125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_0638 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_0638  aldose 1-epimerase  100 
 
 
300 aa  610  9.999999999999999e-175  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.221019 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0256  aldose 1-epimerase  90 
 
 
300 aa  534  1e-151  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0100614  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0456  aldose 1-epimerase  59.33 
 
 
300 aa  380  1e-104  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0469  aldose 1-epimerase  59 
 
 
300 aa  376  1e-103  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.799033  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0480  aldose 1-epimerase  59 
 
 
300 aa  376  1e-103  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5648  Aldose 1-epimerase  51.41 
 
 
327 aa  308  9e-83  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1483  Aldose 1-epimerase  36.57 
 
 
313 aa  143  4e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0114405  normal  0.21833 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0866  Aldose 1-epimerase  32.84 
 
 
306 aa  91.7  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.104082  normal  0.0514904 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1019  Aldose 1-epimerase  25.64 
 
 
299 aa  70.9  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.584137  hitchhiker  0.000443551 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0426  aldose 1-epimerase  26.76 
 
 
308 aa  68.2  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2660  aldose 1-epimerase  24.29 
 
 
306 aa  66.2  0.0000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0844306  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1047  hypothetical protein  27.51 
 
 
293 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3398  aldose 1-epimerase  25.79 
 
 
294 aa  65.5  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.226465  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0896  aldose 1-epimerase  26.4 
 
 
293 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.320638 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2057  aldose 1-epimerase  23.62 
 
 
305 aa  63.9  0.000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.107394  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0702  Aldose 1-epimerase  25.08 
 
 
318 aa  63.5  0.000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0656  aldose-1-epimerase  25.3 
 
 
314 aa  62.8  0.000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.629793  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1173  hypothetical protein  24.39 
 
 
285 aa  62.4  0.000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20481  galactose mutarotase-like protein  24.91 
 
 
285 aa  62.4  0.000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.786913 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0696  Aldose 1-epimerase  26.64 
 
 
306 aa  61.6  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00129327 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33650  galactose mutarotase-like enzyme  25.84 
 
 
318 aa  60.5  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2973  Aldose 1-epimerase  28.24 
 
 
303 aa  60.5  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000377273  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1127  aldose 1-epimerase  28.63 
 
 
269 aa  60.5  0.00000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0176464  normal  0.584187 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4277  aldose 1-epimerase  23.79 
 
 
289 aa  60.1  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.436668 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2241  Aldose 1-epimerase  23.76 
 
 
291 aa  59.3  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.61015 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1638  Aldose 1-epimerase  22.41 
 
 
292 aa  58.9  0.00000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.104568  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1278  Aldose 1-epimerase  27.48 
 
 
307 aa  58.9  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.265427  normal  0.286232 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3306  aldose 1-epimerase  22.86 
 
 
291 aa  57  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1836  Aldose 1-epimerase  24.68 
 
 
315 aa  56.2  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0156  hypothetical protein  27.27 
 
 
284 aa  55.5  0.000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.42374  normal  0.0793834 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0149  Aldose 1-epimerase  23.83 
 
 
336 aa  55.1  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0125238 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0523  Aldose 1-epimerase  27.91 
 
 
290 aa  55.5  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2489  Aldose 1-epimerase  26.97 
 
 
308 aa  55.1  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1015  Aldose 1-epimerase  24.53 
 
 
311 aa  54.7  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3046  Aldose 1-epimerase  25.91 
 
 
345 aa  53.9  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.813423  normal  0.148483 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0854  Aldose 1-epimerase  23.92 
 
 
300 aa  54.3  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0393175  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1262  hypothetical protein  23.72 
 
 
344 aa  53.9  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0324  Aldose 1-epimerase  22.39 
 
 
299 aa  53.9  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.296431 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2482  hypothetical protein  23.72 
 
 
357 aa  53.5  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283645  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1083  putative aldose-1-epimerase  27.34 
 
 
305 aa  53.9  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.145719  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2454  aldose 1-epimerase  24.17 
 
 
307 aa  53.5  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0402  hypothetical protein  23.72 
 
 
357 aa  53.5  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.827093  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1225  Aldose 1-epimerase  28.83 
 
 
302 aa  53.5  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3303  hypothetical protein  23.72 
 
 
357 aa  53.5  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1183  aldose 1-epimerase  25.62 
 
 
305 aa  53.1  0.000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.101584  normal  0.174259 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4246  aldose 1-epimerase  25.5 
 
 
289 aa  52.8  0.000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1235  Aldose 1-epimerase  24.41 
 
 
319 aa  52.4  0.000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000417318 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05040  galactose mutarotase-like enzyme  26.74 
 
 
323 aa  52.8  0.000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.556037  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3479  aldose 1-epimerase  23.32 
 
 
357 aa  51.2  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.329911  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4338  hypothetical protein  23.89 
 
 
310 aa  50.8  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27460  galactose mutarotase-like enzyme  29.8 
 
 
334 aa  50.8  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3444  aldose 1-epimerase family protein  23.32 
 
 
357 aa  51.2  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.381459  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3482  aldose 1-epimerase family protein  23.32 
 
 
357 aa  51.2  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0726  Aldose 1-epimerase  30.08 
 
 
328 aa  51.6  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1229  aldose 1-epimerase  27.06 
 
 
303 aa  50.8  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0383  Aldose 1-epimerase  23.79 
 
 
302 aa  51.6  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0186  hypothetical protein  23.64 
 
 
282 aa  50.8  0.00003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3760  Aldose 1-epimerase  21.36 
 
 
290 aa  50.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00879497  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3707  Aldose 1-epimerase  21.36 
 
 
290 aa  50.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2997  Aldose 1-epimerase  26.36 
 
 
302 aa  50.4  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0040024 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1199  aldose 1-epimerase  23.81 
 
 
289 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.938894 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1165  aldose 1-epimerase  23.81 
 
 
289 aa  49.7  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0252324 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3963  aldose 1-epimerase  21.67 
 
 
286 aa  49.7  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.87118  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1930  Aldose 1-epimerase  24.1 
 
 
316 aa  50.1  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.263285  normal  0.479856 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1183  aldose 1-epimerase  22.92 
 
 
357 aa  49.7  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1203  aldose 1-epimerase  28.24 
 
 
320 aa  49.7  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0739  Aldose 1-epimerase  23.61 
 
 
276 aa  49.7  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.220443  normal  0.0861855 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5039  Aldose 1-epimerase  23.53 
 
 
312 aa  49.7  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2372  aldose 1-epimerase  24.51 
 
 
309 aa  49.3  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1712  aldose 1-epimerase  27.72 
 
 
371 aa  48.5  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.602147  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4461  aldose 1-epimerase  28.24 
 
 
303 aa  48.9  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.259661  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1512  aldose 1-epimerase  27.72 
 
 
302 aa  48.5  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1300  aldose 1-epimerase  28.02 
 
 
303 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.372594  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4297  aldose-1-epimerase family protein  23.22 
 
 
295 aa  48.5  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4343  aldose-1-epimerase family protein  23.22 
 
 
295 aa  48.5  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4252  aldose-1-epimerase family protein  23.22 
 
 
295 aa  48.5  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0044  Aldose 1-epimerase  28.81 
 
 
311 aa  47.8  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4435  Aldose 1-epimerase  25.31 
 
 
303 aa  47.8  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.340797 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8681  Aldose 1-epimerase  26.36 
 
 
303 aa  47.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.626175  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1543  aldose 1-epimerase family protein  27.72 
 
 
302 aa  48.5  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.169393  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1458  aldose 1-epimerase  23.41 
 
 
263 aa  48.1  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0514  aldose 1-epimerase  24.69 
 
 
327 aa  48.1  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.165305  decreased coverage  0.000622322 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0950  Aldose 1-epimerase  23.14 
 
 
311 aa  47.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0322782 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0559  Aldose 1-epimerase  24.9 
 
 
262 aa  47.4  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.480763  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17201  galactose mutarotase-related enzyme  23.95 
 
 
282 aa  47.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.593751  normal  0.935497 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0628  aldose 1-epimerase  26.74 
 
 
282 aa  47.4  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.48408  normal  0.247972 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2182  Aldose 1-epimerase  25.29 
 
 
299 aa  47.4  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000157648 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0837  aldose 1-epimerase  27.17 
 
 
303 aa  47  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0568659  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1318  aldose 1-epimerase  27.17 
 
 
303 aa  47  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12920  galactose mutarotase-like enzyme  25 
 
 
321 aa  47  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0901551  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1674  aldose 1-epimerase  25.42 
 
 
325 aa  46.6  0.0006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.416242  hitchhiker  0.00123529 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25911  galactose mutarotase  26.92 
 
 
288 aa  45.8  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0912  aldose 1-epimerase  22.94 
 
 
295 aa  45.8  0.0009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0761  aldose 1-epimerase  23.46 
 
 
299 aa  45.8  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0142  aldose 1-epimerase  22.8 
 
 
353 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0526  aldose 1-epimerase  22.8 
 
 
353 aa  44.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0625  aldose 1-epimerase  22.8 
 
 
353 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.417593  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3438  aldose 1-epimerase  19.53 
 
 
284 aa  44.3  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.406594  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1989  aldose 1-epimerase  26.57 
 
 
304 aa  44.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0593  aldose 1-epimerase  22.8 
 
 
353 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.112152 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>