133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_3405 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_3405  Aldose 1-epimerase  100 
 
 		 353 aa  719    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.237068  normal  0.0908294 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0551  putative aldose-1-epimerase  96.97 
 
 		 297 aa  599  1e-170  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.530428  normal  0.44726 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2610  aldose 1-epimerase  75.57 
 
 		 352 aa  517  1e-146  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.169817 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0402  hypothetical protein  66.86 
 
 		 357 aa  444  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.827093  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3444  aldose 1-epimerase family protein  66.86 
 
 		 357 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.381459  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3482  aldose 1-epimerase family protein  66.86 
 
 		 357 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3303  hypothetical protein  66.86 
 
 		 357 aa  444  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2482  hypothetical protein  66.57 
 
 		 357 aa  441  1e-123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283645  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3479  aldose 1-epimerase  66.57 
 
 		 357 aa  444  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.329911  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1262  hypothetical protein  66.86 
 
 		 344 aa  443  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1183  aldose 1-epimerase  66.09 
 
 		 357 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0142  aldose 1-epimerase  66.87 
 
 		 353 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0625  aldose 1-epimerase  66.87 
 
 		 353 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.417593  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0593  aldose 1-epimerase  66.87 
 
 		 353 aa  437  1e-121  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.112152 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2760  aldose 1-epimerase  65.05 
 
 		 353 aa  429  1e-119  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.385741 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0526  aldose 1-epimerase  68.91 
 
 		 353 aa  427  1e-118  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0550  aldose 1-epimerase  68.91 
 
 		 353 aa  427  1e-118  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0177374  normal  0.655719 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3707  aldose 1-epimerase  68.87 
 
 		 353 aa  420  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.405661  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2754  hypothetical protein  51.58 
 
 		 296 aa  273  4.0000000000000004e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.494847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2993  Aldose 1-epimerase  48.97 
 
 		 294 aa  269  5e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.778062  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2583  Aldose 1-epimerase  48.62 
 
 		 294 aa  267  2e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5831  aldose 1-epimerase  41.81 
 
 		 293 aa  212  5.999999999999999e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0718685  normal  0.204267 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0912  aldose 1-epimerase  39.93 
 
 		 295 aa  199  7e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0896  aldose 1-epimerase  39.32 
 
 		 293 aa  196  6e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.320638 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3306  aldose 1-epimerase  38.75 
 
 		 291 aa  196  6e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1199  aldose 1-epimerase  40.29 
 
 		 289 aa  193  4e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.938894 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1165  aldose 1-epimerase  39.93 
 
 		 289 aa  192  7e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0252324 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1047  hypothetical protein  38.87 
 
 		 293 aa  191  1e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51460  aldose 1-epimerase  38.3 
 
 		 285 aa  186  5e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4246  aldose 1-epimerase  38.3 
 
 		 289 aa  182  6e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1183  aldose 1-epimerase  36.45 
 
 		 305 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.101584  normal  0.174259 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1886  aldose 1-epimerase  34.35 
 
 		 382 aa  173  2.9999999999999996e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.369459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2260  aldose 1-epimerase  35.29 
 
 		 356 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00420753  unclonable  0.0000000181907 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4225  aldose 1-epimerase  33.22 
 
 		 295 aa  164  2.0000000000000002e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.387725  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6249  Aldose 1-epimerase  33.11 
 
 		 296 aa  159  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.783578 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3762  Aldose 1-epimerase  38.31 
 
 		 296 aa  156  6e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.993298  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3474  Aldose 1-epimerase  39.56 
 
 		 296 aa  155  9e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.84486 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1133  aldose 1-epimerase  31.89 
 
 		 290 aa  145  9e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02436  hypothetical protein  31.89 
 
 		 290 aa  145  1e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1124  Aldose 1-epimerase  31.89 
 
 		 290 aa  145  1e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02400  hypothetical protein  31.89 
 
 		 290 aa  145  1e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2696  aldose 1-epimerase family protein  31.89 
 
 		 290 aa  145  1e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2829  aldose 1-epimerase family protein  31.89 
 
 		 290 aa  145  1e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3776  aldose 1-epimerase family protein  31.89 
 
 		 290 aa  143  4e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2372  aldose 1-epimerase  32.31 
 
 		 309 aa  143  5e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2029  aldose 1-epimerase  30.69 
 
 		 311 aa  142  7e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.99913  normal  0.429541 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4338  hypothetical protein  29.53 
 
 		 310 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0628  aldose 1-epimerase  32.38 
 
 		 282 aa  139  4.999999999999999e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.48408  normal  0.247972 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2697  aldose 1-epimerase family protein  31.95 
 
 		 290 aa  137  2e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0324  Aldose 1-epimerase  29.73 
 
 		 299 aa  132  1.0000000000000001e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.296431 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0383  Aldose 1-epimerase  28.62 
 
 		 302 aa  130  3e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0950  Aldose 1-epimerase  30.67 
 
 		 311 aa  129  6e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0322782 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1585  Aldose 1-epimerase  30.62 
 
 		 305 aa  125  2e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.92898  normal  0.309256 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1015  Aldose 1-epimerase  29.9 
 
 		 311 aa  123  4e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0696  Aldose 1-epimerase  31.79 
 
 		 306 aa  116  6e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00129327 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2023  aldose 1-epimerase  31.31 
 
 		 298 aa  116  6.9999999999999995e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1083  hypothetical protein  31.65 
 
 		 323 aa  115  7.999999999999999e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000316766  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5533  Aldose 1-epimerase  30 
 
 		 308 aa  106  6e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0149  Aldose 1-epimerase  27.04 
 
 		 336 aa  80.5  0.00000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0125238 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1048  aldose 1-epimerase  27.23 
 
 		 297 aa  75.9  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3963  aldose 1-epimerase  27.59 
 
 		 286 aa  73.6  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.87118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4362  aldose 1-epimerase family protein  23.05 
 
 		 295 aa  67  0.0000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0044  Aldose 1-epimerase  34.06 
 
 		 311 aa  66.6  0.0000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4402  aldose-1-epimerase family protein  26.24 
 
 		 300 aa  66.6  0.0000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4134  aldose 1-epimerase  23.05 
 
 		 295 aa  66.2  0.0000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03764  predicted aldose-1-epimerase  26.24 
 
 		 308 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4107  Aldose 1-epimerase  26.24 
 
 		 308 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03713  hypothetical protein  26.24 
 
 		 308 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4109  aldose 1-epimerase family protein  22.85 
 
 		 295 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0163943  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3398  aldose 1-epimerase  28.57 
 
 		 294 aa  65.1  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.226465  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4264  aldose-1-epimerase family protein  25.57 
 
 		 299 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2057  aldose 1-epimerase  25.74 
 
 		 305 aa  63.9  0.000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.107394  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4277  aldose 1-epimerase  24.05 
 
 		 289 aa  63.5  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.436668 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4297  aldose-1-epimerase family protein  22.78 
 
 		 295 aa  63.5  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4343  aldose-1-epimerase family protein  22.78 
 
 		 295 aa  63.5  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4252  aldose-1-epimerase family protein  22.78 
 
 		 295 aa  63.5  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5326  aldose-1-epimerase family protein  25.82 
 
 		 300 aa  63.5  0.000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.6155 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1674  aldose 1-epimerase  34.86 
 
 		 325 aa  63.2  0.000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.416242  hitchhiker  0.00123529 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0225  galactose mutarotase  25 
 
 		 314 aa  62.8  0.000000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00000500571  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0739  Aldose 1-epimerase  26.83 
 
 		 276 aa  62.8  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.220443  normal  0.0861855 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5039  Aldose 1-epimerase  25.09 
 
 		 312 aa  62.8  0.000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2660  aldose 1-epimerase  23.65 
 
 		 306 aa  62.4  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0844306  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1458  aldose 1-epimerase  31.47 
 
 		 263 aa  60.8  0.00000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3760  Aldose 1-epimerase  22.48 
 
 		 290 aa  59.3  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00879497  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3707  Aldose 1-epimerase  22.48 
 
 		 290 aa  59.3  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2178  Aldose 1-epimerase  27.41 
 
 		 329 aa  58.5  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0702  Aldose 1-epimerase  24.5 
 
 		 318 aa  58.2  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1278  Aldose 1-epimerase  30.49 
 
 		 307 aa  58.2  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.265427  normal  0.286232 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1897  aldose 1-epimerase  28.83 
 
 		 290 aa  57.8  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2241  Aldose 1-epimerase  24.52 
 
 		 291 aa  57  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.61015 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4435  Aldose 1-epimerase  30.06 
 
 		 303 aa  55.5  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.340797 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0173  galactose mutarotase-like protein  26.24 
 
 		 294 aa  55.5  0.000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000630537  hitchhiker  0.00000000000000230696 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0226  galactose mutarotase  28.66 
 
 		 318 aa  54.3  0.000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00706113  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4408  aldose-1-epimerase family protein  23.16 
 
 		 280 aa  54.3  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3303  putative aldose-1-epimerase  29.74 
 
 		 297 aa  54.3  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.575493 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1267  Aldose 1-epimerase  31.73 
 
 		 301 aa  53.9  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.560353  hitchhiker  0.00115827 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4230  aldose-1-epimerase family protein  22.79 
 
 		 280 aa  53.1  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2432  aldose 1-epimerase  26.54 
 
 		 301 aa  52.4  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0573284  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1836  Aldose 1-epimerase  29.29 
 
 		 315 aa  51.6  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2489  Aldose 1-epimerase  29.52 
 
 		 308 aa  51.6  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>