128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_2993 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_2993  Aldose 1-epimerase  100 
 
 		 294 aa  601  1.0000000000000001e-171  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.778062  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2583  Aldose 1-epimerase  94.22 
 
 		 294 aa  567  1e-161  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2754  hypothetical protein  68.97 
 
 		 296 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.494847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3405  Aldose 1-epimerase  48.97 
 
 		 353 aa  269  4e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.237068  normal  0.0908294 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0551  putative aldose-1-epimerase  48.58 
 
 		 297 aa  259  3e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.530428  normal  0.44726 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2610  aldose 1-epimerase  46.55 
 
 		 352 aa  259  3e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.169817 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1183  aldose 1-epimerase  47.59 
 
 		 357 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0402  hypothetical protein  48.11 
 
 		 357 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.827093  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3444  aldose 1-epimerase family protein  48.11 
 
 		 357 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.381459  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3482  aldose 1-epimerase family protein  48.11 
 
 		 357 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3303  hypothetical protein  48.11 
 
 		 357 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0550  aldose 1-epimerase  47.39 
 
 		 353 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0177374  normal  0.655719 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0526  aldose 1-epimerase  47.39 
 
 		 353 aa  253  3e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1262  hypothetical protein  48.11 
 
 		 344 aa  253  3e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2760  aldose 1-epimerase  47.08 
 
 		 353 aa  253  3e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.385741 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2482  hypothetical protein  48.11 
 
 		 357 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283645  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3479  aldose 1-epimerase  47.77 
 
 		 357 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.329911  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0142  aldose 1-epimerase  46.74 
 
 		 353 aa  250  2e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0625  aldose 1-epimerase  46.74 
 
 		 353 aa  250  2e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.417593  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0593  aldose 1-epimerase  46.74 
 
 		 353 aa  250  2e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.112152 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3707  aldose 1-epimerase  48.11 
 
 		 353 aa  249  3e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.405661  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0912  aldose 1-epimerase  41.5 
 
 		 295 aa  192  4e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5831  aldose 1-epimerase  40.69 
 
 		 293 aa  192  7e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0718685  normal  0.204267 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0896  aldose 1-epimerase  37.15 
 
 		 293 aa  176  3e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.320638 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51460  aldose 1-epimerase  39.5 
 
 		 285 aa  173  2.9999999999999996e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1047  hypothetical protein  37.67 
 
 		 293 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6249  Aldose 1-epimerase  35.59 
 
 		 296 aa  155  8e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.783578 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1199  aldose 1-epimerase  34.72 
 
 		 289 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.938894 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3306  aldose 1-epimerase  35.19 
 
 		 291 aa  152  5e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1165  aldose 1-epimerase  34.38 
 
 		 289 aa  152  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0252324 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2372  aldose 1-epimerase  35.14 
 
 		 309 aa  151  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4225  aldose 1-epimerase  32.66 
 
 		 295 aa  149  4e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.387725  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0383  Aldose 1-epimerase  33.11 
 
 		 302 aa  148  9e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1886  aldose 1-epimerase  32.77 
 
 		 382 aa  147  2.0000000000000003e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.369459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1183  aldose 1-epimerase  33.45 
 
 		 305 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.101584  normal  0.174259 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4338  hypothetical protein  32.43 
 
 		 310 aa  146  3e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4246  aldose 1-epimerase  34.38 
 
 		 289 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3474  Aldose 1-epimerase  38.08 
 
 		 296 aa  142  6e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.84486 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0628  aldose 1-epimerase  34.63 
 
 		 282 aa  140  1.9999999999999998e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.48408  normal  0.247972 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2260  aldose 1-epimerase  34.88 
 
 		 356 aa  140  3.9999999999999997e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00420753  unclonable  0.0000000181907 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3762  Aldose 1-epimerase  37.02 
 
 		 296 aa  139  7e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.993298  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3776  aldose 1-epimerase family protein  32.25 
 
 		 290 aa  127  3e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2029  aldose 1-epimerase  32.61 
 
 		 311 aa  126  4.0000000000000003e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.99913  normal  0.429541 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1133  aldose 1-epimerase  31.88 
 
 		 290 aa  126  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2697  aldose 1-epimerase family protein  32.73 
 
 		 290 aa  126  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02436  hypothetical protein  31.52 
 
 		 290 aa  124  2e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1124  Aldose 1-epimerase  31.52 
 
 		 290 aa  124  2e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2696  aldose 1-epimerase family protein  31.52 
 
 		 290 aa  124  2e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2829  aldose 1-epimerase family protein  31.52 
 
 		 290 aa  124  2e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02400  hypothetical protein  31.52 
 
 		 290 aa  124  2e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0324  Aldose 1-epimerase  30.51 
 
 		 299 aa  119  6e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.296431 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0950  Aldose 1-epimerase  30.13 
 
 		 311 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0322782 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1015  Aldose 1-epimerase  28.72 
 
 		 311 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1083  hypothetical protein  30.51 
 
 		 323 aa  103  3e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000316766  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0696  Aldose 1-epimerase  30.77 
 
 		 306 aa  101  1e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00129327 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1585  Aldose 1-epimerase  30 
 
 		 305 aa  100  3e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.92898  normal  0.309256 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1048  aldose 1-epimerase  30.26 
 
 		 297 aa  94.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2023  aldose 1-epimerase  28.76 
 
 		 298 aa  88.2  2e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5533  Aldose 1-epimerase  28.75 
 
 		 308 aa  82.8  0.000000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0149  Aldose 1-epimerase  28.66 
 
 		 336 aa  82.8  0.000000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0125238 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2489  Aldose 1-epimerase  30.65 
 
 		 308 aa  67.8  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4134  aldose 1-epimerase  22.85 
 
 		 295 aa  67.4  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03764  predicted aldose-1-epimerase  26.6 
 
 		 308 aa  66.2  0.0000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4107  Aldose 1-epimerase  26.6 
 
 		 308 aa  66.2  0.0000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03713  hypothetical protein  26.6 
 
 		 308 aa  66.2  0.0000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4109  aldose 1-epimerase family protein  22.85 
 
 		 295 aa  65.9  0.0000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0163943  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4264  aldose-1-epimerase family protein  27.27 
 
 		 299 aa  65.9  0.0000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4362  aldose 1-epimerase family protein  22.64 
 
 		 295 aa  65.9  0.0000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5326  aldose-1-epimerase family protein  26.02 
 
 		 300 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.6155 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4402  aldose-1-epimerase family protein  25.51 
 
 		 300 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0044  Aldose 1-epimerase  34.29 
 
 		 311 aa  63.9  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2660  aldose 1-epimerase  24.7 
 
 		 306 aa  62.8  0.000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0844306  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1674  aldose 1-epimerase  28.86 
 
 		 325 aa  60.5  0.00000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.416242  hitchhiker  0.00123529 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2182  Aldose 1-epimerase  28.96 
 
 		 299 aa  60.5  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000157648 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1278  Aldose 1-epimerase  31.75 
 
 		 307 aa  60.5  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.265427  normal  0.286232 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3963  aldose 1-epimerase  28.02 
 
 		 286 aa  59.3  0.00000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.87118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1127  aldose 1-epimerase  29.22 
 
 		 269 aa  57.8  0.0000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0176464  normal  0.584187 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1083  putative aldose-1-epimerase  28.17 
 
 		 305 aa  57.4  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.145719  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2432  aldose 1-epimerase  29.44 
 
 		 301 aa  57.4  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0573284  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4297  aldose-1-epimerase family protein  24.41 
 
 		 295 aa  57  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4343  aldose-1-epimerase family protein  24.41 
 
 		 295 aa  57  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4252  aldose-1-epimerase family protein  24.41 
 
 		 295 aa  57  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1897  aldose 1-epimerase  29.28 
 
 		 290 aa  57  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0226  galactose mutarotase  29.48 
 
 		 318 aa  56.6  0.0000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00706113  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4435  Aldose 1-epimerase  29.94 
 
 		 303 aa  56.2  0.0000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.340797 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4277  aldose 1-epimerase  25.99 
 
 		 289 aa  55.1  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.436668 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1836  Aldose 1-epimerase  28.95 
 
 		 315 aa  55.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0559  Aldose 1-epimerase  26.9 
 
 		 262 aa  54.3  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.480763  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2057  aldose 1-epimerase  25.83 
 
 		 305 aa  54.7  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.107394  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0739  Aldose 1-epimerase  25.95 
 
 		 276 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.220443  normal  0.0861855 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1267  Aldose 1-epimerase  34.29 
 
 		 301 aa  53.9  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.560353  hitchhiker  0.00115827 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3398  aldose 1-epimerase  29.57 
 
 		 294 aa  53.5  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.226465  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5039  Aldose 1-epimerase  22.95 
 
 		 312 aa  52.8  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8681  Aldose 1-epimerase  33.02 
 
 		 303 aa  52.4  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.626175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33650  galactose mutarotase-like enzyme  28.57 
 
 		 318 aa  51.6  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5648  Aldose 1-epimerase  26.77 
 
 		 327 aa  52.4  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0225  galactose mutarotase  29.91 
 
 		 314 aa  51.6  0.00001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00000500571  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1458  aldose 1-epimerase  26.28 
 
 		 263 aa  51.2  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0514  aldose 1-epimerase  27.61 
 
 		 327 aa  51.6  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.165305  decreased coverage  0.000622322 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0702  Aldose 1-epimerase  23.03 
 
 		 318 aa  50.8  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>