121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_0896 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_0896  aldose 1-epimerase  100 
 
 		 293 aa  600  1e-170  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.320638 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1047  hypothetical protein  83.62 
 
 		 293 aa  511  1e-144  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1183  aldose 1-epimerase  56.9 
 
 		 305 aa  344  1e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.101584  normal  0.174259 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1165  aldose 1-epimerase  56.4 
 
 		 289 aa  341  7e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0252324 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1199  aldose 1-epimerase  56.4 
 
 		 289 aa  340  2e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.938894 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4246  aldose 1-epimerase  55.71 
 
 		 289 aa  338  4e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3306  aldose 1-epimerase  56.06 
 
 		 291 aa  335  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51460  aldose 1-epimerase  49.82 
 
 		 285 aa  300  2e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3405  Aldose 1-epimerase  39.32 
 
 		 353 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.237068  normal  0.0908294 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0551  putative aldose-1-epimerase  40.29 
 
 		 297 aa  192  4e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.530428  normal  0.44726 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2610  aldose 1-epimerase  37.06 
 
 		 352 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.169817 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2583  Aldose 1-epimerase  37.07 
 
 		 294 aa  178  1e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0550  aldose 1-epimerase  38.11 
 
 		 353 aa  177  1e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0177374  normal  0.655719 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1183  aldose 1-epimerase  38.62 
 
 		 357 aa  177  2e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2993  Aldose 1-epimerase  37.15 
 
 		 294 aa  176  3e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.778062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0526  aldose 1-epimerase  38.11 
 
 		 353 aa  176  5e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0142  aldose 1-epimerase  37.76 
 
 		 353 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0625  aldose 1-epimerase  37.76 
 
 		 353 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.417593  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0593  aldose 1-epimerase  37.76 
 
 		 353 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.112152 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2760  aldose 1-epimerase  36.15 
 
 		 353 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.385741 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2482  hypothetical protein  37.93 
 
 		 357 aa  171  1e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283645  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3479  aldose 1-epimerase  37.59 
 
 		 357 aa  171  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.329911  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0402  hypothetical protein  37.93 
 
 		 357 aa  171  1e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.827093  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1262  hypothetical protein  37.93 
 
 		 344 aa  171  1e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3444  aldose 1-epimerase family protein  37.93 
 
 		 357 aa  171  1e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.381459  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3482  aldose 1-epimerase family protein  37.93 
 
 		 357 aa  171  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3303  hypothetical protein  37.93 
 
 		 357 aa  171  1e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3707  aldose 1-epimerase  37.76 
 
 		 353 aa  168  9e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.405661  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2754  hypothetical protein  36.46 
 
 		 296 aa  165  9e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.494847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2260  aldose 1-epimerase  33.22 
 
 		 356 aa  159  4e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00420753  unclonable  0.0000000181907 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5831  aldose 1-epimerase  35.71 
 
 		 293 aa  158  1e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0718685  normal  0.204267 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0912  aldose 1-epimerase  36.77 
 
 		 295 aa  153  2.9999999999999998e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1886  aldose 1-epimerase  33.91 
 
 		 382 aa  150  3e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.369459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4225  aldose 1-epimerase  32.67 
 
 		 295 aa  149  4e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.387725  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02436  hypothetical protein  33.67 
 
 		 290 aa  148  9e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1124  Aldose 1-epimerase  33.67 
 
 		 290 aa  148  9e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02400  hypothetical protein  33.67 
 
 		 290 aa  148  9e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2696  aldose 1-epimerase family protein  33.67 
 
 		 290 aa  148  9e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2829  aldose 1-epimerase family protein  33.67 
 
 		 290 aa  148  9e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1133  aldose 1-epimerase  33.33 
 
 		 290 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3776  aldose 1-epimerase family protein  33.67 
 
 		 290 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2697  aldose 1-epimerase family protein  33.56 
 
 		 290 aa  145  6e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2029  aldose 1-epimerase  31.6 
 
 		 311 aa  145  7.0000000000000006e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.99913  normal  0.429541 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6249  Aldose 1-epimerase  31.31 
 
 		 296 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.783578 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0324  Aldose 1-epimerase  32 
 
 		 299 aa  141  9.999999999999999e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.296431 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4338  hypothetical protein  32.19 
 
 		 310 aa  138  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0628  aldose 1-epimerase  31.03 
 
 		 282 aa  136  5e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.48408  normal  0.247972 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0383  Aldose 1-epimerase  31.14 
 
 		 302 aa  133  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3762  Aldose 1-epimerase  33.61 
 
 		 296 aa  126  6e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.993298  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3474  Aldose 1-epimerase  32.93 
 
 		 296 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.84486 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2372  aldose 1-epimerase  30.43 
 
 		 309 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1015  Aldose 1-epimerase  29.7 
 
 		 311 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0950  Aldose 1-epimerase  29.87 
 
 		 311 aa  113  3e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0322782 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1585  Aldose 1-epimerase  29 
 
 		 305 aa  113  5e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.92898  normal  0.309256 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0696  Aldose 1-epimerase  30.54 
 
 		 306 aa  110  2.0000000000000002e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00129327 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5533  Aldose 1-epimerase  29.59 
 
 		 308 aa  98.6  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2023  aldose 1-epimerase  29.73 
 
 		 298 aa  96.3  6e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1083  hypothetical protein  28.96 
 
 		 323 aa  85.5  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000316766  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0149  Aldose 1-epimerase  26.13 
 
 		 336 aa  75.5  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0125238 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0702  Aldose 1-epimerase  27.57 
 
 		 318 aa  68.9  0.00000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5648  Aldose 1-epimerase  27.65 
 
 		 327 aa  66.2  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1235  Aldose 1-epimerase  27.49 
 
 		 319 aa  65.5  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000417318 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3303  putative aldose-1-epimerase  26.02 
 
 		 297 aa  63.5  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.575493 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1278  Aldose 1-epimerase  30.25 
 
 		 307 aa  63.2  0.000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.265427  normal  0.286232 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0739  Aldose 1-epimerase  27.24 
 
 		 276 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.220443  normal  0.0861855 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3398  aldose 1-epimerase  26.52 
 
 		 294 aa  60.5  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.226465  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0456  aldose 1-epimerase  26.21 
 
 		 300 aa  60.1  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4402  aldose-1-epimerase family protein  25.99 
 
 		 300 aa  59.7  0.00000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03764  predicted aldose-1-epimerase  27.78 
 
 		 308 aa  59.7  0.00000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4107  Aldose 1-epimerase  27.78 
 
 		 308 aa  59.7  0.00000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03713  hypothetical protein  27.78 
 
 		 308 aa  59.7  0.00000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0044  Aldose 1-epimerase  29.59 
 
 		 311 aa  58.5  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1897  aldose 1-epimerase  26.17 
 
 		 290 aa  57.8  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0469  aldose 1-epimerase  25.81 
 
 		 300 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.799033  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0480  aldose 1-epimerase  25.81 
 
 		 300 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2489  Aldose 1-epimerase  27.44 
 
 		 308 aa  57.4  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5326  aldose-1-epimerase family protein  27.16 
 
 		 300 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.6155 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8681  Aldose 1-epimerase  34.32 
 
 		 303 aa  56.6  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.626175  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1225  Aldose 1-epimerase  25.77 
 
 		 302 aa  55.8  0.0000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1674  aldose 1-epimerase  24.65 
 
 		 325 aa  55.8  0.0000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.416242  hitchhiker  0.00123529 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4109  aldose 1-epimerase family protein  25.16 
 
 		 295 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0163943  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4297  aldose-1-epimerase family protein  26.94 
 
 		 295 aa  54.7  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4343  aldose-1-epimerase family protein  26.94 
 
 		 295 aa  54.7  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4252  aldose-1-epimerase family protein  26.94 
 
 		 295 aa  54.7  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4134  aldose 1-epimerase  25.16 
 
 		 295 aa  53.5  0.000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4264  aldose-1-epimerase family protein  26.99 
 
 		 299 aa  53.5  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4362  aldose 1-epimerase family protein  25.16 
 
 		 295 aa  53.1  0.000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1895  aldose 1-epimerase family protein  28.16 
 
 		 306 aa  52.4  0.000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0295  aldose 1-epimerase family protein  28.16 
 
 		 295 aa  52.4  0.000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3963  aldose 1-epimerase  25.51 
 
 		 286 aa  52.4  0.000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.87118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1019  Aldose 1-epimerase  26.34 
 
 		 299 aa  52  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.584137  hitchhiker  0.000443551 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1267  Aldose 1-epimerase  29.7 
 
 		 301 aa  50.4  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.560353  hitchhiker  0.00115827 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2454  aldose 1-epimerase  29.7 
 
 		 307 aa  49.3  0.00008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0866  Aldose 1-epimerase  26.97 
 
 		 306 aa  49.3  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.104082  normal  0.0514904 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1163  aldose 1-epimerase  24.49 
 
 		 323 aa  48.1  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.887027  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0270  galactose mutarotase related enzyme  24.53 
 
 		 291 aa  47.8  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.117354  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0638  aldose 1-epimerase  26.4 
 
 		 300 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.221019 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0256  aldose 1-epimerase  25.6 
 
 		 300 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0100614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4435  Aldose 1-epimerase  30.18 
 
 		 303 aa  47.8  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.340797 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2997  Aldose 1-epimerase  28.31 
 
 		 302 aa  47  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0040024 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>