 1-epimerase family protein  27.52 
 
 		 295 aa  57.8  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4134  aldose 1-epimerase  27.52 
 
 		 295 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0702  Aldose 1-epimerase  24.91 
 
 		 318 aa  57.4  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4402  aldose-1-epimerase family protein  26.09 
 
 		 300 aa  56.6  0.0000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03764  predicted aldose-1-epimerase  25.88 
 
 		 308 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4107  Aldose 1-epimerase  25.88 
 
 		 308 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03713  hypothetical protein  25.88 
 
 		 308 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12920  galactose mutarotase-like enzyme  26.61 
 
 		 321 aa  55.5  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0901551  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1048  aldose 1-epimerase  24.82 
 
 		 297 aa  54.3  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2432  aldose 1-epimerase  26.5 
 
 		 301 aa  54.7  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0573284  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2182  Aldose 1-epimerase  28 
 
 		 299 aa  54.3  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000157648 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2973  Aldose 1-epimerase  27.27 
 
 		 303 aa  55.1  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000377273  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4264  aldose-1-epimerase family protein  24.37 
 
 		 299 aa  53.5  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2454  aldose 1-epimerase  28.3 
 
 		 307 aa  53.1  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4297  aldose-1-epimerase family protein  25.93 
 
 		 295 aa  52.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4343  aldose-1-epimerase family protein  25.93 
 
 		 295 aa  52.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4252  aldose-1-epimerase family protein  25.93 
 
 		 295 aa  52.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1458  aldose 1-epimerase  24 
 
 		 263 aa  52.8  0.000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2997  Aldose 1-epimerase  26.67 
 
 		 302 aa  52.8  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0040024 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3303  putative aldose-1-epimerase  30.18 
 
 		 297 aa  52.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.575493 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8681  Aldose 1-epimerase  28.19 
 
 		 303 aa  50.8  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.626175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2178  Aldose 1-epimerase  24.21 
 
 		 329 aa  51.2  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0226  galactose mutarotase  25.49 
 
 		 318 aa  50.4  0.00003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00706113  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4408  aldose-1-epimerase family protein  27.08 
 
 		 280 aa  50.4  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1836  Aldose 1-epimerase  26.19 
 
 		 315 aa  50.4  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1895  aldose 1-epimerase family protein  26.79 
 
 		 306 aa  50.1  0.00005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0295  aldose 1-epimerase family protein  26.79 
 
 		 295 aa  50.1  0.00005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4435  Aldose 1-epimerase  24.27 
 
 		 303 aa  49.7  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.340797 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4230  aldose-1-epimerase family protein  27.08 
 
 		 280 aa  49.7  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3295  Aldose 1-epimerase protein  27.74 
 
 		 289 aa  48.9  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.498729  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>