204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2454 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2454  aldose 1-epimerase  100 
 
 		 307 aa  609  1e-173  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2973  Aldose 1-epimerase  50.65 
 
 		 303 aa  269  5e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000377273  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8681  Aldose 1-epimerase  47.7 
 
 		 303 aa  251  1e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.626175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0426  aldose 1-epimerase  46.36 
 
 		 308 aa  251  1e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0514  aldose 1-epimerase  46.03 
 
 		 327 aa  249  6e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.165305  decreased coverage  0.000622322 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2997  Aldose 1-epimerase  48.04 
 
 		 302 aa  246  3e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0040024 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1836  Aldose 1-epimerase  47.04 
 
 		 315 aa  241  1e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4435  Aldose 1-epimerase  46.9 
 
 		 303 aa  229  4e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.340797 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2182  Aldose 1-epimerase  45.54 
 
 		 299 aa  228  7e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000157648 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1019  Aldose 1-epimerase  42.67 
 
 		 299 aa  227  2e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.584137  hitchhiker  0.000443551 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2432  aldose 1-epimerase  46.84 
 
 		 301 aa  226  3e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0573284  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1163  aldose 1-epimerase  43.89 
 
 		 323 aa  216  4e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.887027  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1278  Aldose 1-epimerase  45.25 
 
 		 307 aa  215  7e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.265427  normal  0.286232 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1235  Aldose 1-epimerase  43.33 
 
 		 319 aa  212  7e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000417318 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1225  Aldose 1-epimerase  43.71 
 
 		 302 aa  210  3e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3398  aldose 1-epimerase  43.61 
 
 		 294 aa  210  3e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.226465  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2489  Aldose 1-epimerase  43.33 
 
 		 308 aa  207  2e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33650  galactose mutarotase-like enzyme  41.18 
 
 		 318 aa  204  2e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3303  putative aldose-1-epimerase  41.2 
 
 		 297 aa  192  7e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.575493 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1083  putative aldose-1-epimerase  43.05 
 
 		 305 aa  191  2e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.145719  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1267  Aldose 1-epimerase  41.78 
 
 		 301 aa  189  5.999999999999999e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.560353  hitchhiker  0.00115827 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0225  galactose mutarotase  37.92 
 
 		 314 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00000500571  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12920  galactose mutarotase-like enzyme  40.92 
 
 		 321 aa  183  3e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0901551  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05040  galactose mutarotase-like enzyme  38.41 
 
 		 323 aa  181  2e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.556037  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0044  Aldose 1-epimerase  41.47 
 
 		 311 aa  179  4e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4402  aldose-1-epimerase family protein  35.22 
 
 		 300 aa  176  3e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0226  galactose mutarotase  38.08 
 
 		 318 aa  175  9.999999999999999e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00706113  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0866  Aldose 1-epimerase  39.87 
 
 		 306 aa  173  2.9999999999999996e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.104082  normal  0.0514904 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1897  aldose 1-epimerase  40.27 
 
 		 290 aa  173  3.9999999999999995e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.481432 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03764  predicted aldose-1-epimerase  34.88 
 
 		 308 aa  171  1e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4107  Aldose 1-epimerase  34.88 
 
 		 308 aa  171  1e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03713  hypothetical protein  34.88 
 
 		 308 aa  171  1e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0523  Aldose 1-epimerase  38.74 
 
 		 290 aa  170  4e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0854  Aldose 1-epimerase  37.5 
 
 		 300 aa  167  2e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0393175  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5326  aldose-1-epimerase family protein  34.45 
 
 		 300 aa  166  5e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.6155 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1522  Aldose 1-epimerase  37.62 
 
 		 293 aa  165  8e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4264  aldose-1-epimerase family protein  34.22 
 
 		 299 aa  162  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4252  aldose-1-epimerase family protein  33.33 
 
 		 295 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4297  aldose-1-epimerase family protein  33.33 
 
 		 295 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4343  aldose-1-epimerase family protein  33.33 
 
 		 295 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4408  aldose-1-epimerase family protein  32.63 
 
 		 280 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4230  aldose-1-epimerase family protein  32.28 
 
 		 280 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1674  aldose 1-epimerase  36.74 
 
 		 325 aa  132  5e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.416242  hitchhiker  0.00123529 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5039  Aldose 1-epimerase  31.02 
 
 		 312 aa  113  3e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27460  galactose mutarotase-like enzyme  33.72 
 
 		 334 aa  112  6e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0726  Aldose 1-epimerase  33.07 
 
 		 328 aa  110  2.0000000000000002e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3046  Aldose 1-epimerase  28.62 
 
 		 345 aa  101  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.813423  normal  0.148483 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0656  aldose-1-epimerase  28.63 
 
 		 314 aa  97.1  4e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.629793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1127  aldose 1-epimerase  28.83 
 
 		 269 aa  91.3  2e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0176464  normal  0.584187 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1930  Aldose 1-epimerase  28.73 
 
 		 316 aa  89.7  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.263285  normal  0.479856 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0149  Aldose 1-epimerase  32.55 
 
 		 336 aa  84  0.000000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0125238 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0559  Aldose 1-epimerase  25.9 
 
 		 262 aa  83.2  0.000000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.480763  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0702  Aldose 1-epimerase  28.85 
 
 		 318 aa  82.4  0.000000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1458  aldose 1-epimerase  28.47 
 
 		 263 aa  82.4  0.000000000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6330  aldose 1-epimerase  29.8 
 
 		 362 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1585  Aldose 1-epimerase  25.57 
 
 		 305 aa  73.6  0.000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.92898  normal  0.309256 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6030  aldose 1-epimerase  29.71 
 
 		 362 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.808799  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4184  Aldose 1-epimerase  30.63 
 
 		 360 aa  68.9  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2023  aldose 1-epimerase  29.93 
 
 		 298 aa  68.9  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4072  Aldose 1-epimerase  30.63 
 
 		 360 aa  68.9  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0950  Aldose 1-epimerase  28.85 
 
 		 311 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0322782 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0630  aldose 1-epimerase  28.88 
 
 		 356 aa  66.6  0.0000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4205  aldose 1-epimerase  28.78 
 
 		 362 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.613008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0655  aldose 1-epimerase  28.88 
 
 		 356 aa  66.6  0.0000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1015  Aldose 1-epimerase  27.68 
 
 		 311 aa  66.2  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0799  aldose 1-epimerase  29.66 
 
 		 397 aa  65.1  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0469  aldose 1-epimerase  32.23 
 
 		 300 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.799033  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2178  Aldose 1-epimerase  25.8 
 
 		 329 aa  65.5  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0480  aldose 1-epimerase  32.23 
 
 		 300 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0456  aldose 1-epimerase  31.82 
 
 		 300 aa  63.5  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0696  Aldose 1-epimerase  27.35 
 
 		 306 aa  63.5  0.000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00129327 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2336  aldose 1-epimerase  30.18 
 
 		 376 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.360362  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5648  Aldose 1-epimerase  26.09 
 
 		 327 aa  62  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6249  Aldose 1-epimerase  25.66 
 
 		 296 aa  60.8  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.783578 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4249  aldose 1-epimerase  29.43 
 
 		 353 aa  61.2  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6635  Aldose 1-epimerase  27.2 
 
 		 361 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.779767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6508  aldose 1-epimerase  26.91 
 
 		 362 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6742  aldose 1-epimerase  26.91 
 
 		 362 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112366  normal  0.547611 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4277  aldose 1-epimerase  22.82 
 
 		 289 aa  59.3  0.00000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.436668 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6331  aldose 1-epimerase  26.84 
 
 		 362 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3593  Aldose 1-epimerase  26.81 
 
 		 355 aa  58.9  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00379165  hitchhiker  0.0000198106 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3707  Aldose 1-epimerase  24.21 
 
 		 290 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2798  aldose 1-epimerase  31.17 
 
 		 321 aa  58.2  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3760  Aldose 1-epimerase  23.92 
 
 		 290 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00879497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1122  aldose 1-epimerase  31.14 
 
 		 392 aa  58.2  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1503  Aldose 1-epimerase  30.09 
 
 		 317 aa  57.4  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.72169 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2624  aldose 1-epimerase  26.83 
 
 		 371 aa  57  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.240433 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1039  Aldose 1-epimerase  30.99 
 
 		 357 aa  56.6  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594028  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1805  aldose 1-epimerase  31.15 
 
 		 385 aa  56.6  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.122387 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1269  Aldose 1-epimerase  32.74 
 
 		 414 aa  56.2  0.0000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0872441  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1210  aldose 1-epimerase  24.82 
 
 		 347 aa  55.8  0.0000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00282737  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3011  Aldose 1-epimerase  30.72 
 
 		 400 aa  55.5  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.415447  hitchhiker  0.00870507 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1083  hypothetical protein  28.78 
 
 		 323 aa  54.7  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000316766  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1638  Aldose 1-epimerase  19.76 
 
 		 292 aa  54.7  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.104568  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1538  aldose 1-epimerase  26.42 
 
 		 345 aa  54.3  0.000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5831  aldose 1-epimerase  26.51 
 
 		 293 aa  53.5  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0718685  normal  0.204267 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3008  Aldose 1-epimerase  25.5 
 
 		 434 aa  53.9  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0819  aldose 1-epimerase  28.29 
 
 		 351 aa  53.5  0.000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1758  aldose 1-epimerase  26.99 
 
 		 372 aa  53.5  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00365517  normal  0.11441 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0912  aldose 1-epimerase  28.3 
 
 		 295 aa  53.1  0.000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>