102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_4134 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010468  EcolC_4134  aldose 1-epimerase  100 
 
 		 295 aa  612  9.999999999999999e-175  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4109  aldose 1-epimerase family protein  99.66 
 
 		 295 aa  608  1e-173  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0163943  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4362  aldose 1-epimerase family protein  99.32 
 
 		 295 aa  609  1e-173  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1048  aldose 1-epimerase  51.7 
 
 		 297 aa  329  4e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5831  aldose 1-epimerase  26.47 
 
 		 293 aa  82.4  0.000000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0718685  normal  0.204267 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1083  hypothetical protein  25.52 
 
 		 323 aa  79  0.00000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000316766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1886  aldose 1-epimerase  26.2 
 
 		 382 aa  79  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.369459  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1015  Aldose 1-epimerase  26.33 
 
 		 311 aa  78.6  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2754  hypothetical protein  25.46 
 
 		 296 aa  77.4  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.494847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0550  aldose 1-epimerase  24.44 
 
 		 353 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0177374  normal  0.655719 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1127  aldose 1-epimerase  24.9 
 
 		 269 aa  72.8  0.000000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0176464  normal  0.584187 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0526  aldose 1-epimerase  24.06 
 
 		 353 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0950  Aldose 1-epimerase  26.52 
 
 		 311 aa  72  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0322782 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1458  aldose 1-epimerase  24.9 
 
 		 263 aa  71.6  0.00000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2489  Aldose 1-epimerase  25.98 
 
 		 308 aa  70.1  0.00000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0593  aldose 1-epimerase  23.68 
 
 		 353 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.112152 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0142  aldose 1-epimerase  23.31 
 
 		 353 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0625  aldose 1-epimerase  23.31 
 
 		 353 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.417593  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51460  aldose 1-epimerase  31.09 
 
 		 285 aa  68.6  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0559  Aldose 1-epimerase  21.51 
 
 		 262 aa  67  0.0000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.480763  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4225  aldose 1-epimerase  26.67 
 
 		 295 aa  67.4  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.387725  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2610  aldose 1-epimerase  23.42 
 
 		 352 aa  67  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.169817 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2993  Aldose 1-epimerase  22.85 
 
 		 294 aa  67.4  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.778062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3707  aldose 1-epimerase  22.93 
 
 		 353 aa  67  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.405661  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3405  Aldose 1-epimerase  23.05 
 
 		 353 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.237068  normal  0.0908294 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2583  Aldose 1-epimerase  25 
 
 		 294 aa  66.2  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2697  aldose 1-epimerase family protein  26.62 
 
 		 290 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0628  aldose 1-epimerase  24.33 
 
 		 282 aa  64.3  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.48408  normal  0.247972 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0551  putative aldose-1-epimerase  22.83 
 
 		 297 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.530428  normal  0.44726 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2760  aldose 1-epimerase  23.31 
 
 		 353 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.385741 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1133  aldose 1-epimerase  26.24 
 
 		 290 aa  63.5  0.000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0383  Aldose 1-epimerase  22.94 
 
 		 302 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3776  aldose 1-epimerase family protein  26.24 
 
 		 290 aa  63.2  0.000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0149  Aldose 1-epimerase  28.4 
 
 		 336 aa  62  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0125238 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02436  hypothetical protein  26.24 
 
 		 290 aa  61.2  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1124  Aldose 1-epimerase  26.24 
 
 		 290 aa  61.2  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2696  aldose 1-epimerase family protein  26.24 
 
 		 290 aa  61.2  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2829  aldose 1-epimerase family protein  26.24 
 
 		 290 aa  61.2  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02400  hypothetical protein  26.24 
 
 		 290 aa  61.2  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2023  aldose 1-epimerase  25.65 
 
 		 298 aa  59.7  0.00000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5533  Aldose 1-epimerase  24.71 
 
 		 308 aa  59.7  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4338  hypothetical protein  23.49 
 
 		 310 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1225  Aldose 1-epimerase  24.62 
 
 		 302 aa  59.3  0.00000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2029  aldose 1-epimerase  25 
 
 		 311 aa  58.5  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.99913  normal  0.429541 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0912  aldose 1-epimerase  27.52 
 
 		 295 aa  57.4  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1262  hypothetical protein  21.19 
 
 		 344 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2482  hypothetical protein  21.19 
 
 		 357 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283645  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0402  hypothetical protein  21.19 
 
 		 357 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.827093  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3444  aldose 1-epimerase family protein  21.19 
 
 		 357 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.381459  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3482  aldose 1-epimerase family protein  21.19 
 
 		 357 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3303  hypothetical protein  21.19 
 
 		 357 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3479  aldose 1-epimerase  21.19 
 
 		 357 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.329911  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6249  Aldose 1-epimerase  26.06 
 
 		 296 aa  55.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.783578 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4264  aldose-1-epimerase family protein  26.01 
 
 		 299 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0896  aldose 1-epimerase  25.16 
 
 		 293 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.320638 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3306  aldose 1-epimerase  27.81 
 
 		 291 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5326  aldose-1-epimerase family protein  27.44 
 
 		 300 aa  53.1  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.6155 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1183  aldose 1-epimerase  22.42 
 
 		 357 aa  53.1  0.000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0225  galactose mutarotase  25.41 
 
 		 314 aa  53.1  0.000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00000500571  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4277  aldose 1-epimerase  21.93 
 
 		 289 aa  52.8  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.436668 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1267  Aldose 1-epimerase  26.81 
 
 		 301 aa  52.8  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.560353  hitchhiker  0.00115827 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2454  aldose 1-epimerase  29.25 
 
 		 307 aa  52  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4297  aldose-1-epimerase family protein  23.08 
 
 		 295 aa  52.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4343  aldose-1-epimerase family protein  23.08 
 
 		 295 aa  52.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4252  aldose-1-epimerase family protein  23.08 
 
 		 295 aa  52.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1897  aldose 1-epimerase  24.82 
 
 		 290 aa  52  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0696  Aldose 1-epimerase  22.61 
 
 		 306 aa  52  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00129327 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03764  predicted aldose-1-epimerase  26.83 
 
 		 308 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4107  Aldose 1-epimerase  26.83 
 
 		 308 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1674  aldose 1-epimerase  25.75 
 
 		 325 aa  51.2  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.416242  hitchhiker  0.00123529 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2260  aldose 1-epimerase  23.47 
 
 		 356 aa  51.6  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00420753  unclonable  0.0000000181907 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4402  aldose-1-epimerase family protein  26.83 
 
 		 300 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4408  aldose-1-epimerase family protein  25.52 
 
 		 280 aa  51.2  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03713  hypothetical protein  26.83 
 
 		 308 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1585  Aldose 1-epimerase  22.58 
 
 		 305 aa  50.1  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.92898  normal  0.309256 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1047  hypothetical protein  23.75 
 
 		 293 aa  49.7  0.00006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1278  Aldose 1-epimerase  24.43 
 
 		 307 aa  49.3  0.00007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.265427  normal  0.286232 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1115  aldose 1-epimerase  25.38 
 
 		 351 aa  48.9  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2057  aldose 1-epimerase  21.93 
 
 		 305 aa  48.9  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.107394  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0226  galactose mutarotase  24.82 
 
 		 318 aa  48.5  0.0001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00706113  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4230  aldose-1-epimerase family protein  25 
 
 		 280 aa  48.5  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2241  Aldose 1-epimerase  29.03 
 
 		 291 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.61015 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2182  Aldose 1-epimerase  25.45 
 
 		 299 aa  48.1  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000157648 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3398  aldose 1-epimerase  23.57 
 
 		 294 aa  47.4  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.226465  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4435  Aldose 1-epimerase  23.53 
 
 		 303 aa  45.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.340797 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1551  aldose 1-epimerase  25.17 
 
 		 340 aa  44.7  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1593  aldose 1-epimerase  27.41 
 
 		 349 aa  44.3  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3707  Aldose 1-epimerase  25.31 
 
 		 290 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0044  Aldose 1-epimerase  22.75 
 
 		 311 aa  43.9  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1538  aldose 1-epimerase  24 
 
 		 345 aa  43.5  0.004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1761  Aldose 1-epimerase  26.49 
 
 		 286 aa  43.5  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3760  Aldose 1-epimerase  25.66 
 
 		 290 aa  43.5  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00879497  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0854  Aldose 1-epimerase  21.33 
 
 		 300 aa  43.5  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0393175  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1895  aldose 1-epimerase family protein  22.87 
 
 		 306 aa  43.1  0.006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0514  aldose 1-epimerase  25.71 
 
 		 327 aa  43.1  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.165305  decreased coverage  0.000622322 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1344  aldose 1-epimerase  26.49 
 
 		 343 aa  42.7  0.007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1024  galactose mutarotase-like protein  24.84 
 
 		 298 aa  42.7  0.007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.353327  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1368  aldose 1-epimerase  23.72 
 
 		 348 aa  42.4  0.008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00941348  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12920  galactose mutarotase-like enzyme  26.47 
 
 		 321 aa  42.7  0.008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0901551  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0030  aldose 1-epimerase  25.29 
 
 		 335 aa  42.4  0.009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.413428  normal  0.24254 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>